石楠
佛羅里達(dá)州是美國重要的柑橘產(chǎn)區(qū),近年來,柑橘黃龍病對(duì)這里所有的柑橘樹造成了巨大的威脅??茖W(xué)家們正試圖通過一種新技術(shù)對(duì)柑橘的基因進(jìn)行修改,以得到對(duì)黃龍病免疫的柑橘樹種。
正是柑橘成熟的季節(jié),柑橘種植農(nóng)布萊克卻憂心忡忡。他查看著自家的柑橘樹,從樹葉上拂下幾個(gè)小小的灰點(diǎn),那是亞洲柑橘木虱。這種小蟲比一粒米還小,但它們傳播的柑橘黃龍病卻足以毀掉佛羅里達(dá)州整個(gè)柑橘產(chǎn)業(yè)。
從19世紀(jì)50年代開始,布萊克家族就在佛羅里達(dá)州種植柑橘,至今已經(jīng)過了五代。布萊克家族經(jīng)歷過颶風(fēng)、霜凍和害蟲帶來的種種打擊,但在過去十年左右的時(shí)間里,他們眼看著黃龍病變成了最嚴(yán)重的災(zāi)難。
柑橘葉片上長黃斑是柑橘黃龍病的代表性癥狀。在布萊克的柑橘林中,幾乎所有正在結(jié)果的柑橘樹都感染了這種疫病。造成黃龍病的病原體是一種韌皮部桿菌,這種病菌會(huì)入侵并阻塞柑橘樹的韌皮部。韌皮部是植物體內(nèi)運(yùn)輸有機(jī)質(zhì)(主要是糖分)的內(nèi)部管道系統(tǒng),植物葉片光合作用產(chǎn)生的糖分會(huì)通過這些管道運(yùn)到根部、枝干和果實(shí)。當(dāng)柑橘樹的韌皮部被阻斷時(shí),其光合作用和營養(yǎng)供應(yīng)都會(huì)受到巨大的影響。一些柑橘樹可能因此“餓死”,幸存的樹木結(jié)出的果實(shí)也常常是酸澀、畸形的。在1997年,這個(gè)行業(yè)的鼎盛時(shí)期,佛羅里達(dá)州的柑橘種植面積超過4000平方千米,產(chǎn)量高達(dá)2.44億箱。然而,由于黃龍病和“厄瑪”颶風(fēng)的“兩連擊”,2018年該州柑橘的預(yù)期產(chǎn)量僅有4600萬箱,這是自二戰(zhàn)以來產(chǎn)量最低的一年。美國農(nóng)業(yè)部已經(jīng)花費(fèi)了近5億美元來對(duì)抗黃龍病,但至少在目前,美國還不得不從巴西進(jìn)口橙子等柑橘類水果。
除了柑橘以外,很多農(nóng)作物都飽受病蟲害的威脅?,F(xiàn)代農(nóng)業(yè)大多采用單作模式,即在大片土地上種植單一的作物,這些作物在基因上高度相似,便于統(tǒng)一管理和收獲。但這也意味著,當(dāng)疫病發(fā)生時(shí),同種作物會(huì)接連被感染。此外,貿(mào)易全球化也意味著疫病可以傳播得更快更遠(yuǎn),而氣候變化會(huì)影響昆蟲的分布,導(dǎo)致某些地區(qū)出現(xiàn)新的害蟲,帶來新的病原體。另一方面,隨著人口增長,人們對(duì)食物的需求也越來越大,到2050年,全球農(nóng)業(yè)要為100億人提供口糧。而一種新興的基因工程技術(shù)——基因編輯可能是解決這些問題的關(guān)鍵之一。
2005年,美國邁阿密的柑橘首次出現(xiàn)了黃龍病感染,這令全美國的柑橘種植者感到擔(dān)憂。這種來自亞洲的疫病早已臭名昭著,因?yàn)樵缭谝粋€(gè)世紀(jì)前,黃龍病就曾對(duì)中國的柑橘種植業(yè)造成過巨大打擊。隨后,黃龍病在美國蔓延,與此同時(shí),全世界還有幾十個(gè)國家也出現(xiàn)了不同程度的黃龍病疫情。
當(dāng)黃龍病在佛羅里達(dá)州肆虐時(shí),遺傳學(xué)家弗雷德·格米特等科學(xué)家從柑橘行業(yè)組織申請(qǐng)到一筆資金,用以對(duì)柑橘樹的基因進(jìn)行測(cè)序??茖W(xué)家們認(rèn)為,他們也許能從柑橘樹的基因圖譜中找到某種遺傳學(xué)解決方案的思路。在眾多病樹中間,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了一些強(qiáng)大的“幸存者”。這些樹雖然會(huì)被感染,但癥狀較輕,并能結(jié)出健康的果實(shí)。研究人員正試圖找出它們體內(nèi)與抗病性相關(guān)的基因。
