白亞龍
索玉娟
林 婷
沈源源
趙曉燕
劉海燕
周昌艷
(上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)與檢測(cè)技術(shù)研究所,上海 201403)
食用菌蛋白質(zhì)含量高,營(yíng)養(yǎng)豐富,具有增強(qiáng)免疫力、降血糖等保健作用[1]。棉籽殼營(yíng)養(yǎng)豐富是理想的食用菌栽培原料[2]。中國(guó)也是轉(zhuǎn)基因棉花種植大國(guó),根據(jù)國(guó)際農(nóng)業(yè)生物技術(shù)應(yīng)用服務(wù)組織的報(bào)道,在2014年中國(guó)轉(zhuǎn)基因棉花種植面積就已達(dá)棉花總種植面積的93%,而且呈不斷增長(zhǎng)的趨勢(shì)[3]。大量的轉(zhuǎn)基因棉籽殼會(huì)作為培養(yǎng)料用于食用菌栽培,因此,有必要考察外源轉(zhuǎn)基因片段是否會(huì)通過栽培從轉(zhuǎn)基因棉籽殼水平轉(zhuǎn)移到所栽培的食用菌中。
在之前的研究中,并沒有達(dá)到統(tǒng)一的共識(shí)。徐寶梁[4]與于莉[5]分別用轉(zhuǎn)基因棉籽殼和轉(zhuǎn)基因油菜籽為主要原料種植平菇,均沒有發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因片段從棉籽殼向平菇水平轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象,用添加有轉(zhuǎn)基因片段的液體培養(yǎng)基培養(yǎng)平菇菌絲體,也未發(fā)現(xiàn)水平轉(zhuǎn)移現(xiàn)象。然而,馬務(wù)超等[6]用轉(zhuǎn)基因棉籽種植銀耳,在所栽培的銀耳中檢出轉(zhuǎn)基因啟動(dòng)子CaMV35S與終止子NOS,但是沒有發(fā)現(xiàn)Cry1A片段。閆燕[7]與Ying Shang等[8]用轉(zhuǎn)基因棉籽種植平菇,采摘不同時(shí)期的平菇樣品,經(jīng)過PCR檢測(cè)發(fā)現(xiàn)均存在外源轉(zhuǎn)基因片段CaMV35、NOS、CrylA(b)-CrylA(c)??傊?,從目前的研究來看,對(duì)于轉(zhuǎn)基因棉籽殼栽培食用菌是否會(huì)發(fā)生外源轉(zhuǎn)基因片段水平轉(zhuǎn)移現(xiàn)象仍然需要更多的試驗(yàn)確認(rèn)與驗(yàn)證。本研究從銀耳生產(chǎn)基地與菇廠采集以棉籽殼為主要培養(yǎng)物栽培的15份銀耳樣品和10份平菇樣品,此外,還從大中型超市和農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)采集47份食用菌樣品,用PCR擴(kuò)增檢測(cè)是否存在轉(zhuǎn)基因棉籽殼中的外源片段CaMV35S、NOS、CpTⅠ、CryIA(c)。
1.1.1 試劑
溶壁酶:10 U/μL,上海天根生化科技有限公司;
蛋白酶K:40 mAnsom u/mg,美國(guó)Merck公司;
基因組DNA提取試劑盒:上海索來寶生物科技有限公司;
2×EasyTaq PCR SuperMix (-dye)-PCR SuperMix:北京全式金生物技術(shù)有限公司;
所用水均為滅菌的Milli-Q水。
1.1.2 食用菌樣品
15份轉(zhuǎn)基因棉籽殼為主原料栽培的銀耳樣品:培養(yǎng)基質(zhì)中棉籽殼含量>75%,采集自福建福州某銀耳種植基地;
10份以轉(zhuǎn)基因棉籽殼為主培養(yǎng)物栽培的平菇樣品:棉籽含量約為92%,采摘自上海奉賢莊行某菇廠;
47份市售食用菌樣品(其中平菇10份、杏鮑菇8份、香菇8份、金針菇6份、銀耳6份、海鮮菇4份、白玉菇3份、秀珍菇2份):上海市閔行區(qū)各大中型超市與農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)。
1.1.3 引物
PCR擴(kuò)增所需引物見表1,均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
1.1.4 儀器
微量臺(tái)式離心機(jī):Eppendorf 5415D型,德國(guó)Eppendorf公司;
