賀薈靜,劉金成,劉芡芡,王 云,*
(1. 青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)系,山東 青島266021;2. 山東省萊鋼醫(yī)院檢驗科,山東萊蕪 271126)
鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是在中國南方高發(fā)的一種頭頸部腫瘤,其發(fā)生與EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染密切相關(guān),但EBV致癌機制尚不明確[1]。EBV編碼小RNA(EBV-encoded small RNAs, EBERs)為 非 編 碼 RNA, 包 括 EBER1和EBER2,是所有EBV感染類型中表達(dá)豐度最高的mRNA,其致癌作用已在多種細(xì)胞系中得到證實,因此EBERs在NPC及其他EBV相關(guān)腫瘤中可能發(fā)揮重要作用[2-3]。我們前期對EBV相關(guān)腫瘤中 EBV基因多態(tài)性的研究中發(fā)現(xiàn)了可能與NPC相關(guān)的 EBERs基因變異型EB-8m,該變異型在 EBER2基因轉(zhuǎn)錄區(qū)出現(xiàn)6處共有突變[4],進(jìn)一步的功能學(xué)研究發(fā)現(xiàn)變異型EBER2可促進(jìn)NPC細(xì)胞系增殖,并對 α-干擾素(interferon-α, IFN-α)誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡具有抵抗作用[5]。以往有研究表明EBERs可通過與RNA激活蛋白激酶(RNA-activated protein kinase,PKR)結(jié)合并抑制其激活從而增強細(xì)胞抗凋亡能力[6-9]。PKR是絲氨酸/蘇氨酸激酶,可被IFN或雙鏈RNA激活發(fā)生磷酸化,是IFN抗病毒作用中的效應(yīng)因子,在細(xì)胞生長和細(xì)胞凋亡中也具有調(diào)控作用,多數(shù)研究認(rèn)為PKR激活后可誘導(dǎo)翻譯起始因子eIF2α磷酸化從而抑制細(xì)胞蛋白質(zhì)合成,導(dǎo)致細(xì)胞凋亡,在腫瘤發(fā)生中發(fā)揮抑癌基因的作用[10-11]。EBER1和EBER2均可形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),并通過莖環(huán)與包括PKR在內(nèi)的幾種細(xì)胞蛋白結(jié)合[2,12]。由于EB-8m變異型在EBER2的6處突變有5處位于莖環(huán)內(nèi)[4,13],因此本研究在以往實驗基礎(chǔ)上,進(jìn)一步檢測EB-8m變異型EBER2對NPC細(xì)胞系細(xì)胞凋亡的影響,同時檢測其對PKR結(jié)合和磷酸化以及相關(guān)因子磷酸化和蛋白表達(dá)的影響,探討變異型EBER2增強NPC細(xì)胞抗凋亡作用的機制。
EBV陰性NPC細(xì)胞系HONE1和CNE1由廣東醫(yī)學(xué)院病理科朱偉教授饋贈; EBER2基因慢病毒表達(dá)載體由上海吉瑪生物制藥有限公司構(gòu)建;真核表達(dá)質(zhì)粒載體pcDNA3.1-PKR-FLAG由上海邁浦生物科技有限公司構(gòu)建。PCR引物由南京金斯瑞生物科技有限公司合成;細(xì)胞凋亡檢測試劑Annexin V-APC和 7-氨基-放線菌素D(7-amino-actinomycin D, 7 -AAD)分別購自美國eBioscience公司和美國BD公司;RNA蛋白結(jié)合免疫共沉淀試劑盒Magna RIPTM RNA-Binding Protein Immunoprecipitation Kit購于美國Millipore公司;質(zhì)粒提取試劑盒購于北京天根生化科技有限公司;Real-time PCR試劑盒購于德國Roche公司;Lipofectamine 2000購于美國Invitrogen公司;BCA蛋白質(zhì)定量試劑盒、蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)、 β-actin單克隆抗體和二抗購于武漢博士德公司;PKR、eIF2α、c-Jun及磷酸化PKR(phosphorylated PKR,P-PKR)、P-eIF2 α、P-c-Jun多克隆抗體,F(xiàn)lag-Tag單克隆抗體和Bcl-2單克隆抗體購于美國ImmunoWay公司;DMEM培養(yǎng)基和胎牛血清購于美國Hyclone公司;Trizol RNA提取試劑購于美國Gibco公司;Active人類IFN-α全長蛋白質(zhì)購于英國Abcam公司。
Roche Light Cycler 96型Real-time PCR擴增儀購自德國Roche公司;FUSION FX7顯影儀購自法國VILBER公司;電轉(zhuǎn)儀購自美國Bio-Rad公司。
