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        抗艱難梭菌毒素納米抗體在乳酸乳球菌中重組表達及其功能分析

        2018-11-07 08:58:36武國松李杉
        生物技術(shù)通報 2018年10期
        關(guān)鍵詞:梭菌球菌乳酸

        武國松 李杉

        (華南理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院,廣州 510006)

        艱難梭菌(Clostridium difficile)為革蘭氏陽性厭氧芽孢桿菌,是抗生素藥物相關(guān)性腹瀉的主要致病菌[1-2];由于近年來抗生素的廣泛使用,特別是強毒菌株(027/NAPI/BI)的出現(xiàn),使得艱難梭菌感染(Clostridium difficileinfection,CDI)在國內(nèi)外呈上升趨勢[3];CDI常見病癥為假膜性結(jié)腸炎,外周白細胞明顯增多,腹瀉,發(fā)熱等,嚴重的會出現(xiàn)急性腎衰竭和低血壓甚至死亡,復(fù)發(fā)率高達40%[4]。

        目前用萬古霉素、非達霉素作為感染的一線治療方案,然而抗生素藥物易進一步破壞腸道微生態(tài),加重菌群失衡,從而引起反復(fù)感染[5]。1989年在駱駝的血清中發(fā)現(xiàn)一種天然缺失輕鏈只含有重鏈的抗體[9]。具有相對分子質(zhì)量小(分子量只有15 kD左右)、穩(wěn)定性強、抗原結(jié)合性能好、易表達及免疫原性低等特點。這種只由重鏈可變區(qū)構(gòu)成的單域抗體被稱為VHH抗體(Variable domain of heavy chain of heavy-chain antibody,VHH)[6],亦被稱為納米抗體(Nanobody,Nb)。納米抗體具有多種優(yōu)勢[12-13],在食品及藥物開發(fā)等領(lǐng)域擁有廣闊的前景。

        本實驗室已獲得了從駝羊血清中分離的抗艱難梭菌毒素的基因E3和AA6,通過短小的連接序列(Linker)將E3及AA6串聯(lián)在一起,從而轉(zhuǎn)化成二價雙特異的形式,相比單價納米抗體,二價納米抗體具有更高的抗原識別能力及抗原親和力[7]。從而增強其對毒素B的抑制效率,為治療艱難梭菌感染奠定基礎(chǔ)。

        乳酸菌是治療性蛋白載體,自身具有免疫佐劑作用,能夠在強胃酸環(huán)境下生存,不需要對抗原進行復(fù)雜的處理。乳酸菌高效表達系統(tǒng)NICE(The nisin controlled expression,NICE)是在乳鏈菌肽(Nisin)誘導(dǎo)下由 nisA 啟動子控制目的基因表達的[8]。nisin可以在含有 nisRK的菌中高度誘導(dǎo)克隆在 nisA啟動子之后的基因而自身不會產(chǎn)生內(nèi)毒素。當在菌的對數(shù)生長期時加入微量的 nisin,目的基因的濃度依賴誘導(dǎo)將會發(fā)生,且誘導(dǎo)作用與 nisin的濃度在一定范圍內(nèi)成正比,誘導(dǎo)效率可高1 000倍以上[9]。