當(dāng)他們?cè)?011年發(fā)布第一個(gè)柑橘基因組序列時(shí),測(cè)序技術(shù)的成本已經(jīng)大幅下降。第二年,CRISPR基因編輯技術(shù)誕生了。這項(xiàng)技術(shù)為植物育種帶來了新的可能。
相比以往的轉(zhuǎn)基因技術(shù),基因編輯技術(shù)更加精準(zhǔn)、快捷,而且成本也較低。這一技術(shù)的另一個(gè)優(yōu)勢(shì)是:通過基因編輯,科學(xué)家可以在不引入外源遺傳物質(zhì)的前提下對(duì)植物基因組進(jìn)行修改,這樣就可以繞過轉(zhuǎn)基因這一“雷區(qū)”。
在植物中進(jìn)行基因編輯的難點(diǎn)之一是,怎樣把CRISPR組件導(dǎo)入植物細(xì)胞內(nèi)。過去,科學(xué)家使用農(nóng)桿菌將相關(guān)序列導(dǎo)入植物細(xì)胞中,但這種方法仍然屬于轉(zhuǎn)基因的范疇。最近,研究者開始使用“基因槍”將CRISPR組件直接“射入”細(xì)胞?;驑尲葲]有槍管也沒有扳機(jī),它發(fā)射的“子彈”是納米級(jí)的金粒子??茖W(xué)家將CRISPR組件包裹在金粒子表面,通過基因槍將其高速發(fā)射,這些粒子就會(huì)穿透植物細(xì)胞膜,將CRISPR組件導(dǎo)入細(xì)胞。
經(jīng)過基因編輯的植物細(xì)胞還只是單個(gè)的細(xì)胞,科學(xué)家們使用組織培養(yǎng)技術(shù)將它們培育成一棵棵小苗。這項(xiàng)技術(shù)依賴于植物細(xì)胞的全能性。每個(gè)單獨(dú)的植物細(xì)胞在一定的條件下能發(fā)生脫分化,成為全能的“干細(xì)胞”,并增殖分化成為完整的植株。
在佛羅里達(dá)大學(xué)柑橘研究和教育中心,生物學(xué)家王年和他年輕的團(tuán)隊(duì)正試圖通過基因編輯技術(shù)培育出一種抗黃龍病的柑橘。對(duì)柑橘進(jìn)行基因編輯是一項(xiàng)很有挑戰(zhàn)性的工作,柑橘并不是模式生物,它們的基因組相當(dāng)復(fù)雜。所幸,所有的柑橘屬植物(包括檸檬、柚子、橘子和橙子等)在基因上都非常相似,這意味著相同的基因編輯方案可用于多個(gè)物種。
具有諷刺意味的是,科學(xué)家們還沒能在實(shí)驗(yàn)室里培育出黃龍病的病原體,這使得研究變得更加困難。另一個(gè)障礙是,黃龍病是一種相對(duì)較新的疾病,因此植物自身對(duì)其抵抗力很弱,缺少具有研究價(jià)值的抗病基因。科學(xué)家們研究了柑橘的進(jìn)化史后發(fā)現(xiàn),盡管人類種植柑橘的歷史已有幾千年,但柑橘黃龍病直到最近幾個(gè)世紀(jì)才出現(xiàn)。柑橘類植物還沒能在這么短的時(shí)間內(nèi)發(fā)展出抗病能力,即使是野生的柑橘種類也飽受黃龍病的摧殘。
那么,如果科學(xué)家能對(duì)柑橘這樣復(fù)雜的植物進(jìn)行基因編輯,他們的經(jīng)驗(yàn)對(duì)其他作物的基因編輯也會(huì)很有用。王年團(tuán)隊(duì)在過去的一年取得了重大突破,他們已經(jīng)確定了13種可能導(dǎo)致柑橘易感染黃龍病的潛在基因?,F(xiàn)在,他們正用基因編輯技術(shù)來敲除這些基因。研究人員并不知道哪個(gè)或者哪幾個(gè)基因是抵抗黃龍病的關(guān)鍵,因此,他們嘗試了所用可能的組合。
經(jīng)過基因編輯的植株都先被放置在培養(yǎng)間。在這個(gè)略顯擁擠的小房間中,植物生長燈照亮了架子上一排排培養(yǎng)皿和培養(yǎng)瓶。這些小小的瓶子里可能裝著柑橘種植業(yè)救星,但答案要在幾年后才能揭曉。
