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        漳州紫泥圍墾區(qū)海水中弧菌類群研究

        2018-03-30 01:41:21陳明霞鄭計瑞李和陽
        安徽農(nóng)業(yè)科學 2018年9期
        關鍵詞:紫泥弧菌類群

        陳明霞,鄭計瑞,李和陽

        (1.華僑大學化工學院,福建廈門 361021;2.國家海洋局第三海洋研究所,福建廈門 361005)

        弧菌作為近海、河口環(huán)境中微生物區(qū)系的主要成員,廣泛分布于自然水域及漁業(yè)生物中,是引發(fā)人類細菌性疾病的主要病原之一。人們通過飲用不潔水,食用未加工或未加工熟的帶有致病弧菌的食物,特別是海產(chǎn)品而感染發(fā)病[1-4]。近年來,海水養(yǎng)殖業(yè)的快速發(fā)展,加快了海水生境的破壞,養(yǎng)殖環(huán)境不斷惡化,使養(yǎng)殖動物病害不斷發(fā)生?;【?Vibriosis) 主要是由弧菌屬(Vibrio)細菌引起的一類細菌性疾病,也是海水養(yǎng)殖動物主要的細菌病害之一。已知海水養(yǎng)殖動物弧菌病病原菌超過20種,危害到魚類、貝類及甲殼類中各種養(yǎng)殖動物,不僅給養(yǎng)殖業(yè)造成巨大的經(jīng)濟損失[5],而且導致野生海水動物大量死亡,進而導致食用人員腸道疾病或食物中毒?;【∠嚓P病原的研究已經(jīng)成為養(yǎng)殖病害及養(yǎng)殖環(huán)境治理的主要研究領域之一。

        福建省漳州龍海市東北部的紫泥鎮(zhèn),地處福建省第二大河九龍江出??冢瑢儆谙痰粎R處,水質(zhì)較好,水產(chǎn)養(yǎng)殖發(fā)達。紫泥圍墾區(qū)是其中重要的海水養(yǎng)殖區(qū)域,同樣存在著養(yǎng)殖環(huán)境惡化及水產(chǎn)致病菌嚴重等問題。筆者采用傳統(tǒng)的TCBS培養(yǎng)基分離篩選菌株及分子鑒定方法,對該養(yǎng)殖區(qū)域的弧菌類群進行分析,探討該養(yǎng)殖區(qū)潛在的弧菌病病原菌種類及其可能的風險。

        1 材料與方法

        1.1樣品采集海水樣品采集點位于福建漳州龍海紫泥圍墾區(qū)養(yǎng)殖區(qū)域的01站位(117.908 916°E,24.448 861°N),03站位(117.906 578°E,24.449 108°N)和06站位(117.907 878°E,24.446 680°N),樣品采集時間為2011年2月。

        1.2培養(yǎng)基2216E和TCBS培養(yǎng)基(Thiosulfate Citrate Bile Salts Sucrose)參考文獻[6]中描述。

        1.3弧菌的分離培養(yǎng)將01、03、06這3個站位的海水樣品進行梯度稀釋,得到100、10-1、10-2共3個樣品梯度,每個梯度分別取200 μL于TCBS瓊脂平板上,涂布均勻,于25 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng);每個梯度做2個重復。隨機挑取分離良好的48個菌落接種于2216E 瓊脂平板上,盡可能保證挑取到所有的菌落類型。對所分離的菌株在2216E 平板上進行3次以上純化,以保證得到純培養(yǎng)物。

        1.4弧菌的鑒定對所分離得到的TCBS菌株進行16S rRNA基因-RFLP酶切譜型分析,挑選各RFLP譜型代表菌,通過16S rRNA基因序列比對及系統(tǒng)發(fā)育分析進行菌種分子鑒定,16S rRNA 基因的PCR擴增及酶切分析方法參考文獻[7-8]中描述。菌株16S rRNA基因序列由南京金斯特生物技術有限公司測定,所得序列校正后在EzBioCloud數(shù)據(jù)庫比對分析并獲取相近菌種的16S rRNA基因序列。利用DNAman(version 5.1,Lynnon BioSoft)軟件進行序列同源性分析及構建16S rRNA基因系統(tǒng)進化樹。

        2 結果與分析

        2.1弧菌16SrRNA基因-RFLP分析不同樣品在TCBS培養(yǎng)基上生長的菌落皆屬于典型的黃色或綠色,隨機挑取48個菌落(盡可能包括所有不同菌落類型),純化后,使用細菌通用引物27F和1492R對所分離的48個菌株進行16S rRNA基因-PCR擴增(圖1),用AfaI和MspI限制性內(nèi)切酶對48個菌株16S rRNA基因擴增片段進行雙酶切并進行聚丙烯酰胺凝膠電泳分析(RFLP分析)。結果表明,48個菌株可分為6種不同的RFLP分子譜型(Ⅰ~Ⅵ),每種RFLP譜型挑出1個代表菌株進行16S rRNA基因的序列及系統(tǒng)發(fā)育學分析。

