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        一種改進(jìn)的條件方差和醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn)*

        2018-10-18 06:43:52相艷桂鵬王碩許春榮邵黨國劉利軍湯守國
        生物醫(yī)學(xué)工程研究 2018年1期
        關(guān)鍵詞:方法

        相艷,桂鵬,王碩,許春榮,邵黨國,劉利軍,湯守國

        (昆明理工大學(xué) 信息工程與自動(dòng)化學(xué)院,昆明 650051)

        1 引 言

        圖像配準(zhǔn)是指通過某種空間變換,能使兩幅圖像的特征點(diǎn)或者對應(yīng)點(diǎn)在空間上達(dá)到一致。其中保持不動(dòng)的圖像稱為參考圖像,進(jìn)行空間變換的稱為浮動(dòng)圖像。圖像配準(zhǔn)一般由4個(gè)基本模塊組成,即幾何變換、圖像插值、相似性測度和函數(shù)優(yōu)化[1]。相似性測度衡量了參考圖像和浮動(dòng)圖像匹配的程度。用于圖像配準(zhǔn)的相似性測度有相關(guān)法、最小化灰度差法、灰度比的方差最小化法、劃分一致法、最小化聯(lián)合熵方法和互信息法等,其中歸一化互信息(normalized mutual information,NMI)被認(rèn)為是配準(zhǔn)精度和魯棒性較好的回溯式配準(zhǔn)方法之一[2]。但多模圖像配準(zhǔn)中NMI函數(shù)曲線容易出現(xiàn)局部極值,從而影響配準(zhǔn)的精度和魯棒性。交叉累計(jì)剩余熵(cross cumulative residual entropy,CCRE)使用累計(jì)剩余分布函數(shù)代替概率密度函數(shù),能得到更光滑的配準(zhǔn)目標(biāo)函數(shù)[3],近年來在多模圖像配準(zhǔn)中得到了很好的應(yīng)用。但CCRE 需要計(jì)算分布函數(shù),每次迭代時(shí)間較長,影響了配準(zhǔn)效率[4]。Pickering 等人首次提出使用條件方差和(the sum of conditional variance,SCV)進(jìn)行多模圖像配準(zhǔn),使用高斯牛頓法求解量化后圖像的SCV極小值,從而得到空間變換參數(shù)[5]。文獻(xiàn)[6]的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明這種新的相似性測度與互信息相比,準(zhǔn)確度和魯棒性都有改善。此后,SCV更多被用于視覺追蹤、視覺伺服[7-8]。

        SCV的主要缺點(diǎn)是它僅使用參考和浮動(dòng)圖像的量化信息計(jì)算聯(lián)合直方圖[7]。本研究認(rèn)為,在計(jì)算SCV的聯(lián)合直方圖時(shí),就應(yīng)該把浮動(dòng)圖像非網(wǎng)格點(diǎn)的插值方法結(jié)合進(jìn)去,從而克服SCV的這個(gè)限制。浮動(dòng)圖像非網(wǎng)格點(diǎn)的插值對NMI、CCRE、SCV這些相似性測度曲線的光滑程度都有不同程度的影響。傳統(tǒng)的插值方法有最近鄰插值、線性插值、PV插值,這些插值方法明顯缺陷是會(huì)產(chǎn)生插值偽影。插值偽影會(huì)產(chǎn)生局部極值,引起全局最優(yōu)值的移動(dòng),從而給函數(shù)尋優(yōu)帶來困難,影響配準(zhǔn)結(jié)果[9]。為了減少插值偽影,提高配準(zhǔn)效率,新的插值方法不斷涌現(xiàn)。其中一類方法是改變參與計(jì)算聯(lián)合概率密度的鄰域點(diǎn)范圍,并使用改進(jìn)的核函數(shù)來分配鄰域點(diǎn)的權(quán)重,針對該類方法,Rohde等人通過頻域分析指出,擴(kuò)大鄰域點(diǎn)范圍、采用高階的插值函數(shù)能從整體上降低局部極值的出現(xiàn)[10]。然而,隨著插值函數(shù)階次的增加,算法的復(fù)雜度也相應(yīng)增加。為此,本研究設(shè)計(jì)了一種新的插值函數(shù)來替代高階插值函數(shù),從而提高現(xiàn)有SCV算法的性能。

        實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,本研究方法在進(jìn)行多模圖像配準(zhǔn)時(shí),在保證準(zhǔn)確度的同時(shí),對空間變換較大和噪聲較強(qiáng)的情況具有較好的魯棒性,比NMI、CCRE和原SCV方法具有更高的配準(zhǔn)成功率。