柑橘樹需要數(shù)年才能達(dá)到成熟期。在編輯了柑橘樹的基因組后,研究人員將不得不耐心等待小樹苗長大。兩年之后,他們才能將植物暴露在柑橘黃龍病中。只有到那時(shí),研究人員才知道這棵樹是否對(duì)其具有免疫力。即便這一步取得了成功,他們還得再等上幾年才能讓抗病植株結(jié)出果實(shí),以確保果實(shí)風(fēng)味不減。
盡管距離培養(yǎng)出抗黃龍病柑橘還有很長時(shí)間,但這項(xiàng)工作已經(jīng)給柑橘種植業(yè)帶來了一些希望。培養(yǎng)瓶中的小苗長大后就會(huì)被種在溫室里。溫室里有一棵健康的葡萄柚樹,這是經(jīng)過基因編輯的抗柑橘潰瘍?。ㄒ环N危害較大的柑橘疫?。┑闹仓辍?h3>轉(zhuǎn)基因、基因編輯與農(nóng)業(yè)的未來
據(jù)估計(jì),到2050年全世界總?cè)丝趯⑦_(dá)到97億,更多的人口意味著對(duì)衣食住行更多的需求,而其中最基本的就是食物。舉例而言,到2050年,全球糧食產(chǎn)量至少要比現(xiàn)在增加一倍,才能喂飽那么多人。
另一方面,氣候變化會(huì)給農(nóng)作物生產(chǎn)造成更多障礙。越來越多極端天氣的出現(xiàn)將給農(nóng)作物生長帶來重重困難;而由于氣候變暖,生活在溫暖地帶的昆蟲和病菌可能會(huì)擴(kuò)散到原本較為寒冷的地帶,帶來更多植物病蟲害。
面對(duì)這樣的困境,我們必須采取一系列措施,比如改進(jìn)農(nóng)業(yè)管理技術(shù),培育高產(chǎn)抗病的新品種作物等。隨著分子生物學(xué)的進(jìn)步,基因工程育種已成為頗具潛力的育種方法。
然而,轉(zhuǎn)基因育種的發(fā)展并非一帆風(fēng)順。除了本身的技術(shù)難題和成本問題外,公眾對(duì)轉(zhuǎn)基因技術(shù)的不信任也是一大阻礙。轉(zhuǎn)基因作物的推廣不太順利,傳統(tǒng)的育種方法又過于低效,科學(xué)家不得不開始考慮其他的育種方法。最近,很多育種專家把目光投向了正在蓬勃發(fā)展的基因編輯技術(shù)。
很多人對(duì)轉(zhuǎn)基因作物抱著懷疑甚至抗拒的態(tài)度。但實(shí)際上,轉(zhuǎn)基因作物的加工制品在我們的日常生活中隨處可見。以美國為例,美國種植的玉米和大豆大部分都是轉(zhuǎn)基因品種,而這兩種作物被廣泛用于食品工業(yè)。大豆油、大豆蛋白、玉米淀粉、玉米糖漿等常見的食品原料通常都是由轉(zhuǎn)基因作物制成的。制造奶酪的凝乳酶也來自經(jīng)過基因改造的微生物。
轉(zhuǎn)基因玉米和大豆早在20世紀(jì)90年代中期就在美國上市。最初對(duì)轉(zhuǎn)基因作物的反對(duì)聲音來自種植這些作物的農(nóng)民,他們的不滿主要是針對(duì)生產(chǎn)轉(zhuǎn)基因種子的企業(yè)而非轉(zhuǎn)基因本身。因?yàn)檫@些企業(yè)提高了種子和農(nóng)藥售價(jià),并實(shí)施過度嚴(yán)苛的專利保護(hù)政策,很多農(nóng)民頗有怨言。后來,一些普通民眾也對(duì)轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物產(chǎn)生了不滿和質(zhì)疑。
美國國家科學(xué)院在2016年發(fā)布的一份大規(guī)模研究報(bào)告表明,轉(zhuǎn)基因作物是安全的,且與常規(guī)作物的營養(yǎng)價(jià)值沒有差別。但公眾對(duì)轉(zhuǎn)基因的認(rèn)識(shí)還很模糊。就在2016年,美國一項(xiàng)民意調(diào)查顯示,絕大多數(shù)人表示轉(zhuǎn)基因沒有什么了解;大約一半人不確定他們是否吃過轉(zhuǎn)基因食品;雖然有16%的人表示自己對(duì)轉(zhuǎn)基因生物十分關(guān)心,但他們的看法基本上是負(fù)面的。
