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        核盤菌分枝酸變位酶同源效應(yīng) 蛋白啟動(dòng)子的克隆及功能分析

        2018-11-01 08:24:18盛寅生任愛芝趙培寶
        華北農(nóng)學(xué)報(bào) 2018年5期
        關(guān)鍵詞:盤菌變位水楊酸

        常 雪,盛寅生,任愛芝,趙培寶

        (1.聊城大學(xué) 植物保護(hù)系,山東 聊城 252000;2.聊城市林業(yè)局,山東 聊城 252000)

        核盤菌(Sclerotiniasclerotiorum(Lib.) de Bary)屬于子囊菌(Ascomycetes),核盤菌科(Sclerotiniaceae),核盤菌屬(Sclerotinia)[1],是一種寄主范圍廣泛的植物病原真菌,能侵染油菜、向日葵、豆科、葫蘆科、茄科蔬菜等400多種植物,引起菌核病[2]。菌核在核盤菌整個(gè)生活史中發(fā)揮了至關(guān)重要的作用,一般情況下,菌核會(huì)在被侵染的組織內(nèi)部產(chǎn)生,多數(shù)會(huì)在莖的髓部,當(dāng)然在高濕情況下也可能在發(fā)病組織表面產(chǎn)生[3]。核盤菌對(duì)寄主的破壞性較大,在其致病過程中草酸和細(xì)胞壁降解酶發(fā)揮著重要作用[4-6],而且核盤菌能夠產(chǎn)生活性氧并利用寄主過敏性壞死反應(yīng)來克服寄主防御、促進(jìn)自身侵染[7-9]。隨著核盤菌全基因組序列的公布,核盤菌致病機(jī)制的研究開啟了新篇章,除了傳統(tǒng)的細(xì)胞壁降解酶、草酸等致病因子,人們也開始關(guān)注一些分泌性效應(yīng)蛋白在核盤菌與植物互作過程中的作用。例如Guyon等[10]通過分泌組分析找到了78個(gè)潛在的效應(yīng)蛋白候選對(duì)象,并對(duì)其中的16個(gè)分泌蛋白在不同植物中表達(dá)模式進(jìn)行了分析;Lyu等[11]證明了一小分子效應(yīng)蛋白SsSSVP1能夠通過影響植物能量代謝,從而有利于自身侵染;Zhu等[12]研究了一分泌效應(yīng)蛋白SSITL能于侵染早期階段,在抑制茉莉酸介導(dǎo)的抗病過程中發(fā)揮作用。前期研究明確了分支酸變位酶同源效應(yīng)蛋白能夠提高核盤菌致病性。為了進(jìn)一步探究其作用機(jī)制,對(duì)啟動(dòng)子進(jìn)行了克隆分析,旨在為進(jìn)一步研究其表達(dá)調(diào)控奠定基礎(chǔ)。

        1 材料和方法

        1.1 供試材料

        核盤菌(Sclerotinia.sclerotiorum)來自德克薩斯農(nóng)工大學(xué) Prof.Dickman,M.B,GFP來自質(zhì)粒pBluntNAT-GFP1-1;潮霉素抗性基因hph來自質(zhì)粒 PUC-ATPH,引物:XS1-1:5′-GCAAGGAGGATCCTAATAG AATC-3′,XS1-2:5′-TCCCCCCGGGGTTGGGTGATTG AAG-3′;hph1:5′-ATGAAAAAGCCTGAACTC-3′,hph2:5′-CTATTCCTTTGCCCTCGG-3′,由上海生工合成,其他試劑為國(guó)產(chǎn)分析純。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 生物信息學(xué)分析效應(yīng)蛋白基因的上游序列 通過啟動(dòng)子在線軟件Promoter 2.0和Promoter scan等對(duì)上游序列進(jìn)行分析,以尋找基因的順式元件及啟動(dòng)子。

        1.2.2 效應(yīng)蛋白啟動(dòng)子的PCR擴(kuò)增 CTAB法提取核盤菌DNA,采用所設(shè)計(jì)的引物XS1-1和XS1-2經(jīng)PCR來擴(kuò)增基因上游的啟動(dòng)子序列。

