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        肝細(xì)胞癌相關(guān)基因CTNNB1的3號外顯子突變研究*

        2018-10-17 10:01:28徐艷譚維維胡迅楊宗澤樊萍張姝席佳蕾王亞曦
        西部醫(yī)學(xué) 2018年10期
        關(guān)鍵詞:密碼子外顯子基因突變

        徐艷 譚維維 胡迅 楊宗澤 樊萍 張姝 席佳蕾 王亞曦

        (四川大學(xué)華西醫(yī)院生物樣本庫,四川 成都 610041)

        原發(fā)性肝細(xì)胞癌 (Hepatocellular carcinoma,HCC) 是常見的原發(fā)性惡性腫瘤之一,腫瘤相關(guān)病死率居全球第二位[1]。HCC的發(fā)病率與性別及地域相關(guān),男性發(fā)病率為女性的2~4倍,在地域中主要分布在亞洲 (75%) ,其中大約50%發(fā)生在中國,中國男性HCC的發(fā)病率約為 40.0 /1000000,女性約為15.3 /1000000[2-3]。

        HCC的發(fā)生發(fā)展受環(huán)境與遺傳等多因素影響,多年的研究已發(fā)現(xiàn)一些腫瘤相關(guān)基因在細(xì)胞周期調(diào)節(jié)、細(xì)胞生長及粘附等功能中具有重要的作用,可能會引起廣泛的基因組改變并破壞正常細(xì)胞信號通路功能,最終導(dǎo)致HCC的發(fā)生。其中,癌基因CTNNB1位于3q22.1, 其所編碼的蛋白β-catenin是HCC相關(guān)研究中的一個(gè)熱點(diǎn),該基因在HCC中的突變率可達(dá)到12.8%~44.4%,突變類型大多為單核苷酸置換和缺失突變,并且集中在其3號外顯子區(qū)域[4]。中國人群中相關(guān)的研究報(bào)導(dǎo)較少,本研究擬對HCC患者的CTNNB1基因3號外顯子突變情況進(jìn)行測序,并通過免疫組化方法檢測突變患者組織中β-catenin蛋白的表達(dá)水平,探討該基因3號外顯子突變與HCC發(fā)生的相關(guān)性。

        1 對象與方法

        1. 1 對象及材料 隨機(jī)選取四川大學(xué)華西醫(yī)院已行手術(shù)的100例原發(fā)性肝細(xì)胞癌患者腫瘤組織及配對的遠(yuǎn)端正常組織樣本200份?;颊呔鶠闈h族,其中男85 例,女15例,年齡18~75歲,所有樣本均為手術(shù)后取樣分裝立即液氮凍存?zhèn)溆?。所有患者均由醫(yī)院病理科明確診斷為HCC。本研究經(jīng)四川大學(xué)華西醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn),患者均簽署知情同意書。

        1.2 方法

        1.2.1 DNA提取 天根生化科技(北京)有限公司血液/組織/細(xì)胞基因組DNA提取試劑盒提取組織DNA。NanoDrop 8000分光光度計(jì)測量DNA濃度及純度,A260/A280的比值在1.8~2.0之間時(shí)DNA的純度符合PCR擴(kuò)增要求。

        1.2.2 PCR擴(kuò)增CTNNB1基因3號外顯子 引物序列為F1: 5′-CAATGGGTCAT ATCACA GATTCT -3′,R1:5′-CTAAGTATTTGCTATCCTAAATGGT -3′。PCR擴(kuò)增體系包括: DNA模板 (25 ng/ml) 2μl、 KOD-Plus-Neo高保真PCR酶 (1.0U/μl) 0.4μl、上下游引物 (10 μmol/L)各0.5μl、Dntp (2 mmol/L) 2μl、MgSO4(25 mmol/L) 1.2 μl、PCR緩沖液2μl,用pH 8.2雙蒸滅菌水補(bǔ)足總體積20μl。94℃預(yù)變性2 min;98℃變性10s,55℃退火30s,68℃延伸30s,共35個(gè)循環(huán)后68℃延伸5 min。擴(kuò)增產(chǎn)物為466bp片段大小,經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測。