        本研究應(yīng)用NICE系統(tǒng)構(gòu)建質(zhì)粒pNZ8148-E3-AA6,獲得重組乳酸乳球菌NZ9000/ pNZ8148-E3-AA6,誘導(dǎo)表達納米抗體,通過SDS-PAGE 和Western blot鑒定表達產(chǎn)物,親和層析法純化目標蛋白,并對所獲得重組二價納米抗體進行初步活性鑒定,可以中和艱難梭菌毒素TcdB的細胞毒性。本研究成功在乳酸乳球菌中表達具有抑制TcdB細胞毒性的納米抗體,旨在為治療艱難梭菌感染提供一個潛在方法,具有一定的應(yīng)用前景。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌株、質(zhì)粒和培養(yǎng)基 乳酸乳球菌NZ9000,質(zhì)粒pNZ8148(氯霉素抗性)由江南大學(xué)生物工程學(xué)院張娟博士惠贈。M17培養(yǎng)基:購自青島海博生物技術(shù)有限公司;GM17液體培養(yǎng)基(M17培養(yǎng)基中含 0.5%葡萄糖);G-SGM17液體培養(yǎng)基:M17干粉培養(yǎng)基37.25 g/L,蔗糖0.5 mol/L,甘氨酸2.5%,115℃高壓滅菌20 min,待冷卻至50℃以下時加入0.22 μm濾膜過濾的葡萄糖溶液,其終濃度為0.5%。細胞培養(yǎng)相關(guān)試劑:DMEM(Dulbecco’s Modified Eagle Medium)細胞培養(yǎng)基(Gibco),胰蛋白酶(0.25%Trypsin,Gibco),PBS緩沖液(雙螺旋生物科技,上海),胎牛血清(FBS,Gibco),青霉素和鏈霉素雙抗(Gibco),二甲基亞砜(DMSO,Sigma)

        1.1.2 主要試劑及儀器 PrimerSTAR Max聚合酶、DNA Marker 購自寶生物工程(大連)有限公司。限制性內(nèi)切酶NcoⅠ和SacⅠ、T4DNA 連接酶購自Thermo公司。CCK8檢測液購自背景索寶來生物科技有限公司,質(zhì)粒小提試劑盒以及膠回收試劑盒購自TIANGEN公司。革蘭陽性菌質(zhì)粒小提試劑盒購自北京索萊寶科技有限公司,BCA Protein Assay Kit購自Thermo公司,nisin購自 Sigma公司。非洲綠猴腎細胞株(Vero細胞,實驗室保存)。其他試劑均為分析純。PCR儀Bio-Rad公司,凝膠成像儀Bio-Rad,熒光倒置顯微鏡(Olypus IX71,日本)。Spectramax M5酶標儀購自美谷分子儀器(上海)有限公司。

        1.2 方法

        1.2.1 引物的設(shè)計與合成 根據(jù)E3和AA6的基因序列,在E3基因序列的 3′端添加Linker(G4S)密碼子,在AA6的3′端添加6個His標簽,利用Primer 5.0 設(shè)計擴增基因的引物:E3-F1:5′- CATG CCATGGCTATGGCGGCCGCTTCCCAG-3′(下劃線處為NcoⅠ酶切位點),E3-R1:5′-ATCGAGCTCTTAG TGGTGGTGGTGGTGGTGTGATCCGCCTCCGCCTTGT GGTTTTGGTGTCTTGGGTTCC-3′(下劃線處為SacⅠ酶切位點)。AA6-F2 :5′-ATCGAGCTCATGGCGGCC GCTCAGTTGCA -3′(下劃線處為SacⅠ酶切位點),AA6-R2 :5′-CCCAAGCTTTTAGTGGTGGTGGTGGTG GTGTTGTGGTTTTGGTGTCTTGGGTTCTGA-3′(下劃線處HindIII酶切位點),引物由生工生物工程(上海)服務(wù)有限公司合成。

        1.2.2 重組表達載體的構(gòu)建及蛋白小量表達 PCR分別擴增E3、AA6納米抗體編碼基因,酶切依次將AA6、E3連接至載體pNZ8148 上,雙酶切及測序鑒定獲得質(zhì)粒pNZ8148-E3-AA6。按Holo等[10]方法制備乳酸乳球菌 NZ9000感受態(tài)細胞。將連接產(chǎn)物通過電穿孔轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化到NZ9000感受態(tài)細胞中,設(shè)置電壓2 000 V,電脈沖時間為1.5-5.0 ms。電轉(zhuǎn)細胞在GM17 恢復(fù)培養(yǎng)基(含20 mmol/LMgCl2,2 mmol/L CaCl2)30℃培養(yǎng)2 h后,取100 μL涂布到GM17氯霉素抗性平板上,30℃厭氧培養(yǎng)24-48 h。雙酶切進行鑒定,重組菌株為NZ9000/ pNZ8148-E3-AA6。