        1.2.3 啟動(dòng)子的功能驗(yàn)證 GFP融合載體的構(gòu)建:以pBluntNAT-GFP為基礎(chǔ),插入真菌篩選標(biāo)記潮霉素抗性基因,再將經(jīng)PCR克隆得到的啟動(dòng)子(N-Pro)片段連入載體中,構(gòu)建得到啟動(dòng)子+GFP融合載體,具體操作步驟如圖1所示:

        轉(zhuǎn)化核盤菌:通過REMI介導(dǎo)的真菌轉(zhuǎn)化技術(shù)轉(zhuǎn)化核盤菌原生質(zhì)體,潮霉素篩選轉(zhuǎn)化子[13]。

        圖1 載體構(gòu)建流程Fig.1 Construction of the vector

        轉(zhuǎn)化子中GFP熒光檢測(cè):采用熒光顯微鏡檢測(cè)獲得的轉(zhuǎn)化子菌絲GFP熒光表達(dá)狀態(tài),來驗(yàn)證啟動(dòng)子功能。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 啟動(dòng)子預(yù)測(cè)結(jié)果

        經(jīng)過對(duì)基因上游大約2 000 bp的片段進(jìn)行啟動(dòng)子在線預(yù)測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn),該基因上游區(qū)域-495--745 bp具有啟動(dòng)子序列特征,-536 bp處有一個(gè)TATAbox結(jié)構(gòu),-70--78 bp處含有CAAT box,這些是真菌啟動(dòng)子所具備的啟動(dòng)元件,因此,推測(cè)其上游區(qū)域具有啟動(dòng)子功能,預(yù)測(cè)結(jié)果如表1所示。

        表1 啟動(dòng)子預(yù)測(cè)結(jié)果Tab.1 The result of the promoter prediction

        2.2 啟動(dòng)子的克隆與融合載體的構(gòu)建

        2.2.1 啟動(dòng)子的PCR擴(kuò)增 采用CTAB法提取核盤菌DNA,利用引物XS1-1和XS1-2進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得長(zhǎng)度為733 bp的DNA序列(圖2)。

        1.啟動(dòng)子的DNA片段;M. DNA Marker DL2000。 1.The DNA of promoter;M.DNA Marker DL2000.

        經(jīng)測(cè)序表明,本試驗(yàn)得到分枝酸變位酶基因的上游序列,包含預(yù)測(cè)的啟動(dòng)子元件,序列如圖3所示。

        2.2.2 GFP融合載體的構(gòu)建 以pBluntNAT-GFP為基礎(chǔ),插入真菌篩選標(biāo)記潮霉素抗性基因,再將經(jīng)PCR克隆得到的啟動(dòng)子(N-Pro)片段連入載體中,取代GFP自身所攜帶的啟動(dòng)子,構(gòu)建得到啟動(dòng)子(N-Pro)+GFP融合載體。

        2.3 轉(zhuǎn)化子的篩選與驗(yàn)證

        將上述載體經(jīng)REMI介導(dǎo)的技術(shù)轉(zhuǎn)化核盤菌原生質(zhì)體,得到了能在含有潮霉素的PDA培養(yǎng)基上生長(zhǎng)的轉(zhuǎn)化子。提取轉(zhuǎn)化子DNA,以hph1-hph2為引物經(jīng)PCR驗(yàn)證,擴(kuò)增到了預(yù)期條帶(圖4),表明載體已整合到轉(zhuǎn)化子基因組中。

        圖3 啟動(dòng)子DNA序列Fig.3 The DNA sequence of the promoter

        1.對(duì)照;2-3.轉(zhuǎn)化子;M.DNA Marker DL2000。 1.CK;2-3.Transformations;M.DNA Marker DL2000.