        2 理論與方法2.1 SCV原理

        參考圖像和浮動(dòng)圖像的灰度值可以看作兩個(gè)隨機(jī)矩陣R、T(n×m)。令x=(x,y)為包含像素坐標(biāo)的向量,(x,y)∈{1,2,…,m}×{1,2,…,n},w(x,pa)是一個(gè)轉(zhuǎn)換函數(shù),其中空間變換參數(shù)pa將像素x從T(x)映射到R,x→w(x,pa)。參考圖像和浮動(dòng)圖像之間的條件方差和計(jì)算公式為[11]:

        (1)

        (2)

        ε(·)表示數(shù)學(xué)期望運(yùn)算。

        2.2 改進(jìn)的插值方法

        當(dāng)參數(shù)pa將像素x從T(x)映射到R時(shí),該像素經(jīng)過空間變換映射到參考圖像中時(shí)通常為非網(wǎng)格點(diǎn),而非網(wǎng)格點(diǎn)的空間插值方法會(huì)影響聯(lián)合直方圖的計(jì)算,從而影響SCV曲線的平滑程度,最終影響配準(zhǔn)結(jié)果。常用的PV插值法是根據(jù)權(quán)重分配原則,將每對像素對聯(lián)合直方圖的貢獻(xiàn)按權(quán)重分配給相鄰的四個(gè)像素對。PV插值的一個(gè)缺陷是當(dāng)插值點(diǎn)正好落在網(wǎng)格點(diǎn)處時(shí),則該網(wǎng)格點(diǎn)處權(quán)重為1,而其他相鄰的三個(gè)網(wǎng)格點(diǎn)權(quán)重為0,這會(huì)導(dǎo)致相似性測度容易在整數(shù)倍位移處出現(xiàn)局部極值。而改進(jìn)的PV插值方法通過擴(kuò)大鄰域點(diǎn)范圍,使用改進(jìn)的插值函數(shù)來分配鄰域點(diǎn)的權(quán)重。

        以2D圖像為例,設(shè)浮動(dòng)圖像上某點(diǎn)經(jīng)空間變換后與參考圖像的點(diǎn)q(非網(wǎng)格點(diǎn))對應(yīng),點(diǎn)q的鄰域點(diǎn)為qi(i=1,2,…,16),見圖1。p、q點(diǎn)對聯(lián)合直方圖貢獻(xiàn)的概率計(jì)算如下:

        h(T(p),R(q))+=ωi,i=1,2,…,16

        (3)

        其中ωi為每個(gè)領(lǐng)域點(diǎn)qi的權(quán)重。

        wi=f(dix)·f(diy)

        (4)

        上式中dix和diy為點(diǎn)qi(i=1,2,…,16)與q在x和y方向上的距離。

        圖1 改進(jìn)的插值方法2D示意圖

        文獻(xiàn)[12]指出,插值函數(shù)應(yīng)該滿足以下三個(gè)條件:

        (1)f(x)≥0;

        (3)f(x) 為單調(diào)遞減函數(shù)。

        本研究提出了一種滿足上述三個(gè)條件的插值函數(shù),具有如下形式:

        (5)

        如果令鄰域點(diǎn)與插值點(diǎn)達(dá)到最大距離時(shí)不分配權(quán)重,即x=2時(shí)f(x)=0,則c=2。此時(shí)式(5)可簡化為:

        (6)

        當(dāng)點(diǎn)q落在非網(wǎng)格點(diǎn)上時(shí),參與聯(lián)合直方圖統(tǒng)計(jì)的鄰域點(diǎn)數(shù)目有16個(gè);而當(dāng)點(diǎn)q落在網(wǎng)格點(diǎn)q6上時(shí),參與聯(lián)合直方圖統(tǒng)計(jì)的鄰域點(diǎn)數(shù)目是最少的,有9 個(gè)。能分配到權(quán)重的最多鄰域點(diǎn)數(shù)與最少鄰域點(diǎn)數(shù)的比例為16:9,比傳統(tǒng)PV插值法的比例4:1要小。該比例越小,說明聯(lián)合直方圖的概率分布越分散[12],從而SCV出現(xiàn)局部極值的幾率降低。

        在計(jì)算鄰域點(diǎn)權(quán)重時(shí),上式中的公倍數(shù)1/4對鄰域點(diǎn)的影響是相同的,因此可將其提出,公式(6)可以進(jìn)一步簡化為:

        (7)

