金歡煥 陳少云
(浙江中醫(yī)藥大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,浙江杭州 310053)
糖苷酶(Glycoside hydrolases, GH, EC 3.2.1),又稱(chēng)糖苷水解酶,廣泛存在于生物體中,在自然界糖苷鍵的水解過(guò)程中扮演著非常重要的角色。糖苷酶作為一類(lèi)重要的化合物,在食品、醫(yī)療、工業(yè)等領(lǐng)域都有著十分廣泛的利用價(jià)值。但目前已知存在的糖苷酶大多數(shù)都存在酶活力低的問(wèn)題,且該酶來(lái)源十分匱乏。因此,尋找天然產(chǎn)耐有機(jī)溶劑糖苷酶的微生物顯得尤為重要。本實(shí)驗(yàn)采用含有機(jī)溶劑的培養(yǎng)基,篩選能產(chǎn)耐有機(jī)溶劑糖苷酶的微生物,并對(duì)所得微生物進(jìn)行生物學(xué)鑒定,優(yōu)化產(chǎn)酶條件,為進(jìn)一步的研究和應(yīng)用提供酶源和基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
1.1.1 主要設(shè)備與材料
臺(tái)式高速冷凍離心機(jī),德國(guó)希格瑪離心機(jī)有限公司,singma3K15型;PCR自動(dòng)系列化分析儀,德國(guó)耶拿分析儀,Tpersonal型;瓊脂糖水平電泳儀,北京市六一儀器廠,DYCP-32A型。
浙江臺(tái)州路橋某家化工企業(yè)所排污水長(zhǎng)期污染過(guò)的土樣。羧甲基纖維素鈉(CM C-N a)、N,N-二甲基甲酰胺(DMF)、對(duì)硝基苯酚-p-D-葡萄糖苷、HEPES。
1.1.2 培養(yǎng)基
富集培養(yǎng)基:羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)10.0 g/L,DMF 5%,胰蛋白胨25.0 g/L,酵母提取物3.0 g/L,NaCl 5.0 g/L,KHPO3.0 g/L,KHPO1.0 g/L,微量元素液100 mL/L(MgSO·7HO 0.3g,F(xiàn)eSO·7HO 0.005 g,CaCl0.005g,溶于100 ml蒸餾水中),pH 7.0。
初篩培養(yǎng)基:將富集培養(yǎng)基中的胰蛋白胨替換成(NH)SO5.0 g/L。
圖1 產(chǎn)耐有機(jī)溶劑糖苷酶微生物顯微形態(tài)
圖2 菌株ZXS的16SrDNA序列比對(duì)
圖3 不同因素對(duì)酶活力的影響
復(fù)篩液體培養(yǎng)基:羧甲基纖維素鈉(CM C-Na)10.0 g/L,蛋白胨 3.0 g/L,酵母提取物2.0 g/L,DMF 5%,(NH)SO5.0 g/L,NaCl 5 g/L,KHPO3 g/L,KHPO1.0 g/L,微量元素溶液100 mL/L,pH 7.0。1.2 方法
1.2.1 富集培養(yǎng)
將采集的土壤懸浮在裝有90 mL已滅菌的生理鹽水的錐形瓶中,在180 r/min,30 ℃條件下的搖床中震蕩30 min,取部分菌液轉(zhuǎn)移到富集液體培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng),然后重復(fù)轉(zhuǎn)接2次。
1.2.2 初篩
選擇有明顯的微生物生長(zhǎng)的富集培養(yǎng)液,取部分富集培養(yǎng)液涂布于初篩固體培養(yǎng)基上,30 ℃恒溫箱中培養(yǎng)24 h,觀察平板上微生物生長(zhǎng)情況。
1.2.3 復(fù)篩及酶活測(cè)定
從初篩培養(yǎng)基中挑取明顯生長(zhǎng)的單菌落于復(fù)篩液體培養(yǎng)基中培養(yǎng),然后取菌懸液離心收集菌體,再用等體積的50 mM HPPES(pH7.0)緩沖液重懸,制得菌懸液,以對(duì)硝基苯酚葡萄糖苷為底物,測(cè)其糖苷酶活力大小。
1.2.4 菌種鑒定
分離純化菌種,觀察純種菌種的菌落形態(tài),包括菌落大小,顏色,濕度,邊緣等;用革蘭氏染色,用顯微鏡觀察細(xì)菌形態(tài);根據(jù)試劑盒提取基因組DN A,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增(50 μl的體系:去離子水21 μl,PrimeSTAR MAX Premix 25 μl,基因組1 μl,引物pF-rRNA和pR-rRNA各1.5 μ l),瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR結(jié)果。接著對(duì)PCR產(chǎn)物割膠回收,利用割膠回收試劑盒純化基因組以及回收基因組。最后,進(jìn)行測(cè)序,在基因庫(kù)進(jìn)行比對(duì),制作進(jìn)化樹(shù)。
