亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        2016—2017年廣西4種野生鳥類新城疫病原學(xué)檢測(cè)與遺傳進(jìn)化分析

        2018-05-09 06:12:05謝麗基謝芝勛羅思思鄧顯文謝志勤黃嬌玲曾婷婷張艷芳張民秀
        中國(guó)動(dòng)物檢疫 2018年5期

        謝麗基,謝芝勛,羅思思,鄧顯文,謝志勤,王 盛,黃嬌玲,曾婷婷,張艷芳,范 晴,張民秀

        (廣西壯族自治區(qū)獸醫(yī)研究所,廣西獸醫(yī)生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣西南寧 530001)

        新城疫(Newcastle disease,ND)是由新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)引起的,以感染禽類為主的一種急性、烈性傳染病[1]。盡管NDV只有1個(gè)血清型,但不同毒株間的生物學(xué)特性存在明顯差異。根據(jù)NDV F基因高變區(qū)序列差異,可將毒株分為兩類:Ⅰ類(ClassⅠ)和Ⅱ類(ClassⅡ)[2-3]。Ⅱ類NDV流行時(shí)間較長(zhǎng),至少包括18個(gè)基因型。導(dǎo)致世界各國(guó)ND大流行的強(qiáng)毒株和常用弱毒疫苗株均屬于此分支[4-5]。

        與Ⅱ類相比,Ⅰ類NDV出現(xiàn)較晚。我國(guó)2008年后陸續(xù)檢測(cè)和分離到了Ⅰ類 NDV[6-7]。雖然研究表明所有Ⅰ類NDV均為無毒或弱毒株,但已有學(xué)者證實(shí)Ⅰ類NDV可通過在雞或雞胚中連續(xù)傳代增強(qiáng)毒力[8-9]。野鳥是NDV的自然儲(chǔ)存宿主,可作為病毒的傳播媒介,隨自然遷徙將病毒傳染給家禽,導(dǎo)致家禽ND的暴發(fā)[10]。新疆、吉林、湖南和陜西等地對(duì)野生鳥類進(jìn)行了ND監(jiān)測(cè),探索了野生鳥類與家禽NDV感染的區(qū)別和聯(lián)系,通過分析NDV遺傳進(jìn)化情況,預(yù)測(cè)了家禽NDV感染的流行趨勢(shì),為ND防治提供了理論依據(jù)[10-15]。

        廣西是鳥類的主要遷徙地,同時(shí)擁有龐大的野生鳥類資源[16],因此有必要對(duì)廣西野鳥攜帶的Ⅰ類和Ⅱ類NDV都進(jìn)行監(jiān)測(cè)。本研究于2016—2017年在廣西采集4種野生鳥類的口咽/泄殖腔棉拭子樣本進(jìn)行病毒分離鑒定,并對(duì)分離毒株進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析,從而為科學(xué)防控ND提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 主要試劑

        病毒基因組RNA/DNA快速純化試劑盒和DNA片斷膠回收試劑盒:購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司;Prime Script II 1stStrand cDNA Synthesis Kit、Premix Ex TaqTM試劑盒和PMD18-T試劑盒:購(gòu)自大連寶生物公司。

        1.2 樣品和SPF雞胚

        樣品:采自2016—2017年廣西野生動(dòng)物救護(hù)中心收容和救護(hù)的4種野鳥;SPF雞胚:購(gòu)自北京梅里亞維通實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司,由本實(shí)驗(yàn)室無菌孵化至9~11日齡。

        1.3 病毒分離鑒定

        將采集的咽喉/泄殖腔棉拭子,放入青-鏈霉素PBS溶液中,低溫(4 ℃)作用4 h,然后充分捻轉(zhuǎn)、擠壓,3 000 r/min離心10 min;取上清接種9~11日齡SPF雞胚,收獲24~96 h內(nèi)死亡或活胚的雞胚尿囊液,通過血凝試驗(yàn)(HA)、血凝抑制(HI)試驗(yàn)進(jìn)行病毒鑒定。

        1.4 核酸提取

        參照RNA/DNA快速純化試劑盒說明書,對(duì)HA和HI鑒定為NDV陽(yáng)性的尿囊液提取RNA。

        1.5 RT-PCR擴(kuò)增

        參照PrimeScript II 1stStrand cDNA Synthesis Kit說明書,對(duì)提取的RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA。使用國(guó)標(biāo) GBT 16550—2008和文獻(xiàn)[2,17]中的引物(表1),對(duì)NDV F基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增。國(guó)標(biāo)GB/T 16550—2008中的引物未說明擴(kuò)增Ⅰ類,還是Ⅱ類NDV,文獻(xiàn)[2]中的引物說明特異擴(kuò)增Ⅰ類NDV,文獻(xiàn)[17]中的引物說明可擴(kuò)增Ⅰ類和Ⅱ類NDV。將50 μL PCR產(chǎn)物電泳后,切膠經(jīng)DNA片斷膠回收試劑盒純化回收。將純化PCR產(chǎn)物克隆至pMD-18T載體。陽(yáng)性克隆送深圳華大基因科技服務(wù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。