恒溫混勻振蕩器:Thermo Mixer型,德國(guó)Eppendorf 公司;
PCR儀:Eppendorf AG型,德國(guó)Eppendorf公司。
1.2.1 基因組DNA提取
(1) 平菇樣品等(除銀耳外的其他食用菌)基因組DNA提?。悍Q取少量(約1 g)樣品,倒入適量液氮,立即研磨,重復(fù)3次。取研成粉末的樣品100 mg,加200 μL試劑盒所配溶液A,加入10 μL溶壁酶與20 μL RNase A,再加入100 mg玻璃珠,在振蕩器上振蕩約5 min。加入40 μL 50 mg/mL的蛋白酶K,充分混勻,55 ℃孵育30 min。12 000 r/min 離心2 min。將上清轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的離心管中,加入200 μL試劑盒所配溶液B。接下來步驟完全參照試劑盒說明書,最終基因組DNA溶解于100 μL緩沖液當(dāng)中。
(2) 銀耳樣品基因組DNA提取:稱取少量(約1 g)樣品,倒入適量的液氮,立即研磨,重復(fù)3次。取研成粉末的樣品50 mg,加400 μL試劑盒所配溶液A,加入10 μL溶壁酶與20 μL RNase A,再加入100 mg玻璃珠,在振蕩器上振蕩約5 min。加入40 μL 50 mg/mL的蛋白酶K,充分混勻,55 ℃ 孵育30 min。加入與溶液等量的10% CTAB溶液,65 ℃ 繼續(xù)處理30 min,12 000 r/min離心5 min。取200 μL上清轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的離心管中,然后加入200 μL試劑盒所配溶液B。后續(xù)步驟同1.2.1(1)。
表1 引物序列匯總Table 1 The sequences of primers for PCR
1.2.2 PCR檢測(cè)
(1) PCR擴(kuò)增體系(25 μL):12.5 μL 2×EasyTaq PCR SuperMix (-dye)-PCR SuperMix,10 μmmol/L的上下游引物各0.5 μL,加無菌水至25 μL。
(2) PCR熱循環(huán)步驟:94 ℃保持5 min,每個(gè)循環(huán)溫度為94,58,72 ℃下分別保持30 s,共35個(gè)循環(huán),最后72 ℃再延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物用2%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,4S Red Plus核酸染色劑(上海生工)染色觀察結(jié)果。
在食用菌樣品的基因組DNA提取中,為了增加DNA提取的效率,參照說明書之外,對(duì)有些步驟進(jìn)行了適當(dāng)?shù)恼{(diào)整。在提取中,因?yàn)殂y耳含有大量的膠質(zhì),在液氮研磨之后用溶液溶解,即使離心也是呈現(xiàn)黏稠的流體狀,無法用試劑盒所配的層析柱進(jìn)行操作。參考文獻(xiàn)[9]在處理液中添加10%的CTAB溶液(使終濃度為5%)處理,離心后得到澄清的上層清液。以來自于銀耳種植基地和菇廠的15份銀耳和10份平菇樣品為例,提取的基因組DNA母液在稀釋10倍后,進(jìn)行內(nèi)源基因的擴(kuò)增。平菇樣品擴(kuò)增平菇β-action基因(引物為AC-r/f)[10-11],銀耳樣品用真菌通用引物ITS4/5進(jìn)行擴(kuò)增。電泳結(jié)果均呈現(xiàn)明亮的條帶(圖1),說明提取的DNA無抑制物,可以進(jìn)行PCR擴(kuò)增檢測(cè)。
M.DNA Marker NC.陰性對(duì)照?qǐng)D1 15份銀耳樣品與10份平菇樣品的內(nèi)源基因擴(kuò)增Figure 1 Amplification of endogenous genes of 15 Tremella fuciformis samples and 10 Pleurotus ostreatus samples
