馬程遠(yuǎn),關(guān)鍵,張中宏,梁文晉,任俠,王耀林
慢性阻塞性肺疾?。–OPD)是呼吸系統(tǒng)的一種多發(fā)病與常見病,其特征性表現(xiàn)為持續(xù)性呼吸道癥狀、氣流受限;通常氣流受限由有毒顆粒或氣體導(dǎo)致的氣道、肺泡異常所引起。目前COPD的確切發(fā)病機制尚不明確。但導(dǎo)致COPD發(fā)生的危險因素主要為環(huán)境因素與遺傳因素,兩者相互作用。環(huán)境因素包括吸煙、生物燃料煙霧、空氣污染、職業(yè)性暴露等。而遺傳因素也是COPD發(fā)生、發(fā)展重要的內(nèi)在原因。CHO等[1]進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析研究(GWAS)發(fā)現(xiàn)HHIP、FAM13A、CHRNA3、RIN3、MMP12、TGFB2基因與COPD有相關(guān)性。WANG等[2]發(fā)現(xiàn)HHIP基因rs12504628位點與COPD患者第1 秒用力呼氣末容積/用力肺活量比值(FEV1/FVC)具有相關(guān)性,提示在中國漢族人群中HHIP基因與COPD易感性相關(guān)。新疆聚居著維吾爾族、哈薩克族、蒙古族、柯爾克孜族等47個民族,而COPD也是新疆常見疾病。HHIP基因多態(tài)性和新疆蒙古族COPD易感性是否存在相關(guān)性尚未得知。因此,本研究分析新疆蒙古族的COPD患者和健康志愿者的HHIP基因rs1489758、rs1492820位點基因頻率,探討HHIP基因多態(tài)性和新疆蒙古族COPD易感性之間的關(guān)系。
1.1 研究對象 選取2016年1月—2017年6月新疆巴音郭楞蒙古自治州醫(yī)院和新疆博爾塔拉蒙古自治州醫(yī)院診斷為COPD的蒙古族患者259例(病例組),男186例,女73例;平均年齡(69.2±10.5)歲。COPD診斷標(biāo)準(zhǔn):依據(jù)《慢性阻塞性肺疾病診治指南(2013年修訂版)》[3]中的診斷標(biāo)準(zhǔn),有吸煙、環(huán)境污染等高危因素接觸史,臨床癥狀:咳嗽、咳痰、氣喘2年以上,每年持續(xù)3個月以上,需行肺功能檢查;使用支氣管擴(kuò)張藥物后,F(xiàn)EV1/FVC<70%。選取同期體檢中心的體檢健康的蒙古族志愿者245例(對照組),男160例,女85例;平均年齡(67.6±9.8)歲。對照組納入標(biāo)準(zhǔn):無長期咳嗽、咳痰、氣喘病史,肺功能正常(FEV1/FVC≥70%)。排除支氣管擴(kuò)張、支氣管哮喘、肺結(jié)核、肺癌、肺栓塞等呼吸系統(tǒng)疾病。兩組性別、年齡比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=2.48,t=1.77;P=0.12、0.08)。本研究經(jīng)石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn),研究對象均知情同意。
1.2 方法
1.2.1 肺功能測定 研究對象統(tǒng)一使用全自動肺功能測定儀(美國Medgraphics公司),由統(tǒng)一規(guī)范培訓(xùn)的醫(yī)務(wù)人員進(jìn)行檢測。首先將基本資料(如姓名、年齡、性別、身高、體質(zhì)量、人種等)輸入肺功能測定儀,測定研究對象的FEV1占預(yù)計值百分比(FEV1%)、FVC及FEV1/FVC,連續(xù)重復(fù)檢測3次(期間每次間隔休息1 min),選取最大的結(jié)果記錄。
1.2.2 DNA提取 患者均抽取外周靜脈血3 ml,乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝混勻,-80 ℃保存。采用天根生化科技(北京)有限公司提供試劑盒(離心柱型)提取DNA,按照試劑盒說明書進(jìn)行操作。應(yīng)用NanoDrop-2000核酸蛋白測序儀測試DNA濃度及純度。
