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        LAMP技術(shù)在涂陰肺結(jié)核中的臨床快速診斷價(jià)值

        2018-11-01 09:27:34陳伊黃文焰
        實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志 2018年19期
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)

        陳伊 黃文焰

        深圳市寶安區(qū)慢性病防治院(廣東深圳 518102)

        結(jié)核病是結(jié)核分枝桿菌感染引起的一種慢性傳染病,目前我國(guó)結(jié)核病的患病率形勢(shì)不容樂觀并呈現(xiàn)地區(qū)不平衡性[1]。涂陰肺結(jié)核由于痰涂片陰性,在現(xiàn)有的基層診療機(jī)構(gòu)的常規(guī)結(jié)核診斷技術(shù)下,容易造成誤診漏診的情況發(fā)生,延誤患者的治療,因此如何更加準(zhǔn)確、快速、簡(jiǎn)便地診斷涂陰肺結(jié)核對(duì)于結(jié)核病的防治工作具有重要意義。

        環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop?mediated isothermal amplification,LAMP)是由 NOTOMI[2]等在 2010 年創(chuàng)建,是一種新型核酸檢測(cè)技術(shù),該技術(shù)最大的特點(diǎn)是不需要像傳統(tǒng)的PCR技術(shù)一樣變溫?cái)U(kuò)增,只需在恒溫條件(60~65℃)下就可完成反應(yīng),并且結(jié)果可以目測(cè)判斷?,F(xiàn)今LAMP技術(shù)在結(jié)核病的診斷應(yīng)用方面也已有相關(guān)研究[3-9]并顯示出良好的臨床效能。2016年世界衛(wèi)生組織推薦該技術(shù)用于有肺結(jié)核臨床癥狀和體征的成人[10]。

        GeneXpert MTB/RIF檢測(cè)系統(tǒng)是一種以半巢式實(shí)時(shí)定量PCR為技術(shù)基礎(chǔ)的全自動(dòng)結(jié)核分枝桿菌檢測(cè)系統(tǒng),能同時(shí)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌及利福平耐藥并在2 h內(nèi)完成,具有快速,準(zhǔn)確,操作簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn)。世界衛(wèi)生組織已批準(zhǔn)GeneXpert MTB/RIF用于結(jié)核分枝桿菌及多重耐藥結(jié)核分枝桿菌的快速診斷。國(guó)內(nèi)外也已有應(yīng)用GeneXpert MTB/RIF檢測(cè)系統(tǒng)的臨床研究[11-13]。

        本研究通過(guò)應(yīng)用LAMP法對(duì)臨床確診為肺結(jié)核的患者和非結(jié)核患者進(jìn)行結(jié)核分枝桿菌的檢測(cè),并同時(shí)與痰涂片法進(jìn)行對(duì)比分析,來(lái)評(píng)估其在肺結(jié)核尤其是涂陰肺結(jié)核中的診斷價(jià)值。傳統(tǒng)結(jié)核分枝桿菌PCR檢測(cè)技術(shù)作為一種快速檢測(cè)技術(shù),需要PCR實(shí)驗(yàn)室,考慮到現(xiàn)有基層結(jié)核診療機(jī)構(gòu)的設(shè)施現(xiàn)狀,以及目前同樣作為快速診斷技術(shù)的GeneXpert MTB/RIF全自動(dòng)檢測(cè)系統(tǒng)不需要如此嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及人員素質(zhì)要求的優(yōu)勢(shì),本研究采用GeneXpert MTB/RIF全自動(dòng)檢測(cè)系統(tǒng),來(lái)對(duì)比分析LAMP技術(shù),以此評(píng)估LAMP技術(shù)在涂陰肺結(jié)核快速診斷方面的臨床價(jià)值及優(yōu)點(diǎn)。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 選擇2016~2017年本院臨床診斷為肺結(jié)核的患者170例,非結(jié)核患者100例,本次入選研究對(duì)象在16~61歲之間。

        1.2 儀器與試劑 lamp法檢測(cè)試劑盒由廣州迪澳生物科技有限公司提供;GeneXpert MTB/RIF檢測(cè)試劑盒由美國(guó)Cepheid公司提供;儀器:恒溫?cái)U(kuò)增儀由廣州迪澳生物科技有限公司提供;Gene Xpert儀器由美國(guó)Cepheid公司提供。