        30℃靜置培養(yǎng)過夜的重組菌按照1∶100的比例轉(zhuǎn)接至5 mL GM17培養(yǎng)基中(氯霉素終濃度為10 ug/mL),測定不同時間點重組乳酸乳球菌 NZ9000/pNZ8148-E3-AA6的OD600值,在培養(yǎng)至菌液 OD600值為0.4-0.5時加入終濃度為 1 ng/mL 的誘導(dǎo)劑 nisin進行誘導(dǎo)表達,12 h時收集菌體。收集的菌體經(jīng)超聲破碎后,SDS-PAGE和 Western-blot鑒定。

        1.2.3 重組乳酸乳球菌的大量表達 將誘導(dǎo)后的菌液500 mL離心,每克濕菌體用3 mL 5 mmol/L咪唑緩沖液重懸,菌體用高壓破碎儀進行破碎,4℃12 000 r/min離心30 min 收集上清液。將上清液加入預(yù)先用5 mmol/L咪唑緩沖液平衡的Ni-NTA 層析柱內(nèi),分別用100(20% buffer B)mmol/L、150(30%buffer B)mmol/L咪唑緩沖液洗脫,并收集洗脫液,SDS-PAGE 電泳檢測目的蛋白分離純化效果,透析至1×PBS溶液,使用BCA 蛋白濃度測定試劑盒測定蛋白濃度。

        1.2.4 CCK8法檢測二價納米抗體E3-AA6蛋白對毒素TcdB的抑制實驗 在細胞變圓實驗中,用不同濃度梯度TcdB處理Vero細胞,并且在顯微鏡下觀察細胞的形態(tài)變化。分別統(tǒng)計細胞變圓率,通過觀察統(tǒng)計得出,當毒素TcdB濃度為0.0125 ng/mL時,24 h變圓率約為70% 左右,選定此濃度為對照實驗施加毒素濃度。將對數(shù)生長期Vero細胞,用含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基配制1×105/mL細胞懸液,按每孔個細胞約1×104個(100 μL)加入到96 孔細胞培養(yǎng)板中,過夜培養(yǎng)后,進行毒素中和實驗。分別設(shè)置3個實驗組:空白組、對照組、實驗組??瞻捉M施加完全培養(yǎng)基,對照組施加完全培養(yǎng)基和0.0125ng/mL TcdB,實驗組為Vero細胞同時施加加0.0125 ng/mL TcdB和12.5、25、50 μg/mL的重組納米抗體蛋白,每個濃度設(shè)置3次平行實驗。培養(yǎng)2 h,6 h,12 h,18 h和24 h后每孔加入10 μL CCK8 檢測液,37℃孵育2 h后,酶標儀在450 nm檢測其吸光度值。

        1.2.5 統(tǒng)計學(xué)處理 采用 Origin 9.1.軟件及SPSS 22.0軟件進行數(shù)據(jù)分析,數(shù)據(jù)以x-±s表示。

        2 結(jié)果

        2.1 重組乳酸乳球菌蛋白表達與鑒定

        根據(jù)重組乳酸乳球菌的生長曲線確定菌液 OD600為 0.4-0.5時,加入nisin,終濃度為1 ng/ mL。將12h誘導(dǎo)培養(yǎng)的重組乳酸乳球菌,超聲破碎處理后進行SDS-PAGE(圖1-A)可見經(jīng)誘導(dǎo)的重組菌在32 kD處有與預(yù)期大小一致的條帶,未誘導(dǎo)的重組乳酸乳球菌未見相應(yīng)條帶,說明經(jīng)誘導(dǎo)的目的蛋白在重組乳酸乳球菌中獲得表達。

