亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        磁珠法和煮沸法核酸提取在HPV-DNA分型中的比較

        2018-03-29 00:58:19李文靜田芯瑗徐紅星吳冬生許華英
        檢驗醫(yī)學(xué)與臨床 2018年6期
        關(guān)鍵詞:檢測

        許 瓊,李文靜△,田芯瑗,徐紅星,吳冬生,許華英

        (1.南京醫(yī)科大學(xué)附屬蘇州市立醫(yī)院本部檢驗科 215168;2.蘇州大學(xué)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗技術(shù)專業(yè),江蘇蘇州 215000)

        人乳頭瘤病毒(HPV)是乳多空病毒科的一組DNA病毒,目前已鑒定出140多種HPV基因型[1]。人類是HPV唯一宿主,男女老少皆可被感染。除低危亞型(LR-HPV)主要感染手、足皮膚,口腔黏膜和泌尿生殖道上皮細(xì)胞等引起疣變外,高危亞型(HR-HPV)致癌性較強,可引起包括宮頸癌、口咽部和口腔舌鱗狀細(xì)胞癌[2]、外陰癌[3]、頭頸癌等在內(nèi)的惡性病變[4]。因此,HPV基因分型檢測對于高危人群疾病的預(yù)防、早期診斷、治療方案制訂和疫苗的開發(fā)應(yīng)用等具有重要指導(dǎo)意義。

        HPV-DNA的提取是各種基于核酸技術(shù)進行HPV分型的基礎(chǔ),其提取效率的高低直接影響檢測結(jié)果和臨床診療。本研究采用成熟的流式熒光雜交技術(shù)進行多重聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)后續(xù)的雜交分型[5-6],借助臨床常規(guī)宮頸脫落細(xì)胞標(biāo)本及棉拭子標(biāo)本,體外模擬溶血環(huán)境進行了基于手工提取的煮沸法和基于Pre-NAT全自動核酸提取系統(tǒng)的磁珠法在核酸提取中的比較,現(xiàn)報道如下。

        1 資料與方法

        1.1一般資料 標(biāo)本來源于南京醫(yī)科大學(xué)附屬蘇州市立醫(yī)院婦科、宮頸門診、皮膚性病科、泌尿及生殖科門診患者。收集96份常規(guī)宮頸脫落細(xì)胞標(biāo)本、30份皮膚及男性生殖道拭子標(biāo)本進行試驗。采集血紅蛋白(Hb)水平為136 g/L的患者血常規(guī)標(biāo)本,用未采樣脫落細(xì)胞保存液分別稀釋至68.00、34.00、17.00、8.50、4.25、2.13、1.06及0.53 g/L備用。

        1.2儀器與試劑 磁珠法核酸提取試劑來自上海浩源生物科技有限公司;煮沸法HPV核酸提取試劑、HPV核酸擴增試劑、流式熒光雜交法HPV分型試劑盒及宮頸脫落細(xì)胞保存液來自上海透景生命科技有限公司;酚抽提法試劑盒來自江蘇泰州碩世生物科技有限公司。儀器主要有Pre-NAT全自動核酸提取系統(tǒng)(美國Perkin Elmer公司)、Verriti 96孔梯度PCR儀(美國ABI公司)、Luminex200流式熒光點陣儀(上海透景生命科技有限公司)、Bioer恒溫金屬浴等。

        1.3方法

        1.3.1標(biāo)本采集 所有標(biāo)本采集均經(jīng)醫(yī)師征得患者同意并承諾保護患者隱私。宮頸脫落細(xì)胞標(biāo)本:先用棉拭子輕輕拭去宮頸口分泌物,再用專用采樣刷插入宮頸內(nèi)1~2 cm,緊貼宮頸口,稍用力轉(zhuǎn)動3圈,將采樣刷放入標(biāo)本保存液中,輕搖洗滌數(shù)次,以便得到盡可能多的宮頸脫落細(xì)胞;皮膚脫落細(xì)胞采用無菌棉拭子,反復(fù)擦拭病變部位獲得;泌尿生殖系統(tǒng)標(biāo)本采用無菌棉拭子插入陰莖內(nèi)1~2 cm,輕輕旋轉(zhuǎn)2圈停留1~2 min以獲得足夠多的分泌物。

