祁云霞,達(dá) 賴,付紹印,何小龍,張興夫,王 標(biāo),特日格勒,劉永斌
(內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010031)
微小RNA(microRNA,簡稱miRNA)是非編碼RNA(non-coding RNA)家族的一員,長度一般在18~25 nt(nucleotide),普遍存在于真核生物中。 編碼miRNA的基因一般位于蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū),不翻譯成蛋白質(zhì)。miRNA序列在不同物種間保守性強(qiáng),表達(dá)具有時空特異性,是其他功能基因表達(dá)的重要調(diào)控分子,參與多種重要的生命活動。據(jù)推測,人體中超過三分之一的基因都受到miRNA 的調(diào)控[1]。
1993年,Lee等在研究線蟲時克隆到1個基因lin4,該基因不編碼蛋白質(zhì),而是編碼一個長度為22 nt的小分子RNA,調(diào)控胚胎發(fā)育[2]。7年后,在線蟲中發(fā)現(xiàn)了第2個同樣具有基因調(diào)控功能的小分子RNA 1et-7。后來陸續(xù)在果蠅、小鼠和人類等生物中也發(fā)現(xiàn)了這樣的小分子RNA,它們長度在18~25 nt,作為非編碼基因組的一部分調(diào)控基因表達(dá),被命名為miRNA。截至目前,已在小鼠上發(fā)現(xiàn)了1 915種成熟miRNA,人上發(fā)現(xiàn)了2 588種miRNA[miRBase數(shù)據(jù)庫(V21)2014年 6月發(fā)布數(shù)據(jù)][3],并且這一數(shù)量還在不斷增長。
miRNA由基因組DNA在細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄形成初級pri-miRNA后,經(jīng)過核糖核酸酶Drosha剪切成發(fā)夾結(jié)構(gòu)的前體pre-miRNA,后者被運(yùn)送出核后由核糖核酸酶 Dicer加工成熟[4-6]。成熟的miRNA通過RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC)作用于靶基因的 mRNA 的 3′非翻譯區(qū)(3′-UTR),降解靶基因mRNA或抑制其翻譯。近年發(fā)現(xiàn),miRNA也可以作用于mRNA的編碼區(qū),直接調(diào)節(jié)基因的翻譯過程,而且在不同物種中,靶位點(diǎn)也不具有保守性[7]。miRNA的生物合成和作用機(jī)制可用圖1表示。
圖1 miRNA的生物合成與工作原理[8]
隨著研究的深入,miRNA在雌性哺乳動物生殖過程中的作用也逐漸受到重視。Dicer是miRNA成熟過程中必需的加工酶,敲除Dicer后雌性小鼠會產(chǎn)生不同表型的缺陷,但有個共同的特點(diǎn)是都出現(xiàn)不同程度的生殖缺陷,這些生殖缺陷是由Dicer敲除后pre-miRNA的聚集和成熟體的減少導(dǎo)致的[9-10]。
Rajkovic研究小組[11]利用 miRNA 芯片技術(shù)研究了鼠卵巢中miRNA的表達(dá)情況,在檢測的373種鼠miRNA中有177種在野生型新生鼠的卵巢中顯著表達(dá),其中表達(dá)量最高的是miR-199a;而在人上的研究發(fā)現(xiàn),人卵巢上皮癌發(fā)生過程中,miR-199a 的表達(dá)量急劇降低[12-13]。
Pan等[14]利用基因芯片,比較了人子宮內(nèi)膜基質(zhì)細(xì)胞和腺上皮細(xì)胞的miRNA表達(dá),發(fā)現(xiàn)在檢測的287個miRNA中有32個差異表達(dá),這些差異表達(dá)miRNA的靶基因中,有一部分與維持子宮內(nèi)膜功能相關(guān),例如轉(zhuǎn)化生長因子(TGF-β)和受體、雌激素受體(ER)、孕酮受體(PR)和芳香化酶CYP19A1。此外,類固醇激素可調(diào)節(jié)子宮內(nèi)膜中miRNA表達(dá),例如,子宮內(nèi)膜基質(zhì)細(xì)胞和上皮細(xì)胞中的miR-20a、miR-26a和miR-21受雌激素和孕酮調(diào)節(jié);miR-20a在基質(zhì)細(xì)胞中的表達(dá)、miR-21在腺上皮的表達(dá)受雌激素下調(diào);孕酮抑制基質(zhì)細(xì)胞中miR-20a、miR-26a和miR-21的表達(dá),但在腺上皮中卻對miR-20a和miR-26a有明顯的上調(diào)[14]。
Fiedler等[15]比較小鼠排卵前卵巢顆粒細(xì)胞的miRNA表達(dá)譜,發(fā)現(xiàn)LH/hCG處理前后在所檢測的212個miRNA中,有13個差異表達(dá),其中miR-132和miR-212在LH/hCG處理后均顯著上調(diào)。用實(shí)時定量PCR檢測發(fā)現(xiàn),無論體內(nèi)或體外,LH/hCG可以同時上調(diào)miR-132和miR-212的前體和成熟體。
在牛的生殖系統(tǒng)中,包括子宮、卵巢、輸卵管以及黃體等組織器官也發(fā)現(xiàn)了大量的miRNA表達(dá),如 miR-18a、miR-29a 和 miR-199 等[16]。
在國內(nèi),姚桂東[17]對小鼠卵泡發(fā)育過程中的miRNA進(jìn)行了研究,他們檢測了TGF-β1刺激小鼠腔前卵泡顆粒細(xì)胞的miRNA表達(dá)變化情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)3個miRNA發(fā)生顯著上調(diào),13個miRNA顯著下調(diào)[17]。其中,miR-224是上調(diào)最為顯著的miRNA之一。這種上調(diào)效果可以通過在顆粒細(xì)胞培養(yǎng)基中加入SB431542而阻斷,其中SB431542是一種能夠阻斷TGFβ下游Smad2/3發(fā)生磷酸化的抑制劑,表明TGF-β1促進(jìn)顆粒細(xì)胞miR-224的上調(diào)至少部分是通過經(jīng)典的TGF-β/Smads信號通路[17]。
蘇立杰等[18]分析了大白豬胎盤(妊娠33 d和90 d)的MicroRNA表達(dá)變化,從檢測的56個miRNA中篩選出31個差異表達(dá)miRNA。這些差異miRNA的靶基因主要富集在細(xì)胞過程、發(fā)育過程、代謝過程以及生物黏附等GO條目中。通路分析發(fā)現(xiàn),顯著富集的通路與黏附、新陳代謝和內(nèi)分泌功能密切相關(guān)[18]。
