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        干細胞資源庫及信息管理系統(tǒng)的標準化建設

        2018-03-19 06:18:01趙慶輝周紅梅湯紅明穆會玲張乃心劉中民
        轉(zhuǎn)化醫(yī)學雜志 2018年1期
        關鍵詞:生物管理研究

        趙慶輝,周紅梅,湯紅明,何 斌,穆會玲,張乃心,劉中民

        當前人工器官、器官移植和組織工程等方法已經(jīng)成為組織或器官、損傷、缺損等修復或治療的重要手段[1-5],而術后排斥反應、感染、免疫反應、供體來源困難等問題日益突出。干細胞技術的進步,可“制造或再生”出結構和功能均較為復雜的器官,為干細胞治療、組織替代治療、器官移植等提供新的技術途徑[6-11]。

        干細胞技術的誕生堪稱是生物醫(yī)學發(fā)展史上重要里程碑,尤其是2項技術革新突破。Ashworth等[12]完成了動物克隆實驗,證實了成體細胞的巨大潛能。Thomson等[13]培養(yǎng)出的人類胚胎干細胞,為組織再生與修復提供了新的細胞來源。干細胞是具有自我更新和分化潛能的細胞,具有可塑性。理論上,在一定條件下,可以定向分化成機體的功能細胞,形成任何類型的組織和器官。

        借助于干細胞與再生醫(yī)學全球發(fā)展的強勁勢頭,干細胞臨床研究迎來歷史性機遇。干細胞資源是干細胞臨床研究、再生醫(yī)學研究的基石與基礎組件,它將成為疾病研究、藥物研發(fā)的寶貴資源,在疾病預測、診斷及治療上變得極為重要。干細胞資源庫及信息管理系統(tǒng)的標準化建設促進細胞、體液、組織及器官等樣本的處理、貯存、質(zhì)量控制等技術改進與發(fā)展,也將帶動一系列新方法、新技術、新理念的涌現(xiàn)與進步[14-15]。

        上海市東方醫(yī)院(同濟大學附屬東方醫(yī)院,以下簡稱“東方醫(yī)院”)生物樣本庫創(chuàng)建于2015年,是國內(nèi)首家集干細胞資源和其他樣本資源為一體的標準化樣本庫。一期投資金額約3 000萬元,占地面積約550平方米。目前擁有種子庫、主庫、工作庫、產(chǎn)品庫、第三方細胞儲存中心5大功能的干細胞資源庫和涵蓋符合大學、醫(yī)院重點學科發(fā)展所需的組織、體液等樣本與其他臨床特色資源,以期為干細胞臨床研究和應用服務,亦為高校、科研院所、企事業(yè)單位等提供科研、臨床、藥物篩選等需求的合格樣本。

        1 干細胞資源庫概況

        根據(jù)國際生物和環(huán)境樣本庫協(xié)會(International Society for Biological and Environmental Repositories,ISBER)最佳實踐、中國醫(yī)藥生物技術協(xié)會組織生物樣本庫分化驗收手冊、美國血庫協(xié)會(American Association of Blood Banks,AABB)相關標準與《中華人民共和國藥典》關于細胞庫建設的規(guī)范等,各功能區(qū)進行布局規(guī)劃(圖1)。

        圖1 東方醫(yī)院生物樣本庫平面布局圖

        目前,東方醫(yī)院生物樣本庫可貯存樣本量達300萬份。功能區(qū)域涵蓋細胞存儲區(qū)(細胞種子庫、主細胞庫與工作細胞庫)、組織樣本存儲區(qū)(深低溫冰箱區(qū)和氣相液氮罐區(qū))、病理蠟塊貯存室、組織樣本處理區(qū)、質(zhì)控區(qū)、細胞收發(fā)區(qū)、組織樣本收發(fā)區(qū)、檔案室、總控室、庫房等(圖2)。生物樣本庫現(xiàn)配有氣相液氮罐44臺(液氮罐配備自動化液氮管道和液氮供應塔)、深低溫冰箱15臺,并配備冷鏈監(jiān)控系統(tǒng),以及擁有離心機、生物安全柜、純水機、PCR儀、酶標儀等儀器設備,總價值約2 500萬元。

        A:內(nèi)走廊;B:液氮存儲區(qū);C:深低溫冰箱存儲區(qū);D:病理蠟塊存儲區(qū);E:細胞收發(fā)區(qū);F:質(zhì)控室圖2 東方醫(yī)院生物樣本庫實體圖

        東方醫(yī)院已建立并逐步完善一支過硬的生物樣本庫專職技術和管理隊伍,通過與大學、醫(yī)學院、其他醫(yī)院等協(xié)助共享,形成國內(nèi)較大的生物樣本庫共享平臺,為人類疾病基因和功能基因研究提供臨床樣本資源,并為人類疾病的生物醫(yī)學和轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究構建良好平臺,把臨床優(yōu)勢與基礎需要有機結合,帶動臨床,科研與教學工作,提升學科競爭力和學術影響力。生物樣本庫結構與功能見圖3所示。