        2.4 啟動(dòng)子+GFP的轉(zhuǎn)化子熒光表達(dá)分析

        采用熒光顯微鏡分別對(duì)轉(zhuǎn)化子的菌絲和接種到煙草葉片的菌絲進(jìn)行熒光檢測(cè),菌絲中均檢測(cè)到了GFP熒光信號(hào)(圖5),表明GFP能夠正常表達(dá)。本結(jié)果表明,克隆到的啟動(dòng)子序列能夠啟動(dòng)熒光蛋白表達(dá),具有啟動(dòng)子功能。

        3 結(jié)論與討論

        綜上所述,本試驗(yàn)擴(kuò)增到的分枝酸變位酶同源基因的上游733 bp的DNA序列能夠啟動(dòng)GFP表達(dá),具有啟動(dòng)子功能。該啟動(dòng)子的克隆為進(jìn)一步研究該效應(yīng)蛋白的功能奠定了基礎(chǔ)。

        A.菌絲內(nèi)GFP熒光;B.煙草葉片中菌絲的GFP熒光;C.亮視野下的葉片。 A.The GFP fluorescence of the hyphae;B. The GFP fluorescence of the hyphae in the leaf of tobacco; C.The result in bright field of vision.

        莽草酸途徑 (Shikimate pathway)是微生物和植物的基本代謝途徑,其終產(chǎn)物是分支酸 (Cho-rismate)[14]。分支酸是生物中許多化合物的前體,包括芳香族氨基酸 (如苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸)、水楊酸 (SA)、IAA及其他次生代謝物[15]。

        分支酸變位酶 (Chorismate mutase,CM)催化分支酸轉(zhuǎn)化成預(yù)苯酸,為苯丙氨酸與酪氨酸的合成提供前體,從而改變分枝酸進(jìn)一步轉(zhuǎn)化路徑,影響體內(nèi)水楊酸的水平及其植物抗性水平[16]。對(duì)于寄生性的病原微生物來講,其所需要的苯丙氨酸和絡(luò)氨酸可以從寄主獲得,分枝酸變位酶對(duì)于自身氨基酸代謝可能并不是必需的。但通過NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中Blast發(fā)現(xiàn),該類基因在部分真菌如黑粉菌(Ustilagomaydis)、核盤菌(Sclerotiniasclerotiorum)等的部分病原微生物體內(nèi)存在,推測(cè)可能在植物病原菌與植物的聯(lián)系中發(fā)揮作用。研究也證明,在專性寄生的黑粉菌中分枝酸變位酶基因Cmu1與其致病性密切相關(guān),侵染后水楊酸水平顯著下降[16]。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),在死體營(yíng)養(yǎng)的病原物中僅核盤菌具有分枝酸變位酶同源基因,前期研究表明,該基因與致病性相關(guān),但對(duì)其如何發(fā)揮作用還不清楚。核盤菌與灰葡萄孢(BotrytiscinereaPers.)致病機(jī)制類似,屬于一種死體營(yíng)養(yǎng)的病原真菌[17],通常認(rèn)為,植物對(duì)死體營(yíng)養(yǎng)病原物的抗性過程中水楊酸通路并不發(fā)揮主要作用[18]。水楊酸途徑可能是核盤菌侵染的操縱目標(biāo),一系列結(jié)果表明了水楊酸途徑也參與了植物與死體營(yíng)養(yǎng)真菌的互作[19]。通過擬南芥各類激素突變體的抗性分析發(fā)現(xiàn),核盤菌誘導(dǎo)抗性信號(hào)主要由茉莉酸和脫落酸誘導(dǎo),但不依賴水楊酸信號(hào)途徑[20]。但是核盤菌接種12 h內(nèi)水楊酸途徑被激活,隨后在接種24 h后茉莉酸途徑被激活,這些結(jié)果證明了油菜抗核盤菌與相繼激活水楊酸途徑和茉莉酸途徑有關(guān)[21]。

        前期研究表明,核盤菌分枝酸變位酶同源基因與致病性密切相關(guān),對(duì)于其在致病過程中如何發(fā)揮作用值得進(jìn)一步探究。通過對(duì)其啟動(dòng)子進(jìn)行克隆,來進(jìn)一步探究該效應(yīng)蛋白的表達(dá)調(diào)控以及在與植物互作過程中的作用機(jī)制。下一步將通過酵母單雜交分離與該啟動(dòng)子作用的反式因子,進(jìn)一步研究其表達(dá)調(diào)控機(jī)理,為其作用機(jī)制研究提供幫助。

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