        1.3 質(zhì)控菌株 結(jié)核分枝桿菌H37Rv來(lái)自深圳市慢性病防治中心,大腸埃希菌由本院提供。

        1.4 方法 對(duì)入選的所有痰標(biāo)本進(jìn)行l(wèi)amp法、痰涂片抗酸染色法以及GeneXpert MTB/RIF檢測(cè)。

        1.4.1 LAMP技術(shù) 按照產(chǎn)品說(shuō)明書操作。每批次樣本檢測(cè)的同時(shí)行陰陽(yáng)性對(duì)照及質(zhì)控。

        1.4.1.1 樣本處理 將痰樣本中加入等體積的4%NaOH溶液,渦旋振蕩混勻,室溫靜置15 min,吸取1 mL加入離心管中,12 000 r/min(離心半徑25 mm)離心5 min,去上清,加入1 m L 0.9%NaCL混勻,12 000 r/min(離心半徑25 mm)離心5 min,去上清,加入100 μL DNA提取液混勻,100℃加熱10 min后迅速冷卻,12 000 r/min(離心半徑25 mm)離心2 min,取2 μL上清液用于核酸擴(kuò)增。

        1.4.1.2 加樣擴(kuò)增 在含22 μL反應(yīng)液及1 μL Bst聚合酶的PCR反應(yīng)管中加入20 μL密封液并將2 μL模板加入密封液面以下,10 000 r/min(離心半徑25 mm)離心5 s,放入恒溫?cái)U(kuò)增儀中,63℃擴(kuò)增45 min。

        1.4.1.3 結(jié)果判定 擴(kuò)增曲線呈“S”型曲線,判斷為陽(yáng)性,含有結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群;擴(kuò)增曲線呈一條直線或傾斜直線,判斷為陰性,不含有結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群或低于檢測(cè)限(1×102/mL)。

        1.4.2 GeneXpert MTB/RIF 操作及判讀嚴(yán)格按說(shuō)明書進(jìn)行檢測(cè)。根據(jù)痰液標(biāo)本的性狀,加入合適體積的標(biāo)本處理液,一般為痰液體積的兩倍,搖動(dòng)數(shù)次,并靜置10~15 min,待痰液全部溶解,吸取2 mL全部溶解的痰液至GeneXpert MTB/RIF反應(yīng)試劑盒,注意不要產(chǎn)生氣泡,將反應(yīng)盒放入Gene Xpert儀器檢測(cè),不可將反應(yīng)盒顛倒搖晃。

        1.4.3 痰涂片抗酸染色法 按照《中國(guó)結(jié)核病防治規(guī)劃痰涂片鏡檢標(biāo)準(zhǔn)化操作及質(zhì)量保證手冊(cè)》操作。

        1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS 19.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,對(duì)計(jì)量資料采用百分比和描述,方法間配對(duì)計(jì)數(shù)資料的比較采用McNemar檢驗(yàn)和Kappa一致性檢驗(yàn)。率的比較采用χ2檢驗(yàn)。χ2檢驗(yàn)及McNemar檢驗(yàn)以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 LAMP技術(shù)與痰涂片抗酸染色比較 在170例肺結(jié)核患者組中,LAMP法檢出83例陽(yáng)性,陽(yáng)性率為48.8%,痰涂片抗酸染色檢出60例陽(yáng)性,陽(yáng)性率35.2%。兩種方法一致性分析,兩者一致性一般(κ=0.680)。McNemar檢驗(yàn)分析顯示,兩方法差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。在肺結(jié)核患者組LAMP法敏感性高于痰涂片抗酸染色法,陽(yáng)性率約13%的差異。見表1。LAMP法恒溫?cái)U(kuò)增曲線圖見圖1。

        圖1 LAMP法恒溫?cái)U(kuò)增曲線圖Fig.1 Graph of isothermal amplification curve using LAMP

