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        誘導(dǎo)型啟動子在植物基因工程中的研究進展

        2018-03-03 07:30:21楊瑞娟白建榮常利芳
        山西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年2期
        關(guān)鍵詞:誘導(dǎo)型擬南芥元件

        楊瑞娟 ,白建榮 ,李 銳 ,常利芳

        (1.山西大學(xué)生物工程學(xué)院,山西 太原 030006;2.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所,山西 太原 030031)

        啟動子是位于基因的上游,能夠被RNA聚合酶特異性識別的一段DNA序列。它像“開關(guān)”,控制基因表達的起始時間和程度。啟動子組成包括核心啟動子與上游啟動子元件。核心啟動子由轉(zhuǎn)錄起始位點、TATA框和5'UTR序列組成[1-2]。上游啟動子元件包括CAAT框、GC框和一些組成型及特異型元件,這些元件結(jié)合相應(yīng)的蛋白因子能夠提高轉(zhuǎn)錄效率[3]。啟動子按功能及作用方式可分為誘導(dǎo)型啟動子、組織特異型啟動子和組成型啟動子[4]。但是某些條件下,一個啟動子可能有2類啟動子的特性[5]。

        植物基因工程是將外源基因?qū)胧荏w細胞,使其與受體染色體整合,改變受體植物遺傳特性的一種方法。它不但可以克服物種間的生殖隔離,還可以大大加快植物育種進程。外源基因的表達必須有啟動子的驅(qū)動。傳統(tǒng)的基因工程中使用的大多是組成型啟動子,它在植物的整個生命周期中都高強度表達,導(dǎo)致基因產(chǎn)物過度累積以及隨之而來的代謝紊亂甚至植物死亡。誘導(dǎo)型啟動子是在植物適應(yīng)環(huán)境和長期進化過程中形成的,能夠響應(yīng)特殊的生物、物理、化學(xué)信號,進而提高特定基因轉(zhuǎn)錄水平,來適應(yīng)一定范圍內(nèi)環(huán)境變化的一類啟動子。在沒有誘導(dǎo)因子存在的條件下,它控制的編碼基因不表達或本底表達,一旦環(huán)境中出現(xiàn)誘導(dǎo)因素,編碼基因表達迅速增加。按照響應(yīng)環(huán)境的不同可以分為生物脅迫誘導(dǎo)的啟動子、物理脅迫誘導(dǎo)的啟動子、化學(xué)脅迫誘導(dǎo)的啟動子[6]。誘導(dǎo)型啟動子不但可以避免目的基因的持續(xù)表達對植物能量的過度消耗,而且可以消除基因產(chǎn)物積累對植物本身造成的傷害,成為近年來植物基因工程的研究熱點。

        筆者從生物、物理、化學(xué)3個誘導(dǎo)方面對抗逆相關(guān)誘導(dǎo)型啟動子的研究進行了綜述,以期為相關(guān)學(xué)者的研究提供依據(jù)。

        1 生物脅迫誘導(dǎo)型啟動子

        植物在生長發(fā)育過程中會受到病原微生物如病毒、細菌、真菌等的侵染以及害蟲的吞食侵害,從而導(dǎo)致存活率下降。生物脅迫誘導(dǎo)型啟動子是指在植物受到生物脅迫時可以激活保護蛋白基因并調(diào)控其相關(guān)表達,從而消除有害代謝產(chǎn)物對植物自身起到保護作用。目前相關(guān)研究已取得一定進展(表1)。

        表1 生物脅迫誘導(dǎo)型啟動子

        1.1 病原菌誘導(dǎo)型啟動子

        WRKYs轉(zhuǎn)錄因子在植物抗病反應(yīng)中起重要作用,PETITOT等[7]克隆了咖啡WRKY轉(zhuǎn)錄因子的同源基因啟動子CaWRKY1a和CaW-RKY1b,發(fā)現(xiàn)真菌脅迫可以誘導(dǎo)該啟動子。何康[8]通過研究水稻抗紋枯病基因OS2H16啟動子POs2H16,確定AATCA片段能夠獨立響應(yīng)紋枯病菌誘導(dǎo)。牟少亮等[9]研究發(fā)現(xiàn),OsERF96基因可應(yīng)答白葉枯病或稻瘟病病原菌的侵染,其啟動子可以應(yīng)答病原菌侵染誘導(dǎo)。

