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        荒漠草原中間錦雞兒灌叢的土壤微生物多樣性

        2018-09-11 08:07:08王德凱王躍棠梅續(xù)芳解李娜李清芳馬成倉
        關鍵詞:錦雞兒灌叢桿菌屬

        王德凱 ,李 穎 ,王躍棠 ,梅續(xù)芳 ,解李娜 ,李清芳 ,馬成倉

        (1.天津師范大學生命科學學院,天津300387;2.天津師范大學天津市動植物抗性重點實驗室,天津300387)

        土壤微生物是生活在土壤中的細菌、真菌、放線菌、藻類的總稱.其組成和結構一方面受土壤性質(zhì)的影響,如土壤水分、土壤溫度、pH、土壤養(yǎng)分、土壤質(zhì)地等[1-2];另一方面,土壤微生物群落與植物生長過程緊密相關,植物通過凋落物、根系分泌物、植物生產(chǎn)力等影響土壤微生物群落[3-4].灌木已成為全球草地生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,其密度和蓋度較大且呈逐年增加趨勢.灌叢的形成改變了地表土壤資源的分配,使水分和養(yǎng)分較多地聚集在灌叢內(nèi),導致土壤資源具有空間異質(zhì)性,形成“沃島”[5].“沃島”的形成又會引發(fā)土壤有機碳和其他成分的空間異質(zhì)性,加劇了資源的異質(zhì)化和斑塊化[6],從而影響土壤微生物群落.灌叢土壤資源異質(zhì)化又會引起灌叢內(nèi)外植被的異質(zhì)化,進一步影響土壤微生物群落[7-8].

        錦雞兒屬(Caragana Fabr.)植物是內(nèi)蒙古草原最常見的灌木,具有很強的適應干旱、寒冷環(huán)境和耐貧瘠能力,不僅是牲畜的優(yōu)質(zhì)牧草,還能夠防風固沙、保持水土[9].本研究以內(nèi)蒙古荒漠草原的中間錦雞兒灌叢的土壤微生物為研究對象,通過傳統(tǒng)培養(yǎng)法和分子生物學技術,比較灌叢內(nèi)外土壤微生物群落的差異,探討中間錦雞兒灌叢形成導致的土壤資源異質(zhì)化對土壤微生物的影響,進一步理解中間錦雞兒灌叢的沃島效應.

        1 材料與方法

        1.1 研究區(qū)概況

        樣地位于內(nèi)蒙古鄂托克旗的烏蘭鎮(zhèn)(北緯39°1′,東經(jīng)107°98′),該地區(qū)為典型的溫帶大陸性季風氣候,日照充足,四季分明,年平均降水量約為250 mm,降水主要集中在7—9月份.年平均蒸發(fā)量為2 400~2 800 mm,是降水量的8到12倍.年平均氣溫為6.5℃,年日照時數(shù)約3 000 h.土壤質(zhì)地以疏松的砂質(zhì)壤土或沙土為主.

        1.2 研究方法

        1.2.1 土壤樣品采集

        2016年7月在鄂托克旗烏蘭鎮(zhèn)選取3個優(yōu)勢種為中間錦雞兒的地區(qū)作為樣地,每個樣地隨機選取3株中間錦雞兒灌叢,在灌叢內(nèi)和灌叢外(距離灌叢邊緣 2 m)分別采集 0~10 cm(A 層)、10~20 cm(B 層)、30~40 cm(C層)的土壤樣品約300 g,用自封袋密封.樣品于4℃保存,一部分用于土壤理化性質(zhì)的測定,一部分用于土壤微生物多樣性的測定.

        1.2.2 土壤理化性質(zhì)的測定

        采用水浸提電位法測定土壤pH值;采用烘干法測量含水量;采用重鉻酸鉀容量法測定有機質(zhì)(Organic matter)含量;采用碳酸氫鈉浸提-鉬銻抗比色法測定速效磷(Available phosphorus)含量;采用醋酸銨浸提-火焰光度法測定速效鉀(Available potassium)含量;使用流動分析儀測定硝態(tài)氮(Nitrate nitrogen)和銨態(tài)氮(Ammonium nitrogen)含量.將土樣浸提,然后用DDS~LLA型電導儀測定電導率(Electricconductivity)[10].中間錦雞兒灌叢內(nèi)外的土壤理化性質(zhì)如表1所示.