        1.3.2HPV-DNA提取 (1)磁珠法:將標(biāo)本充分混勻,轉(zhuǎn)移500 μL至標(biāo)本管,置于Pre-NAT全自動核酸提取系統(tǒng)標(biāo)本架(標(biāo)本需要量300 μL,一次可檢測96份標(biāo)本)。標(biāo)本首先經(jīng)過抽提液的裂解釋放HPV-DNA,再在磁珠的吸附作用和電磁場作用下,經(jīng)過2次洗滌充分去除雜質(zhì),最后經(jīng)洗脫液使HPV-DNA與磁珠分離,含有HPV-DNA的洗脫液用于PCR擴增。(2)煮沸法:將標(biāo)本充分混勻,取300 μL至EP管,13 000 r/min離心5 min吸棄上清液,加核酸提取液200 μL充分振蕩混勻,100 ℃裂解10 min,13 000 r/min離心5 min,上清液用于PCR擴增。(3)酚抽提法:將標(biāo)本充分混勻,取300 μL至EP管,13 000 r/min離心5 min吸棄上清液,加400 μL裂解液反復(fù)抽打,利用吸附柱2次洗滌去除雜質(zhì),換新收集管,加50 μL洗脫液洗脫吸附柱上的DNA用于PCR擴增。

        1.3.3HPV-DNA擴增 取5 μL HPV-DNA模板加入分裝好的擴增試劑,總體系20 μL,按下列條件進行多重PCR擴增:95 ℃ 5 min;95 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,68 ℃ 30 s 5個循環(huán);95 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,68 ℃ 30 s 30個循環(huán)。

        1.3.4雜交與檢測 將擴增后的DNA產(chǎn)物與探針進行雜交,不同型別的HPV結(jié)合到不同的探針上去,待測的DNA產(chǎn)物再與熒光物質(zhì)藻紅蛋白標(biāo)記的鏈霉親和素(SA-PE)結(jié)合,進行流式分析檢測。通過判斷何種編碼微球及熒光強度,得到數(shù)字化結(jié)果,通過專用軟件分析確定HPV型別。條件:取擴增產(chǎn)物3 μL,加入22 μL微球雜交液95 ℃ 5 min,48 ℃ 30 min;加入SA-PE 75 μL,48 ℃孵育15 min。Globin信號值低于150表示試驗失敗,信號值為150~<300為弱陽性,信號值≥300為陽性。

        1.3.5抗Hb干擾試驗 將4份無Hb污染的HPV-58型陽性患者標(biāo)本混合并分裝成18管(磁珠法與煮沸法各9管,每管300 μL),13 000 r/min離心5 min吸棄上清液后分別加入上述9種不同水平的Hb保存液300 μL,-20 ℃反復(fù)凍融后進行HPV-DNA提取。

        2 結(jié) 果

        2.1兩種核酸提取方法結(jié)果比較 將96份臨床標(biāo)本混勻后各取300 μL用磁珠法和煮沸法進行核酸提取。兩種核酸提取方法檢測結(jié)果一致率為91.7%(88/96),8份標(biāo)本檢測不一致,采用酚抽提法進行驗證,結(jié)果與磁珠法一致,均為弱陽性(信號值為150~<300)。磁珠法內(nèi)參Globin及陽性標(biāo)本HPV亞型信號值均顯著高于煮沸法(t=8.807、4.676,P<0.05)。見表1。

        表1 兩種核酸提取方法檢測結(jié)果比較(n)