        注:M.DL 2000;1~15.紫泥圍墾區(qū)06站位菌株編號Note:M.DL2000;1~15.Strains numbers of station 06 of Zini marine aquaculture area圖1 部分弧菌菌株16S rRNA基因PCR擴增結果Fig.1 16S rRNA gene PCR amplification results of some Vibrio strains

        2.2弧菌16SrRNA基因序列及系統(tǒng)發(fā)育學分析對6個代表菌株進行16S rRNA基因的序列比對鑒定(表1)及系統(tǒng)發(fā)育分析(圖2),6個菌株屬于4種弧菌。Ⅰ型代表菌株JR-5和Ⅱ型代表菌株JR-12屬于同一個物種(group 1),與V.crassostreaeLGP7T(大黃魚弧菌)、V.celticusRd 8.15T(凱爾特人弧菌)、V.gigantisCAIM 25T(牡蠣弧菌)的16S rRNA基因序列相似度皆為100.00%,無法區(qū)分,但從系統(tǒng)發(fā)育樹上明顯可見菌株JR-5、JR-12與V.crassostreaeLGP7T距離更為接近,處在一個小分支上;Ⅲ型代表菌株JR-10和Ⅳ型代表菌株JR-19屬于同一個物種(group 2),與V.atlanticusVb 11.11T(大西洋弧菌)、V.tasmaniensisLMG 21574T(塔斯馬尼亞弧菌)皆有99%以上的同源性,但系統(tǒng)發(fā)育樹分析顯示菌株JR-10、JR-19與V.atlanticusVb 11.11T具有更近的親緣關系;Ⅴ型代表菌株JR-15與V.splendidusATCC 33125T(燦爛弧菌)有99.85%的同源性,為group 3;VI型代表菌株JR-20與V.lentus4OM4T(緩慢弧菌) 有98.60%的同源性,為group 4。不同弧菌類群所占比例不同,group 2 占有58.3%,具有絕對的優(yōu)勢,其他3類比例相當:group 1和4各占14.6%、group 3占12.5%。

        3 討論

        紫泥圍墾區(qū)屬于海水養(yǎng)殖區(qū)域,鹽度相對較高,以TCBS培養(yǎng)基分離獲取的菌株100%為弧菌,不包含有其他非弧菌TCBS類群,該結果與陳明霞等[6]、李和陽等[9]研究結果相符,TCBS培養(yǎng)類群中弧菌所占的比例與鹽度息息相關。

        表1 不同RFLP譜型代表菌株16S rRNA基因序列系統(tǒng)關系分析結果

        注:結點處數(shù)字表示Bootstrap 1 000 次重復檢驗的自舉值(僅顯示高于50%的數(shù)值;括號中為每個16S rRNA基因序列的登錄號;比例尺代表每100 bp 5個堿基替換數(shù)Note:The bootstrap values above 50% from 1 000 replicates are shown.The accession number of each 16S rRNA gene sequence is given in parenthesis.The scale bar represents 5 substitutions per 100 bp圖2 根據(jù)16S rRNA基因序列構建的紫泥圍墾區(qū)海水弧菌代表菌株系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic tree of representative Vibrio strains from Zini marine aquaculture area based on bacterial 16S rRNA gene

        根據(jù)Drancourt 等[10-11]提出16S rRNA基因序列同源性鑒定規(guī)則及相關的系統(tǒng)進化樹分析,紫泥圍墾區(qū)主要的弧菌類群有4類,分別為group 1-V.crassostreae;group 2-V.atlanticus;group 3-V.splendidus和group 4-V.lentus。其中V.crassostreae和V.atlanticus至少含有2種類型的16S rRNA基因拷貝,因此具有2個的RFLP譜型。這4類弧菌都屬于專性需鹽細菌,是海水或咸水養(yǎng)殖水體的重要弧菌成員。

        弧菌屬包含100多個不同物種,分屬于14個進化分支[12],紫泥圍墾區(qū)的4種弧菌類群皆屬于V.splendidus進化分支[13-15]。V.splendidus可引起魚類、對蝦和牡蠣的疾病[5];V.crassostreae于2004年分離自生病的長牡蠣(Crassostreagigas)血淋巴[13],是長牡蠣的條件致病菌[16];V.atlanticus最早分離自海灣扇貝(Ruditapesphilippinarum)[15],目前并無實例證明該菌屬于致病菌[12],但其近似種V.tasmaniensis卻被報道可以引起柳珊瑚疾病[17];V.lentus可引起野生章魚(Octopusvulgaris)疾病[18],其對養(yǎng)殖生物同樣具有嚴重威脅。