        表1 中間錦雞兒灌叢內(nèi)外土壤理化性質(zhì)Tab.1 Physical and chemical characteristics of soil inside and outside Caragana intermedia shrubs

        1.2.3 土壤微生物群落的多樣性測定

        (1)土壤微生物培養(yǎng):分別采用牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基、馬丁氏培養(yǎng)基和高氏一號培養(yǎng)基法培養(yǎng)土壤中的細菌、真菌和放線菌,采用稀釋平板計數(shù)法計數(shù),結果以每克干土所含的微生物菌落數(shù)表示.用平板劃線分離法分離純化微生物菌落.

        1g干土中的菌落數(shù)(cfu/g)=M×鮮土質(zhì)量/干土質(zhì)量式中:M=a×u/V,a為培養(yǎng)皿中的平均菌落數(shù),u為稀釋倍數(shù),V為每個培養(yǎng)皿中加入的土壤懸液的體積(本實驗中為0.2 mL).

        (2)微生物的分子生物學鑒定:細菌和放線菌DNA采用生工Ezup柱式細菌基因組DNA抽提試劑盒進行提取,真菌DNA采用生工Ezup柱式真菌基因組DNA抽提試劑盒提取,按照試劑盒說明書進行操作.采用通用引物 1492R(5′-GGT TAC CTT GTT ACGACT T-3′)和 27F(5′-AGA GTT TGA TCC TGG CTCAG-3′)擴增細菌和放線菌16S rDNA片段,GeoA2(5′-CCA GTA GTC ATA TGC TTG TCT C-3′)和 Geo11(5′-ACC TTG TTA CTT TTA CTT CC-3′)擴增真菌18S rDNA片段.PCR擴增產(chǎn)物由北京華大基因公司測序,所得堿基序列提交至GenBank數(shù)據(jù)庫,使用BLAST程序進行比對分析,將菌株鑒定到屬.

        采用Shannon-Wiener多樣性指數(shù)(H′)分析評價土壤微生物群落的多樣性[11].

        式中:Pi表示群落中第i個物種的個體數(shù)占群落中個體總數(shù)的比例.

        1.3 數(shù)據(jù)分析

        利用SPSS17.0軟件進行單因素方差分析(One-way ANOVAs)(P<0.05),分析灌叢內(nèi)外不同土層間微生物菌落數(shù)量和多樣性的差異.用Tukey HSD做多重比較.采用獨立樣本t檢驗分析灌叢內(nèi)外的差異.采用CANOCO 4.5軟件對土壤微生物和環(huán)境因子之間的關系進行冗余分析.用Monte Carlo置換檢驗分析環(huán)境因子對土壤微生物群落影響的統(tǒng)計學意義(P<0.05).

        2 結果與分析

        2.1 中間錦雞兒灌叢土壤微生物的數(shù)量

        中間錦雞兒灌叢內(nèi)外不同土層的土壤微生物數(shù)量如圖1所示.

        圖1 灌叢內(nèi)外土壤細菌、放線菌和真菌菌落總數(shù)Fig.1 Quantity of bacteria,actinomycetes and fungi inside and outside the shrubs

        由圖1可以看出,土壤微生物總數(shù)表現(xiàn)為:細菌>放線菌>真菌.灌叢內(nèi)土壤細菌數(shù)隨著土層深度的增加顯著下降(P<0.05),而灌叢外則呈先緩慢增加后減少的趨勢;同一土層灌叢內(nèi)土壤細菌總數(shù)均顯著高于灌叢外的數(shù)量(P<0.05).灌叢內(nèi)外放線菌總數(shù)均表現(xiàn)為A層>B層>C層,且不同土層間的差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05);同一土層灌叢內(nèi)的土壤放線菌總數(shù)均大于灌叢外的數(shù)量,A層和B層灌叢內(nèi)外的差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05),C層灌叢內(nèi)外數(shù)量相近(P>0.05).灌叢內(nèi)外的土壤真菌數(shù)隨著土層深度的增加均呈先增加后減少的趨勢,不同土層之間的差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05);同一土層灌叢內(nèi)土壤真菌總數(shù)均顯著高于灌叢外的數(shù)量(P<0.05).