        2.2抗Hb干擾試驗 體外模擬不同Hb水平的血性標(biāo)本,采用兩種方法進行核酸提取,檢測結(jié)果及信號值見表2,當(dāng)Hb水平大于17 g/L時,煮沸法HPV-58分型失?。欢胖榉ú皇蹾b干擾。

        表2 不同Hb水平下兩種核酸提取方法的檢測結(jié)果(信號值)

        2.330份棉拭子標(biāo)本檢測結(jié)果 將30份棉拭子浸泡在700 μL生理鹽水中10 min充分洗脫細(xì)胞,混勻后各取300 μL進行檢測。兩種方法均成功檢出內(nèi)參Globin 24份標(biāo)本(80.0%),5份標(biāo)本均檢測失敗。另外,磁珠法HPV陽性率為54.2%,而煮沸法為41.7%(P=0.564)。見表3。

        表3 30份棉拭子標(biāo)本檢測結(jié)果(n)

        3 討 論

        隨著人們健康意識的增強,HPV篩查項目得到普及,檢查量與日俱增。迄今為止,HPV篩查不僅應(yīng)用于女性婦科疾病[7]、皮膚性病檢查[8],還廣泛應(yīng)用于男性泌尿及生殖系統(tǒng)疾病檢查[9]。多重PCR-流式熒光雜交技術(shù)檢測HPV-DNA分型在臨床中已廣泛應(yīng)用[5-6],但在實際工作中,影響因素較多,如實驗室條件、實驗人員技術(shù)、標(biāo)本狀態(tài)等。日常工作中發(fā)現(xiàn),雖然嚴(yán)格遵循采樣操作程序或避開經(jīng)期取樣,相當(dāng)部分患者的脫落細(xì)胞標(biāo)本仍帶有明顯血性,這可能是采樣不慎,或更多由于采樣部位發(fā)生病變所致。而皮膚科患者及男性患者所采集的棉拭子標(biāo)本通常細(xì)胞含量較少。血性標(biāo)本、細(xì)胞量少的標(biāo)本可通過影響核酸提取的質(zhì)和量導(dǎo)致檢測失敗,因此采用純度好、效率高的核酸提取技術(shù)至關(guān)重要。為此,本研究對基于手工提取的煮沸法和基于Pre-NAT全自動核酸提取系統(tǒng)的磁珠法的核酸提取效率進行了比較,旨在解決檢驗工作中的實際問題,更好地服務(wù)臨床。

        D′SOUZA等[10]指出,盡管是來源于同一份HPV標(biāo)本,前處理方法的不同也會導(dǎo)致HPV分型的差異。為使結(jié)果具有可比性,本研究在試驗設(shè)計上除核酸提取過程不同外,其余操作包括標(biāo)本量、模板上樣量、擴增試劑、擴增程序及結(jié)果讀取均相同。對比試驗顯示,兩種方法結(jié)果一致性為91.7%,說明兩種核酸提取方法具有可比性;而8份結(jié)果不一致的標(biāo)本,經(jīng)酚抽提法驗證,其結(jié)果與磁珠法一致,均為弱陽性,說明磁珠法對于病毒表達量低的標(biāo)本更敏感。磁珠法內(nèi)參Globin及HPV亞型信號值均顯著高于煮沸法也支持上述觀點。

        通過體外模擬不同程度溶血環(huán)境發(fā)現(xiàn),Hb對以煮沸變性為原理的核酸檢測技術(shù)存在干擾,而對以磁珠法為提取原理的檢測則無干擾,并且各種Hb水平下的信號值相差不大。研究表明,標(biāo)本中的紅細(xì)胞可通過血紅素的卟啉環(huán)與Taq酶產(chǎn)生不可逆結(jié)合而抑制Taq酶的活性,導(dǎo)致PCR反應(yīng)受到抑制。溶血血清和非溶血血清其乙型肝炎病毒(HBV)-DNA熒光定量PCR檢測結(jié)果差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)[11]。而謝秋華等[12]研究得出,HPV-DNA擴增檢測結(jié)果不受溶血標(biāo)本影響,可能與其實驗的最高Hb水平僅為10 g/L有關(guān)。