        圖3 生物樣本庫結構與功能示意圖

        2 信息管理系統(tǒng)標準化建設

        2.1 建設思路 由東方醫(yī)院創(chuàng)新打造的干細胞臨床研究信息管理系統(tǒng)涵蓋臨床部、制備部、檢測部、樣本部、質(zhì)量部等單元功能模塊。信息管理系統(tǒng)采用閉環(huán)設計理念,各單元功能模塊交互貫通。樣本信息由臨床部發(fā)起,經(jīng)由樣本部到制備部、檢測部、樣本部、質(zhì)量部、最后回到臨床部。

        2.2 功能單元 東方醫(yī)院干細胞臨床研究信息管理系統(tǒng)按照國家法律法規(guī)、相關行業(yè)標準與政策的要求,分為以下功能單元。①臨床部,職責為項目方案申請、學術委員會評審、倫理審查與知情同意、受試者招募、樣本采集、臨床研究與跟蹤隨訪等。②制備部,職責為樣本接收、分離純化、培養(yǎng)擴增、誘導分化、凍存轉(zhuǎn)運、復蘇取樣等。③檢測部,職責為樣本接收、篩查質(zhì)檢、報告發(fā)放、室內(nèi)質(zhì)控與室間質(zhì)評等。④樣本部,職責為樣本接收、注釋標識、入庫存儲、放行分發(fā)、包裝運輸、廢除登記等。⑤信息部,職責為系統(tǒng)維護、安全防護、備份恢復、隱私保護、權限分配、放行審批等。⑥質(zhì)量部,職責為質(zhì)量體系與質(zhì)控制度建立、過程監(jiān)督與檢查、內(nèi)部審核、外部審核與認證認可等。

        2.3 初步建設成效

        2.3.1 臨床資料數(shù)據(jù)庫子系統(tǒng) 建立了臨床數(shù)據(jù)的抽取、存儲支持平臺,降低了醫(yī)院業(yè)務系統(tǒng)的負荷,同時對臨床數(shù)據(jù)的統(tǒng)一存儲管理,有利于臨床數(shù)據(jù)的準確性和一致性,方便數(shù)據(jù)的查詢搜索。臨床資料數(shù)據(jù)庫子系統(tǒng)實現(xiàn)的功能有:適配器管理、來源管理、患者管理、結構管理、映射管理等。

        2.3.2 干細胞臨床研究項目管理子系統(tǒng) 初步建立了干細胞臨床研究子系統(tǒng)(院內(nèi)版),以及優(yōu)化了干細胞臨床研究試驗管理和執(zhí)行流程,以便于提高干細胞臨床試驗的質(zhì)量,協(xié)助研究者更便捷的完成科學研究。

        干細胞臨床研究項目管理子系統(tǒng)實現(xiàn)的功能有干細胞臨床研究項目管理、學術委員會管理、倫理委員會管理、項目信息管理、供體管理、受試者信息管理、生物樣本采集、隨訪管理、電子病例設計器管理、經(jīng)費管理、質(zhì)量控制、設備管理、培訓管理、文件管理、科研項目管理、系統(tǒng)設置、工作人員履歷管理等。

        2.3.3 臨床數(shù)據(jù)與樣本資源庫管理系統(tǒng) 初步建立了臨床數(shù)據(jù)與樣本資源庫管理系統(tǒng)(院內(nèi)版),以及優(yōu)化了樣本的存儲和管理流程,以便于后期樣本的使用和價值最大化。

        生物樣本庫管理子系統(tǒng)實現(xiàn)的功能有容器管理、樣本管理、樣本源管理、數(shù)據(jù)管理、隨訪管理、質(zhì)控管理、統(tǒng)計分析、報警管理、操作日志管理、用戶組和樣本組管理、題庫和問卷管理、條形碼打印、系統(tǒng)設置、組合查詢等。

        3 展望

        干細胞資源庫與信息管理系統(tǒng)的標準化建設將促進資源整合與優(yōu)化,打破基礎與臨床研究圍墻和壁壘,改變固有的轉(zhuǎn)化模式。通過對樣本信息和臨床信息關聯(lián)分析來探究疾病的發(fā)生、發(fā)展、分型、轉(zhuǎn)歸等,以提高臨床診治水平,從而實現(xiàn)“從臨床中來到臨床中去”與“個體化精準治療”目標,推進轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究與促進精準醫(yī)療的發(fā)展。

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        [3] 邢飛,彭靜,陳龍,等.組織工程骨膜包被雙相陶瓷磷酸鈣修復兔尺骨缺損[J] .中國組織工程研究與臨床康復,2016,20(47):7006-7013.

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