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        內(nèi)蒙古漢族人群硒蛋白S基因rs34713741多態(tài)性與大腸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系

        2018-11-29 03:13:00邢少姬康茹雪王殿棟鄭連生張亞瓊
        中國(guó)老年學(xué)雜志 2018年22期
        關(guān)鍵詞:等位基因多態(tài)性基因型

        邢少姬 康茹雪 張 萱 王殿棟 鄭連生 張亞瓊 何 珊

        (包頭醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院,內(nèi)蒙古 包頭 014060)

        大腸癌(CRC)在我國(guó)城市和農(nóng)村發(fā)病率分列所有惡性腫瘤的第3、5位,病死率分別居第4、5位〔1〕?,F(xiàn)已明確,遺傳和環(huán)境因素相互作用是導(dǎo)致CRC發(fā)生的主要原因,其中,環(huán)境因素是導(dǎo)致腫瘤發(fā)生的始動(dòng)因素,個(gè)體遺傳特征則決定腫瘤的易感性。硒蛋白(Sel)S是一種內(nèi)質(zhì)網(wǎng)及細(xì)胞膜駐留蛋白。目前研究發(fā)現(xiàn),SelS具有廣泛的生物學(xué)功能,能清除過(guò)氧化物,保護(hù)細(xì)胞免遭氧化物損傷,抑制和調(diào)節(jié)炎癥和免疫反應(yīng),在維持細(xì)胞DNA和蛋白質(zhì)的穩(wěn)定中發(fā)揮重要作用等〔2,3〕。近年來(lái),國(guó)內(nèi)外的一些研究發(fā)現(xiàn),SelS基因多態(tài)性與胃腸道惡性腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)〔4~7〕,但尚未見(jiàn)內(nèi)蒙古地區(qū)漢族人群的相關(guān)報(bào)道。本研究采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)技術(shù)檢測(cè)CRC患者的SelS基因多態(tài)性,探討內(nèi)蒙古漢族人群CRC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)與SelS基因多態(tài)性的相關(guān)性。

        1 資料和方法

        1.1一般資料 2015年7月至2016年10月包頭市腫瘤醫(yī)院、包頭醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院經(jīng)組織病理學(xué)確診的新發(fā)CRC患者126例(CRC組),男73例,女53例,年齡39~79〔平均(61.81±12.55)〕歲,均無(wú)放、化療史,無(wú)胃腸道遺傳病史。對(duì)照組來(lái)自同期社區(qū)健康體檢人群135例,男85例,女50例,年齡35~80〔平均(60.07±10.42)〕歲,經(jīng)詢問(wèn)病史、體檢和各項(xiàng)實(shí)驗(yàn)室檢查排除其他胃腸道遺傳病、糖尿病、冠心病及高血壓等其他疾病。入選對(duì)象均為漢族,已在內(nèi)蒙古地區(qū)居住10年以上,彼此無(wú)血緣關(guān)系。CRC組和對(duì)照組在年齡、性別上差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

        1.2主要試劑和儀器 基因組DNA提取試劑盒(北京全式金生物技術(shù)有限公司),引物(上海生工生物工程股份有限公司),PCR擴(kuò)增試劑盒和100 bp DNA Ladder Marker(北京天根生化科技有限公司),限制性內(nèi)切酶HinfI(英國(guó)NEB公司)。UV-160分光光度計(jì)(日本島津制作所)、高速離心機(jī)(湖南湘儀實(shí)驗(yàn)室儀器開(kāi)發(fā)有限公司),PCR儀C1000 TouchTM Thermal Cycler及凝膠成像分析系統(tǒng)(美國(guó)Bio-Rad 公司)。

        1.3基因組DNA的提取與引物合成 采集研究對(duì)象空腹靜脈血2 ml,乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝,試劑盒提取外周血基因組DNA,用UV-160分光光度計(jì)測(cè)定DNA濃度和純度,-20℃保存。SelS基因rs34713741多態(tài)位點(diǎn)引物序列參考文獻(xiàn)〔6,7〕,上游序列:5′-CTTCCGGTGCGCTCCTAC-3′,下游序列:5′-GGCGACCACTGACTTCCTT-3′,擴(kuò)增目的基因長(zhǎng)度為 302 bp。在Pubmed-SNP數(shù)據(jù)庫(kù)中查詢SelS基因rs34713741位點(diǎn)兩側(cè)基因序列(NC_000015.10)的準(zhǔn)確性,并通過(guò)BLAST 軟件驗(yàn)證引物的特異性。