1.2.3 基因多態(tài)性檢測 (1)引物設(shè)計:根據(jù)GenBank提供的基因序列,應(yīng)用Primer 4軟件對引物進(jìn)行設(shè)計,上述過程由上海天昊生物科技有限公司完成。rs1489758位點引物序列F5'-TTACACTTGCCGAGGCCATATTC-3',R3'-GAAGGCACCAACGAGGAGTTTG-5';rs1492820 位 點引 物 序 列F5'-CCTGCCATGAAGTCCCAATGAG-3',R3'-GCTGCTCACTGAATTTTTCCTGGT-5'。2個 位 點擴(kuò)增長度分別為349 、285 bp。(2)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)擴(kuò)增:PCR反應(yīng)體系(10 μl)包含1×GC-I buffer(Takara.),0.3 mmol/L dNTP,3.0 mmol/L Mg2+,1 U HotStarTaq polymerase(Qiagen Inc.),1 μl樣 本DNA和1 μl多重PCR引物。PCR反應(yīng)條件:預(yù)變性95 ℃2 min。以下過程循環(huán)11次:變性94 ℃ 20 s,退火65℃ 40 s,延伸72 ℃ 1.5 min,循環(huán)每次降低0.5 ℃。以下過程循環(huán)24次:變性94 ℃ 20 s,退火59 ℃ 30 s,延伸 72 ℃ 1.5 min。延伸 72 ℃ 2 min,4 ℃保存。(3)PCR產(chǎn)物純化:在10 μl PCR產(chǎn)物加5 U SAP酶、2 U Exonuclease I酶,37 ℃溫浴1 h,75 ℃滅活15 min。(4)延伸反應(yīng):延伸反應(yīng)體系(10 μl)包含5 μl SNaPshot Multiplex Kit(ABI),2 μl純化多重PCR產(chǎn)物,1 μl延伸引物混合物,2 μl超純水。延伸引物濃度:2個位點均為1.6 μmol/L。延伸過程:變性96 ℃ 1 min;以下過程循環(huán)28次:變性96 ℃ 10 s,退火55 ℃ 5 s,延伸60 ℃ 30 s,4 ℃保存。(5)延伸產(chǎn)物純化:10 μl延伸產(chǎn)物中加入1 U SAP酶,37 ℃溫浴1 h,75 ℃滅活15 min。(6)延伸產(chǎn)物上ABI3730XL測序儀:取0.5 μl純化后延伸產(chǎn)物,0.5μl Liz120 SIZE STANDARD,9 μl Hi-Di混勻,95 ℃變性5 min上ABI3730XL測序儀,采 用 GeneMapper 4.1(AppliedBiosystems Co.,Ltd.,USA)分析數(shù)據(jù)。
1.3 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS 24.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。計量資料以()表示,兩組間比較采用t檢驗,多組間比較用單因素方差分析;計數(shù)資料比較采用χ2檢驗;遺傳平衡檢驗采用Hardy-Weinberg平衡檢驗;采用Logistic回歸分析COPD的影響因素。以p<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 Hardy-Weinberg平衡檢驗 HHIP基因rs1489758、rs1492820位點單核苷酸多態(tài)性(SNP)分型結(jié)果:病例組259例,rs1489758位點分型失敗16例,rs1492820位點分型失敗15例;對照組245例,rs1489758、rs1492820位點分型失敗各1例。rs1489758、rs1492820位點基因型分布符合Hardy-Weinberg遺傳平衡(χ2=2.24、0.61,P=0.13、0.43)。
2.2 病例組HHIP基因rs1489758、rs1492820位點不同基因型患者的肺功能比較 HHIP基因rs1489758、rs1492820位點不同基因型患者的FEV1%比較,差異有 統(tǒng) 計 學(xué) 意 義(p<0.05)。HHIP基 因 rs1489758、rs1492820位點不同基因型患者的FEV1/FVC比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05,見表1、2)。
表1 病例組HHIP基因rs1489758位點不同基因型患者的肺功能比較(,%)Table 1 Comparison of pulmonary function parameters in patients in the case group by the genotype of rs1489758 at the HHIP gene locus