含 EBER2原型和變異型基因的慢病毒表達(dá)載體構(gòu)建、細(xì)胞轉(zhuǎn)染及穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞篩選的步驟見參考文獻(xiàn)[5],EBER2-B95-8、EBER2-8m和對照分別表示含原型EBER2基 因、變異型E BER2基因以及只含載體的細(xì)胞。
分別對上述含有兩種 EBER2基因的HONE1和CNE1細(xì)胞以及只含載體的對照細(xì)胞進(jìn)行IFN-α和順鉑凋亡誘導(dǎo)實驗。收集對數(shù)生長期的細(xì)胞,并且將細(xì)胞懸液濃度調(diào)整為6×104/mL,鋪6孔板,CO體積分?jǐn)?shù)為2 5%、37 ℃條件下培養(yǎng)過夜,IFN-α誘導(dǎo)時加入濃度10 000 IU/mL的IFN-α作用72 h后檢測細(xì)胞凋亡;順鉑誘導(dǎo)時加入2 μg/mL順鉑分別作用24和48 h后檢測細(xì)胞凋亡。采用Annexin V-APC和7-AAD雙染,流式細(xì)胞術(shù)檢測細(xì)胞凋亡情況,計算細(xì)胞凋亡率,具體步驟按照試劑盒說明書進(jìn)行。每種細(xì)胞設(shè)置3個復(fù)孔,取3次試驗均值。
采用Western blot檢測 EBER2基因轉(zhuǎn)染HONE1和CNE1細(xì)胞及對照細(xì)胞中各種蛋白的表達(dá)情況。將10 0 00 IU/mL的IFN-α加入EBER2-B95-8、EBER2-8m和對照細(xì)胞培養(yǎng)液中作用24 h后,收集各組細(xì)胞,提取蛋白,BCA法測定蛋白質(zhì)濃度,取50 μ g蛋白進(jìn)行SDS-PAGE電泳,轉(zhuǎn)膜,封閉1~2 h后與一抗(1∶1 000稀釋) 4 ℃孵育過夜,用TBST洗膜3次,加入二抗(1∶2 000稀釋),室溫反應(yīng)2 h,再用TBST洗膜3次,最后用發(fā)光試劑ECL(A液和B液)進(jìn)行顯色,暗室曝光并保存圖片。Image J軟件進(jìn)行條帶灰度分析,目的蛋白灰度值/β-actin灰度值表示目的蛋白相對表達(dá)量,取3次實驗均值。
對含有兩種 EBER2基因的HONE1和CNE1細(xì)胞進(jìn)行RNA和PKR蛋白結(jié)合免疫共沉淀實驗。首先制備PKR真核表達(dá)質(zhì)粒載體pcDNA3.1-PKR-FLAG。人PKR基因的GenBank序列號為M85294,cDNA全長1 656 bp。PKR cDNA序列前連接FLAG短肽標(biāo)簽(DYKDD DDK)編碼序列(GATTACAAGGATGACGACGATAAG),然后克隆至pcDNA3.1,轉(zhuǎn)化大腸桿菌 D H5α,通過氨芐青霉素抗性、PCR擴增及測序鑒定,選擇PKR序列完全正確的陽性克隆,提取質(zhì)粒DNA,進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染實驗。待細(xì)胞融合至90%時,用Lipofectamine 2000將質(zhì)粒pcDNA3.1-PKR-FLAG分別瞬時轉(zhuǎn)染EBER2-B95-8和EBER2-8m細(xì)胞。收集轉(zhuǎn)染48 h后的細(xì)胞,制備細(xì)胞裂解產(chǎn)物,吸取1/10細(xì)胞裂解產(chǎn)物作為“input”,-80 ℃儲存直至RNA純化,剩余細(xì)胞裂解產(chǎn)物與以anti-FLAG抗體制備的免疫沉淀磁珠混合進(jìn)行免疫共沉淀反應(yīng),陰性對照為試劑盒提供的IgG抗體免疫磁珠。取免疫共沉淀產(chǎn)物,分別提取純化RNA和蛋白,用于EBER2 RNA和PKR蛋白檢測。免疫共沉淀反應(yīng)、RNA純化和蛋白提取的步驟詳見RNA蛋白結(jié)合免疫共沉淀試劑盒說明書。
采用Real-time PCR檢測EBER2 RNA,引物序列及擴增片段長度見文獻(xiàn)[5]。對提取純化的“input”和免疫共沉淀產(chǎn)物中的RNA,進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄獲得cDNA,參照試劑盒說明書進(jìn)行Real-time PCR反應(yīng),以3%的瓊脂糖凝膠電泳鑒定擴增條帶。參照免疫共沉淀試劑盒說明書,計算免疫共沉淀產(chǎn)物中EBER2的富集倍數(shù):用input的 CT值 對實驗組和IgG組的 CT值 進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化,?CT,normalized= CT- [CT,input- log2(input稀釋因子)],由于Realtime PCR的“input”為免疫共沉淀細(xì)胞溶解產(chǎn)物量的10%, 所 以input稀 釋 因 子 為10; 實 驗 組 ? ?CT=?CT,normalizedtested- Δ CT,normalizedIgG, 實驗組目的RNA的富集倍數(shù)為2-ΔΔCT,取3次 試 驗均值。分別以PKR多克隆抗體和Flag-Tag單克隆抗體作為一抗,采用Western blot檢測免疫共沉淀產(chǎn)物中攜帶FLAG的PKR蛋白。