        1.4PCR擴(kuò)增 PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為25 μl,其中含6 μl模板(約100 ng),上、下游引物各1 μl(10 μmol/L),12.5 μl 2×Taq PCR Master Mix,4.5 μl去離子水。PCR擴(kuò)增反應(yīng)參數(shù):預(yù)變性95℃、5 min,變性95℃、30 s,退火62℃、30 s,延伸72℃、1 min,35個(gè)循環(huán),最后延伸72℃、5 min。

        1.5基因分型及測(cè)序 酶切反應(yīng)體系為20 μl,其中包括PCR擴(kuò)增產(chǎn)物12 μl,HinfI內(nèi)切酶2.0 μl,10×限制性內(nèi)切酶緩沖液2.0 μl,去離子水4.0 μl。37℃水浴30 min后,酶切產(chǎn)物于2.5%瓊脂糖凝膠上電泳,用凝膠成像分析系統(tǒng)分析其基因型(TT型為302 bp 1個(gè)片段;CT型為302 bp、198 bp、104 bp 3個(gè)片段;CC型為198 bp、104 bp 2個(gè)片段)。為驗(yàn)證分型的準(zhǔn)確性,隨機(jī)選取50例PCR產(chǎn)物純化后送上海美吉生物北京實(shí)驗(yàn)基地測(cè)序驗(yàn)證。

        1.6統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSS 17.0軟件進(jìn)行χ2檢驗(yàn)、Fisher確切概率法、非條件Logistic回歸模型。

        2 結(jié) 果

        2.1SelS基因rs34713741多態(tài)位點(diǎn)分型及測(cè)序結(jié)果 SelS基因rs34713741位點(diǎn)存在2個(gè)等位基因C和T,組成CC、CT、TT 3種基因型(見(jiàn)圖1)。且測(cè)序結(jié)果與酶切結(jié)果完全一致(見(jiàn)圖2)。

        M:100 bp DNA Ladder Marker;1、3:TT型;4、5、7:CT型;2、6:CC型圖1 SelS基因rs34713741 RFLP基因分型電泳結(jié)果

        A為CC型;B為CT型;C為T(mén)T型;橫線部分為內(nèi)切酶HinfI識(shí)別位點(diǎn),箭頭所指為SelS基因rs34713741位點(diǎn)堿基圖2 SelS基因rs34713741位點(diǎn)PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果

        2.2SelS基因rs34713741位點(diǎn)多態(tài)性與CRC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系 研究人群SelS基因rs34713741位點(diǎn)頻率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,表明所選樣本具有群體代表性(χ2=0.017,P>0.05)。CRC組和對(duì)照組CC、CT、TT基因型分布頻率、等位基因C、T分布頻率均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05),見(jiàn)表1。

        表1 兩組SelS基因rs34713741位點(diǎn)基因型、等位基因分布〔n(%)〕

        2.3SelS基因rs34713741位點(diǎn)多態(tài)性與不同臨床特征的關(guān)系 遠(yuǎn)端大腸組和對(duì)照組的CC、CT、TT基因型分布頻率比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),遠(yuǎn)端大腸組CC基因型分布頻率明顯低于對(duì)照組,攜帶T等位基因的CT和(或)TT個(gè)體患CRC的風(fēng)險(xiǎn)是CC基因型個(gè)體的1.719倍(OR=1.719,95%CI:1.144~2.582)。近端大腸組、高、中、低分化組中CC、CT、TT基因型分布頻率與對(duì)照組比較均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(均P>0.05)。提示SelS基因rs34713741位點(diǎn)多態(tài)性影響遠(yuǎn)端CRC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),但與腫瘤分化程度無(wú)關(guān)聯(lián)。見(jiàn)表2。