        據(jù)調(diào)查,許多養(yǎng)殖戶會自購現(xiàn)成的TCBS培養(yǎng)基平板進行弧菌的分離培養(yǎng),并通過觀察菌落的顏色和數(shù)量以判斷可能潛在的副溶血弧菌(V.parahemolyticus)病害危機,這顯然并不科學而且經(jīng)常會背道而馳。該研究明確了特定時間段內(nèi)紫泥圍墾區(qū)弧菌的類群組成,即該區(qū)域的弧菌主要為V.splendidus相關種類,對于針對性地防控這些弧菌引起的養(yǎng)殖動物疾病具有一定的指導價值。

        [1] FARMER J J,JANDA J,BIRKHEAD K.Vibrio[M]//MURRAY P,BARON E,JORGENSEN J,et al.Manual of clinical microbiology.8th ed.Washington,DC:ASM Press,2003:706-718.

        [2] JOHNSON C N,BOWERS J C,GRIFFITT K J,et al.Ecology ofVibrioparahaemolyticusandVibriovulnificusin the coastal and estuarine waters of Louisiana,Maryland,Mississippi,and Washington (United States) [J].Appllied & environmental microbiology,2012,78(20):7249-7257.

        [3] HLADY W G,KLONTZ K C.The epidemiology ofVibrioinfections in Florida,1981-1993 [J].Journal of infectious diseases,1996,173(5):1176-1183.

        [4] 鄭經(jīng)川.弧菌性腹瀉的若干問題[J].中國實用內(nèi)科雜志,1995,14(3):133-135.

        [5] 鄭天倫,王國良,金珊.海水養(yǎng)殖動物弧菌病防治的研究進展[J].臺灣海峽,2002,21(3):372-378.

        [6] 陳明霞,李和陽,馬云飛,等.九龍江口沉積物TCBS (Thiosulfate Citrate Bile Salts Sucrose)菌群的分布[J].微生物學報,2012,52(5):637-644.

        [7] 陳明霞,李和陽,陳維維,等.68株北極產(chǎn)蛋白酶菌株的篩選、鑒定以及部分酶學性質(zhì)[J].微生物學報,2013,53(7):702-709.

        [8] DELONG E F.Archaea in coastal marine environments [J].Proceedings of the national academy of sciences of the United States of America,1992,89(12):5685-5689.

        [9] 李和陽,陳明霞,鄭天凌,等.深圳海域水體和九龍江口沉積物中TCBS菌群與弧菌相關性的研究[J].臺灣海峽,2011,30(3):394-399.

        [10] DRANCOURT M,BOLLET C,CARLIOZ A,et al.16S ribosomal DNA sequence analysis of a large collection of environmental and clinical unidentifiable bacterial isolates[J].Journal of clinical microbiology,2000,38(10):3623-3630.

        [11] DRANCOURT M,BERGER P,RAOULT D.Systematic 16S rRNA gene sequencing of atypical clinical isolates identified 27 new bacterial species associated with humans[J].Journal of clinical microbiology,2004,42(5):2197-2202.

        [12] ROMALDE J L,DIéGUEZ A L,LASA A,et al.NewVibriospecies associated to molluscan microbiota:A review[J].Frontiers in microbiology,2013,4(1):413.

        [13] FAURY N,SAULNIER D,THOMPSON F L,et al.Vibriocrassostreaesp.nov.,isolated from the haemolymph of oysters (Crassostreagigas)[J].International journal of systematic & evolutionary microbiology,2004,54(6):2137-2140.

        [14] LE ROUX F,GAY M,LAMBERT C,et al.Phylogenetic study and identification ofVibriosplendidus-related strains based ongyrBgene sequences[J].Diseases of aquatic organisms,2004,58(2/3):143-150.

        [15] DIéGUEZ A L,BEAZ-HIDALGO R,CLEENWERCK I,et al.Vibrioatlanticussp.nov.andVibrioartabrorumsp.nov.isolated from the clamsRuditapesphilippinarumandRuditapesdecussatus[J].International journal of systematic & evolutionary microbiology,2011,61(10):2406-2411.

        [16] BRUTO M,JAMES A,PETTON B,et al.Vibriocrassostreae,a benign oyster colonizer turned into a pathogen after plasmid acquisition[J].The ISME Journal,2017,11(4):1043-1052.

        [17] VATTAKAVEN T,BOND P,BRADLEY G,et al.Differential effects of temperature and starvation on induction of the viable-but-nonculturable state in the coral pathogensVibrioshiloiandVibriotasmaniensis[J].Applied & environmental microbiology,2006,72(10):6508-6513.

        [18] FARTO R,ARMADA S P,MONTES M,et al.Vibriolentusassociated with diseased wild octopus (Octopusvulgaris)[J].Journal of invertebrate pathology,2003,83(2):149-156.

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