孟繁杰,羅麗雙,于月新,張寧,郝冬梅
(中國人民解放軍第202醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)中心,沈陽 110003)
近幾年來,如何普及更精準(zhǔn)的產(chǎn)前篩查項目一直是優(yōu)生優(yōu)育要解決的關(guān)鍵問題,唐氏篩查準(zhǔn)確性低且伴有漏診,并不能成為可信度高的篩查手段。羊水培養(yǎng)雖作為診斷的金標(biāo)準(zhǔn),但很多孕婦無法接受其有創(chuàng)性的采樣手段。孕婦血漿中存在胎兒游離DNA這一發(fā)現(xiàn)改變了這個局面[1-2]。隨著二代測序技術(shù)的迅速發(fā)展,無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測技術(shù)對胎兒染色體非整倍體疾病13-三體綜合征、18-三體綜合征、21-三體綜合征的檢測具有極高的準(zhǔn)確性[3-4],不僅如此,近幾年的研究[5]發(fā)現(xiàn)其對性染色體的檢測也具有很高準(zhǔn)確性。本研究通過對2014年至2016年于中國人民解放軍第202醫(yī)院生殖中心就診的6 283例孕婦的血漿進(jìn)行高通量二代測序,同時對高?;颊哌M(jìn)行有創(chuàng)性介入診斷,明確了無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測對性染色體異常的篩查起到關(guān)鍵作用。
選擇2014年12月至2016年12月間自愿在我院進(jìn)行無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測的6 283例孕婦,年齡16~51歲,平均年齡31.9歲,其中不愿意接受羊水穿刺的高齡孕婦 (>35歲) 1 934例,低齡孕婦4 349例。平均孕周16.09周。
1.2.1 DNA提?。翰裳?(EDTA抗凝) 采取5 mL孕婦外周靜脈全血,4 ℃、1 600 g離心10 min。取上清血漿,4 ℃、16 000 g再次離心10 min。按照核酸提取試劑盒操作說明書進(jìn)行血漿樣本中游離DNA的提取。
1.2.2 文庫構(gòu)建:將提取的DNA進(jìn)行末端修復(fù),并用B1和B2磁珠對其進(jìn)行純化,連接接頭,PCR擴(kuò)增。
1.2.3 文庫定量:采用qPCR的方法對構(gòu)建完的文庫進(jìn)行DNA定量并分析數(shù)據(jù)。
1.2.4 測序模板的制備:將文庫根據(jù)定量后的數(shù)據(jù)進(jìn)行混合,采用One Touch2對混合后的文庫進(jìn)行擴(kuò)增,最后用ES對模板序列進(jìn)行富集操作。
1.2.5 用BioelectronSeq 4000進(jìn)行上機(jī)測序:開啟氮氣瓶,用18 MΩ純水進(jìn)行儀器清洗;儀器初始化;設(shè)置Plan;準(zhǔn)備上機(jī)文庫;上機(jī)和測序。
1.2.6 測序數(shù)據(jù)分析:測序結(jié)束后,運用無創(chuàng)產(chǎn)前數(shù)據(jù)分析管理軟件對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,得到樣本X染色體和Y染色體的Z值,根據(jù)每個樣本的Z值判斷樣本的檢測結(jié)果。
參加無創(chuàng)基因檢測的6 283例孕婦中,包含相當(dāng)一部分染色體非整倍體的高危人群。這些高危人群包括高齡孕婦( 分娩時年齡≥35歲) ,占36%( 2 262/6 283) ;血清學(xué)唐氏篩查結(jié)果顯示高危的孕婦,占7%( 377/6 283) ;彩超顯示胎兒異常的孕婦,占2%(125/6 283) 。除此之外,還包括一些通過體外授精手段成功受孕的孕婦,占7%( 440/6 283) ,其他占49%(3 079/6 283) 。
無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測的6 283例樣本中篩查出性染色體異常14例,篩查陽性率為0.22%。這14例陽性結(jié)果中包括6例XO高危、6例XXY高危和2例XXX高危。其中,1例XO高危、1例XXY高危和1例XXX高危孕婦拒絕進(jìn)一步診斷,對其余11例樣本進(jìn)行了核型分析。結(jié)果顯示:11例患者中,5例XO高危中2例被確診為胎兒性染色體異常 (其中1例確診為XO/XXX嵌合體,另外1例確診為XO) ,3例被確診為正常核型;5例XXY高危都被確診為XXY;1例XXX高危確診為XXX。本研究中無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測性染色體異常的準(zhǔn)確率為73% (8/11) 。見表1。
2011年至2014年我院未開展無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測前,平均每年通過羊水培養(yǎng)性染色體異常胎兒的檢出率為0.8%,其中2011年為0.9% (2/229), 2012年為1.1% (2/189), 2013年為 0.7% (1/154), 2014年為 0.6%(1/167)。2015年至2016年我院開展無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測后,平均每年性染色體異常胎兒的檢出率為4.3%,其中2015年為4.5% (5/112) ,2016年為4.1%(4/145) 。與2011年至2014年未開展無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測相比,2015年至2016年我院胎兒性染色體異常檢出率增加,差異有統(tǒng)計學(xué)意義 (χ2=11.394,P < 0.05) 。