        2.2 中間錦雞兒灌叢土壤微生物的群落組成

        2.2.1 細菌

        本研究從中間錦雞兒灌叢內(nèi)外土壤中共分離出細菌13屬,如表2所示.無論是灌叢內(nèi)還是灌叢外,A層的優(yōu)勢屬均為芽孢桿菌屬(Bacillus)和短小桿菌屬(Curtobacterium Yamada),B層和C層的優(yōu)勢屬為芽孢桿菌屬、短小桿菌屬和類芽孢桿菌屬(Paenibacillus Ash),優(yōu)勢屬的相對豐度在不同土層間的差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05).在灌叢內(nèi),芽孢桿菌屬的相對豐度隨土層深度增加顯著下降(P<0.05),灌叢外則無顯著差異(P>0.05).無論是灌叢內(nèi)還是灌叢外,類芽孢桿菌屬的相對豐度均隨土層深度的增加而顯著升高(P<0.05).在灌叢內(nèi),短小桿菌屬在B層的數(shù)量最多,在灌叢外則是A層數(shù)量最多.壤霉菌屬(A-gromyces)、溶桿菌屬(Lysobacter)、鞘氨醇桿菌屬(Sphingobacterium sp)、嗜麥芽窄食單胞菌屬(Stenotrophomonas maltophilia))、金黃桿菌屬(Chryseobacterium))、假單胞菌屬(Pseudoxanthomonas)為灌叢內(nèi)特有屬,且壤霉菌屬、溶桿菌屬、鞘氨醇桿菌屬、金黃桿菌屬均集中在灌叢內(nèi)的A層.節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)僅在A層出現(xiàn).葡萄球菌屬(Staphylococcus)在各土層均能檢測到,灌叢內(nèi)各土層間的差異較小(P>0.05),灌叢外則隨著土層深度的增加呈下降趨勢(P<0.05).中華根瘤菌屬(Sinorhizobium Chen)在灌叢內(nèi)僅在A層檢測到;灌叢外則分布于A層和B層.微桿菌屬(Microbacterium)在灌叢內(nèi)的各個土層均可檢測到,且A層和C層數(shù)量相近,顯著高于B層;灌叢外則出現(xiàn)于B層和C層,且后者數(shù)量顯著高于前者(P<0.05).

        表2 灌叢內(nèi)外土壤細菌群落組成及相對豐度Tab.2 Community composition and relative abundance of bacteria inside and outside shrubs %

        2.2.2 真菌

        中間錦雞兒灌叢內(nèi)外土壤中共分離出真菌12屬,如表3所示.由表3可以看出,曲霉屬(Aspergillus)為灌叢內(nèi)外各土層的優(yōu)勢屬,且相對豐度隨著土層深度的增加顯著增加(P<0.05).小囊菌(Microascaceae)為灌叢內(nèi)B、C層和灌叢外C層的優(yōu)勢屬.青霉屬(Penicillium)主要集中在灌叢內(nèi)的A層和灌叢外的B、C層,灌叢內(nèi)的相對豐度隨著土層深度的增加顯著降低(P<0.05),灌叢外則是B層數(shù)量最多.莖點霉屬(Phorna)和隱球菌屬(Cryptococcus)均僅出現(xiàn)在灌叢內(nèi)外的A層,而鏈格孢霉屬(Alternaria)出現(xiàn)在A層和B層.木霉屬(Trichoderma)、露漆濕斑菌屬(Myrothecium roridum)和小麥葉枯病菌(Septoriatritici)均為灌叢內(nèi)特有屬,疣孢漆斑菌屬(Myrothecium verrucaria)為灌叢外特有屬.鐮刀菌屬(FusariumLink)、球毛殼菌屬(Chaetomium)和小囊菌(Microascaceae)在灌叢內(nèi)外的各個土層均能檢測到,通常富集在B層和C層.