        1.2 害蟲誘導(dǎo)型啟動子

        當(dāng)受到害蟲吞食后植物體內(nèi)水楊酸(SA)劇增,促使相關(guān)基因表達。KUMAR等[22]將煙草病害蛋白啟動子PR-1a嵌合CaMV35S導(dǎo)入棉花,發(fā)現(xiàn)昆蟲吞食能夠驅(qū)動cry1EC基因表達,同時噴施SA可以提高棉花的抗蟲性。有研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)擬南芥根部有線蟲寄生時,3種細菌防衛(wèi)素基因(Pdf2.1,Pdf2.2,Pdf2.3)被誘導(dǎo)表達。SIDDIQUE等[23]將Pdf2.1啟動子與GUS基因融合轉(zhuǎn)入擬南芥之后用線蟲感染,發(fā)現(xiàn)GUS基因在其根中特異性表達。關(guān)麗梅等[24]將從秈稻基因組中獲得的Os01g73940啟動子片段BPHIP連接到帶有GUS報告基因的植物表達載體上,并轉(zhuǎn)入中花11。通過GUS組織化學(xué)染色和定量RT-PCR檢測證明,BPHIP是一個受褐飛虱和茉莉酸處理誘導(dǎo)上調(diào)的啟動子。

        2 物理脅迫誘導(dǎo)型啟動子

        物理脅迫誘導(dǎo)型啟動子是指響應(yīng)光、極端溫度、干旱等逆境脅迫使植物適應(yīng)非正常光照、溫度和干旱等惡劣環(huán)境,維持生長發(fā)育。這類啟動子的研究開始的較早,研究成果最多(表2)。

        2.1 光誘導(dǎo)型啟動子

        光在植物生長發(fā)育中起重要作用,如光合作用、光形態(tài)建成。常見的光誘導(dǎo)型啟動子有cab啟動子和rbcS基因啟動子。一般光誘導(dǎo)啟動子同時具有綠色組織特異性[5,25]。王旭靜等[25]研究發(fā)現(xiàn),中棉Gacab啟動子含有GT1元件I-box和G-box等光誘導(dǎo)元件并且具有光誘導(dǎo)性。習(xí)雨琳等[5]將A-tRBCS-1A啟動子片段轉(zhuǎn)化擬南芥,分析不同光照條件下的表達模式,結(jié)果顯示,該啟動子是光誘導(dǎo)型和組織特異型啟動子。

        2.2 溫度誘導(dǎo)型啟動子

        2.2.1 高溫誘導(dǎo)型啟動子 高溫脅迫條件下植物體內(nèi)會大量合成如HSP70,HSP90和HSP100等熱激蛋白來減輕脅迫引起的傷害[26],當(dāng)熱激元件HSE與熱激因子HSF相互作用才能激活熱激蛋白基因的轉(zhuǎn)錄活性。RR?NDL等[27]研究發(fā)現(xiàn),大豆Gmhsp17.32B啟動子具有一段熱誘導(dǎo)因子(HSE)的同功序列。FREEMAN等[28]研究表明,大麥Hvhsp17基因啟動子在高溫下能驅(qū)動Hvhsp17基因在水稻中表達。

