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        ICU患者艱難梭菌分離培養(yǎng)與流行病學(xué)特征研究

        2018-04-24 05:49:47曾勇彬劉安超李武唐堯賴毅真葉思琪林曉林建東林宇嵐楊濱
        微生物學(xué)雜志 2018年4期
        關(guān)鍵詞:梭菌毒素抗生素

        曾勇彬,劉安超,李武,唐堯,賴毅真,葉思琪,林曉,林建東,林宇嵐,楊濱

        1.福建醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院,福建 福州 350005;2.福建醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)與工程學(xué)院,福建 福州 350005

        艱難梭菌(Clostridiumdifficile,CD)是一種革蘭陽性、專性厭氧的粗大芽孢桿菌,于1935年由Hall和O′Toole首次從健康新生兒糞便中分離[1]。艱難梭菌分布廣泛,可在健康人胃腸道定植,是一種條件致病菌,經(jīng)糞-口傳播,也是院內(nèi)獲得性腸道感染及抗生素相關(guān)性腹瀉(antibiotic associated diarrhea,AAD)的主要病原菌。艱難梭菌包括產(chǎn)毒株和非產(chǎn)毒株兩種:非產(chǎn)毒株無致病性;產(chǎn)毒株可產(chǎn)生A、B兩種主要的致病毒素(分別由tcdA和tcdB基因編碼),少數(shù)可產(chǎn)生二元毒素[2-3]。

        當(dāng)腸道微生態(tài)平衡遭到破壞(如濫用/長期使用抗生素、免疫抑制劑、質(zhì)子泵抑制劑、化療藥物等)時,腸道正常菌群受到抑制,艱難梭菌大量生長,可造成艱難梭菌感染(Clostridiumdifficileinfection,CDI)和艱難梭菌相關(guān)性腹瀉(Clostridiumdifficileassociated diarrhea,CDAD),輕者表現(xiàn)為自限性腹瀉,重者可出現(xiàn)偽膜性腸炎,中毒性巨結(jié)腸,甚至死亡[4]。近幾年來,全球范圍內(nèi)CDI的發(fā)生率和病死率日益增加,在歐洲和北美已有多次暴發(fā)流行,引起世界各國的廣泛關(guān)注,預(yù)防艱難梭菌感染顯然成為醫(yī)院感染控制的新挑戰(zhàn)[3]。

        研究發(fā)現(xiàn),CDI的高危因素包括廣譜抗生素的使用、老齡、長時間住院、免疫系統(tǒng)缺陷、化學(xué)治療、嚴(yán)重的基礎(chǔ)疾病、應(yīng)用質(zhì)子泵抑制劑、應(yīng)用H2受體抑制劑和應(yīng)用糖皮質(zhì)激素等[5-6]。ICU患者由于病情比較危重、基礎(chǔ)疾病相對較多,部分病人需聯(lián)合應(yīng)用抗生素以及有可能長期住院,極有可能增加CDI的發(fā)生風(fēng)險,甚至暴發(fā)流行,這對ICU患者來說可能是致命的[7]。本研究針對我院ICU住院時間>7 d的患者,調(diào)查艱難梭菌定植/感染情況,為了解艱難梭菌的流行情況,開展艱難梭菌的治療和控制提供參考。

        1 對象與方法

        1.1標(biāo)本收集 選擇2016年9月至2017年6月福建醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院ICU住院時間>7 d的139例患者為研究對象,收集糞便樣本,采集患者新鮮糞便3~5 g(若是液狀糞便,采集2~3 mL),裝于清潔的不含防腐劑的糞便采集管中。

        1.2臨床資料收集 通過查閱病歷系統(tǒng)收集臨床資料,包括患者年齡、性別、入院時間、臨床診斷、所用抗生素類型、所用抗生素的先后順序、所用抗生素的持續(xù)時間、白細(xì)胞計數(shù)、中性粒細(xì)胞計數(shù)、淋巴細(xì)胞計數(shù)、C-反應(yīng)蛋白(CRP)、降鈣素原(PCT)等以及質(zhì)子泵抑制劑(PPI)、組胺受體抑制劑、激素等藥物使用情況。艱難梭菌定植(Clostridiumdifficilecolonization,CDC)是指艱難梭菌培養(yǎng)陽性,但患者未出現(xiàn)腹瀉癥狀;艱難梭菌感染(CDI)定義為患者出現(xiàn)腹瀉同時產(chǎn)毒艱難梭菌培養(yǎng)陽性;腹瀉定義為24 h內(nèi)出現(xiàn)3次以上不成形便。

        1.3試劑與儀器 ABI梯度PCR儀(VeritiTM96,美國Life Technologies公司)、臺式離心機(德國Eppendorf公司)、電子天平(德國Sartorius公司)、DYY-7C型電泳儀(北京六一儀器廠)、NanoDrop 2000微量紫外分光光度計(美國Thermo Fisher 公司)、GENbag厭氧產(chǎn)氣袋和艱難梭菌鑒定平板(法國生物梅里埃公司)、布魯克MALDI Biotyper質(zhì)譜儀(美國布魯克 道爾頓公司)、2×PCR MasterMix(大連寶生物工程有限公司)、細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(北京天根生化有限公司)、艱難梭菌毒素A & B檢測試劑盒(美國TechLab公司)。