        利用公式(7)計(jì)算插值函數(shù)的值,相當(dāng)于在利用公式(6)計(jì)算出鄰域點(diǎn)單個(gè)方向上的插值權(quán)重之后,再給每一個(gè)插值點(diǎn)權(quán)重都擴(kuò)大4倍。因?yàn)檫@種變換是統(tǒng)一的線性比例變換,因此,不會(huì)改變公式(6)的權(quán)重分配,還能提高算法的效率。

        2.3 本研究的相似性測度

        本研究設(shè)計(jì)的相似性測度計(jì)算步驟如下:

        (1) 對于尋優(yōu)過程中給出的空間變換參數(shù)pa,將像素x從T(x)映射到R。根據(jù)映射至R中的插值點(diǎn)位置計(jì)算該點(diǎn)與其16個(gè)鄰域點(diǎn)的距離,從而利用公式(7)計(jì)算出插值函數(shù)值,進(jìn)一步利用公式(4)計(jì)算出每個(gè)鄰域點(diǎn)的權(quán)重。

        (2) 根據(jù)公式(3)計(jì)算出每一個(gè)插值點(diǎn)貢獻(xiàn)給聯(lián)合直方圖的概率,從而得到參考圖像和浮動(dòng)圖像的聯(lián)合直方圖,用H(u,v)表示,其中u表示參考圖像的灰度,v表示浮動(dòng)圖像的灰度。u=1,2,…,dR;v=1,2,…dT,dR和dT是R和T的最大像素灰度級數(shù)目。

        (3) 將公式(2)中的數(shù)學(xué)期望進(jìn)一步展開為以下公式進(jìn)行計(jì)算:

        (8)

        (9)

        3 四種相似性測度曲線的比較

        以BrainWeb數(shù)據(jù)集[13]中正常腦部磁共振T1加權(quán)第50斷層圖像為參考圖像,見圖2(a),浮動(dòng)圖像為相應(yīng)斷層的PD加權(quán)像,見圖2(b)。此外,圖2(c)為根據(jù)公式(8)計(jì)算得到的浮動(dòng)圖像的期望值,圖2(d)為圖1(a)與(c)相減得到的圖像,計(jì)算圖2(d)中像素灰度的平方和,即得到(a)與(b)的SCV。

        將圖2(b)沿x軸及y軸平移-5~5像素,平移步長為0.1像素,計(jì)算其與圖2(a)的NMI、CCRE、SCV以及本研究的相似性測度,得到見圖3結(jié)果(SCV和本研究方法都取負(fù)值)。從圖3中可以看出,NMI、CCRE、SCV在網(wǎng)格點(diǎn)位置都有不同程度的波動(dòng),其中NMI的局部極值最為明顯,CCRE次之,SCV也有一定程度的波動(dòng),而本研究提出的方法最為平滑。NMI的抖動(dòng)最為嚴(yán)重,極易使尋優(yōu)陷入局部極值中,導(dǎo)致配準(zhǔn)失敗。本研究方法相比其他三種相似性測度,能保證優(yōu)化算法順利找到全局最值(最大或最小),從而成功配準(zhǔn)。

        圖2 實(shí)驗(yàn)所用的醫(yī)學(xué)圖像

        4 多模圖像配準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)

        本研究分別針對多模圖像配準(zhǔn)中,空間變換范圍不同或噪聲強(qiáng)度不同時(shí),四種相似性測度的表現(xiàn)進(jìn)行測試,實(shí)驗(yàn)一針對的是空間變換范圍不同的情況,參考圖像為BrainWeb數(shù)據(jù)集中正常腦部磁共振T1加權(quán)第90斷層圖像,浮動(dòng)圖像為相應(yīng)斷層的T2加權(quán)像并做一定的剛體變換,設(shè)tx、ty分別為浮動(dòng)圖像沿x和y軸的平移,θ為繞圖像中心點(diǎn)的順時(shí)針旋轉(zhuǎn)角度。在一定取值范圍內(nèi)隨機(jī)選取三個(gè)參數(shù)的值,每一組測試中隨機(jī)選取20個(gè)不同的剛體變換T=[tx,ty,θ]進(jìn)行測試,其中第一組測試中tx、ty的絕對值范圍為1~2,θ的絕對值范圍為0~1;第二組中tx、ty的絕對值范圍為14~15,θ的絕對值范圍為2~3;第三組中tx、ty的絕對值范圍加大至19~20,θ的絕對值范圍為3~4,使用步長為5的Powell算法對NMI、CCRE、SCV和本研究方法相似性測度進(jìn)行尋優(yōu),得到不同的配準(zhǔn)參數(shù)T′=[tx′,ty′,θ′],并與真實(shí)的參數(shù)T比較,求取與T的誤差△T=[△tx,△ty,△θ]。如果尋優(yōu)陷入局部極值,則配準(zhǔn)失敗。本研究中配準(zhǔn)的性能評估采用以下公式計(jì)算:

        (10)

        如果兩幅圖像完全配準(zhǔn),那么Err=0,如果Powell尋優(yōu)陷入局部極值,則配準(zhǔn)失敗。圖4為每組測試中20次配準(zhǔn)的成功率。

        圖3 NMI、CCRE、SCV和本研究的相似性測度

        由上圖可知,第一組測試中,當(dāng)空間變換不大時(shí), NMI、CCRE、SCV和本研究的方法成功率均達(dá)到了100%。第二組測試中,當(dāng)空間變換加大時(shí),本研究方法配準(zhǔn)成功率為100%,SCV為89.47%,CCRE為89.47%,NMI為0。第三組測試中,本研究方法配準(zhǔn)成功率為73.68%,SCV為57.89%,CCRE為68.42%,NMI為0??梢钥闯?,當(dāng)浮動(dòng)圖像相比參考圖像的空間變化增加時(shí),NMI、CCRE、SCV方法配準(zhǔn)成功率都會(huì)降低,本研究提出的方法仍然可以達(dá)到較高的配準(zhǔn)成功率。

        圖4 實(shí)驗(yàn)一的配準(zhǔn)結(jié)果

        實(shí)驗(yàn)二針對的是噪聲強(qiáng)度不同的情況。參考和浮動(dòng)圖像與實(shí)驗(yàn)一相同,但浮動(dòng)圖像做T=[9,9,2]的剛體變換。每一組測試中參考和浮動(dòng)圖像按照文獻(xiàn)[14]的方法隨機(jī)添加20次強(qiáng)度不同的的萊斯噪聲。第四組測試的噪聲標(biāo)準(zhǔn)差為14,第五組的噪聲標(biāo)準(zhǔn)差為17,第六組的噪聲標(biāo)準(zhǔn)差為19。圖5為每組測試中20次配準(zhǔn)的成功率。

        圖5 實(shí)驗(yàn)二的配準(zhǔn)結(jié)果

        由圖5可知,當(dāng)空間變換大并有噪聲存在時(shí),NMI不能完成配準(zhǔn)任務(wù),配準(zhǔn)率為0。第四組測試中本研究方法配準(zhǔn)成功率為100%,SCV為89.47%,CCRE為78.95%。第五組測試中本研究方法配準(zhǔn)成功率為89.45%,SCV為84.21%,CCRE為47.37%。第六組測試中本研究方法配準(zhǔn)成功率為89.47%,SCV為68.42%,CCRE為52.63%。由圖5可以看出,當(dāng)噪聲增大時(shí),CCRE、SCV方法配準(zhǔn)成功率都會(huì)降低,本研究提出的方法仍可達(dá)到較高的配準(zhǔn)成功率。

        表1列出以上六組測試中,成功配準(zhǔn)得到的空間參數(shù)誤差的平均值。

        可以看出,本研究方法在保證配準(zhǔn)成功率的同時(shí),具有和其他方法一致甚至明顯優(yōu)于其他方法的配準(zhǔn)精度。

        表1配準(zhǔn)精度

        Table 1 Registering accuracy

        5 結(jié)束語

        在多模醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn)中,傳統(tǒng)相似性測度曲線存在局部極值,為空間變換參數(shù)尋優(yōu)帶來困難。針對此問題,本研究提出一種改進(jìn)的SCV作為相似性測度。實(shí)驗(yàn)表明,該方法與NMI、CCRE和原SCV相比有以下優(yōu)點(diǎn):(1)當(dāng)參考圖像和浮動(dòng)圖像的空間差別不大時(shí),這四種相似性測度都能完成配準(zhǔn)任務(wù),而本研究方法精度最高。(2)當(dāng)參考圖像和浮動(dòng)圖像的空間差別較大或受到較大噪聲干擾時(shí),本研究方法的配準(zhǔn)成功率最高。如前所述,本研究方法的相似性測度曲線較為光滑,從而提高配準(zhǔn)的魯棒性。(3)綜合比較,本研究方法在保證了配準(zhǔn)精度的同時(shí)對較大的空間變換和較強(qiáng)的噪聲具有魯棒性。該方法可以進(jìn)一步擴(kuò)展至3D醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn)中。今后將進(jìn)一步研究該方法的3D配準(zhǔn)應(yīng)用。

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