        2.2.2 冷凍誘導(dǎo)型啟動子 低溫條件下,植物體內(nèi)會發(fā)生如改變蛋白質(zhì)、碳水化合物組分或合成一些新的物質(zhì)等一系列生化反應(yīng)。冷響應(yīng)基因COR(cold-regulated)含有順式作用元件CRT和DRE[29]。BELINTANI等[30]研究發(fā)現(xiàn),甘蔗ipt基因啟動子ATCOR15a可使ipt基因在冷凍脅迫下表達量增加,減少冷凍引起植物的損傷。WANG等[31]分離了玉米中受低溫、干旱誘導(dǎo)顯著表達的蛋白激酶基因ZmCKS2的啟動子,并對其進行功能驗證。結(jié)果表明,ZmCKS2啟動子受干旱、低溫脅迫和不同激素(ABA,MeJA,SA)的多因素誘導(dǎo),缺失啟動子片段P2(367 bp)是受低溫、MeJA和SA誘導(dǎo)的最小的啟動子片段。呂兆勇等[32]研究證明,葡萄PCAN啟動子具有低溫和干旱脅迫下誘導(dǎo)表達的特性(表2)。

        表2 物理脅迫誘導(dǎo)型啟動子

        2.3 干旱誘導(dǎo)型啟動子

        干旱條件下,植物根毛細胞感知水分脅迫信號并進行信號轉(zhuǎn)導(dǎo),誘導(dǎo)水分脅迫相關(guān)基因的表達。1992年YAMAGUCHI-SHINOZAKI等[53]首次從擬南芥中分離并且克隆出逆境誘導(dǎo)型啟動子rd29。BIHMIDINE等[54]研究發(fā)現(xiàn),rd29A,rd29B基因啟動子在干旱條件下均被明顯激活,是抗旱型啟動子。楊梅等[55]分離了干旱脅迫強烈誘導(dǎo)的水稻內(nèi)源基因Oshox24的啟動子Oshox24P,并通過GUS活性檢測證明,該啟動子是干旱誘導(dǎo)型啟動子,可以調(diào)控目標(biāo)基因在水稻中的表達。

        3 化學(xué)脅迫誘導(dǎo)型啟動子

        化學(xué)脅迫誘導(dǎo)型啟動子是指在激素、高鹽、營養(yǎng)元素缺乏和含量過高等逆境條件下使植物可以生長的一類啟動子。這類啟動子的誘導(dǎo)因素受人類活動影響較大,比如為了作物增產(chǎn)而過量施肥,導(dǎo)致土地鹽堿化和土壤板結(jié),使農(nóng)作物受到新的脅迫,導(dǎo)致減產(chǎn)。與物理脅迫誘導(dǎo)型啟動子相比,該類啟動子研究較少(表3)。

        表3 化學(xué)脅迫誘導(dǎo)型啟動子

        3.1 激素誘導(dǎo)型啟動子

        植物的生長發(fā)育過程受激素的調(diào)節(jié)作用,但是激素不能直接作用于啟動子序列,而是先與植物體內(nèi)受體結(jié)合,激活受體蛋白,然后再由作用于啟動子中相應(yīng)激素應(yīng)答元件,驅(qū)動下游基因的表達,從而引起一系列生理反應(yīng)[87]。XU等[70]分離了白松PsPR10啟動子,并構(gòu)建融合報告基因載體轉(zhuǎn)入煙草,分別用 SA,ABA,JA,NaCl,甘露醇和 PEG-6000 處理轉(zhuǎn)基因植株,分別分析各種脅迫條件下GUS基因在根、莖、葉中的表達。結(jié)果表明,在所有脅迫條件下根的GUS活性均比對照組高,而莖和葉中GUS活性只在SA,ABA和JA條件下有增高。余建等[74]克隆了桑樹MnACO基因MnACO1啟動子片段,對序列進行分析發(fā)現(xiàn),含有響應(yīng)赤霉素的GARE-motif和響應(yīng)植物激素的AuxRE元件。GUS活性分析表明,MnACO1為誘導(dǎo)型啟動子兼具組成型啟動子特性。