        表1 三種檢測(cè)方法的比較Tab.1 Comparison of three detection methods

        2.2 LAMP法在涂陰肺結(jié)核、涂陽(yáng)肺結(jié)核及非結(jié)核患者中的比較 根據(jù)痰涂片抗酸染色的結(jié)果,將肺結(jié)核患者組分為涂陰及涂陽(yáng)肺結(jié)核兩組進(jìn)行分析。LAMP法在肺結(jié)核組與非結(jié)核組的陽(yáng)性檢出率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=60.908,P<0.05)。110例涂陰肺結(jié)核患者中,LAMP檢出陽(yáng)性26例;60例涂陽(yáng)肺結(jié)核患者中,LAMP檢出陽(yáng)性57例;100例非結(jié)核患者中,LAMP檢出陽(yáng)性3例。LAMP法在涂陰肺結(jié)核患者、涂陽(yáng)肺結(jié)核患者及非結(jié)核患者中的陽(yáng)性率分別為23.6%(26/110)、95.0%(57/60)、3.0%(3/100)。將涂陰肺結(jié)核與涂陽(yáng)肺結(jié)核組的陽(yáng)性檢出率比較,兩組的陽(yáng)性檢出率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=79.132,P<0.05)。涂陰肺結(jié)核組與非結(jié)核組的陽(yáng)性檢出率比較,兩組的陽(yáng)性檢出率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=18.741,P<0.05)。涂陽(yáng)肺結(jié)核組與非結(jié)核患者組的陽(yáng)性檢出率比較,兩組的陽(yáng)性檢出率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=135.4,P<0.05)。LAMP技術(shù)在涂陽(yáng)肺結(jié)核患者組的陽(yáng)性率最高。見表2。

        2.3 GeneXpert MTB/RIF技術(shù)分析 GeneXpertMTB/RIF在肺結(jié)核患者組中檢出陽(yáng)性89例,其陽(yáng)性率為52.4%(89/170),其在肺結(jié)核組與非結(jié)核組的陽(yáng)性檢出率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=78.096,P< 0.05)。

        表2 LAMP法和GeneXpert MTB/RIF檢測(cè)結(jié)果比較Tab.2 Comparison of LAMP and GeneXpert MTB/RIF Test Results

        2.4 LAMP法與GeneXpert MTB/RIF技術(shù)比較兩方法在肺結(jié)核患者組的陽(yáng)性率分別為48.8及52.4%,見表1。兩種方法一致性分析,兩者一致性最佳(κ=0.906)。McNemar檢驗(yàn)分析顯示,兩方法陽(yáng)性率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。在110例涂陰肺結(jié)核患者組中,以Xpert MTB/RIF技術(shù)為標(biāo)準(zhǔn),LAMP法的敏感度為82.8%(24/29)、特異度為97.5%(79/81),總體一致率93.6%(103/110)。兩種方法一致性分析,兩者一致性最佳(κ=0.879)。McNemar檢驗(yàn)分析顯示,兩方法陽(yáng)性率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見表2。

        3 討論

        目前由于多重耐藥結(jié)核的增加以及HIV合并感染的出現(xiàn)等一系列的原因,結(jié)核病已成為全球性的公共衛(wèi)生難題,在我國(guó)結(jié)核病的就診人群以肺結(jié)核患者居多[1]。疑似肺結(jié)核的患者如若抗酸染色痰涂片檢測(cè)陰性,在基層診療機(jī)構(gòu)中,臨床往往需要結(jié)合痰培養(yǎng)結(jié)果以及診斷性治療的情況等才能判斷是否為結(jié)核病,但作為金標(biāo)準(zhǔn)的羅氏培養(yǎng)法通常需要4~8周的時(shí)間,耗時(shí)長(zhǎng),敏感度較低,這無(wú)疑會(huì)增加人群感染的風(fēng)險(xiǎn)以及延誤患者的治療,因此簡(jiǎn)單快速,高效價(jià)廉的結(jié)核檢測(cè)技術(shù)對(duì)于涂陰肺結(jié)核的診斷具有重要意義。

