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        直腸癌化療對5-氟尿嘧啶耐藥者二氫嘧啶脫氫酶基因表達水平及突變的影響*

        2018-02-13 01:14:52趙雪晴錢世寧李鵬飛
        檢驗醫(yī)學與臨床 2018年13期
        關(guān)鍵詞:耐藥檢測

        趙雪晴,李 全,錢世寧,李鵬飛△

        (1.江蘇省南京市婦幼保健醫(yī)院 210029;2.江蘇省中醫(yī)院,南京 210029)

        抗癌藥物5-氟尿嘧啶(5-FU)是腫瘤患者化療藥物中普遍使用的。但是,5-FU在患者身上的療效及毒性有顯著差異,尤其是在毒性方面不同個體差異較大,嚴重情況會出現(xiàn)致死性的腹瀉、骨髓抑制等[1-2]。機體內(nèi)的5-FU有80%~85%經(jīng)過肝臟的二氫嘧啶脫氫酶(DPD)代謝成為無活性成分排出體外[2]。研究表明5-FU的不良反應(yīng)與其代謝和清除的限速酶DPD活性密切相關(guān)[3]。隨著分子診斷技術(shù)的迅速發(fā)展,對參與5-FU分解代謝的DPD編碼基因的重要位點進行測序,尋找出能夠指導臨床化療的關(guān)鍵突變,為5-FU個體化用藥提供科學依據(jù)。本研究擬檢測使用5-FU化療的患者外周血單個核細胞DPD基因表達水平及突變情況,現(xiàn)報道如下。

        1 資料與方法

        1.1一般資料選擇2015年2月至2016年6月在江蘇省中醫(yī)院腫瘤科住院的50例直腸癌患者,經(jīng)病理證實為結(jié)直腸癌,治療均使用5-FU,其中化療敏感組22例,男14例、女8例,中位年齡63.2歲;化療耐藥組28例,男18例、女10例,中位年齡62.1歲。兩組患者的年齡和性別等一般資料比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),具有可比性。所有受試者均簽署臨床試驗知情同意書。

        1.2方法

        1.2.1外周血單個核細胞分離按照說明書采用Ficoll分離液分離所有患者外周血單個核細胞。

        1.2.2實時定量PCR檢測DPD mRNA的表達采用Trizol 法提取總RNA,使用Eppendorf核酸蛋白檢測儀測定RNA水平,隨后反轉(zhuǎn)錄成cDNA。mRNA反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系(20 μL):5×PrimescriptTM緩沖液4 μL,PrimescriptTMRT Enzyme Mix Ⅰ 1 μL,Oligo dT Primer 1 μL,Random 6 mers 4 μL,RNase Free H2O 10 μL。反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)條件:37 ℃ 15 min,85 ℃ 5 min,4 ℃ 5 min。使用TaKaRa公司熒光定量檢測試劑盒,按照試劑說明書進行實時定量PCR。PCR反應(yīng)體系(20 μL):2×SYBR green 染料10 μL,上下游引物各1 μL,模板cDNA 1 μL,RNase Free H2O 7 μL。反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性10 min;95 ℃變性15 s,60 ℃退火30 s、72 ℃延伸30 s,擴增40個循環(huán);在延伸步驟中采集熒光信號。DPD上游引物(5′-3′):AGG ACG CAA GGA GGG TTT G,下游引物(5′-3′):GTC CGC CGA GTC CTT ACT GA。使用美國ABI7500實時熒光定量PCR儀進行擴增。結(jié)果分析用SDS software version 2.0,分析條件設(shè)置:根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié)Baseline的start值、stop值及Threshold的value值,在analysis菜單下選擇analyze自動分析結(jié)果。β-actin作為內(nèi)參,采用相對定量法(2-ΔΔCT)計算DPD mRNA的相對表達量。

