胡春榮 杜欣娜 李鳳君 金藝華 張 虎 馬利峰
(佳木斯大學(xué)附屬第一醫(yī)院,黑龍江 佳木斯 154007)
1佳木斯大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院
腦源性神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子(BDNF)是神經(jīng)生長(zhǎng)因子蛋白家族的成員。BDNF與其同源受體的結(jié)合可以促進(jìn)成人腦中神經(jīng)元存活。并且在阿爾茨海默病(AD)、帕金森病和亨廷頓病患者中BDNF的表達(dá)降低〔1~3〕。此外,BDNF還可能在調(diào)節(jié)應(yīng)激反應(yīng)和心理障礙的生物學(xué)中發(fā)揮作用〔4〕。盡管BDNF的病生理作用及發(fā)揮作用的機(jī)制已經(jīng)有不少報(bào)道,但是與BDNF結(jié)合的蛋白之間的相互作用網(wǎng)絡(luò)、BDNF發(fā)揮作用的可能機(jī)制及BDNF的其他功能并未見較為全面分析,本文旨在整體上分析BDNF相互作用蛋白質(zhì)的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系、功能和可能機(jī)制。
1.1與BDNF相互作用的蛋白質(zhì)查詢PINA2(http://cbg.garvan.unsw.edu.au/pina/)查找BDNF相互作用的蛋白,STRING(http://www.string-db.org/)查找BDNF相互作用的蛋白,然后將二者綜合在一起,去除重復(fù)項(xiàng)。
1.2在線軟件SRING分析與BDNF相互作用的蛋白質(zhì)之間相互作用的網(wǎng)絡(luò)圖將上述得到的蛋白列表,輸入STRING中,進(jìn)行蛋白間相互作用網(wǎng)絡(luò)圖分析。
1.3GO分析利用DAVID(https://david.ncifcrf.gov/)對(duì)上述蛋白列表進(jìn)行基因本體(Gene Ontology,GO)分析。
1.4KEGG分析利用DAVID(https://david.ncifcrf.gov/)對(duì)上述蛋白列表進(jìn)行KEGG信號(hào)通路分析。
2.1在線軟件SRING分析與BDNF相互作用的蛋白質(zhì)之間相互作用的網(wǎng)絡(luò)圖與BDNF直接或者間接相互作用的蛋白質(zhì)有20個(gè)(見圖1)。
圖1 與BDNF結(jié)合的蛋白質(zhì)之間相互作用的網(wǎng)絡(luò)圖
2.2生物學(xué)過程(GO分析)將數(shù)據(jù)庫(kù)PINA和SRING顯示的BDNF相互作用的22個(gè)蛋白質(zhì)進(jìn)行GO生物學(xué)過程分析,發(fā)現(xiàn)該蛋白集合主要參與生長(zhǎng)因子刺激后細(xì)胞反應(yīng)、軸突導(dǎo)向、神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子信號(hào)通路、細(xì)胞表面受體信號(hào)通路、神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子TRK受體信號(hào)通通路、神經(jīng)元凋亡過程調(diào)節(jié)和學(xué)習(xí)或記憶等生物學(xué)過程。見表1。
2.3分子功能(GO分析)與BDNF相互作用蛋白質(zhì)的GO分子功能分析結(jié)果顯示,該蛋白集合只要均具有神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子受體活性、神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子或受體結(jié)合、神經(jīng)生長(zhǎng)因子結(jié)合及跨膜受體蛋白酪氨酸激酶活性等共能。見表2。
2.4KEGG 信號(hào)通路分析與BDNF相互作用的蛋白集合主要參與神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子信號(hào)通路、MAPK信號(hào)通路、VEGF信號(hào)通路、白細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移、Rap1和Ras等信號(hào)通路。見表3。
表1 與BDNF相互作用的蛋白質(zhì)參與的生物學(xué)過程
表2 與BDNF相互作用的蛋白質(zhì)的分子功能
表3 與BDNF相互作用的蛋白質(zhì)參與的信號(hào)通路
神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子(NT)是中樞和外周神經(jīng)系統(tǒng)中不同神經(jīng)元群體發(fā)育、生長(zhǎng)和分化的基本調(diào)節(jié)因子。神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子的作用由兩類細(xì)胞表面受體決定:Trk受體酪氨酸激酶和p75神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子受體(p75NTR),p75NTR是腫瘤壞死因子的成員之一〔5〕。神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子BDNF以自分泌和旁分泌的方式起作用,并且整個(gè)生命中內(nèi)嗅皮層可以產(chǎn)生BDNF。與受體結(jié)合后,神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子及其受體發(fā)生內(nèi)化,并從軸突末端逆行轉(zhuǎn)運(yùn)至細(xì)胞體。
Trk受體導(dǎo)致環(huán)腺苷酸反應(yīng)元件結(jié)合蛋白(CREB)和細(xì)胞外信號(hào)相關(guān)激酶-5活性(Erk5)升高及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)和磷脂酶C-γ1(PLC-γ1)的磷酸化〔6〕。同時(shí),研究還發(fā)現(xiàn)Akt1是PI3K激活的下游靶點(diǎn)。磷酸化的Akt1正向調(diào)節(jié)CREB和核因子(NF)-κB,介導(dǎo)幾種促生存基因的表達(dá)〔1〕。除了對(duì)神經(jīng)元的作用之外,BDNF似乎是發(fā)育中和成人神經(jīng)系統(tǒng)中突觸活動(dòng)依賴性修飾的普遍機(jī)制的一部分,并且可以促進(jìn)海馬和皮層長(zhǎng)期勢(shì)差〔7〕。BDNF釋放調(diào)節(jié)可以通過高鉀或高頻刺激谷氨酸能突觸誘導(dǎo)〔8〕。在一些神經(jīng)變性疾病中已經(jīng)觀察到BDNF合成和分泌中的改變:AD,帕金森病和亨廷頓病〔2,3〕。本研究顯示,與BDNF相互作用的蛋白質(zhì)有22個(gè),這些蛋白質(zhì)通過神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子信號(hào)通路、MAPK信號(hào)通路及VEGF信號(hào)通路發(fā)揮功能。
BDNF具有治療AD的潛力〔9,10〕。BDNF在誘導(dǎo)神經(jīng)祖細(xì)胞向神經(jīng)元表型方向分化方面起著重要的作用。將神經(jīng)前體細(xì)胞暴露在BDNF中2 h即可誘導(dǎo)完全的神經(jīng)元分化,β-微管蛋白陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)目明顯增多,表明BDNF能促使有絲分裂后神經(jīng)前體細(xì)胞向神經(jīng)元樣表型終末細(xì)胞分化〔11〕。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)亦獲得了相同的結(jié)果,將BDNF注入側(cè)腦室和第三腦室排列的特殊皮質(zhì)結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)BRDU陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)目明顯增多,新產(chǎn)生的細(xì)胞表達(dá)神經(jīng)元特異性標(biāo)志物微管相關(guān)蛋白(MAP)2和微管蛋白〔12〕。而BDNF則在早期即表現(xiàn)為對(duì)胚膽堿能神經(jīng)元胞體和突起的發(fā)育有較強(qiáng)的作用,在橫切海馬傘后,注入BDNF可阻止軸突的膽堿能神經(jīng)元的死亡,表明BDNF具有促進(jìn)基底前腦膽堿能神經(jīng)元存活的作用〔13〕。與此類似的是,本研究中GO分析結(jié)果顯示這些與BDNF相互作用的蛋白主要具有神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子和受體活性,主要參與神經(jīng)元軸突生成、調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖和凋亡。
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