        3.2 鹽誘導(dǎo)型啟動子

        最早被克隆并進行功能分析的鹽誘導(dǎo)型啟動子是擬南芥rd29A基因的啟動子[53]。張新宇等[82]對經(jīng)300 mmol/LNaCl處理前后的轉(zhuǎn)AtPUB18基因啟動子的擬南芥幼苗進行組織化學(xué)染色,結(jié)果表明,處理后GUS基因的表達量明顯上調(diào),說明At-PUB18基因啟動子是高鹽誘導(dǎo)型啟動子。SUN等[83]研究發(fā)現(xiàn),旱稻液泡膜質(zhì)子轉(zhuǎn)運焦磷酸酶啟動子TsVP1在高鹽誘導(dǎo)下有較強的活性。

        3.3 營養(yǎng)元素相關(guān)誘導(dǎo)型啟動子

        營養(yǎng)元素在植物的生命活動中起重要作用,是植物正常的生長發(fā)育不可缺少的因素。在一定的濃度范圍內(nèi),植物可以正常吸收外界環(huán)境中的營養(yǎng)元素,然而當(dāng)環(huán)境中元素濃度不足或者過高,卻會對植物造成脅迫,影響植物生長發(fā)育。

        氮是植物蛋白質(zhì)、核酸和葉綠素的重要組成部分,氮素的含量直接影響葉片中葉綠素的含量,土壤中氮素缺乏會導(dǎo)致植物葉片黃化、根系量減少。劉生等[84]克隆了2個在大豆葉片或根系高豐度表達且響應(yīng)低氮脅迫的基因(RNDI和LNDI)的啟動子,并分別融合GUS基因轉(zhuǎn)化擬南芥。GUS染色表明,2個基因的啟動子都對低氮脅迫有響應(yīng),在氮素脅迫環(huán)境條件下能夠調(diào)控組合的功能基因表達。銅是植物體多種酶類(細胞色素氧化酶、抗壞血酸氧化酶、多酚氧化酶等)的組成成分,還與光合作用有關(guān)。但植物正常生長對銅需要少,土壤中銅含量由于污水灌溉和施用農(nóng)藥遠遠超過了植物所需,導(dǎo)致植物生長受抑制甚至死亡。鐘活權(quán)[86]研究發(fā)現(xiàn),擬南芥AtRD22啟動子含有多個銅響應(yīng)元件CURECORECR,把該啟動子與連接GUS報告基因轉(zhuǎn)化擬南芥后,發(fā)現(xiàn)高Cu2+脅迫條件下,AtRD22啟動子能明顯誘導(dǎo)GUS基因在轉(zhuǎn)基因擬南芥莖和葉中表達。

        4 小結(jié)與展望

        誘導(dǎo)型啟動子是僅在轉(zhuǎn)基因植物受到外界脅迫時驅(qū)動外源基因表達的一種啟動子,相比組成型啟動子的表達模式,誘導(dǎo)型啟動子可以節(jié)約植物體能量,減輕代謝負擔(dān),在避免目的基因過量表達對植物的負面影響的同時提高植物抗逆性,具有重要的科研價值和商業(yè)價值。啟動子主要通過順式作用元件來調(diào)控基因表達。一種啟動子常常存在多種順式作用元件,這些元件以特殊組合方式調(diào)控相關(guān)抗逆基因的表達。目前脅迫誘導(dǎo)啟動子研究主要集中在極端溫度、干旱和高鹽等方面,而關(guān)于營養(yǎng)元素相關(guān)的誘導(dǎo)型啟動子報道較少。

        綜上所述,研究誘導(dǎo)型啟動子作用方式和信號傳遞途徑之間聯(lián)系,可以為外源基因在轉(zhuǎn)基因植株精細調(diào)節(jié)提供理論依據(jù)。同時開展誘導(dǎo)型啟動子尤其是營養(yǎng)元素相關(guān)的啟動子研究,培育營養(yǎng)元素高吸收利用和重金屬耐受性新品種。最終將相關(guān)研究結(jié)果大規(guī)模應(yīng)用于生產(chǎn)實踐,加速植物基因工程改良植物的進程。

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