        表2 SelS基因rs34713741位點(diǎn)多態(tài)性與不同臨床特征的關(guān)系〔n(%)〕

        1)與對(duì)照組比較:P<0.05

        3 討 論

        硒是哺乳動(dòng)物及人體必需的微量元素之一,主要以硒代半胱氨酸的形式存在于蛋白質(zhì)中。SelS的主要生物學(xué)功能有:保護(hù)細(xì)胞免受活性氧損傷的抗氧化功能,參與炎癥反應(yīng),參與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激及相關(guān)蛋白降解,參與脂蛋白代謝、精子發(fā)育等〔8,9〕。SelS的基因定位于15q26.3,包含6個(gè)外顯子和5個(gè)內(nèi)含子,是由1 250和1 292個(gè)堿基組成的兩個(gè)轉(zhuǎn)錄變體,最終的編碼產(chǎn)物均為189個(gè)氨基酸殘基組成的SelS,其中第188位為硒代半胱氨酸殘基〔10〕。因此,一旦SelS基因發(fā)生突變,可能導(dǎo)致其編碼產(chǎn)物發(fā)生變化,進(jìn)而影響抗氧化損傷、抗炎癥反應(yīng)等正常生物學(xué)功能,降低人體細(xì)胞抵御惡性腫瘤發(fā)生的能力??偨Y(jié)目前國(guó)內(nèi)外的相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),與胃腸道惡性腫瘤密切相關(guān)的Sel基因多態(tài)性位點(diǎn)多位于基因的啟動(dòng)子區(qū),該處基因的變異相比于編碼區(qū)對(duì)Sel表達(dá)的影響更大,更易改變個(gè)體罹患腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)〔11〕。目前已發(fā)現(xiàn)SelS基因至少存在15個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),但研究最多的是位于基因啟動(dòng)子區(qū)的rs28665122和rs34713741位點(diǎn)。如日本Shibata等〔12〕發(fā)現(xiàn),SelS基因rs28665122位點(diǎn)多態(tài)性與日本人群胃癌的遺傳易感性具有相關(guān)性,A等位基因的個(gè)體與GG基因型的個(gè)體相比,患胃癌的風(fēng)險(xiǎn)顯著增高。Meplan等〔5〕研究發(fā)現(xiàn)捷克人群SelS基因rs34713741位點(diǎn)多態(tài)性與結(jié)直腸癌的發(fā)病具有相關(guān)性,TT基因型個(gè)體的患病風(fēng)險(xiǎn)是CC基因型個(gè)體的1.68倍。張龍等〔6〕、毛華杰等〔7〕在針對(duì)SelS基因rs34713741位點(diǎn)多態(tài)性與胃腸道癌癥遺傳易感性的相關(guān)研究中發(fā)現(xiàn),SelS基因rs34713741位點(diǎn)多態(tài)性與CRC和胃癌的發(fā)病均有關(guān),癌癥組CC基因型分布頻率明顯低于健康對(duì)照組,T等位基因可能是中國(guó)人群胃腸癌發(fā)病的危險(xiǎn)因素之一。

        本研究提示SelS基因rs34713741位點(diǎn)多態(tài)性與CRC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)相關(guān)性,與遠(yuǎn)端CRC的發(fā)病具有相關(guān)性,T等位基因可能是內(nèi)蒙古漢族人群遠(yuǎn)端CRC發(fā)病的危險(xiǎn)因素,這與張龍等〔8〕等報(bào)道湖南漢族的結(jié)果基本一致,但同時(shí)也存在差異,湖南漢族人群SelS基因rs34713741位點(diǎn)多態(tài)性與CRC發(fā)病有關(guān),攜帶T等位基因的個(gè)體患CRC的風(fēng)險(xiǎn)是CC基因型個(gè)體的1.597倍(OR=1.597,95%CI:1.096~2.326),且在遠(yuǎn)側(cè)CRC組此風(fēng)險(xiǎn)增加,是CC基因型的1.617倍(OR=1.617,95%CI:1.060~2.466)。這可能與不同地區(qū)被研究人群的遺傳背景不同有關(guān)。另外,本研究由于所涉樣本例數(shù)有限,易出現(xiàn)偏倚。在后續(xù)的研究中需繼續(xù)增加樣本例數(shù)進(jìn)行分析。此外,基因間的相互作用及與環(huán)境危險(xiǎn)因素的協(xié)同作用均對(duì)腫瘤的患病風(fēng)險(xiǎn)有較大影響〔13〕。因此,還需繼續(xù)研究基因間及基因與環(huán)境間的交互作用。

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