表1 病例組HHIP基因rs1489758位點不同基因型患者的肺功能比較(,%)Table 1 Comparison of pulmonary function parameters in patients in the case group by the genotype of rs1489758 at the HHIP gene locus
注:FEV1%=第1 秒用力呼氣末容積占預(yù)計值百分比,F(xiàn)EV1/FVC=第1 秒用力呼氣末容積與用力肺活量比值
基因型 例數(shù) FEV1% FEV1/FVC GG 171 60.1±8.7 57.0±5.8 GT 67 59.1±8.1 57.7±4.4 TT 5 49.5±5.5 56.5±3.6 F值 4.71 0.47 P值 0.01 0.62
表2 病例組HHIP基因rs1492820位點不同基因型患者的肺功能比較(,%)Table 2 Comparison of pulmonary function parameters in patients in the case group by the genotype of rs1492820 at the HHIP gene locus
表2 病例組HHIP基因rs1492820位點不同基因型患者的肺功能比較(,%)Table 2 Comparison of pulmonary function parameters in patients in the case group by the genotype of rs1492820 at the HHIP gene locus
基因型 例數(shù) FEV1% FEV1/FVC AA 67 57.8±9.3 57.1±6.2 AG 127 60.5±7.6 57.4±5.1 GG 50 58.7±9.6 56.8±5.3 F值 3.13 0.26 P值 0.04 0.77
2.3 HHIP基因rs1489758、rs1492820位點基因型與等位基因分布比較 病例組與對照組HHIP基因rs1489758、rs1492820位點基因型、等位基因分布比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(p<0.05,見表3、4)。
表3 HHIP基因rs1489758位點基因型、等位基因分布比較〔n(%)〕Table 3 Comparison of patterns of genotype and allele frequencies of rs1489758 at the HHIP gene locus
2.4 COPD影響因素的Logistic回歸分析 以是否患COPD(否=0,是 =1)為因變量,以rs1489758位點多態(tài)性(賦值:GG=0,GT=1,TT=2;G=0,T=1)、rs1492820位點多態(tài)性(賦值:AA=0,AG=1,GG=2;A=0,G=1)為自變量,進(jìn)行Logistic回歸分析,結(jié)果顯示,rs1489758位點基因型GT、等位基因T和rs1492820位點基因型GG、等位基因G是發(fā)生COPD的影響因素(p<0.05,見表 5)。
表4 HHIP基因rs1492820位點基因型、等位基因分布比較〔n(%)〕Table 4 Comparison of patterns of genotype and allele frequencies of rs1492820 at the HHIP gene locus
表5 COPD影響因素的Logistic回歸分析Table 5 Logistic regression analysis of COPD