2.1.1 形態(tài)鑒定
對(duì)微生物進(jìn)行革蘭氏染色,并在顯微鏡下觀察其染色情況以及形態(tài),實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖1所示,微生物革蘭氏染色呈紫色,所以該微生物屬于革蘭氏陽(yáng)性菌,并且微生物的形態(tài)呈桿狀,桿狀比較短,屬于短桿菌類(lèi)。
2.1.2 分子生物學(xué)鑒定
通過(guò)提取基因組,再進(jìn)行PCR,瓊脂糖凝膠電泳后進(jìn)行割膠回收純化基因,并將片段收回用于測(cè)序。經(jīng)過(guò)序列比對(duì),得出該微生物的生長(zhǎng)進(jìn)化樹(shù)如圖2所示。經(jīng)過(guò)序列比對(duì)得出該微生物與Enterobacter cloacae(陰溝腸桿菌)一類(lèi)序列最為接近。
2.2.1 反應(yīng)溫度對(duì)酶活力的影響
對(duì)于反應(yīng)溫度進(jìn)行優(yōu)化,分別考察了20、25、30、35、37、40 ℃條件下微生物ZXS的產(chǎn)酶活力,每個(gè)條件都進(jìn)行3次平行重復(fù)試驗(yàn)。結(jié)果如圖3(A)所示,隨著反應(yīng)溫度的不斷升高,該酶活力先升高達(dá)到最大值后再降低,其中在溫度為35 ℃時(shí)產(chǎn)酶效果最佳。
2.2.2 反應(yīng)體系pH值對(duì)酶活力的影響
對(duì)于反應(yīng)體系中的p H進(jìn)行優(yōu)化,分別在p H為5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0的條件下進(jìn)行考察,每個(gè)條件進(jìn)行3次平行重復(fù)試驗(yàn),再檢測(cè)微生物ZXS的產(chǎn)酶活力。結(jié)果如圖3(B)所示,隨著pH的變化酶活力也在不斷地變化,總體趨勢(shì)是隨著pH的不斷增大,酶活力呈現(xiàn)上升趨勢(shì),其中pH為7.0和10.0時(shí)酶活力達(dá)到最高,接近相等,所以該菌株在一定程度上具有耐受堿性能力,并且在pH 5.0~10.0之間時(shí),此酶的催化活力都相對(duì)較穩(wěn)定。
2.2.3 DMF濃度對(duì)酶活力的影響
對(duì)于反應(yīng)體系中有機(jī)溶劑試劑DMF的含量進(jìn)行考察,分別選取了不含DMF試劑,含5%、10%、15%、20%DMF的反應(yīng)體系進(jìn)行反應(yīng),每個(gè)條件進(jìn)行3次平行重復(fù)試驗(yàn),再檢測(cè)微生物ZXS的產(chǎn)酶活力。結(jié)果如圖3(C)所示,隨著DMF濃度的升高,菌株的產(chǎn)酶性能逐漸減弱,但并沒(méi)有完全抑制酶活力,所以總體上D MF對(duì)該酶的酶活力有一定的抑制作用。
2.2.4 不同有機(jī)溶劑對(duì)酶活力的影響
對(duì)于微生物ZXS的耐有機(jī)溶劑性能進(jìn)行考察,在反應(yīng)體系中分別含有10%的DMF、二甲基亞砜(DMSO)、無(wú)水乙醇的條件下進(jìn)行催化反應(yīng),每個(gè)條件進(jìn)行3次重復(fù)試驗(yàn),再檢測(cè)微生物ZXS的產(chǎn)酶活力。結(jié)果如圖3(D)所示,該菌株在相同條件下對(duì)二甲基亞砜的耐受力更好,對(duì)無(wú)水乙醇的耐受力最差。
本實(shí)驗(yàn)篩選得到1株產(chǎn)耐有機(jī)溶劑糖苷酶的微生物,命名為ZXS,屬于Enterobacter cloacae(陰溝腸桿菌)類(lèi)革蘭氏陽(yáng)性菌株。該菌株在無(wú)有機(jī)溶劑的情況下酶活最高達(dá)到40.2U/L。經(jīng)進(jìn)一步對(duì)其產(chǎn)酶條件的優(yōu)化,菌株培養(yǎng)8h后,在反應(yīng)溫度為35℃,pH為7.0,DMF含量為5%時(shí),酶活力最高達(dá)到25.9U/L。
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