采用SPSS 18.0統(tǒng)計軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,EBER2-B95-8組和EBER2-8m組免疫共沉淀產(chǎn)物中EBER2富集倍數(shù)間差異的分析采用t檢驗,EBER2-B95-8組、EBER2-8m組和對照組細(xì)胞凋亡率間和蛋白表達(dá)量間差異的分析采用完全隨機資料方差分析及q檢 驗。以 α=0.05為檢驗水準(zhǔn)。
流式細(xì)胞術(shù)檢測結(jié)果見圖 1。IFN-α誘導(dǎo)實驗中,兩種細(xì)胞系EBER2-B95-8組和EBER2-8m組細(xì)胞凋亡率均低于 對 照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),且EBER2-8m組細(xì)胞凋亡率低于EBER2-B95-8組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。順鉑凋亡誘導(dǎo)實驗中,在誘導(dǎo)后的24和48 h,兩種細(xì)胞系EBER2-B95-8組和EBER2-8m組細(xì)胞凋亡率均低于 對 照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),且EBER2-8m組細(xì)胞凋亡率低于EBER2-B95-8組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。
EBER2基因轉(zhuǎn)染細(xì)胞中PKR和相關(guān)因子磷酸化及蛋白表達(dá)情況見圖2。與 對 照組細(xì)胞比較,EBER2-B95-8和EBER2-8m組細(xì)胞中總PKR、eIF2α和c-Jun表達(dá)水平無明顯差異,但P-PKR、P-eIF2α和P-c-Jun表達(dá)減少,Bcl-2表達(dá)增多,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05或 P<0.01)。變異型基因和野生型基因轉(zhuǎn)染細(xì)胞比較,HONE1細(xì)胞中,P-PKR和P-eIF2α在EBER2-8m組的水平低于EBER2-B95-8組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05), P-c-Jun和 Bcl-2的 表 達(dá) 尚 無 明 顯 差 異 (圖2A和B);CNE1細(xì)胞中P-PKR在EBER2-8m組的水平低于EBER2-B95-8組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),其他蛋白的表達(dá)無明顯差異。
Real-time PCR產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果見圖3A,“input”組和anti-FLAG免疫共沉淀產(chǎn)物可觀察到EBER2擴增條帶,IgG組未觀察到EBER2擴增條帶。CNE1和HONE1細(xì)胞中,EBER2-8m組免疫共沉淀產(chǎn)物中EBER2的富集倍數(shù)(2-??CT)高于EBER2-B95-8組,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)(圖3B)。以FLAG抗體和PKR抗體作為一抗,通過Western blot均可在anti-FLAG免疫共沉淀產(chǎn)物中檢測到FLAG-PKR蛋白,IgG組未檢測到FLAG-PKR蛋白(圖3C)。
圖3 PKR免 疫共沉淀產(chǎn)物中 EBER2 RNA 和 PKR蛋白檢測結(jié)果
EBERs 是近年來得到認(rèn)可的EBV致癌基因,本研究順鉑和IFN-α凋亡誘導(dǎo)實驗的結(jié)果顯示野生型和變異型EBER2均可增強NPC細(xì)胞的抗凋亡能力。以往實驗也表明EBERs在腫瘤細(xì)胞系中可以抵抗多種因素誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡,如IFN-α、Fas、低氧、放線菌酮和糖皮質(zhì)激素等誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡[6-9,14]。PKR是一種各組織細(xì)胞廣泛表達(dá)的雙鏈RNA依賴的蛋白質(zhì)激酶,正常情況下處于無活性狀態(tài),當(dāng)與雙鏈RNA結(jié)合后,PKR構(gòu)象發(fā)生變化,通過自身及相互磷酸化激活,作用于下游因子eIF2α、 NF-κB或絲裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)等調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡或生長[11,15-17]。