胎兒游離DNA在母體外周血循環(huán)中的發(fā)現(xiàn),標(biāo)志著胎兒無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測領(lǐng)域的開端,并且使得無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測得以發(fā)展。無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測作為一項通過分析孕婦外周血中游離DNA染色體數(shù)量的差異、對胎兒染色體非整倍體疾病21-三體綜合征 (唐氏綜合癥) 、18-三體綜合征 (愛德華氏綜合征) 、13-三體綜合征 (帕陶氏綜合征) 進(jìn)行無創(chuàng)產(chǎn)前篩查項目,以其高靈敏性 (98.6%~100%) 和高特異性 (99.7%~100%) 而被廣泛用于臨床[6-10]。在我院參加無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測的6 283例孕婦中發(fā)現(xiàn),無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測不只對這3對染色體有著很高的準(zhǔn)確性,對胎兒性染色體異常的檢測也有著很高的準(zhǔn)確性,并且在我院近2年的應(yīng)用中,對提高性染色體非整倍體異常的檢出率起到了很大的作用。
性染色體非整倍體異常主要包括Turner綜合征(45,XO) 、克氏綜合征 (47,XXY) 、超雌綜合征 (47,XXX) 、超雄綜合征 (47,XYY) 。這些疾病在胎兒生長發(fā)育過程中造成不同程度的影響,包括性器官發(fā)育不全,伴有智力、神經(jīng)功能障礙或其他臟器功能異常。其中,Turner綜合征在胎兒中的發(fā)病率約為1/2 500,并且有研究[11]表明首胎是Turner綜合征的母親再次懷孕時,胎兒為Turner綜合征的概率比一般人群高35倍,發(fā)病率為1.4%??耸暇C合征在男嬰中的發(fā)病率約為0.23%[12]。這些性染色體異??赡軐?dǎo)致胎兒性分化異常,從而導(dǎo)致其生殖器官發(fā)育不全、智力和生長發(fā)育障礙、智力低下、心腎發(fā)育異常等癥狀[13]。性染色體異常很少致死(除3個月內(nèi)自然流產(chǎn))[14],在B超下更是很難發(fā)現(xiàn)異常。羊水穿刺是診斷性染色體異常的有效手段,但由于其有創(chuàng)性,很少有孕婦會選擇這項檢查。近幾年來,雖然人們優(yōu)生意識有所提升,但每年在我院做診斷的總?cè)藬?shù)平均只有180人。這種低診斷率使得性染色體異常的胎兒很難被及時發(fā)現(xiàn),錯過最佳的身體和心理治療時間,直到生育年齡才在不孕不育門診發(fā)現(xiàn)這一問題,我院每年都有一些因為性染色體異常導(dǎo)致不孕不育的夫妻前來就診。所以,對性染色體異常進(jìn)行無創(chuàng)篩查是臨床上需要的一種檢測[10]。我院開展無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測后,其不僅對胎兒染色體非整倍體疾病13-三體綜合征、18-三體綜合征、21-三體綜合征的檢測有很高的準(zhǔn)確性和特異性,對性染色體異常檢測的準(zhǔn)確性也很高。而且,由于其無創(chuàng)的特點,大多孕婦可以接受這種檢測手段。近2年共有6 283例孕婦在我院接受這項檢測,其中36%為高齡人群,7%為人工授精受孕,這些孕婦很難接受羊水穿刺這種有創(chuàng)的檢測手段。在檢測到的14例無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測顯示性染色體異常的孕婦,仍有3例拒絕羊水穿刺診斷堅持分娩胎兒。無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測技術(shù)雖然對于性染色體異常的檢測只是一種篩查手段,但由于其高準(zhǔn)確率的特點,可以提示孕婦在分娩之后注意觀察孩子的生長發(fā)育,盡早發(fā)現(xiàn)、診斷和治療患兒,在最佳階段對患兒進(jìn)行生長激素、性激素治療和心理輔導(dǎo)。
表1 無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測性染色體異常結(jié)果Tab.1 Sex chromosome abnormalities detected by non-invasive prenatal genetic testing
我院從2014年12月開始開展無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測,在此之前,無胎兒性染色體異常的篩查方法,都是對一些高危人群通過羊水培養(yǎng)方法診斷出性染色體異常胎兒。2011年前,在我院做羊水穿刺的孕婦較少,并且無胎兒性染色體異常的孕婦做羊水培養(yǎng)。隨著對優(yōu)生優(yōu)育的重視,自2011年后進(jìn)行羊水培養(yǎng)的孕婦數(shù)量有所增加。在我院開展無創(chuàng)產(chǎn)前篩查這2年里,胎兒性染色體檢出率明顯提高,由2011年至2014年的平均0.8%升高至2015年至2016年的平均4.3%,說明無創(chuàng)產(chǎn)前篩查可以很有效的提高性染色體異常的檢出率。由此可見,無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測的開展對性染色體異常的檢出起到關(guān)鍵作用。
[1] LO YM,CORBEETTA N,CHAMBERLAIN PF,et al. Presence of fetal DNA in maternal plasma[ J]. Lancet,1997,350( 9076) :485-487.