        抗酸染色痰涂片法陽(yáng)性檢出率受痰標(biāo)本質(zhì)量,取樣時(shí)間以及排菌量等的影響較大,靈敏度較低。LAMP技術(shù)通過(guò)高效DNA聚合酶識(shí)別目標(biāo)基因,在恒溫狀態(tài)擴(kuò)增45 min即可完成反應(yīng),全過(guò)程只需2 h完成,在時(shí)間和設(shè)備上充分滿足了臨床檢測(cè)需要,特別是對(duì)于基層診療機(jī)構(gòu)而言,具有巨大優(yōu)勢(shì)。本研究結(jié)果顯示LAMP法與痰涂片抗酸染色法相比,LAMP法在肺結(jié)核組中的陽(yáng)性檢出率高,高出約13%。有研究[6]顯示,LAMP法在診斷結(jié)核病方面表現(xiàn)優(yōu)于常規(guī)涂片鏡檢,這與本研究一致。LAMP法在涂陽(yáng)肺結(jié)核患者組的陽(yáng)性率為95.0%,與涂陰肺結(jié)核患者中的陽(yáng)性檢出率為23.6%相比,LAMP法在涂陽(yáng)肺結(jié)核患者組的敏感性更高。國(guó)外研究顯示,LAMP法在涂陽(yáng)肺結(jié)核的陽(yáng)性率為92.0%,在涂陰肺結(jié)核的檢測(cè)中,涂陰比涂陽(yáng)的陽(yáng)性率低,這與本研究結(jié)果相近[9]。LAMP法在涂陽(yáng)涂陰肺結(jié)核患者組的陽(yáng)性率差別,可能是由于患者痰標(biāo)本中結(jié)核分枝桿菌的量不同造成??顾崛旧低科ú荒軈^(qū)分結(jié)核分枝桿菌及非結(jié)核分枝桿菌,調(diào)查顯示,非結(jié)核分枝桿菌感染在疑似結(jié)核的就診人群占有一定的比例[14],應(yīng)用LAMP法技術(shù)可以在2 h內(nèi)區(qū)分出痰標(biāo)本中是結(jié)核分枝桿菌還是非結(jié)核分枝桿菌,減少了醫(yī)療差錯(cuò)的發(fā)生,這有利于臨床作出正確的診斷及制定治療方案。本次研究中痰涂片抗酸染色陽(yáng)性而LAMP法檢測(cè)陰性的樣本有可能是由非結(jié)核分枝桿菌感染所致。對(duì)于臨床常規(guī)開展的結(jié)核病檢驗(yàn)項(xiàng)目抗酸染色痰涂片法而言,其需要具有專業(yè)經(jīng)驗(yàn)的人員進(jìn)行鏡檢,效率低,而LAMP法操作簡(jiǎn)單,易于批量操作,便于準(zhǔn)確而及時(shí)的出具檢驗(yàn)結(jié)果。

        GeneXpert MTB/RIF是近年來(lái)世界衛(wèi)生組織批準(zhǔn)推薦的結(jié)核分枝桿菌快速檢測(cè)技術(shù),其不但可以快速檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌而且可以檢測(cè)利福平耐藥,本研究將LAMP技術(shù)與GeneXpert MTB/RIF這一種近年來(lái)應(yīng)用的結(jié)核分枝桿菌快速檢測(cè)技進(jìn)行比較,以此評(píng)估LAMP技術(shù)的效能。有研究顯示GeneXpert MTB/RIF在涂陽(yáng)結(jié)核患者中的診斷性高于涂陰結(jié)核患者,其在涂陰肺結(jié)核的診斷上也有很好的臨床價(jià)值[15-16],這與本研究結(jié)果一致。LAMP技術(shù)和GeneXpert MTB/RIF技術(shù)檢測(cè)涂陰肺結(jié)核患者組的陽(yáng)性檢出率分別為23.6%和26.4%,兩者的陽(yáng)性檢出率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,一致性分析最佳,這表明兩種方法在涂陰肺結(jié)核中的診斷效能一致。REDDY等[7]研究數(shù)據(jù)顯示LAMP技術(shù)比GeneXpert MTB/RIF的敏感性高,本研究結(jié)果顯示,LAMP技術(shù)在肺結(jié)核組的檢出率與GeneXpert MTB/RIF無(wú)差異,這可能是人群差異造成。有研究表明痰標(biāo)本質(zhì)量對(duì)GeneXpert MTB/RIF具有影響[17],因此痰標(biāo)本質(zhì)量也可能引起上述結(jié)果。

        LAMP技術(shù)優(yōu)點(diǎn)與局限性:LAMP技術(shù)操作簡(jiǎn)單、不需要系統(tǒng)專業(yè)的培訓(xùn)、用時(shí)少、生物安全性高,與GeneXpert MTB/RIF相比檢測(cè)費(fèi)用較低,設(shè)備環(huán)境要求較低,但其不能區(qū)分死菌和活菌,且不能像GeneXpert MTB/RIF一樣在檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌的同時(shí)檢測(cè)耐藥,這在一定程度上影響了其臨床應(yīng)用。

        綜上所述,LAMP技術(shù)在涂陰肺結(jié)核痰標(biāo)本快速檢測(cè)方面具有良好的診斷效能,具有較好的臨床應(yīng)用價(jià)值和應(yīng)用前景。

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