        表1 試驗(yàn)所使用引物序列

        1.6 分離株F基因序列和遺傳進(jìn)化分析

        根據(jù)測(cè)序結(jié)果,推導(dǎo)出NDV分離株F基因的氨基酸序列,確定112~117位氨基酸裂解位點(diǎn)基序。從GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)下載NDV參考序列(表2),利用 MEGA 6軟件,對(duì)F基因序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,采用鄰位相連法(Neighbor-joining)構(gòu)建系統(tǒng)遺傳進(jìn)化樹。

        2 結(jié)果

        2.1 病原學(xué)檢測(cè)

        2016—2017年在廣西4種野鳥中開展了ND病原學(xué)檢測(cè),共采集野鳥口咽/泄殖腔棉拭子650份,其中斑鳩120份、鷓鴣261份、鴿子215份、山雞54份。經(jīng)病毒分離、RT-PCR和序列測(cè)定,共分離到10株NDV,病毒分離率為1.54%。10株病毒中,5株來源于斑鳩,3株來源于鴿子,2株來源于鷓鴣(表3)。

        表2 NDVF 基因序列分析參考毒株及其F 蛋白裂解位點(diǎn)詳細(xì)信息

        表3 廣西地區(qū)4種野鳥新城疫病原學(xué)檢測(cè)

        2.2 分離株F基因PCR擴(kuò)增

        使用國(guó)標(biāo)GBT 16550—2008中的引物 P1和P2,運(yùn)用RT-PCR對(duì)10 株NDV分離株進(jìn)行F 基因擴(kuò)增,僅分離到2株鷓鴣源NDV(“159 鷓鴣19”“158鷓鴣18”)中擴(kuò)增出535 bp的條帶。用文獻(xiàn)[2]中的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果均為陰性。對(duì)另外8株NDV分離株,使用文獻(xiàn)[17]中的引物FTY1和FTY2,擴(kuò)增出 968 bp的條帶。10個(gè)NDV分離株F基因的PCR擴(kuò)增電泳結(jié)果見圖1。

        圖1 NDV 廣西分離株F基因擴(kuò)增結(jié)果

        2.3 分離株F基因序列和遺傳進(jìn)化分析

        10株NDV分離株的氨基酸裂解位點(diǎn)基序均為112R-R-Q-K-R-F117,符合NDV強(qiáng)毒株的典型特征。對(duì)2016—2017年主動(dòng)監(jiān)測(cè)中分離到的NDV進(jìn)行F基因序列測(cè)定,構(gòu)建了系統(tǒng)遺傳進(jìn)化樹(圖2)。所分離的10株NDV毒株中,8株為Ⅱ類NDV基因VI型(斑鳩源5株、鴿子源3株),2株為Ⅱ類NDV基因XII 型(均從鷓鴣中分離到)。構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹所用序列為NDV F基因編碼區(qū)1~374位核苷酸(圖2)。

        圖2 根據(jù)F基因1~374 bp核苷酸序列繪制的遺傳進(jìn)化樹

        3 討論

        據(jù)報(bào)道,我國(guó)新疆、吉林、湖南和陜西等地從野鳥中分離的NDV主要為Ⅱ類NDV的基因I、II和VI型[10-15]。與這些報(bào)道類似,本研究也發(fā)現(xiàn)了Ⅱ類NDV基因VI型。近年來,我國(guó)在家禽中檢測(cè)到了Ⅱ類NDV基因XII型[6,18],但未在野鳥中發(fā)現(xiàn)。本研究在廣西鷓鴣中分離到了基因XII型,因此應(yīng)關(guān)注這種新型NDV在國(guó)內(nèi)野鳥和家禽中的分布和流行情況,加大主動(dòng)監(jiān)測(cè)力度。由于當(dāng)前使用的NDV疫苗主要為基因VII、II和I型,鑒于基因XII型的發(fā)現(xiàn),有必要開展當(dāng)前疫苗對(duì)XII型的免疫效果評(píng)估。同時(shí),由于本研究樣品均采自廣西野生動(dòng)物救護(hù)中心收容和救護(hù)的野鳥,來源相對(duì)單一,為更好地闡明4種鳥類NDV的病原生態(tài)學(xué)分布,后續(xù)應(yīng)拓寬鳥類樣品的采集范圍。