        Western-blot、Anti-His-tag抗體檢測結(jié)果(圖2)顯示,誘導(dǎo)的重組乳酸乳球菌在32 kD處有特異性條帶,表明目的蛋白在重組乳酸乳球菌中獲得表達,通過鎳柱親和層析純化目的蛋白,SDS-PAGE檢測(圖1-B),BCAProtein Quantification Kit測定其蛋白濃度為 720 μg /mL。

        圖1 表達產(chǎn)物的 SDS-PAGE分析

        2.2 二價納米抗體E3-AA6蛋白對毒素TcdB的抑制

        CCK8法實驗結(jié)果(圖3)表明二價納米抗體E3-AA6對TcdB有抑制作用,并且TcdB的抑制作用與納米抗體的濃度呈現(xiàn)一定的正相關(guān),根據(jù)公式:抑制率(%)={1-[OD(實驗組)-OD(空白)]/[OD(對照組)-OD(空白)]}×100,計算得出當二價納米抗體E3-AA6濃度為50 μg /mL時,對TcdB的抑制率在24 h時為39%。

        圖2 表達產(chǎn)物的Western-blotting分析

        圖3 納米抗體E3-AA6對毒素TcdB的抑制效應(yīng)

        3 討論

        艱難梭菌廣泛存在于自然環(huán)境及動物糞便中,是人體腸道中的正常菌群。由于廣泛應(yīng)用廣譜抗生素、免疫抑制劑或化療藥物等藥物,人體腸道微生物菌群平衡被擾亂,艱難梭菌大量繁殖,引發(fā)艱難梭菌感染,導(dǎo)致嚴重腹瀉和腸道炎癥甚至死亡。

        目前針對艱難梭菌感染,常見的CDI治療是抗生素治療[11],甲硝唑用于CDI輕中度患者,萬古霉素用于CDI重度患者,菲達霉素是一種大環(huán)內(nèi)酯類抗菌藥物,對艱難梭菌有殺菌活性,但是對其他革蘭氏陽性菌作用有限,一般用于治療復(fù)發(fā)患者[12]。但近年高毒素菌株出現(xiàn),藥物的敏感性降低,甲硝唑和萬古霉素可進一步破壞腸道微生態(tài)平衡,艱難梭菌感染復(fù)發(fā)率很高,且治愈后復(fù)發(fā)率高達25%-60%[13]。因此抗生素藥物需要向窄譜,不可吸收,可重復(fù)給藥,安全性高等方向發(fā)展[14]。另一種新型CDI治療方式是糞菌移植法,其原理是將健康供體的糞便經(jīng)過過濾后注入到患者的結(jié)腸中,達到重新恢復(fù)正常結(jié)腸菌群的目的[15-16]。

        圖4 不同濃度E3-AA6對毒素TcdB 的抑制作用

        納米抗體因其分子量小、高特異性等特性,在治療艱難梭菌感染方面有著天然優(yōu)勢[17]。本實驗室獲得了從駝羊血清中分離的抗艱難梭菌毒素的基因E3和AA6,蛋白分子量分別為15 kD左右,通過Linker連接,設(shè)計成雙特異性納米抗體,通過乳酸乳球菌表達系統(tǒng),獲得了32 kD的純化蛋白。在細胞毒素實驗中,施加0.0125 ng/mL TcdB,Vero細胞24 h的變圓率為70%,施加50 μg/mL二價納米抗體E3-AA6,細胞變圓率明顯降低,通過CCK8試劑盒測定細胞活性,抑制率達到39%。證明二價納米抗體E3-AA6對艱難梭菌TcdB有一定的中和作用。結(jié)合乳酸乳球菌可通過胃進入到腸道,直接作用于艱難梭菌,為今后的體內(nèi)實驗提供實驗依據(jù)。

        4 結(jié)論

        本研究成功構(gòu)建了抗艱難梭菌毒素的重組表達載體pNZ8148- E3-AA6,通過NICE系統(tǒng)實現(xiàn)了二價納米抗體E3-AA6穩(wěn)定表達;在對Vero細胞變圓實驗及CCK8實驗中,E3-AA6能夠有效的中和艱難梭菌毒素TcdB。

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