市場營銷助長了公眾對(duì)轉(zhuǎn)基因的偏見。美國一些超市有“非轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品”專區(qū),很多食品的包裝上也貼著“非轉(zhuǎn)基因”的標(biāo)簽——盡管大多數(shù)農(nóng)作物根本沒有轉(zhuǎn)基因的品種。食品生產(chǎn)商將“非轉(zhuǎn)基因”視為一種宣傳口號(hào),這就是為什么有“非轉(zhuǎn)基因天然鹽”這樣的產(chǎn)品出現(xiàn)的原因,而顯然,氯化鈉根本沒有DNA。這就是一種營銷的噱頭,不算高明但很有效。
很多科學(xué)家相信,轉(zhuǎn)基因育種有可能解決從作物病蟲害到農(nóng)藥濫用等各種問題。但消費(fèi)者的態(tài)度也影響了農(nóng)民對(duì)作物品種的選擇,盡管美國監(jiān)管部門不要求對(duì)轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品做特別標(biāo)示,農(nóng)民也不愿意冒險(xiǎn)種植消費(fèi)者可能不喜歡的作物。
近幾年,基因編輯技術(shù)飛速發(fā)展,給作物育種帶來新的希望。常規(guī)的轉(zhuǎn)基因技術(shù)通常涉及在作物基因組內(nèi)插入來自完全不同物種的DNA,且插入位點(diǎn)無法控制,而基因編輯則可以針對(duì)特定位點(diǎn)對(duì)作物基因組進(jìn)行精確可控的修改。經(jīng)過基因編輯的作物,既不含其他物種的基因,其基因組與常規(guī)作物的基因組也只有微小的差別。在自然條件下,植物體內(nèi)也會(huì)發(fā)生基因突變、缺失和重組,基因編輯從結(jié)果上看和這些自然變異是類似的,只是省去了人工篩選的程序。
2016年4月,美國農(nóng)業(yè)部(USDA)為第一批CRISPR編輯作物開了綠燈,包括一種能抵御褐變的蘑菇和一種不含直鏈淀粉、只有支鏈淀粉的糯玉米。在此之前,已經(jīng)有一些通過其他技術(shù)“編輯”過的作物獲批上市。美國農(nóng)業(yè)部在一系列文件中解釋道,這些新型基因編輯作物不需要作為轉(zhuǎn)基因生物(GMO)進(jìn)行管理,因?yàn)樗鼈兣c傳統(tǒng)培育的植物基本上沒有區(qū)別。
相比轉(zhuǎn)基因大國美國,歐洲各國對(duì)基因編輯的態(tài)度要謹(jǐn)慎得多。一些歐洲國家對(duì)轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品有著嚴(yán)格限制,盡管目前這些國家的政府對(duì)農(nóng)作物基因編輯采取不干預(yù)的態(tài)度,但一些民眾認(rèn)為,政府應(yīng)該像對(duì)轉(zhuǎn)基因作物一樣對(duì)基因編輯作物進(jìn)行嚴(yán)格監(jiān)管。
基因編輯技術(shù)能否擺脫“轉(zhuǎn)基因”的陰影?它會(huì)對(duì)未來的農(nóng)業(yè)產(chǎn)生多大的影響?現(xiàn)在看來還都是未知數(shù)。
CRISPR/Cas系統(tǒng)是目前最常用的基因編輯工具,它是一種存在于很多原核生物(細(xì)菌、古菌)中的一種后天免疫系統(tǒng)。當(dāng)細(xì)菌被病毒侵染時(shí),它們會(huì)把入侵者的DNA片段整合在自己基因組的CRISPR序列中,作為“通緝照片”。當(dāng)同樣的病毒再次“入侵”時(shí),細(xì)菌就能迅速識(shí)別這段序列,并轉(zhuǎn)錄出一種特殊的RNA(crRNA),引導(dǎo)Cas蛋白在特定位置剪切病毒的DNA,使其失活。
2012年,美國生物學(xué)家詹妮弗·杜德納與法國生物學(xué)家埃馬紐埃爾·卡彭蒂耶聯(lián)合進(jìn)行了一項(xiàng)研究,她們利用人工合成的crRNA序列和一種Cas蛋白(Cas9),在體外進(jìn)行了DNA序列的精準(zhǔn)剪切。隨后,對(duì)基因編輯的研究突飛猛進(jìn)?,F(xiàn)在,科學(xué)家已經(jīng)可以利用CRISPR/Cas系統(tǒng)精確地在動(dòng)植物基因組中定位和修改特定的基因。