EBERs屬非編碼RNA,可與細(xì)胞雙鏈RNA識別因子相互作用[2-3,12],EBERs與PKR的結(jié)合能抑制其發(fā)生磷酸化進(jìn)而失活。有研究在B淋巴瘤細(xì)胞系BJAB[6]、 鼻咽上皮細(xì)胞NP69[7]、 BL細(xì)胞系A(chǔ)kata[8]以及腸上皮細(xì)胞407[9]中均發(fā)現(xiàn)EBERs可通過結(jié)合PKR抑制其發(fā)生磷酸化從而增強細(xì)胞抗凋亡能力。以往研究均采用包括EBER1和EBER2在內(nèi)的完整EBERs進(jìn)行實驗,本研究結(jié)果顯示獨立的EBER2對抑制NPC細(xì)胞凋亡及PKR激活均具有與完整EBERs類似的作用,提示了EBER2功能的重要性,以往基因敲除實驗表明EBER2是引起B(yǎng)細(xì)胞轉(zhuǎn)化的關(guān)鍵基因[18-19]。
EBER1或EBER2通過形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)與細(xì)胞蛋白結(jié)合[2,12-13],EBERs二級結(jié)構(gòu)對于其發(fā)揮功能至關(guān)重要,誘導(dǎo)突變實驗表明EBER1莖環(huán)堿基突變會影響EBER1與核糖體蛋白L22的結(jié)合,進(jìn)而影響EBER1的促細(xì)胞增殖能力[20]。EB-8m變異型EBERs在 EBER1基因轉(zhuǎn)錄區(qū)序列保守,但在 EBER2基因轉(zhuǎn)錄區(qū)發(fā)生6處突變,其中5處位于莖環(huán)內(nèi)[4,13]。本研究采用Real-time PCR檢測RNA-PKR免疫共沉淀產(chǎn)物中的EBER2,對實驗的各環(huán)節(jié)嚴(yán)格定量,將擴增反應(yīng)控制在指數(shù)增長的線性范圍內(nèi),計算RNA富集倍數(shù)時分別以“input”和IgG組進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理和排除非特異性結(jié)合RNA,獲得的富集倍數(shù)值能在一定程度上反映EBER2與PKR蛋白的結(jié)合能力。由于EBER2-8m變異型EBER2的富集倍數(shù)高于野生型EBER2,且Western blot結(jié)果也顯示EBER2-8m對PKR磷酸化的抑制作用更為明顯,提示EB-8m變異型在EBER2二級結(jié)構(gòu)莖環(huán)處發(fā)生的突變可能促進(jìn)EBER2與PKR的結(jié)合,增強了對PKR磷酸化的抑制作用,進(jìn)而提高了細(xì)胞的抗凋亡能力。EBER2變異如何影響其與PKR的結(jié)合尚需進(jìn)一步研究。
對PKR通路相關(guān)因子的檢測結(jié)果顯示野生型和變異型EBER2均可抑制eIF2α和c-Jun磷酸化并 上調(diào)Bcl-2蛋白表達(dá),該結(jié)果與以往EBERs在其他幾種細(xì)胞中的結(jié)果類似。如在Burkitt淋巴瘤細(xì)胞系A(chǔ)kata中,EBERs過表達(dá)可通過與PKR結(jié)合抑制eIF2α磷酸化[8];在雙鏈RNA類似物poly(I):poly(C)處理后的鼻咽上皮細(xì)胞NP69中,EBERs過表達(dá)導(dǎo)致PKR、p38 MARK和c-Jun的磷酸化水平降低,Bcl-2水平升高,凋亡標(biāo)志物caspase-3和PARP裂解產(chǎn)物的表達(dá)水平降低[7]。c-Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinase,JNK)信號通路是參與調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖和凋亡的重要通路,c-Jun磷酸化被抑制可抑制細(xì)胞凋亡,促進(jìn)細(xì)胞轉(zhuǎn)化[21-22]; B cl-2是最有代表性的凋亡抑制基因[23]。eIF2α是PKR激活后的直接作用底物[15-16],而 c- J un和 B cl-2也可以作為PKR調(diào)節(jié)的下游基因[24-26],本研究 EBER2基因轉(zhuǎn)染細(xì)胞中PKR磷酸化被抑制,上述3種基因磷酸化和表達(dá)也隨之發(fā)生變化,進(jìn)一步證實PKR對3種基因的調(diào)控作用。同時變異型EBER2對PKR磷酸化的抑制作用比野生型EBER2更為顯著,且在HONE1細(xì)胞中,變異型EBER2 對eIF2α的抑制作用亦比野生型EBER2明顯,但變異型和野生型EBER2轉(zhuǎn)染細(xì)胞之間c-Jun磷酸化和Bcl-2表達(dá)尚無明顯差異,提示EBER2變異型可能還通過PKR 以外的途徑調(diào)節(jié)c-Jun磷酸化和Bcl-2表達(dá)。
總之,本研究結(jié)果表明EB-8m變異型EBER2可能增強EBER2與PKR的結(jié)合作用及對PKR磷酸化的抑制作用,同時抑制eIF2α和c-Jun磷酸化并上調(diào)Bcl-2蛋白表達(dá),進(jìn)而增強NPC細(xì)胞的抗凋亡能力。