        本課題組認(rèn)為,溶血會抑制PCR反應(yīng)毋庸置疑,不同學(xué)者得出的不同結(jié)論主要取決于所用核酸提取方法是否能有效去除各種抑制物。本研究中的煮沸法操作簡便,但提取過程無純化步驟,黏蛋白、免疫球蛋白、蛋白酶和多糖等內(nèi)源性PCR抑制物無法去除,通過干擾核酸提取過程的細(xì)胞裂解或者通過抑制DNA聚合酶活性而干擾PCR反應(yīng)[13]。而磁珠法首先將游離的核酸分子特異地吸附到磁性顆粒表面,與蛋白質(zhì)等雜質(zhì)分離,在磁場作用下經(jīng)過2次洗滌,血紅素中的卟啉環(huán)和黏蛋白等干擾物均能被有效去除,從而保證核酸提取的高純度。酚抽提法則是以吸附柱為純化介質(zhì),其亦能有效去除雜質(zhì),檢測結(jié)果支持磁珠法。

        對于棉拭子標(biāo)本,實際工作中檢測失敗的概率較高,本研究中30份標(biāo)本有5份標(biāo)本采用兩種方法均檢測失敗,說明采樣失敗的可能性極大,結(jié)果報告為內(nèi)對照信號低。而成功檢測的24份標(biāo)本中,磁珠法的陽性率高于煮沸法,雖然差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),仍可說明在細(xì)胞含量較少的情況下,磁珠法能夠更加充分地提取標(biāo)本核酸,從而提高檢測的敏感度和結(jié)果準(zhǔn)確度。

        美國Perkin Elmer公司生產(chǎn)的Pre-NAT全自動核酸提取系統(tǒng),是由美國Janus全自動加樣平臺和德國Chemgic磁珠提取技術(shù)綜合而成,一次性可處理96份標(biāo)本,實現(xiàn)了磁珠法提取的全自動化,順應(yīng)了實驗室檢測自動化的發(fā)展趨勢。該平臺還可進行血清DNA的提取用于HBV-DNA定量檢測[14],用途廣泛。

        與煮沸法相比,磁珠法提取的核酸純度更高,提取效率更高,能夠提高下游檢測敏感度,在臨床常見血性標(biāo)本和皮膚、泌尿生殖道棉拭子標(biāo)本HPV的核酸檢測中具有明顯優(yōu)勢。全自動平臺的使用能減少人力、物力成本,避免人為失誤,提高工作效率。綜上所述,基于Pre-NAT全自動核酸提取系統(tǒng)的磁珠法操作簡便、規(guī)范,檢測通量高,抗干擾能力強,更適應(yīng)于臨床。

        [1]ZHANG S K,GUO L W,CHEN Q,et al.The association between human papillomavirus 16 and esophageal cancer in Chinese population:a meta-analysis[J].BMC Cancer,2015,15(1):99-104.

        [2]BLUMBERG J,MONJANE L,PRASAD M,et al.Investigation of the presence of HPV related oropharyngeal and oral tongue squamous cell carcinoma in Mozambique[J].Cancer Epidemiol,2015,39(6):1000-1005.

        [3]HILL-DANIEL J,ROETT M A.Genital cancers in women:vulvar cancer[J].FP Essent,2015,438(1):31-43.

        [4]GILLISON M L,RESTIGHINI C.Anticipation of the impact of human papillomavirus on clinical decision making for the head and neck cancer patient[J].Hematol Oncol Clin North Am,2015,29(6):1045-1060.

        [5]陳昭華,趙星,徐紅星.流式熒光雜交法檢測人乳頭瘤病毒的臨床應(yīng)用[J].檢驗醫(yī)學(xué)與臨床,2013,10(6):658-686.

