陳奕彤,張斯然,張春波,金東日
(延邊大學 長白山生物資源與功能分子教育部重點實驗室,化學系,吉林 延吉 133002)
蛋白質的糖基化是真核細胞中最常見的翻譯后修飾,對蛋白質的折疊、定位及運輸有重要作用[1-4]。作為糖基化修飾的主要類型之一,天冬酰胺(Asn)殘基上的N-糖基化發(fā)揮著重要的生物學功能,如參與細胞黏附、蛋白質折疊和信號轉導等生命過程[4]。人類許多疾病的發(fā)生和發(fā)展均與N-糖鏈結構和表達量的改變有關[5-6]。因此,建立糖蛋白中N-糖鏈的分析方法對尋求疾病中有效的生物信息具有重要的現(xiàn)實意義。
糖蛋白N-糖鏈的常用分析過程為:首先用蛋白酶(如N-糖苷酶F)釋放糖蛋白的糖鏈,獲得糖鏈與蛋白混合物,然后對糖鏈進行富集純化,最后對其結構進行分析。生物質譜可對各種糖鏈進行結構分析,是解決糖鏈結構的有效手段。糖鏈結構研究中,采用電噴霧離子化-質譜(ESI-MS)技術無需衍生化即能確定糖鏈的組成和結構,但易受樣品盒溶劑中干擾物的影響,因此需進行繁瑣的糖鏈分離、純化處理。常用的糖鏈富集純化方法有凝集素親合法、石墨碳柱固相萃取法等。凝集素親合法可以捕獲不同的糖鏈,但凝集素不能吸附所有類型的糖鏈。石墨碳柱存在操作繁瑣、重現(xiàn)性差、樣品損失大、成本高等缺陷。近年來,在線分析技術的發(fā)展使得聯(lián)用技術日趨完善,如氣相色譜-質譜(GC-MS)、液相色譜-質譜(LC-MS)和毛細管電泳-質譜(CE-MS)等聯(lián)用技術無需過多的分離純化步驟,可直接將微量樣品上樣分析,更加有效地獲得相關的糖鏈結構信息。但這些方法存在由于糖鏈本身不易質子化、檢測靈敏度低和很難獲得糖蛋白糖鏈表達量改變信息等問題?;瘜W衍生化方法是解決上述問題的有效方法之一。通過對糖鏈的衍生化,可增加糖鏈的疏水性使之易于在色譜柱上保留,提高糖鏈的質譜靈敏度,還可以進行糖鏈的相對定量分析[7-9]。但需要在實驗過程中進行額外的化學反應,這不僅需要引入試劑,增加反應步驟,還會產生副反應。
前期研究中,本課題組合成了帶1個GlcNAc的同位素標記受體(如PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc,d8-PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc等)[9]。本研究利用Endo-M N175Q能將天然糖肽(如SGP)中糖鏈轉移到糖鏈受體上的特性,以PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc為糖鏈受體,建立了新的糖蛋白糖鏈分析方法,并將此方法應用于糖蛋白N-糖鏈的分析。
1260 HPLC系統(tǒng)聯(lián)用6460三重四極桿質譜(美國Agilent Technologies);HB-100恒溫金屬浴(杭州大和熱電子有限公司);FD-LD-50低溫冷凍干燥機(上海比朗儀器有限公司);H-1650電動離心機(長沙湘林離心機儀器有限公司)。
DL-二流蘇糖醇(DTT)、三(羥甲基)氨基甲烷、鹽酸胍、甲酸銨、磷酸二氫鈉、磷酸氫二鈉、甲酸(色譜純)、乙二胺四乙酸二鈉購自上海阿拉丁生化科技股份有限公司; 碘代乙酰胺(IAA)、碳酸氫銨購自北京百靈威科技有限公司;胎球蛋白(Fetuin)、胰核糖核酸酶B(RNase B)購自Sigma-Aldrich 公司;N-糖苷酶F(PNGase F)購自NEW ENGLAND Biolabs Inc;丙酮、乙腈等均為色譜純。d0/d8-PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc按文獻合成[13]。
取 3 mg 糖蛋白樣品(牛胰核糖核酸酶B、卵清蛋白、胎球蛋白) 溶于50 μL pH 8.5的Tris-HCl(含7 mol/L鹽酸胍和5 mmol/L EDTA)緩沖溶液中,加100 μL 1 mol/L DTT,65 ℃下反應30 min,冷卻至室溫,加140 μL 0.5 mol/L IAA,室溫下反應40 min,加 60 μL 1 mol/L DTT終止反應。