        1.4厭氧培養(yǎng)與質(zhì)譜鑒定 取適量糞便標(biāo)本與等體積無水乙醇振蕩混勻,室溫靜置60 min,3 000 r/min離心5 min,棄上清,將沉淀物分區(qū)劃線接種于艱難梭菌選擇性培養(yǎng)基CDIF(法國生物梅里埃公司),35℃厭氧培養(yǎng)48 h。艱難梭菌在CDIF培養(yǎng)基上生長呈黑色菌落。挑取典型菌落2~3個/平板,使用布魯克MALDI Biotyper質(zhì)譜儀進(jìn)行可疑艱難梭菌的鑒定。質(zhì)譜儀線性正性模式頻率為60 Hz,采集分子量為2 000~20 000的蛋白質(zhì)圖譜。每一個樣本的蛋白質(zhì)譜在不同位置經(jīng)過200次的激光點擊而獲得,采集到的特征性蛋白質(zhì)峰信息通過軟件校正,然后與儀器內(nèi)的微生物數(shù)據(jù)庫圖譜進(jìn)行比對分析,最終獲得鑒定結(jié)果。

        1.5艱難梭菌毒素A & B表型檢測 采用艱難梭菌毒素A&B檢測試劑盒(美國TechLab公司)對質(zhì)譜儀鑒定的陽性菌株進(jìn)行毒素表型檢測。

        1.6艱難梭菌毒素基因檢測 采用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取艱難梭菌DNA。用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計毒素基因擴增引物(包括tcdA、tcdB、cdtA、cdtB,見表1)。PCR反應(yīng)體系25 μL,包括2×PCR MasterMix 12.5 μL、上下游引物各0.7 μL、細(xì)菌模板2.0 μL、ddH2O 9.1 μL。PCR反應(yīng)條件:94℃ 3 min;94℃ 30 s、58℃ 30 s、72℃ 45 s,共40個循環(huán);72℃延伸5 min。取10 μL PCR產(chǎn)物,在2.0%瓊脂糖凝膠上電泳(120 V、90 mA、45 min),觀察結(jié)果。

        表1 艱難梭菌毒素基因PCR引物序列

        2 結(jié) 果

        2.1ICU艱難梭菌定植與非定植患者相關(guān)因素比較 由表2可見,高齡、長時間住院、高淋巴細(xì)胞數(shù)、使用β-內(nèi)酰胺類抗生素是艱難梭菌定值的高危因素。

        2.2ICU患者艱難梭菌定植危險因素分析 Logistic多因素分析結(jié)果顯示,使用β-內(nèi)酰胺類藥物為ICU患者發(fā)生艱難梭菌定植的獨立危險因素(OR=3.881,P=0.039),見表3。

        2.3艱難梭菌菌落形態(tài)與典型質(zhì)譜峰圖 如圖1A所示,艱難梭菌在CDIF顯色培養(yǎng)基上生長呈典型的黑色菌落。艱難梭菌的特征性蛋白質(zhì)質(zhì)譜圖見圖1B,其質(zhì)荷比分布為2 000~12 000;峰的相對強度為(0.1~1.9)×104。

        表2 ICU艱難梭菌定植和非定植患者相關(guān)因素比較

        表3 ICU患者艱難梭菌定植危險因素的Logistic分析

        A:艱難梭菌在CDIF培養(yǎng)基上呈典型的黑色菌落(黑色箭頭所指);B:標(biāo)準(zhǔn)條件下艱難梭菌特征質(zhì)譜圖(橫坐標(biāo)為質(zhì)荷比,縱坐標(biāo)為峰相對強度)

        圖1艱難梭菌在CDIF培養(yǎng)基上的菌落形態(tài)和特征性質(zhì)譜峰圖

        2.4分子流行病學(xué)特征

        2.4.1艱難梭菌毒素A&B表型檢測 共檢出24株艱難梭菌,其中僅有1株為A&B毒素表型陽性,占4.2%,其余23株均未檢出A&B毒素,占95.8%。

        2.4.2艱難梭菌毒素基因檢測 24株艱難梭菌中,14株艱難梭菌的tcdA和tcdB基因檢測陽性,占58.3%;有10株為tcdA/tcdB基因檢測陰性,占41.7%;所有菌株二元毒素基因(ctdA/ctdB)均未檢出。見圖2。