        1.2.3 PCR產(chǎn)物測序及序列分析 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物直接測序,由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司完成。為保證測序結(jié)果的可靠性,采用正反雙向測序?;驕y序結(jié)果使用Chromas軟件和Gene Tool軟件分析,對腫瘤組織、配套正常對照組織測序結(jié)果及GENEBANK中所查到的基因標(biāo)準(zhǔn)序列同時(shí)進(jìn)行比對分析,判斷有無突變并分析相應(yīng)氨基酸的改變情況。

        1.2.4 免疫組化檢測突變患者肝癌組織中 β-catenin蛋白的表達(dá) 根據(jù)測序及序列分析結(jié)果,選取已發(fā)現(xiàn)有CTNNB1基因3號外顯子突變的患者,對其腫瘤及正常對照組織進(jìn)行β-catenin蛋白表達(dá)檢測。所有標(biāo)本制備石蠟切片并采用SP免疫組化法進(jìn)行染色。β-catenin單克隆抗體,SP免疫組化試劑盒和辣根過氧化氫酶二氨基聯(lián)苯胺 (diami-nobenzidine,DAB) 顯色試劑盒購自Dako公司 。主要方法如下:組織經(jīng)中性甲醛固定,石蠟包埋并制成4μ m厚的切片、常規(guī)脫蠟和水化后PBS液沖洗3次,3% H2O2阻斷內(nèi)源性過氧化物酶活性并 置于pH6.0的枸櫞酸緩沖液中進(jìn)行抗原修復(fù);室溫下正常山羊血清阻斷非特異性反應(yīng),滴加一抗試劑,4℃孵育過夜,PBS漂洗3次,滴加生物素標(biāo)記二抗,室溫孵育后滴加辣根過氧化物酶標(biāo)記的鏈霉素卵白素工作液,室溫下孵育,最后DAB顯色、蘇木素復(fù)染、二甲苯透明、中性樹膠封片。PBS代替一抗作為陰性對照。每張切片在高倍鏡 (×400)下隨機(jī)選擇 10 個(gè)不重復(fù)視野。結(jié)合染色強(qiáng)度和陽性細(xì)胞百分比綜合判定結(jié)果。染色強(qiáng)度為無著色0分,淺黃色1分 ,棕黃色2分 ,棕褐色 3分;陽性細(xì)胞百分比<10%計(jì) 0分 ,10%~40%計(jì) 1分,41%~ 70%計(jì)2分 ,≥71%計(jì) 3分;將上述兩項(xiàng)得分相加,0~1分為蛋白表達(dá)陰性,2分為弱陽性,3~4分為陽性,5~6分為強(qiáng)陽性,其中 2~6分為蛋白表達(dá)陽性。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSSl8.0統(tǒng)計(jì)軟件對CTNNB1基因突變與患者性別、發(fā)病年齡、有無乙型肝炎病毒 (hepatitis B virus, HBV) 感染及腫瘤分化程度等臨床病理特征之間的相關(guān)性進(jìn)行分析。其中,計(jì)數(shù)資料比較應(yīng)用四格表卡方檢驗(yàn);計(jì)量資料比較應(yīng)用t檢驗(yàn)或方差分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1CTNNB1基因3號外顯子突變情況 100例腫瘤組織中3例發(fā)生突變,突變率為3%。3例均為雜合錯(cuò)義突變,1例為CTNNB1外顯子區(qū)域第363位堿基出現(xiàn)一個(gè)雜合突變 (c.363 A> T),引起第32位密碼子編碼的氨基酸由天冬氨酸變?yōu)榱死i氨酸 (p.D32V),見圖1;另外2例患者均在外顯子區(qū)域第375位堿基檢測出同一種雜合錯(cuò)義突變 (c.375 A> C),引起第36位密碼子編碼的氨基酸由組氨酸變?yōu)榱烁彼?(p.H36P),見圖2。這兩種突變均位于既往報(bào)道的3號外顯子突變熱點(diǎn)區(qū)域。

