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        低深度高通量測序技術在早期流產中的應用

        2018-06-14 03:57:16羅家宏
        實用中西醫(yī)結合臨床 2018年4期
        關鍵詞:深度

        羅家宏

        (廣東省江門市婦幼保健院醫(yī)學遺傳中心 江門529000)

        隨著環(huán)境變化及社會壓力的增加,早期流產發(fā)病率呈逐年增加的趨勢。相關臨床研究顯示[1],早期流產多因染色體異常所致,占比率高達近60%。常規(guī)染色體分析是診斷早期流產的金標準,但其對樣本、操作流程的要求較高,檢出率也往往較低[2]。低深度高通量測序技術可在24 h內對機體的23對染色體進行堿基信息分析,可發(fā)現(xiàn)微量染色體缺失、重排等[3]。本研究觀察低深度高通量測序技術在早期流產中的應用。現(xiàn)匯報如下:

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 將2017年1月~2018年1月我院收治的265例早期流產患者(99例染色體核型異常)作為研究對象,本研究經(jīng)醫(yī)院倫理委員會批準。患者年齡 20~42歲,平均(26.68±6.26)歲;孕周6~28周,平均(13.36±2.14)周。入組標準:超聲檢查顯示胚胎停止發(fā)育者;患者均簽署檢查同意書;無妊娠期感染者;無有害物質接觸者。排除標準:患者未簽署檢查同意書;妊娠合并感染者;伴有害物質接觸者;臨床資料不完整或失訪者。

        1.2 治療方法 清宮術后取患者絨毛組織或胚胎組織10 mg,提取患者DNA,采用紫外分光光度計測定DNA純度濃度,瓊脂糖電泳測定DNA片段的完整性。取50 ng基因組DNA,隨機打斷,末端修復,加A連接進行構建,測定DNA片段定量濃度及純度,采用Bioelectron SEQ 3000基因測序進行低深度高通量測序技術分析,后將數(shù)據(jù)進行生物信息分析,序列對比軟件對染色體進行核型異常判斷。

        1.3 觀察項目 記錄分析染色體異常的類型及檢出率情況。

        1.4 統(tǒng)計學方法 采用SPSS22.0軟件分析觀察項數(shù)據(jù),采用百分率(%)表示數(shù)據(jù),計數(shù)資料通過χ2檢驗表示。P<0.05為有統(tǒng)計學差異。

        2 結果

        2.1 99例低深度高通量基因測序異常結果 265例早期流產患者中出現(xiàn)99例染色體核型異常者,發(fā)生率為37.36%,低深度高通量測序技術對染色體核型異常的檢出99例,檢出率為100.0%。其中染色體異常核型分布:16三體12例(12.12%)、13三體6例(6.06%)、21三體 9例(9.09%)、2三體 3例(3.03%)、3三體4例(4.04%)、8三體3例(3.03%)、10三體4例(4.04%)、22三體3例(3.03%)、常染色體缺失或 重 排 27例 (27.27%)、45,X 21例(21.21%)、47,XYY 3 例 (3.03%)、47,XXX 4 例(4.04%)。見表1。

        表1 99例低深度高通量基因測序異常結果(%)

        2.2 染色體核型異常不同檢測方法比較 低深度高通量測序對核型異常檢出率為100.00%,顯著高于常規(guī)染色體分析的74.75%(P<0.05),差異具有統(tǒng)計學意義。見表2。

        表2 染色體核型異常不同檢測方法比較

        3 討論

        早期流產是威脅婦女健康與安全的妊娠病理性疾病,胎盤染色體異常是引起妊娠期胚胎停止發(fā)育的關鍵因素之一,染色體異常所致的自然流產率高達60%,嚴重影響其生存質量[4]。以往臨床上主要采用常規(guī)染色體核型分析檢測技術對早期流產患者組織進行分析,但其對樣本處理的要求較高,操作較為復雜,培養(yǎng)時間也較長,同時具有一定程度的培養(yǎng)失敗率[5]。因此,尋找敏感性高、簡便迅速的染色體異常檢測方法對指導臨床妊娠具有較高的價值。