        注:泳道1為DNA標(biāo)準(zhǔn)條帶;泳道2、3、4、5、6為tcdA;泳道7、8、9、10、11為tcdB。

        圖2艱難梭菌毒素A和毒素B基因PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果

        3 討 論

        3.1艱難梭菌感染的現(xiàn)狀 隨著廣譜抗生素的大量使用、人口老齡化的加速、住院時間的延長,艱難梭菌感染已成為住院患者特別是高風(fēng)險科室(如ICU、腫瘤內(nèi)科、血液科等)醫(yī)院感染的主要病原體。加拿大、美國以及歐洲一些國家已經(jīng)多次出現(xiàn)艱難梭菌感染的暴發(fā)流行,引起全球的廣泛關(guān)注[3]。2010年美國醫(yī)療保健流行病學(xué)學(xué)會/美國感染病學(xué)會(SHEA/IDSA)、2009年和2013年歐洲臨床微生物與感染性疾病學(xué)會(ESCMID)、2013年美國胃腸病學(xué)會(ACG)均發(fā)表了CDI的診療指南[8-11]。

        3.2艱難梭菌感染的國內(nèi)外研究情況 報道顯示,艱難梭菌感染在我國部分地區(qū)呈較高水平[12]。高姍等[13]在128例醫(yī)院高風(fēng)險科室的住院患者中,發(fā)現(xiàn)艱難梭菌糞便培養(yǎng)的陽性率為17.19%,毒素陽性率為16.41%??总驳萚14]對江蘇地區(qū)兩所不同規(guī)模醫(yī)院的高危人群進(jìn)行艱難梭菌篩查發(fā)現(xiàn),122例患者中共檢出艱難梭菌38株,其中毒素陽性率為20.49%。韓曉紅等[15]報道惡性腫瘤患者艱難梭菌陽性率為14.8%。國外的研究也顯示,住院和長期住院患者艱難梭菌的定植率可高達(dá)30%~50%[16]。本研究結(jié)果提示,我院ICU科室存在著艱難梭菌流行的風(fēng)險,尤其是長時間住院、高年齡、高淋巴細(xì)胞數(shù)的患者。本研究發(fā)現(xiàn)我院ICU患者艱難梭菌定植率為17.27%,與報道有所差異,這可能與地域差異、研究人群不同有關(guān)[3]。通過艱難梭菌定植的單因素分析,我們發(fā)現(xiàn)年齡可能與艱難梭菌定植有關(guān),其原因可能與老年人患者基礎(chǔ)性疾病比較多,免疫功能較差有關(guān)。另外也與ICU患者住院時間較長(長期住院,患者接觸CD芽孢的機會大),使用抗生素種類多(多種抗生素應(yīng)用更易發(fā)生菌群失調(diào))有關(guān)。研究表明,使用第三代頭孢菌素、喹諾酮類、碳青霉烯類和β-內(nèi)酰胺酶抑制劑會顯著增加CDI發(fā)生風(fēng)險[5]。本研究提示,長期使用β-內(nèi)酰胺類抗生素可增加艱難梭菌感染的風(fēng)險,這可能與抗生素使用易引起腸道菌群失調(diào)有關(guān)。本研究顯示,β-內(nèi)酰胺類抗生素的使用在艱難梭菌定植的發(fā)生過程中起了重要作用,是艱難梭菌定植發(fā)生的獨立危險因素。值得注意的是,本研究還發(fā)現(xiàn)淋巴細(xì)胞數(shù)與艱難梭菌的定值有關(guān),高淋巴細(xì)胞數(shù)患者艱難梭菌更容易定值,其發(fā)生機制尚待進(jìn)一步探索。

        3.3ICU艱難梭菌分子流行情況 由tcdA、tcdB基因編碼的毒素A和毒素B是艱難梭菌產(chǎn)毒株中最常見的兩種外毒素[3]。毒素A是一種腸毒素,可引起黏膜炎癥和細(xì)胞浸潤;毒素B是一種細(xì)胞毒素,其毒性比毒素A強100~1 000倍,可使細(xì)胞發(fā)生凋亡、變性、壞死、脫落。絕大多數(shù)菌株可同時產(chǎn)生毒素A和B,但最近越來越多的研究發(fā)現(xiàn),有的菌株只產(chǎn)生毒素B,而不產(chǎn)生毒素A[2-3]。本研究中有14株艱難梭菌tcdA和tcdB基因檢測陽性,占總分離株的58.3%,而二元毒素基因(ctdA/ctdB)均未檢出,與亞洲各國文獻(xiàn)報道較為一致。

        3.4本研究的臨床意義 艱難梭菌可引起交叉感染,其傳染源包括患者、治療好轉(zhuǎn)的患者、被污染的醫(yī)療器械、物品及醫(yī)護(hù)人員的手等。在當(dāng)前CDI日趨增加的形勢下,我們有必要做好ICU科室的主動預(yù)防監(jiān)測工作,對CDI患者進(jìn)行隔離,消除其播散隱患,慎用抗菌藥物,密切關(guān)注長時間住院、長期使用抗生素等艱難梭菌感染高危因素的患者;加強環(huán)境清潔消毒(包括醫(yī)護(hù)人員的手、臺面、床等等)工作,降低艱難梭菌芽孢傳播的風(fēng)險,防止艱難梭菌感染的暴發(fā)、流行。

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