康麗[19]利用Solexa測序技術(shù)研究了開產(chǎn)前后雞卵巢miRNA的差異表達(dá)。對比42 d雛雞和23周產(chǎn)蛋白來航雞(各3只)的卵巢組織,獲得差異表達(dá)miRNA 72個,其中上調(diào)表達(dá)34個,下調(diào)表達(dá)38個。在未開產(chǎn)雞的卵巢中篩選到189個新miRNA,在開產(chǎn)雞的卵巢中篩選到97個新miRNA[19]。
由上述研究可見,miRNA在人、鼠、牛、豬和雞等生殖系統(tǒng)中廣泛表達(dá),對卵泡發(fā)育、卵母細(xì)胞成熟以及性腺激素等都有調(diào)控作用。但目前對miRNA的表達(dá)模式研究居多,對功能研究尚顯不足,因此應(yīng)深入開展miRNA功能挖掘,以闡明miRNA在動物生殖中的作用機(jī)制。
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[1]秦一雨.miRNA檢測方法學(xué)的研究進(jìn)展[J].醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào),2007,20(11):1198-1201.
[2]LEE R C,F(xiàn)EINBAUM R L,AMBROS V.The C.elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14 [J].Cell,1993,75(5):843-854.
[3]KOZOMARA A,GRIFFITHS-JONES S.miRBase:annotatinghigh confidencemicroRNAsusingdeep sequencing data [J].Nucleic Acids Research,2014,42(Database issue):D68-D73.
[4]任剛,楊增明.MicroRNA在雌性哺乳動物生殖中的作用[J].細(xì)胞生物學(xué)雜志,2009,31(6):805-810.
[5]OKAMURA K,HAGEN J W,DUAN H,et al.The mirtron pathway generates microRNA-class regulatory RNAs in Drosophila[J].Cell,2007,130(1):89-100.
[6]ESQUELA-KERSCHER A,SLACK F J.OncomirsmicroRNAs with a role in cancer [J].Nat Rev Cancer,2006,6(4):259-269.
[7]TAY Y,ZHANG J,THOMSON A M,et al.MicroRNAs to Nanog,Oct4 and Sox2 coding regions modulate embryonic stem cell differentiation [J].Nature,2008,455(7216):1124-1128.
[8]ZOON C K.Current molecular diagnostics of breast cancer and the potential incorporation of microRNA [J].Expert Rev Mol Diagn,2009,9(5):455-467.
[9]OTSUKA M,ZHENG M,HAYASHI M,et al.Impaired microRNA processing causes corpus luteum insufficiency and infertility in mice [J].J Clin Invest,2008,118(5):1944-1954.
[10]NAGARAJA A K,ANDREU-VIEYRA C,F(xiàn)RANCO H L,et al.Deletion of Dicer in somatic cells of the female reproductive tract causes sterility [J].Mol Endocrinol,2008,22(10):2336-2352.
[11]ZHAO H,RAJKOVIC A.MicroRNAs and mammalian ovarian development [J].Semin Reprod Med,2008,26(6):461-468.
[12]YANG H,KONG W,HE L,et al.MicroRNA expression profiling in human ovarian cancer:miR-214 induces cell survial and cispltin resistance by targeting PTEN [J].Cancer Res,2008,68(2):425-433.
[13]IORIO M V,VISONE R,DILEVA G,et al.MicroRNA signatures in human ovarian cancer [J].Cancer Res,2007,67(18):8699-8707.
[14]PAN Q,LUO X,TOLOUBEYDOKHTIT,etal.The expression profile of micro-RNA in endometrium and endometriosis and the in-fluence of ovarian steroids on their expression [J].Mol Hum Reprod,2007,13(11):797-806.
[15]FIEDLER S D,CARLETTIM Z,HONG X,etal.Hormonalregulation ofMicroRNA expression in periovulatory mouse mural granulosa cells [J].Biol Reprod,2008,79(6):1030-1037.
[16]HOSSAIN M M,GHANEM N,HOELKER M,et al.Identification and characterization of MicroRNAs expressed in the bovine ovary [J].BMC Genomics,2009,10:443.
[17]姚桂東.MiRNA-224參與小鼠卵泡發(fā)育調(diào)控作用的研究[D].合肥:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué),2011.
[18]蘇立杰,趙書紅,朱猛進(jìn),等.應(yīng)用Exiqon芯片分離大白豬33天和90天胎盤差異表達(dá)而microRNA[C]//中國動物遺傳育種研究進(jìn)展——第十五次全國動物遺傳育種學(xué)術(shù)討論會論文集.北京:中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會,2009:8.
[19]康麗.雞卵泡發(fā)育相關(guān)基因和miRNA的鑒定及功能分析[D].泰安:山東農(nóng)業(yè)大學(xué),2009.