轉(zhuǎn)基因序列擴(kuò)增所需引物參照SN/T 1199—2010,選取CaMV35S啟動(dòng)子、NOS終止子、結(jié)構(gòu)基因CpTⅠ、CryIA(b)+CryIA(c)、CryIA(c)進(jìn)行檢測(cè),以上海市某菇廠的棉籽殼為例(圖2),檢出CaMV35S啟動(dòng)子、NOS終止子、結(jié)構(gòu)基因CpTⅠ、CryIA(c),同樣地,在來自于福建銀耳種植基地的棉籽殼中同樣也擴(kuò)增出了這些基因(對(duì)培養(yǎng)料進(jìn)行檢測(cè),也檢測(cè)到這4個(gè)基因)。說明這2種棉籽殼來源于品種相同的棉花。不同品種的轉(zhuǎn)基因棉花所檢測(cè)到的序列并不相同,在另一家上海菇廠提供的棉籽殼中,檢測(cè)到CaMV35S啟動(dòng)子、NOS終止子、結(jié)構(gòu)基因CryIA(b)+CryIA(c)、CryIA(c),而未擴(kuò)增出CpTⅠ序列。在銀耳養(yǎng)殖基地的15份銀耳樣品與菇廠的10份平菇樣品中只篩查檢出CaMV35S、NOS、CpTⅠ、CryIA(c) 4種轉(zhuǎn)基因片段。
M.DNA Marker 1.CaMV35S-r/f 2.CpTⅠ-r/f 3.CryIA(b)+CryIA(c)-r/f 4.CryIA(c)-r/f 5.NOS-r/f 6.C18srDNA-r/f NC.陰性對(duì)照
圖2 棉籽殼中轉(zhuǎn)基因序列PCR擴(kuò)增后電泳圖
Figure 2 Amplification of foreign sequences from genetically modified cottonseed hulls
15份新鮮銀耳樣品連同棉籽棒一同收集,提取DNA前銀耳均生長(zhǎng)于棉籽棒上,狀態(tài)良好。最終PCR結(jié)果見圖3,CaMV35S啟動(dòng)子、NOS終止子、結(jié)構(gòu)基因CpTⅠ、CryIA(c)均沒有檢測(cè)到,說明無論啟動(dòng)子與終止子還是結(jié)構(gòu)基因均沒有發(fā)現(xiàn)從轉(zhuǎn)基因棉籽殼向銀耳發(fā)生水平轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象。
M.DNA Marker NC.陰性對(duì)照 PC.陽性對(duì)照?qǐng)D3 15份銀耳樣品外源性轉(zhuǎn)基因片段擴(kuò)增Figure 3 The amplification of foreign genes in 15 Tremella fuciformis samples
對(duì)10份采自菇廠的帶有菌菇棒的平菇樣品做了相同的PCR擴(kuò)增檢測(cè)(提取DNA之前平菇均生長(zhǎng)于含有轉(zhuǎn)基因棉籽殼培養(yǎng)基質(zhì)上,生長(zhǎng)狀態(tài)良好),PCR結(jié)果顯示并無目標(biāo)轉(zhuǎn)基因片段被擴(kuò)增(圖4),說明在平菇樣品內(nèi)并不存在轉(zhuǎn)基因片段。雖然有些引物擴(kuò)增會(huì)出現(xiàn)一些非特異性產(chǎn)物,但是在目標(biāo)條帶大小處并沒有出現(xiàn)相應(yīng)擴(kuò)增條帶。
在銀耳種植基地和菇廠采集的以轉(zhuǎn)基因棉籽殼為主要培養(yǎng)料的銀耳和平菇樣品中,沒有檢測(cè)到外源轉(zhuǎn)基因片段。除此之外,還從當(dāng)?shù)氐霓r(nóng)貿(mào)市場(chǎng)與超市采集食用菌樣品47份,其中,平菇樣品10份、香菇樣品8份、杏鮑菇8份、銀耳樣品6份、蟹味菇樣品4份、秀珍菇樣品2份。這些樣品是市面上常見的食用菌,而且可能會(huì)被含有棉籽殼的培養(yǎng)基質(zhì)栽培。有些食用菌雖然市場(chǎng)常見,但不會(huì)用棉籽殼培養(yǎng),所以未被采集,如屬于草腐菌的雙孢蘑菇。最終的PCR檢測(cè)結(jié)果(見表2)顯示,47份購(gòu)買自大中型超市與農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)的樣品均沒有檢測(cè)到外源轉(zhuǎn)基因片段。
表2 市售食用菌樣品外源轉(zhuǎn)基因片段PCR檢測(cè)結(jié)果?Table 2 The amplification of foreign genes in edible fungi purchased from markets
? +表示陽性;-表示陰性;表示未檢測(cè)。