將上一步變性后的反應液過PD Mini G-25凝膠柱,除去鹽類等小分子物質。用1 mL緩沖液洗脫,收集洗脫液并冷凍干燥8 h后,將樣品溶于50 μL pH 8.0碳酸氫銨緩沖液中,加胰蛋白酶10 μL(0.1 mg),充分混合2 min,于37 ℃金屬浴中恒溫避光反應20 h。
向得到的酶解液中加入300 μL丙酮,于-25 ℃冰柜中放置至少16 h,然后以12 000 g離心15 min,立刻移除上清液,沉淀以氮氣吹干,得到糖肽。
分別取50 μL 4 mmol/L SGP溶液于3個2 mL離心管中,依次加入150、250、350 μL冷丙酮。于-25 ℃冰柜中放置20 h后,以12 000 g離心10 min,移除上清液,將底部沉淀用氮氣吹干。3個離心管中分別加入50 μL 流動相溶解樣品,用LC-MS進行檢測。
向用20 μL pH 6.5磷酸鈉緩沖液溶解的糖肽中加5 μL 1 mol/L d0-PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc(或d8-PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc)和 5 mU 5 μL Endo-M N175Q,在32 ℃金屬浴中進行4 h酶促反應。反應結束后,加10 μL乙腈使酶失活,取2 μL反應液進行LC-MS分析。
色譜柱為YMC色譜柱(2.0 mm×150 mm,3 μm);流動相:A為10 mmol/L 甲酸銨溶液,B為乙腈;梯度洗脫程序:0~18 min,5%~53%B;18~28 min,53%B;28~33 min,53%~95%B;33~36 min,95%~5%B;36~45 min,5%B。流速為 0.2 mL/min,進樣量為2 μL。
離子化條件:ESI電離源,正離子掃描,噴霧電壓 4 kV,霧化氣20 psi(1 psi≈6.9 kPa),加熱氣30 psi,氣簾氣 25 psi,干燥氣流速10 L/min,干燥氣溫度350 ℃,四極桿溫度100 ℃,停留時間100 μs。全掃描模式,掃描范圍m/z100~1 200。數(shù)據(jù)處理軟件為Mass Hunter工作站B.06.06版軟件。
采用在前期研究中合成的易質子化,且?guī)?個GlcNAc的糖基受體PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc[9],以PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc和糖肽(如SGP)作為酶催化反應的底物時,Endo-M N175Q酶促反應可促使糖肽上的糖鏈釋放,并將其轉移至PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc,得到糖鏈標記物,從而增加了糖鏈的疏水性,便于色譜分析,并提高糖鏈的MS檢測靈敏度(圖1)。
糖肽和肽有微小的極性差異,糖肽的親水性強于一般的肽段。當糖肽和肽的混合溶液中加入非極性溶劑時,極性大的糖肽會發(fā)生沉淀,而極性小的肽溶于非極性溶劑中,如Kawasaki等[14]用丙酮沉淀經胰蛋白水解的α1-酸性糖蛋白(αAGP)酶解液中的糖肽,結果有90%以上的糖肽富集在沉淀中。由于酶解液中丙酮的加入量對糖肽富集效果至關重要,本實驗以唾液酸糖肽(SGP)為糖肽模型,分別考察了丙酮體積為樣品體積的3、5、7倍時糖肽的富集效果。結果顯示,當丙酮體積為樣品的5倍時,沉淀中檢測到的SGP的峰面積最大,因此選擇丙酮加入量為樣品體積的5倍。
2.3.1核糖核酸酶B以RNase B作為糖蛋白模型進行胰蛋白酶解、丙酮沉淀糖肽。以富集分離得到的糖肽和PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc為酶促反應底物,進行Endo-M N175Q酶轉糖基反應,得到N-糖鏈標記物并進行LC-MS檢測。為考察丙酮富集糖肽方法對糖蛋白N-糖鏈的檢測情況,以未經丙酮處理的RNase B酶解液進行糖鏈轉移反應,僅檢測到M5N2和M6N2 ,而經丙酮富集后的樣品(圖2)中可檢測到高甘露糖型糖鏈M5N2、M6N2、M7N2、M8N2和M9N2(M:甘露糖; N:N-乙酰葡糖胺)。每種糖鏈均以[M+2H]2+形式檢出,表明丙酮能夠有效沉淀糖肽和肽混合溶液中的糖肽,從而可避免大量存在的肽對N-糖鏈檢測的干擾。進一步根據(jù)每種糖鏈的質譜峰面積對糖鏈進行相對定量分析,將M5N2豐度設為100%,5種高甘露糖型糖鏈M5N2、M6N2、M7N2、M8N2和M9N2的相對豐度依次為100%、95.94%、21.31%、15.9%、4.65%,實驗結果與文獻報道基本一致[15]。