        本研究中分離到NDV的野鳥狀態(tài)良好,無發(fā)病跡象,因而推測(cè)野鳥對(duì)基因VI和XII具有較好的適應(yīng)力與抵抗性,存在向周邊環(huán)境排毒的危險(xiǎn)。廣西豐富的鳥類資源為NDV傳播創(chuàng)造了便利條件。

        NDV 分離株F 蛋白裂解能力是判斷毒力的標(biāo)準(zhǔn)之一[19]。強(qiáng)毒株F蛋白裂解位點(diǎn)區(qū)的氨基酸組成是112R/K-R-Q-K/R-R-F117,而弱毒株相對(duì)應(yīng)的氨基酸組成是112G/E-K/R-Q-G/E-R-L117[20-21]。本研究分離的10株NDV氨基酸裂解位點(diǎn)基序均為112R-R-Q-K-R-F117,符合NDV強(qiáng)毒株的典型特征。后續(xù)將會(huì)進(jìn)行分離毒株的MDT和ICPI致病指數(shù)測(cè)定以及全基因序列測(cè)定分析。

        由于前期在對(duì)NDV F基因的PCR擴(kuò)增中,發(fā)現(xiàn)國(guó)標(biāo)中的引物P1和P2僅能擴(kuò)增Ⅱ類NDV的F基因;文獻(xiàn)[2]中注明的引物CI-F和CI-R并不能擴(kuò)增所有Ⅰ類NDV;文獻(xiàn)[17]中注明的引物FTY1和FTY2并不能擴(kuò)增所有Ⅰ類和Ⅱ類的NDV毒株。這可能是由于NDV F基因變異較大,特別是Ⅰ類和Ⅱ類NDV的F基因。因此,為避免漏檢,本研究使用了國(guó)標(biāo)、文獻(xiàn)[2]和文獻(xiàn)[17]中的3套引物同時(shí)進(jìn)行擴(kuò)增。此外,由于Ⅰ類NDV可通過在雞或雞胚中連續(xù)傳代增強(qiáng)毒力[8-9],因此為更好地預(yù)測(cè)家禽NDV感染的流行趨勢(shì),建議在國(guó)標(biāo)中增加Ⅰ類NDV的檢測(cè)引物。

        4 結(jié)論

        本研究于2016—2017年在廣西采集了4種野鳥的650份口咽/泄殖腔棉拭子進(jìn)行了NDV感染狀況調(diào)查和分子特征分析,共分離到10株病毒;10株分離毒株均為高致病性,其中8株為Ⅱ類NDV基因VI型,2株為基因XII 型。該結(jié)果表明我國(guó)野鳥中流行的NDV以基因VI型為主,但也出現(xiàn)了新基因型(基因XII型)。因此,應(yīng)加大對(duì)野鳥NDV監(jiān)測(cè)的力度,防止其將病毒傳染給家禽,同時(shí)開展當(dāng)前疫苗對(duì)對(duì)NDV XII型的免疫效果評(píng)估。

        參考文獻(xiàn):

        [1] SAIF Y M. Disease of poultry [M]. 11th ed. Ames:Iowa State University Press,2003:64-87.

        [2] 王靜靜,呂艷,趙云玲,等. 2011—2015年中國(guó)Ⅰ類新城疫病原學(xué)監(jiān)測(cè)與遺傳進(jìn)化分析[J]. 病毒學(xué)報(bào),2017(2):211-215.

        [3] DIEL D G,DA S L,LIU H,et al. Genetic diversity of avian paramyxovirus type 1:proposal for a unified nomenclature and classification system of Newcastle disease virus genotypes[J]. Infection genetics and evolution,2012,12(8):1770-1779.

        [4] SNOECK C J,OWOADE A A,COUACYHYMANN E,et al. High genetic diversity of Newcastle disease virus in poultry in West and Central Africa:cocirculation of genotype XIV and newly defined genotypes XVII and XVIII.[J]. Journal of clinical microbiology,2013,51(7):2250-2260.

        [5] LIU X F,WAN H Q,NI X X,et al. Pathotypical and genotypical characterization of Newcastle disease virus isolated from outbreaks in chicken and goose flocks in some regions of China during 1985—2001[J]. Archives of virology,2003,148(7):1387-403.

        [6] 劉華雷,張維,胡北俠,等. 中國(guó)部分地區(qū)2008年I類新城疫病毒F基因遺傳變異分析[J]. 病毒學(xué)報(bào),2009,25(5):382-387.

        [7] LIU X W,WANG X Q,SHUANG W,et al.Surveillance for avirulent Newcastle disease viruses in domestic ducks(Anas platyrhynchos and Cairina moschata)at live bird markets in Eastern China and characterization of the viruses isolated.[J]. Avian pathology,2009,38(5):377-391.