        表3 灌叢內(nèi)外土壤中真菌群落組成及相對豐度Tab.3 Community composition and relative abundance of fungi inside and outside shrubs %

        2.2.3 放線菌

        中間錦雞兒灌叢內(nèi)外土壤中共分離出了放線菌5屬,如表4所示.灌叢內(nèi)和灌叢外各土層的優(yōu)勢屬均為鏈霉菌屬(Streptomyces),相對豐度占各土層放線菌總數(shù)的83%~95%,B層的相對豐度顯著高于A層和 C 層(P<0.05).小單孢菌屬(Micromonospora)僅在灌叢內(nèi)出現(xiàn),為灌叢內(nèi)A層的優(yōu)勢屬.諾卡氏菌屬(Nocardia)同樣僅出現(xiàn)在灌叢內(nèi),為灌叢內(nèi)C層的優(yōu)勢屬,且相對豐度隨著土壤深度增加顯著升高(P<0.05).Dyadobacter屬僅在灌叢內(nèi)的A層檢測到.

        表4 灌叢內(nèi)外土壤中放線菌群落的組成及相對豐度Tab.4 Community composition and relative abundance of actinomycetes inside and outside shrub canopies %

        2.3 中間錦雞兒灌叢土壤微生物多樣性

        中間錦雞兒灌叢不同土層的土壤微生物多樣性指數(shù)計算結果如表5所示.

        表5 灌叢內(nèi)外土壤微生物的Shannon-Wiener指數(shù)Tab.5 Shannon-Wiener index(H′)of soil microorganisms inside and outside the shrubs

        由表5可以看出,中間錦雞兒灌叢內(nèi)土壤細菌的H′指數(shù)隨著土層深度的增加顯著下降(P<0.05),灌叢外則隨著土層深度的增加先增加后下降,但不同土層之間的差異不具有統(tǒng)計學意義(P>0.05);A層和B層灌叢內(nèi)的細菌H′指數(shù)顯著高于灌叢外的數(shù)值,C層灌叢內(nèi)外的數(shù)值相同.土壤真菌的H′指數(shù)在灌叢內(nèi)外均隨著土層深度的增加呈下降趨勢;A層灌叢內(nèi)的數(shù)值顯著高于灌叢外的數(shù)值,B層和C層則是顯著低于灌叢外的數(shù)值(P<0.05).灌叢內(nèi)土壤放線菌的H′隨著土層深度的增加呈下降趨勢(P<0.05),而灌叢外H′隨著土層深度的增加先降低后增加(P<0.05);A層和B層灌叢內(nèi)的放線菌H′指數(shù)顯著高于灌叢外的數(shù)值(P<0.05),C層數(shù)值相近(P>0.05).

        2.4 土壤微生物群落與環(huán)境之間的關系

        2.4.1 土壤細菌群落與環(huán)境的關系

        對中間錦雞兒灌叢土壤細菌群落與環(huán)境之間的關系進行冗余分析,結果如圖2所示.

        圖2 土壤細菌群落和環(huán)境因子的冗余分析Fig.2 RDA diagram of the relationship between soil bacterial communities and environmental factors

        RDA的直接排序圖顯示,第一軸、第二軸對響應變量的解釋比例分別為56.7%和25.6%,Monte Carlo置換檢驗排序軸均達到顯著水平(第一排序軸:F=9.156,P<0.05;所有排序軸:F=5.147,P=0.002),說明環(huán)境因子能夠顯著影響土壤細菌群落.與第一軸關系最密切的是速效鉀(r=0.706 5),與第二軸關系最緊密的是灌叢(r=0.8467).RDA排序圖結果表明,假單胞菌屬、溶桿菌屬、嗜麥芽窄食單胞菌屬、芽胞桿菌屬、壤霉菌屬、溶桿菌屬、金黃桿菌屬和鞘氨醇桿菌屬與土壤有機質(zhì)、硝態(tài)氮含量呈顯著正相關,但與土壤pH呈顯著負相關.類芽孢桿菌屬與土壤含水量呈顯著正相關,與銨態(tài)氮含量呈顯著負相關.中華根瘤菌屬與銨態(tài)氮含量呈顯著正相關,但與土壤含水量呈顯著負相關.節(jié)桿菌屬與速效磷、速效鉀含量呈顯著正相關,與土壤土壤含水量也呈顯著負相關.

        2.4.2 土壤真菌群落與環(huán)境的關系

        對中間錦雞兒灌叢土壤真菌群落與環(huán)境之間的關系進行冗余分析,結果如圖3所示.