M.DNA maker NC.陰性對(duì)照 PC.陽性對(duì)照?qǐng)D4 10份平菇樣品外源性轉(zhuǎn)基因片段篩查Figure 4 The amplification of foreign genes in 10 Pleurotus ostreatus samples
與之前的一些研究不同,不論是種植基地用轉(zhuǎn)基因棉籽殼為主要原料栽培的銀耳和平菇,還是采集市售的樣品,均沒有檢測(cè)到轉(zhuǎn)基因棉籽殼中的外源片段。閆燕等[7]與Ying Shang等[8]用轉(zhuǎn)基因棉籽種植平菇,在栽培的不同時(shí)期采樣檢測(cè),均檢測(cè)到外源轉(zhuǎn)基因片段。然而,同時(shí)也在平菇中檢測(cè)到棉籽的內(nèi)源基因Sad。出現(xiàn)這種情況,可能性有二:① 基因片段可以通過水分進(jìn)入平菇菌體內(nèi),也就是說不論是轉(zhuǎn)基因還是非轉(zhuǎn)基因片段,只要是培養(yǎng)基質(zhì)中含有的基因片段均可能出現(xiàn)在平菇菌體內(nèi),從而被檢測(cè)到。如果這樣,與轉(zhuǎn)基因與否并不相關(guān);② 可能是提取的平菇基因組DNA遭到棉籽殼基因組DNA的污染,所以,不論是棉籽殼中含有的轉(zhuǎn)基因片段還是內(nèi)源基因均被檢測(cè)到。PCR易于污染,尤其是檢測(cè)樣品與陽性樣品在液氮研磨、提取DNA、PCR等操作步驟一同進(jìn)行的情況下。針對(duì)前一種可能,徐寶梁[4]與于莉[5]用額外添加轉(zhuǎn)基因序列的液體培養(yǎng)液培養(yǎng)平菇菌絲體進(jìn)行檢測(cè),未在菌絲體中發(fā)現(xiàn)外源轉(zhuǎn)基因片段,也就是說基因片段并不能通過水分進(jìn)入菌體。當(dāng)然,即使這種情況存在,也僅僅是外源轉(zhuǎn)基因片段通過水分進(jìn)入食用菌菌體,其實(shí)質(zhì)類似于食用菌菌體沾染了微量的棉籽殼核酸物質(zhì),并不會(huì)引起食品安全方面的憂慮。
本研究考察了轉(zhuǎn)基因棉籽殼的外源轉(zhuǎn)基因片段是否會(huì)通過栽培水平轉(zhuǎn)移到食用菌中。從銀耳生產(chǎn)基地和菇廠采集用轉(zhuǎn)基因棉籽殼栽培的15份銀耳樣品與10份平菇樣品,PCR擴(kuò)增檢測(cè)是否存在轉(zhuǎn)基因棉籽殼中的外源片段CaMV35S、NOS、CpTⅠ、CryIA(c),結(jié)果均沒有發(fā)現(xiàn)目標(biāo)序列被擴(kuò)增。針對(duì)可能會(huì)用含有棉籽殼基質(zhì)培養(yǎng)的市售食用菌,從大中型超市與農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)采集47份樣品,通過PCR擴(kuò)增檢測(cè)轉(zhuǎn)基因棉籽殼中的外源片段CaMV35S、NOS、CpTⅠ、CryIA(b)+CryIA(c)、CryIA(c),結(jié)果也沒有發(fā)現(xiàn)目標(biāo)序列被擴(kuò)增。總之,通過PCR篩查,未發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因棉籽殼中外源轉(zhuǎn)基因片段有向所栽培食用菌水平轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象。
本研究未發(fā)現(xiàn)外源轉(zhuǎn)基因片段會(huì)從轉(zhuǎn)基因培養(yǎng)料進(jìn)入食用菌內(nèi),為轉(zhuǎn)基因培養(yǎng)物栽培食用菌的安全性進(jìn)行了澄清。當(dāng)然,這僅僅是定點(diǎn)考察與市場(chǎng)初步篩查的結(jié)果,想要得到更多確切的結(jié)果,可以考慮在食用菌生長(zhǎng)周期澆灌含有人為添加特定外源序列的水,確定外源片段是否會(huì)隨水分進(jìn)入食用菌菌體內(nèi),還可以考察培養(yǎng)基物質(zhì)所含DNA片段是否有可能通過水分進(jìn)入食用菌菌體內(nèi)。此外,還可以考慮進(jìn)一步加大市售食用菌樣品篩查樣本量,用更大量的數(shù)據(jù)徹底消除生產(chǎn)者與消費(fèi)者的顧慮。
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