圖1 以SGP(糖基供體)和PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc(糖基受體)為酶催化反應底物的Endo-M N175Q酶糖鏈轉移反應Fig.1 Reaction scheme for transglycosylation reaction between SGP(a donor) and PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc( an acceptor) with Endo-M N175Q
圖2 RNase B的Endo-M N175Q酶促反應產物N-糖鏈標記物的EIC色譜圖(A)與MS圖(B)Fig.2 EIC chromatograms(A) and MS spectra(B) obtained from the transglycosylation reaction of glycans in RNase B with Endo-M N175Q and d0-PDPZ-Boc-Asn-GlcNAcM:mannose; N:N-acetylgluosamine
2.3.2牛胎球蛋白牛胎球蛋白是一種α糖蛋白,分子量為48.4 kDa,含有1條由341個氨基酸組成的肽鏈,N-糖基化位點在81、138和158 Asn位上,N-糖鏈含有二天線和三天線結構。胎球蛋白N-糖鏈標記物的LC-MS檢測結果見圖3。從提取離子色譜圖中可清晰地檢測到5條糖鏈M3N4G2Ac2、M3N4G2Ac3、M3N5G3Ac、M3N5G3Ac2、M3N6G4Ac4(G:半乳糖; Ac:N-乙酰神經氨酸),并經MS確認。M3N4G2Ac2以[M+2H]2+形式檢測;M3N4G2Ac3、M3N5G3Ac2、M3N6G4Ac4以[M+3H]3+形式檢測;M3N5G3Ac檢測到[M+2H]2+和[M+3H]3+的分子離子峰。以上結果表明,丙酮能夠有效沉淀糖蛋白酶解液中的糖肽,而且這些天然糖肽可作為酶促反應底物,Endo-M N175Q能將糖肽的N-糖鏈轉移到受體上,從而在LC-MS上得到分離和檢測。
綜上所述,與常用的糖肽富集純化方法(如凝集親合法、石墨碳柱固相萃取法)相比,利用丙酮富集糖肽方法操作簡便、成本低、樣品損失少,同時能夠有效富集多種類型的糖肽。通過標記糖鏈上易質子化的基團,不僅可有效分離糖鏈,而且提高了糖鏈的檢測靈敏度。另外,本方法利用同位素標記試劑(如d0-PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc/d8-PDPZ-Boc-Asn-GlcNAc)可對糖鏈進行相對定量分析。
圖3 牛胎球蛋白的Endo-M N175Q酶促反應產物N-糖鏈標記物的EIC色譜圖(A)與MS圖(B)Fig.3 EIC chromatograms(A) and MS spectra(B) obtained from the transglycosylation reaction of glycopeptides in bovine fetuin with Endo-M N175Q and d8-PDPZ-Boc-Asn-GlcNAcM:mannose; N:N-acetylgluosamine; G:galactose; Ac:N-acetylneuraminic acid
本文首次利用丙酮富集技術和Endo-M N175Q轉糖基活性,建立了新的糖蛋白/糖肽N-糖鏈的分析方法。該方法較為簡便,可在溫和的條件下將帶特定基團(如易質子化,同位素標記)的標簽和糖肽的寡糖鏈直接連接,從而得到較好的糖鏈色譜分離和高靈敏質譜檢測,可進行糖鏈的相對定量分析。