        [6]俞錢,徐紅星,朱琴芳.流式熒光雜交法檢測人乳頭瘤病毒基因型的臨床應(yīng)用[J].臨床檢驗雜志,2010,28(4):262-263.

        [7]AGORASTOS T,CHATZISTAMATIOU K,KATSAMAGKAS T,et al.Primary screening for cervical cancer based on High-Risk human papillomavirus(HPV) detection and HPV 16 and HPV 18 genotyping,in comparison to cytology[J].PLoS One,2015,10(3):e0119755.

        [8]何泳潔,曹碧蘭,汪治國,等.132例皮膚疣組織人乳頭瘤病毒分型檢測[J].中華皮膚科雜志,2012,45(7):515-516.

        [9]呂興,馬蘭芳,楊書紅.男性HPV感染的流行病學(xué)研究進展[J].現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué),2015,42(15):2701-2703.

        [10]D′SOUZA G,SUGAR E,RUBY W,et al.Analysis of the effect of DNA purification on detection of human papillo-mavirus in oral rinse samples by PCR[J].J Clin Microbiol,2005,43(11):5526-5535.

        [11]劉小敏,唐恒鋒,李文郎,等.高脂血、溶血標(biāo)本對熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)測定低水平HBV-DNA的影響[J].檢驗醫(yī)學(xué)與臨床,2015,12(21):3217-3218.

        [12]謝秋華,有軍.溶血及宮頸黏液對人乳頭狀瘤病毒DNA檢測結(jié)果的影響[J].中國衛(wèi)生產(chǎn)業(yè),2014,11(4):8-10.

        [13]李金明.實時熒光PCR技術(shù)[M].北京:人民軍醫(yī)出版社,2007:70-71.

        [14]李文靜,徐紅星,陳昭華,等.基于Pre-NAT全自動核酸檢測系統(tǒng)的HBV-DNA超敏檢測試劑方法學(xué)性能驗證[J].臨床檢驗雜志,2015,33(7):532-534.

        猜你喜歡
        檢測
        QC 檢測
        “不等式”檢測題
        “一元一次不等式”檢測題
        “一元一次不等式組”檢測題
        “幾何圖形”檢測題
        “角”檢測題
        “有理數(shù)的乘除法”檢測題
        “有理數(shù)”檢測題
        “角”檢測題
        “幾何圖形”檢測題
        无码人妻久久一区二区三区蜜桃| 国产高潮刺激叫喊视频| 日韩AV无码一区二区三| 美女超薄透明丝袜美腿| 无码三级国产三级在线电影| 日韩av一区二区蜜桃| 漂亮丰满人妻被中出中文字幕| 一边做一边喷17p亚洲乱妇50p | 亚洲日韩av无码| 欧美一级特黄AAAAAA片在线看| 亚洲精品国产品国语在线app | 精品无码国产自产在线观看水浒传 | 蜜桃视频在线观看网址| 国产av精品一区二区三| 国产激情精品一区二区三区| 少妇太爽了在线观看免费视频| 久久国产av在线观看| 在线免费看91免费版.| 亚洲午夜av久久久精品影院色戒| 国产精品99久久久久久猫咪| 国产精品国产午夜免费看福利| 精品国产看高清国产毛片| 偷拍激情视频一区二区| 国产一区二区三区护士| 夜夜夜夜曰天天天天拍国产| 国产精品伦一区二区三级视频| 久久综合五月天| 人妻少妇激情久久综合| 国产亚洲成人精品久久久| 99在线精品免费视频| 色窝窝免费播放视频在线| 亚洲AV无码资源在线观看| 蜜臀精品一区二区三区| 内射人妻无套中出无码| 亚洲欧美精品aaaaaa片| 五码人妻少妇久久五码| 国产精品午夜夜伦鲁鲁| 成人h视频在线观看| 色综合色综合久久综合频道| 日本高清一区二区三区在线| 人妻av中文字幕久久|