        2. 2 β-catenin蛋白在CTNNB1基因3號外顯子突變患者組織中的表達(dá) 對3例檢測到CTNNB1基因3號外顯子突變的HCC患者的腫瘤及配對正常組織進(jìn)行免疫組化檢測,結(jié)果均顯示:β-catenin蛋白在正常肝組織中主要定位于細(xì)胞膜,為弱表達(dá);腫瘤組織染色主要定位于細(xì)胞膜及胞漿,表達(dá)明顯較正常組織增強(qiáng),為強(qiáng)陽性表達(dá),見圖3。

        2.3CTNNB1基因突變與臨床病理特征之間的關(guān)系 將3例CTNNB1突變患者歸為一組,無突變者歸為另一組,對患者的性別、發(fā)病年齡、有無HBV感染及腫瘤分化程度等臨床表型進(jìn)行比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見表1。

        圖1CTNNB1基因雜合錯(cuò)義突變(c.363A>T,p.D32V)

        Figure1Themissensemutations(c.363A>T,p.D32V)ofCTNNB1gene

        圖2CTNNB1基因雜合錯(cuò)義突變(c.375A>C,p.H36P)

        Figure2Themissensemutations(c.375A>C,p.H36P)ofCTNNB1gene

        圖3 HCC患者腫瘤及正常組織中β-catenin蛋白表達(dá)(×400)

        Figure3β-cateninexpressionintumorandnormaltissuesofHCCcases(×400)

        表1CTNNB1基因突變與臨床病理特征相關(guān)性

        Table1TherelationshipbetweenclinicopathologicalcharactersandCTNNB1mutations

        臨床參數(shù)CTNNB1突變有無P性別0.460 男382 女015發(fā)病年齡(歲)0.105 <50046 ≧50351HBV感染0.394 有378 無019分化程度0.647 高分化02 中分化375 低分化020

        3 討論

        大量研究顯示,包括HCC在內(nèi),不同類型的癌癥中均檢測到了CTNNB1基因突變,并且突變大多發(fā)生在3號外顯子區(qū)域。該基因突變能夠造成其編碼蛋白β-catenin表達(dá)異常,在胞質(zhì)內(nèi)聚集并轉(zhuǎn)位入核導(dǎo)致Wnt/β-catenin信號通路異?;罨?,并進(jìn)一步影響到細(xì)胞的生存、增殖、分化及血管生成等各種功能。