        本研究觀察低深度高通量測序技術在早期流產中的應用,其結果顯示:265例早期流產患者中出現(xiàn)99例染色體核型異常者,發(fā)生率為38.67%;其中染色體異常核型分布:16三體12例(12.12%)、13三體 6例(6.06%)、21三體 9例(9.09%)、2三體 3例(3.03%)、3三體4例(4.04%)、8三體3例(3.03%)、10三體4例(4.04%)、22三體3例(3.03%)、常染色體缺 失 或 重 排 27例 (27.27%)、45,X 21例(21.21%)、47,XYY 3 例 (3.03%)、47,XXX 4 例(4.04%)。低深度高通量測序對核型異常檢出率為100.00%顯著高于常規(guī)染色體分析的74.75%,比較具有統(tǒng)計學差異(P<0.05)。因此,低深度高通量測序技術較常規(guī)染色體分析對早期流產患者基因組信息的檢出率較高。這一結果與國內相關研究相一致[6~7]。低深度高通量測序技術具有較高的檢測能力,其可將上萬個測序技術在同一個平臺進行。結合生物學信息,可一次性檢測23對染色體,同時可發(fā)現(xiàn)100 kb染色體缺失或重排等,從而避免常規(guī)染色體核型分析的細胞培養(yǎng),對樣本要求低,取材也較為方面,重復檢測率也較高。本研究發(fā)現(xiàn),通過低深度高通量測序技術對染色體三體的檢出率較高,這可能與孕婦卵巢功能老化,黃體酮水平降低,卵泡紡錘體減弱,從而引起卵細胞在有絲分裂過程中出現(xiàn)錯誤、分離,染色體三倍體的發(fā)生率也較高。

        綜上所述,低深度高通量測序技術較常規(guī)染色體分析對早期流產患者基因組信息的檢出率較高,值得臨床應用和推廣。

        [1]乞艷華,余珊珊,李小鵬,等.孕早期流產物的高通量測序研究[J].山西醫(yī)科大學學報,2017,48(3):271-275

        [2]楊小風,郭婷婷,歸婧,等.高通量測序技術對自然流產的遺傳學價值[J].河南醫(yī)學高等??茖W校學報,2017,29(2):110-113

        [3]張麗,謝嵐,謝紅敏.基于高通量測序技術的78例稽留流產絨毛染色體分析[J].山西醫(yī)藥雜志,2017,46(12):1467-1468

        [4]張玲,邸玥瑩,梅俊,等.基因測序技術在早期自然流產病因診斷中的應用研究[J].中國優(yōu)生與遺傳雜志,2016,24(1):12-13

        [5]周麗穎,余蘭,梁毓,等.自然流產遺傳病因的高通量測序檢測[J].中國優(yōu)生與遺傳雜志,2016,24(8):35-36

        [6]井宣,崔向榮,霍凱,等.高通量測序胚胎植入前遺傳學篩查在復發(fā)性流產患者中的應用[J].中國優(yōu)生與遺傳雜志,2016,24(9):89-91

        [7]張影,向卉芬,徐祖瀅,等.高通量測序技術在復發(fā)性流產病因診斷中的應用[J].中華生殖與避孕雜志,2018,38(2):127-130

        [8]曾湘暉,王莉云,熊正方,等.ART助孕后稽留流產胚胎/胎兒組織采用高通量基因測序技術測定染色體的研究[J].中國優(yōu)生與遺傳雜志,2017,25(12):26-29

        [9]方有燕,吳歡,賀小進,等.高通量基因測序技術在自然流產胎兒絨毛染色體的核型分析[J].安徽醫(yī)科大學學報,2018,35(2):266-270

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