近年研究發(fā)現(xiàn),HHIP基因是COPD的保護(hù)性基因,該基因缺失將增加COPD的風(fēng)險[4]。典型Hedgehog(Hh)信號通路由成熟的Hh配基激活的Hh信號肽(SHh、IHh、DHh)-膜 蛋 白 受 體 PTCH(PTCH1、PTCH2)-跨膜蛋白SMO-融合阻抑蛋白SUFU-核轉(zhuǎn)錄因子Gli(Gli1、Gli2、Gli3)構(gòu)成。脊椎動物細(xì)胞中,無Hh配基時,PTCH阻止SMO轉(zhuǎn)移至纖毛,抑制SMO活性,SUFU與Gli2/3A形成抑制復(fù)合物,Gli2/3A被水解成具有抑制形式的Gli2/3R,抑制下游基因表達(dá)。而成熟的Hh配基和PTCH結(jié)合后,解除PTCH對SMO的抑制,SMO則轉(zhuǎn)移到纖毛上,使Gli2/3A從抑制復(fù)合物上解離,激活下游基因的表達(dá)。研究顯示,異常Hh信號通路會導(dǎo)致腫瘤發(fā)生、發(fā)展,肺癌、肝癌、胃癌、胰腺癌、乳腺癌、前列腺癌等的SHh或IHh轉(zhuǎn)錄上調(diào)[5]。研究發(fā)現(xiàn)Hh配基高表達(dá)對Hh信號通路過度異常激活同樣會造成COPD的發(fā)生、發(fā)展[6]。HHIP基因可以與PTCH競爭結(jié)合Hh配基,負(fù)反饋調(diào)節(jié)Hh信號通路。
近年HHIP基因已成為研究熱點。許多國家對不同種族HHIP基因與COPD關(guān)系進(jìn)行了研究。波蘭315例COPD患者與330例吸煙者對照發(fā)現(xiàn)HHIP基因rs1542725位點多態(tài)性可增加COPD發(fā)?。?]。挪威PILLAI等[8]對823例COPD患者與810例吸煙者對照發(fā)現(xiàn)了HHIP基因rs13118928位點與肺功能FEV1%有關(guān)。中國WANG等[2]對680例COPD患者和687例健康對照者研究,發(fā)現(xiàn)HHIP基因rs12504628位點和FEV1/FVC有相關(guān)性。成芳娟等[9]對HHIP基因多態(tài)性與新疆哈薩克族COPD易感性進(jìn)行研究,結(jié)果顯示rs13118928、rs1828591位點與新疆哈薩克族COPD易感性無相關(guān)性。任俠等[10]對HHIP基因多態(tài)性與新疆維吾爾族COPD易感性進(jìn)行研究,結(jié)果顯示rs1828591、rs12504628位點基因型與FEV1%有關(guān)。本研究采用SNaPshot分型技術(shù)檢測新疆蒙古族259例COPD患者與245例健康志愿者,結(jié)果顯示HHIP基因rs1489758、rs1492820位點與COPD易感性有關(guān)。病例組HHIP基因rs1489758位點基因型GT、等位基因T低于對照組,可能降低發(fā)生COPD的風(fēng)險。病例組HHIP基因rs1492820位點不同基因型GG、等位基因G分布高于對照組,可能增加發(fā)生COPD的風(fēng)險。HHIP基因rs1489758、rs1492820位點基因型與FEV1%有關(guān)。上述國內(nèi)外研究得出部分HHIP基因SNP位點與COPD易感性相關(guān),但同一有關(guān)聯(lián)位點的SNP在不同國家、不同民族的結(jié)果不盡相同[2,7-10]。
HHIP基因SNP位點眾多,本研究根據(jù)GWAS選取了其中的2個(rs1489758、rs1492820),而HHIP基因其他位點與新疆蒙古族COPD易感性的關(guān)系未見報道,其關(guān)系尚不清楚。新疆地廣人稀,交通不便,對樣本收集造成影響,導(dǎo)致總樣本量較少,無法更好闡釋HHIP基因SNP與全部新疆蒙古族COPD易感性關(guān)系。
綜上所述,HHIP基因rs1489758、rs1492820位點多態(tài)性可能與新疆蒙古族COPD的發(fā)生有關(guān)。但今后還需要大樣本、多國家、多民族的病例對照研究,形成更完整的信息數(shù)據(jù)庫,更全面揭示HHIP基因多態(tài)性和COPD易感性的關(guān)系,為未來治療COPD提供新的方向。
作者貢獻(xiàn):馬程遠(yuǎn)進(jìn)行文章的構(gòu)思與設(shè)計、研究的實施與可行性分析、數(shù)據(jù)收集與整理、統(tǒng)計學(xué)處理、結(jié)果的分析與解釋、撰寫論文、論文修訂;關(guān)鍵進(jìn)行研究的實施與可行性分析、論文修訂,負(fù)責(zé)文章的質(zhì)量控制及審校,對文章整體負(fù)責(zé),監(jiān)督管理;張中宏、梁文晉、任俠進(jìn)行研究的實施與可行性分析、數(shù)據(jù)收集與整理、統(tǒng)計學(xué)處理;王耀林進(jìn)行數(shù)據(jù)收集。
本文無利益沖突。