        1.2.3測序法檢測DPD突變檢測化療耐藥組28例患者外周血單個核細胞中DPD突變情況。

        1.2.3.1DNA制備加入600 μL核裂解緩沖液重新懸浮細胞。加入40 μL 10%SDS,混勻。再加入10 μL 20 mg/mL的Proteinase K,5 μL 10 mg/mL的RNase A,混勻,50 ℃水浴過夜。加入200 μL 5.3 mol/L 的NaCl 溶液,混勻,13 000 r/min 4 ℃條件下離心30 min。轉(zhuǎn)移上清液到另一管中,加一倍體積4 ℃預(yù)冷的異丙醇,充分混勻。可見絮狀DNA 析出。13 000 r/min 4 ℃條件下離心15 min,棄上清液。用75%的乙醇洗滌沉淀2 次,棄上清液,室溫晾干。加入適量TE 溶液溶解沉淀,-20 ℃長期保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.3.2PCR及測序采用中山達安有限公司DPD點突變檢測試劑盒。以影響DPD活性較大的點突變?yōu)榘袇^(qū)域,設(shè)計特異性引物,采用PCR體外擴增法結(jié)合測序技術(shù),檢測對DPD活性影響較大的A74G、T85C、A1627G、T1896C、IVS14+1G>A、14G1A、G2194A點突變。PCR反應(yīng)體系如下:BigDye 1.5 μL,Primer 5 pmol,DNA 40~80 ng,H2O至10 μL。采用ABI 7500實時定量PCR儀。反應(yīng)條件如下:96 ℃ 2 min,96 ℃ 30 s,55 ℃ 40 s,35個循環(huán);72 ℃ 50 min,72 ℃ 8 min,4 ℃保存。PCR反應(yīng)產(chǎn)物的純化:每個樣品加入31 μL 乙酸銨(30 μL 95% 乙醇,1 μL 醋酸銨),充分振蕩混勻;15 ℃,4 000 r/min離心45 min;將樣品倒置,下面墊上吸水紙,放入離心機倒甩,轉(zhuǎn)速不要超過300 r/min;每個樣品再加入50 μL 75%乙醇;15 ℃,4 000 r/min,離心25 min;將樣品倒置,下面墊上吸水紙,放入離心機倒甩,轉(zhuǎn)速不要超過300 r/min; 避光晾干(約30 min),每個樣品加入3 μL 上樣緩沖液。

        2 結(jié)  果

        2.1各組DPD基因表達水平實時定量PCR結(jié)果表明,所有患者外周血單個核細胞中均可檢測到DPD mRNA的表達?;熌退幗MDPD mRNA相對表達水平為0.093±0.020,化療敏感組DPD mRNA相對表達水平為0.058±0.010,化療敏感組DPD mRNA水平明顯低于化療耐藥組,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。

        2.2DPD基因突變情況5-FU治療敏感及耐藥患者外周血單個核細胞中均未檢測到DPD突變位點。

        3 討  論

        5-FU是一種治療癌癥的嘧啶類似物的藥物,是用于治療直腸癌的有效方案[4-6]。但有研究表明,DPD的活性可能會導致5-FU的藥理性質(zhì)變異[7-8]。DPD是5-FU分解、代謝和清除的限速酶,DPD活性降低或缺乏與5-FU的降解速度下降呈正相關(guān),因此在治療使用5-FU引發(fā)嚴重的不良反應(yīng)時,DPD活性越低對5-FU的不良反應(yīng)程度越高[9]。

        眾多研究表明DPD表達水平與5-FU的化療療效密切相關(guān),DPD表達水平越高,化療效果越差[10]。本研究發(fā)現(xiàn)采用5-FU化療的患者中化療敏感組DPD mRNA表達水平較化療耐藥組低且差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),因此臨床上在化療前對DPD水平進行測量,可減少和避免不良反應(yīng)的存在,更利于臨床進行個體化治療。

        同時有研究表明個體DPD活性差異與DPD基因某些位點的遺傳多態(tài)性相關(guān)[11]。有學者對1例化療后出現(xiàn)嚴重5-FU毒性致死女性的DPD23個外顯子進行測序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)1個新的DPD基因位點T464A等位基因發(fā)生頻率約為0.2%[12]。同時有學者驗證15種已知的DPD基因序列,新發(fā)現(xiàn)3種:G1218A、C3067T和G1236A,但發(fā)生頻率很低[13]。臨床和實驗研究已經(jīng)表明DPD活性下降與DPD基因多態(tài)性相關(guān)[14]。國內(nèi)目前對此研究較少,因控制DPD多態(tài)性活性的分子機制較為復(fù)雜,許多化療后出現(xiàn)嚴重毒性者并未檢測到DPD基因突變[15]。本次試驗選取幾個已報道的突變位點進行檢測,對5-FU耐藥的患者檢測也暫未發(fā)現(xiàn)DPD基因突變現(xiàn)象。通過實時定量PCR進行擴增及測序,測定DPD基因位點突變情況。本研究發(fā)現(xiàn)5-FU治療敏感及耐藥患者均未檢測到突變,與國內(nèi)學者報道的結(jié)果相同[16-18]。

        總的來說,DPD的基因表達水平與化療敏感性相關(guān)。相信隨著人們對DPD研究的深入,新的DPD突變位點的發(fā)現(xiàn)將有助于預(yù)測5-FU應(yīng)用者的毒性風險和療效,可能成為指導臨床個體化治療的重要參考指標。

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