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        海洋放線菌酰胺酶AM合成基因的克隆

        2018-06-06 08:30:37馬艷玲李海賢劉澤璇許小慶
        現(xiàn)代食品 2018年1期
        關鍵詞:放線菌條帶克隆

        ◎ 馬艷玲,李海賢,翁 萍,劉澤璇,許小慶,曾 榮

        (佛山科學技術學院食品科學與工程學院,廣東 佛山 528231)

        放線菌與人類的生產(chǎn)和生活息息相關,是很多天然藥物和生物活性物質(zhì)的重要來源[1]。海洋放線菌產(chǎn)生了許多具有特殊化學結(jié)構(gòu)以及特殊生理活性和生理功能的物質(zhì)[2]。盡管海洋放線菌的類群和數(shù)量都非??捎^,但很多研究者使用經(jīng)典的分離培養(yǎng)方法培養(yǎng)卻失敗了[3]。近年來,從海洋放線菌中陸續(xù)發(fā)現(xiàn)的SalinosporamideA等一系列新的活性化合物,均可證明海洋是一個具有極大地潛力的資源寶庫[4-7]。因此,本研究旨在以稀有海洋放線菌Salinispora arenicola CNS-205為實驗材料,克隆出海洋放線菌酰胺酶AM的完整基因,以為該基因簇的功能研究奠定基礎。

        1 試驗材料與方法

        1.1 試驗材料

        1.1.1 菌種來源

        海洋放線菌Salinispora CNS-205分子生物學實驗室保存。

        1.1.2 主要試劑

        大腸桿菌DH10B;限制性內(nèi)切酶NdeI和EcoRI;DNA分子標準量marker;DNA聚合酶。DNA提取試劑盒,T4DNA連接酶,凝膠回收試劑盒,質(zhì)粒小提試劑盒等,均購買自天根生化科技(北京)有限公司;其余均為國產(chǎn)分析純試劑。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 重組質(zhì)粒的構(gòu)建

        PCR反應體系:H2O 28.5 μL,5×FAST HiFidelity PCR Buffer 10 μL,20×FAST PCR Enhancer 2.5 μL,DMSO 2 μL,Template 2 μL,PrimerL 2 μL,PrimerR 2 μL,F(xiàn)AST HiFidelity polymerase 1 μL。PCR 程序:升溫90 ℃,2 min;DNA變性95 ℃,30 s;退火53 ℃,30 s;延伸72 ℃,2 min;30個循環(huán)后,72 ℃維持10 min,電泳。PCR產(chǎn)物的片段為雙鏈平末端,需通過酶切的方式將黏性末端暴露出來。酶切反應體系如下(50 μL反應體系):

        然后放入37 ℃水浴鍋中水浴2 h,經(jīng)膠回收后的PCR產(chǎn)物連入pUC-18載體。

        酶連體系(20 μL反應體系):

        1.2.2 酶切驗證

        用EcoRI和NdeI酶切,酶切反應體系如下(10 μL反應體系):

        2 試驗結(jié)果與分析

        2.1 目的基因的PCR擴增

        以海洋放線菌總DNA為模板,用上述引物進行擴增,再EcoRI和NdeI酶切回收。原PCR產(chǎn)物的目的條帶應位于大約1 800 bp處,如圖1所示。

        圖1 PCR電泳圖

        2.2 重組質(zhì)粒的驗證

        圖2中第一個條帶約在2 700 bp左右,為載體的酶切條帶;第二個條帶位于1 800 bp左右,為目的基因的酶切條帶。得出該重組質(zhì)粒后,測序委托南京金斯瑞生物科技有限公司完成。

        圖2 酶切驗證圖

        3 討論

        酰胺酶的?;D(zhuǎn)移活性能催化底物生成其相對應的異羥肟酸,異羥肟酸可作為食品添加劑、生長因子、抗白血病、抗肺結(jié)核病、腫瘤抑制因子等藥物,是極為重要的可用于化學治療的物質(zhì),具有重要的生物學活性。其金屬離子的螯合作用還可以為微生物所吸收利用,在金屬離子匱乏的環(huán)境中具有重要的意義[8]。

        [1]W Fenical,PR Jensen. Developing a new resource for drug discovery: marine actinomycete bacteria[J].Nature Chemical Biology,2006,2(12):666-673.

        [2]侯艷華.四株海洋放線菌遺傳轉(zhuǎn)化體系的研究[D].青島:中國科學院研究生院,2006.

        [3]田 新,朋張偲,李文均.海洋放線菌研究進展[J].微生物學報,2011,51(2):161-169.

        [4]馬艷玲.海洋放線菌基因組文庫的構(gòu)建和功能基因的克隆及序列分析[D].武漢:華中師范大學,2011.

        [5]B Bister,D Bischoff,M Str?bele,et al.Abyssomicin C-A polycyclic antibiotic from a marine Verrucosispora strain as an inhibitor of the paminobenzoic acid / tetrahydrofolate biosynthesis pathway[J].Angewandte Chemie International Edition,2004,43(19):2574-2576.

        [6]HC Kwon,CA Kauffman,PR Jensen,etal.Marinomycins A-D, antitumor-antibiotics of a new structure class from a marine actinomycete of the recently discovered genus “Marinispora”[J].ChemInform,2006,128(24):16410.

        [7]宋亞鵬.丙烯酰胺神經(jīng)毒性機制研究進程[J].畜牧獸醫(yī)雜志,2010,29(2):43-45.

        [8]韓嘉媛.丙烯酰胺的毒性研究[J].衛(wèi)生研究,2006,35(4):513-515.

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