[2] DONDORP W,DE WERT G,BOMBARD Y,et al. Non-invasive prenatal testing for aneuploidy and beyond:challenges of responsible innovation in prenatal screening[ J]. Nature Publishing Group,2015,23( 11) :1438-1450. DOI:10.1038/ejhg.2015.109.
[3] PENG XL,JIANG P. Bioinformatics approaches for fetal DNA fraction estimation in noninvasive prenatal testing[ J]. Int J Mol Sci,2017,18(2) :453-462. DOI:10.3390/ijms18020453.
[4] STRAVER R,OUDEJANS CB,SISTERMANS EA,et al. Calculating the fetal fraction for noninvasive prenatal testing based on genome-wide nucleosome profiles[ J]. Prenat Diagn,2016,36( 7) :614-621. DOI:10.1002/pd.4816.
[5] WANG S,HUANG S,MA L,et al. Maternal X chromosome copy number variations are associated with discordant fetal sex chromosome aneuploidies detected by noninvasive prenatal testing[ J]. Clin Chim Acta,2015,444:113-116. DOI:10.1016/j.cca.2015.02.014.
[6] CHETTY S,GARABEDIAN MJ,NORTON ME,et al. Uptake of noninvasive prenatal testing ( NIPT) in women following positive aneuploidy screening[ J]. Prenat Diagn,2013,33( 6) :542-546. DOI:10.1002/pd.4125.
[7] BIANCHI DW,PLATT LD,GOLDBERG JD,et al. Genome-wide fetal aneuploidy detection by maternal plasma DNA sequencing[ J]. Obstet Gynecol,2012,119(5):890-901. DOI:10.1097/AOG.0b013e-31824fb482.
[8] NORTON ME,BRAR H,WEISS J,et al. Non-invasive chromosomal evaluation ( NICE) study:results of a multicenter prospective cohort study for detection of fetal trisomy 21 and trisomy 18[ J].Am J Obstet Gynecol,2012,207( 137) :131-138. DOI:10.1016/j.ajog.2012.05.021.
[9] NICOLAIDES KH,SYNGELAKI A,GIL M,et al. Validation of targeted sequencing of single-nucleotide polymorphisms for non-invasive prenatal detection of aneuploidy of chromosomes 13,18,21,X,and Y[J]. Prenat Diagn,2013,33( 6) :575-579. DOI:10.1002/pd.4103.
[10] BIANCHI DW,PARKER RL,WENTWORTH J,et al. DNA sequencing versus standard prenatal aneuploidy screening[ J]. N Engl J Med,2014,370( 9) :799-808. DOI:10.1056/NEJMoa1311037.
[11] BTYANT DM,HOEFT F,LAI S,et al. Sex chromosomes and brain:a study of neuroanatomy in XYY syndrome[ J]. Dev Medv Child Neurol,2012,54( 12) :1149-1156. DOI:10.1111/j.1469-8749.2012.04418.x.
[12] JO DG,SEO JT,LEE JS,et al. Klinefelter syndrome diagnosed by prenatal screening tests in high-risk groups[ J]. Korean J Urol,2013,54( 4) :263-265. DOI:10.4111/kju.2013.54.4.263.
[13] 周靜,林遠(yuǎn)珊,曹荔,等. 69,XXY伴嚴(yán)重生長遲緩及眼球突出病例的產(chǎn)前診斷[J]. 中國優(yōu)生與遺傳雜志,2007,15( 10) :51-53.DOI:10.3969/j.issn.1006-9534.2007.10.026.
[14] HELD KR,KERBER S,KAMINSKY E,et al. Mosaicism in 45,X Turner syndrome:does survival in early pregnancy depend on the presence of two sex chromosomes?[ J]. Hum Genet,1992,88( 3) :288-294.