        [8] KOMMERS G D,KING D J,SEAL B S,et al.Virulence of six heterogeneous-origin Newcastle disease virus isolates before and after sequential passages in domestic chickens[J]. Avian pathology,2003,32(1):81-93.

        [9] Zanetti F,Berinstein A,Carrillo E. Effect of host selective pressure on Newcastle disease virus virulence[J].Microbial pathogenesis,2008,44(2):135-140.

        [10] 李勝楠,王海軍,高曉龍,等. 7株野鳥源新城疫病毒F基因和HN基因遺傳變異分析[J]. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志,2015,10(12):1057-1060.

        [11] 郭威. 環(huán)洞庭湖區(qū)新城疫病原監(jiān)測(cè)及分子演化分析[D]. 長(zhǎng)沙:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué),2015.

        [12] 李小陽(yáng). 野鳥源新城疫病毒的基因組分析及其生物學(xué)特性鑒定[D]. 合肥:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué),2016.

        [13] 解秀梅. 鴕鳥源新城疫病毒全基因序列測(cè)定及遺傳進(jìn)化分析[D]. 楊凌:西北農(nóng)林科技大學(xué),2016.

        [14] 趙振振. 2011—2015我國(guó)部分地區(qū)鴿源新城疫病毒分子流行病學(xué)調(diào)查及鴿新城疫疫苗VIb-I4的免疫效力試驗(yàn)[D]. 揚(yáng)州:揚(yáng)州大學(xué),2016.

        [15] 張慧敏,木哈買提江·鐵格斯,史軍,等. 一株新疆野鳥源新城疫病毒的分離鑒定、F基因克隆及遺傳進(jìn)化分析[J]. 中國(guó)畜牧獸醫(yī),2017,44(9):2755-2760.

        [16] 伊劍鋒,余麗江. 廣西繁殖鳥類資源[J]. 生態(tài)學(xué)雜志,2016,35(7):1896-1910.

        [17] 朱杰. 2008—2013年華東地區(qū)新城疫病毒分子流行病學(xué)及HN基因E347K變異對(duì)病毒抗原性的影響[D]. 揚(yáng)州:揚(yáng)州大學(xué),2015.

        [18] LIU H,Lü Y,AFONSO C L,et al. Complete genome sequences of new emerging newcastle disease virus strains isolated from china.[J]. Genome Announcement,2013,1(1).

        [19] BERINSTEIN A,SELLERS H S,KING D J,et al.Use of a hetero duplex mobility assay to detect differences in the fusion protein cleavage site coding sequence among Newcastle disease virus isolates. Journal of clinical microbiology,2001,39(9):3171-3178.

        [20] ALEXANDER D J. OIE Manual of diagnostic tests and vaccines for terrestrial animals[M]. Paris:Office of international des epizooties,2004:270-282.

        [21] COLLINS M S,BASHIRUDDIN J B,ALEXANDER D J. Deduced amino acid sequences at the fusion protein cleavage site of Newcastle disease viruses showing variation in antigenicity and pathogenicity[J]. Archives of virology,1993,128(3/4):363-370.

        亚洲爆乳精品无码一区二区三区| 精品一区二区三区中文字幕在线| 国产精品高清一区二区三区人妖| 国产一区av男人天堂| 国产精品久线在线观看| 8888四色奇米在线观看| 亚洲日本无码一区二区在线观看| 亚洲女人毛茸茸的视频| 男女性杂交内射女bbwxz| 色播久久人人爽人人爽人人片av| 久久半精品国产99精品国产| 和少妇人妻邻居做爰完整版| 精品人妻一区二区三区在线观看 | 精品国产一区二区三区九一色| 香蕉久久一区二区不卡无毒影院| 亚洲精品午夜无码电影网| 四虎在线播放免费永久视频| 亚洲二区三区四区太九| 亚洲综合网国产精品一区| 亚洲男人av天堂午夜在| 国产精品爽爽va在线观看网站| 亚洲av男人免费久久| 国产人妖乱国产精品人妖| 久久av高潮av无码av喷吹| 天天摸夜夜摸摸到高潮| 亚洲不卡中文字幕无码| 中文字幕亚洲综合久久| 蜜桃免费一区二区三区| 香港台湾经典三级a视频| 78成人精品电影在线播放| 午夜亚洲精品视频网站| 国产无套内射又大又猛又粗又爽| 国产精品嫩草影院av| 精精国产xxxx视频在线播放器| 国产自拍一区在线视频| 国产偷久久久精品专区| 色诱久久av| 在线观看免费的黄片小视频| 女人高潮久久久叫人喷水| 亚洲国产区男人本色| 日本午夜理伦三级好看|