        圖3 土壤真菌群落和環(huán)境因子的冗余分析Fig.3 RDA diagram of the relationship between soil fungal communities and environmental factors

        RDA直接排序圖顯示,第一軸、第二軸對響應變量的解釋比例分別為69.3%和11.3%,Monte Carlo置換檢驗排序軸均達到顯著水平(第一排序軸:F=15.825,P<0.05;所有排序軸:F=8.020,P<0.05).與第一軸關系最密切的是灌叢(r=0.754 7),與第二軸關系最緊密的是硝態(tài)氮含量(r=0.863 1).球毛殼菌屬和木霉屬與硝態(tài)氮含量、速效鉀含量和有機質(zhì)含量呈顯著正相關,與土壤pH呈顯著負相關(P<0.05).小囊菌屬與土壤含水量呈顯著正相關,與速效磷含量呈顯著負相關(P<0.05).疣孢漆斑菌屬與速效磷含量含量、土壤pH呈顯著正相關,與土壤有機質(zhì)含量呈顯著負相關(P<0.05).

        放線菌冗余分析Monte Carlo置換檢驗未達到顯著水平,說明環(huán)境因子對放線菌的影響不顯著.

        3 討論與結論

        本研究對內(nèi)蒙古荒漠草原中間錦雞兒灌叢內(nèi)外的微生物多樣性進行調(diào)查,結果發(fā)現(xiàn),土壤可培養(yǎng)細菌的數(shù)量最多,其次是放線菌,真菌數(shù)量最少,這與多數(shù)研究[12-13]結果一致.土壤微生物的數(shù)量和群落多樣性存在明顯的垂直分布異質(zhì)性.如苦豆子、芨芨草、油蒿等的土壤微生物數(shù)量隨土層加深呈下降趨勢[14-16];小興安嶺的原始紅松林、硬闊葉林和白樺林3種林地的土壤微生物多項多樣性指數(shù)隨著土層深度的增加顯著下降[17].細菌和真菌的豐富度隨土壤深度的增加而下降,而放線菌的豐富度隨土壤深度的增加而增加[18-19].本研究結果表明,中間錦雞兒灌叢的土壤可培養(yǎng)細菌、真菌和放線菌的數(shù)量及H′均表現(xiàn)為表層土或次表層土最大,這主要是因為土壤表層覆蓋有較多的凋落物,凋落物的分解提高了土壤表層養(yǎng)分含量,有利于表層土中土壤微生物的生長.另外,土壤性質(zhì)隨著土層深度的變化而變化,從而影響土壤微生物群落.本研究通過RDA分析發(fā)現(xiàn)土壤速效鉀和硝態(tài)氮均與土壤可培養(yǎng)細菌和真菌的關系密切,說明速效鉀和硝態(tài)氮是影響中間錦雞兒土壤細菌和真菌的主要環(huán)境因素.RDA分析還表明土壤可培養(yǎng)放線菌數(shù)量與環(huán)境因子之間的相關性不顯著,說明環(huán)境變化對放線菌群落的影響不大.中間錦雞兒灌叢內(nèi)的土壤細菌、真菌、放線菌數(shù)量和多樣性均大于灌叢外,這是由于中間錦雞兒灌叢的生長發(fā)育引起土壤資源空間異質(zhì)性,灌叢內(nèi)土壤養(yǎng)分聚集,形成比周圍環(huán)境更適宜的微生境[20-21],從而有利于土壤微生物生長.與灌叢外相比,灌叢內(nèi)的植物多樣性更高,這也會增加土壤有機質(zhì)含量并調(diào)節(jié)土壤含水量,即改善了土壤微生物的生存環(huán)境[22-23].

        在土壤細菌中,Lysobacter含有較高的G+C含量和生物分解活性,能分泌各種抗生素、酶和生物活性物質(zhì),并抑制有害細菌的滋生,控制植物疾病.中間錦雞兒灌叢中,Lysobacter僅出現(xiàn)在灌叢內(nèi)表層,這對中間錦雞兒灌叢具有保護作用.諾卡氏菌能夠在一定程度上指示土壤肥力的高低,諾卡氏菌越多,土壤肥力越高.本研究結果表明諾卡氏菌屬只出現(xiàn)在灌叢內(nèi),也說明了灌叢內(nèi)的土壤肥力高于灌叢外的肥力.

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