        目前已發(fā)現(xiàn)其異常表達(dá)與很多癌癥的發(fā)生有關(guān),如肝癌、結(jié)腸癌、肺癌、乳腺癌、甲狀腺癌和前列腺癌等[5-8]。本研究在100例HCC患者腫瘤組織中發(fā)現(xiàn)了兩種雜合錯(cuò)義突變,突變率為3%,其中1例突變 (c.363 A> T) 引起密碼子32所編碼的天冬氨酸變?yōu)榱死i氨酸 ( p.D32V);另外2例患者的同一種突變 (c.375 A> C),則使密碼子36所編碼的組氨酸變?yōu)榱烁彼?( p.H36P)。這兩種突變均位于既往報(bào)道中的CTNNB1基因3號外顯子突變熱點(diǎn)區(qū)域(密碼子32、33、36、37、41、45等區(qū)域)[9-11],即正好位于β-catenin蛋白的重點(diǎn)功能區(qū)域氨基端,這一區(qū)域包括糖原合成酶激酶3β (Glycogen synthase kinase-3β,GSK-3β) 和酪蛋白激酶1α (Casein kinase1α,CK1α) 的磷酸化位點(diǎn),其中,密碼子33、37、41為GSK-3β的磷酸化位點(diǎn)、密碼子45為CK1α的磷酸化位點(diǎn);而本研究檢測到的兩種突變分別位于密碼子32、36,則屬于鄰近GSK-3β綁定位點(diǎn)的非磷酸化位點(diǎn),一些研究報(bào)道認(rèn)為該類突變主要是通過氨基酸的結(jié)構(gòu)變化引起蛋白質(zhì)的功能改變,干擾β-catenin與GSK-3β等激酶的正常結(jié)合并致磷酸化異常,正常情況下, β-catenin 的磷酸化是啟動其泛素降解的起始信號,以上突變最終可能導(dǎo)致β-catenin 逃避降解,并在胞內(nèi)水平升高[12-13]。因此,本研究進(jìn)一步檢測這3例HCC患者腫瘤及配對正常組織中的β-catenin蛋白表達(dá)情況,結(jié)果均顯示β-catenin蛋白在正常組織中弱表達(dá),在腫瘤組織中的表達(dá)則相對明顯增強(qiáng),提示本研究所檢測到的2種突變很可能直接導(dǎo)致了患者腫瘤組織中β-catenin蛋白的異常高表達(dá)。在生理狀態(tài)下,Wnt/β-catenin信號通路參與調(diào)控正常肝細(xì)胞的功能,動物實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),剛出生的小鼠體內(nèi)β-catenin含量會迅速升高并在細(xì)胞核內(nèi)聚集,這種變化與肝細(xì)胞的增殖活躍相一致,在短期內(nèi)可促進(jìn)肝臟的生長;在成年期的肝臟,該基因磷酸化失活,β-catenin蛋白大部分位于細(xì)胞膜上,很少出現(xiàn)于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中[14-15]。針對不同物種的研究又發(fā)現(xiàn),小鼠、大鼠及人類肝臟再生時(shí),β-catenin均有顯著的升高,這種升高是由于蛋白降解的減少所致,而非mRNA的高表達(dá)造成,因此,Wnt/β-catenin通路在肝臟的生長和再生修復(fù)中發(fā)揮著重要的作用[16],但這種生理性的升高通常在48 h內(nèi)降至正常水平。病理狀況下,胞漿內(nèi)β-catenin水平升高入核形成β-catenin-Tcf/Lef復(fù)合體,通過調(diào)控其下游靶基因的表達(dá)并與其它信號通路,如核因子-κB(Human nuclear factor-kappa B,NF-κB)、轉(zhuǎn)化生長因子β (Transforming growth factor-β,TGF-β) 等通路相互作用而參與HCC的發(fā)生,轉(zhuǎn)移等過程[17-18]。

        HBV慢性感染是我國HCC發(fā)生的最主要病原之一,既往針對CTNNB1基因突變與HBV相關(guān)HCC的研究結(jié)果并不一致,部分研究在HBV相關(guān)HCC患者中檢測到較高的CTNNB1基因突變率[20],而較多的研究則認(rèn)為相對于丙型肝炎病毒 (Hepatitis C virus,HCV) 感染或飲酒相關(guān)的HCC,CTNNB1的基因突變率在HBV相關(guān)HCC中是相對較低的[21-22]。本研究觀察到3例檢測出突變的患者共同的特征都是大于50歲的男性HBV感染患者,但經(jīng)過統(tǒng)計(jì)分析,突變與臨床病理特征之間的關(guān)系無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,可能與納入研究的樣本量相對較小、同時(shí)在本研究人群中所發(fā)現(xiàn)的突變率較低有關(guān),還需加大樣本量進(jìn)一步證實(shí),并考慮該基因其它外顯子突變的可能性。

        4 結(jié)論

        本研究結(jié)果表明,CTNNB1基因3號外顯子突變存在于HCC患者腫瘤組織中,并導(dǎo)致其編碼蛋白的異常表達(dá),可能與HCC的發(fā)生相關(guān)。由于納入研究的樣本量較小,需擴(kuò)大樣本量對該基因變異予以進(jìn)一步驗(yàn)證。

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