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        我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中的收錄及數(shù)據(jù)展示分析

        2018-02-08 08:53:25■李
        中國(guó)科技期刊研究 2018年7期
        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫(kù)

        ■李 彩 杜 冰 徐 虹 王 晴

        四川大學(xué)華西口腔醫(yī)學(xué)院編輯部,四川省成都市人民南路三段14號(hào) 610041

        PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)是當(dāng)今世界最權(quán)威、最具影響力,并被生物醫(yī)學(xué)工作者廣泛使用的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)之一。PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)是我國(guó)生物醫(yī)學(xué)期刊的重要國(guó)際展示平臺(tái),被PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)收錄不僅是對(duì)期刊學(xué)術(shù)水平的肯定,更會(huì)因其使用的廣泛性和權(quán)威性而增加論文的被引頻次,提升期刊國(guó)際影響力[1-4]。我國(guó)學(xué)者對(duì)PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)的選刊標(biāo)準(zhǔn)和收錄程序進(jìn)行了大量研究[5-7],并對(duì)我國(guó)生物醫(yī)學(xué)期刊被其收錄的現(xiàn)狀進(jìn)行了探討[8-9],為我國(guó)生物醫(yī)學(xué)期刊入選PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)提出了大量建議。但目前這些研究主要著眼于我國(guó)醫(yī)學(xué)期刊整體的分析,而缺乏對(duì)中文醫(yī)學(xué)期刊被PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的情況分析。與英文期刊相比,中文期刊的國(guó)際化進(jìn)程比較落后,因此對(duì)醫(yī)學(xué)期刊的整體分析無(wú)法反映中文期刊的情況。

        被PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)收錄不是期刊的最終目的,通過(guò)數(shù)據(jù)展示促進(jìn)期刊的傳播才是最重要的。與國(guó)內(nèi)數(shù)據(jù)庫(kù)不同,PubMed數(shù)據(jù)輸入方式已轉(zhuǎn)變?yōu)橛善诳霭嬲咧苯犹峤浑娮影鏀?shù)據(jù),并要求所有入選期刊均提供按要求制作的可擴(kuò)展標(biāo)記語(yǔ)言(Extensible Markup Language,XML)數(shù)據(jù)[10]。經(jīng)過(guò)幾十年的發(fā)展,PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)的功能不斷增強(qiáng)和完善,檢索更加方便快捷,同時(shí)提供了豐富的外部鏈接和多語(yǔ)種摘要功能[11-13]。這些措施的實(shí)施為期刊快速、全面地展示自己創(chuàng)造了條件,但對(duì)期刊出版者的要求也更高,這對(duì)中文醫(yī)學(xué)期刊來(lái)說(shuō)是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)。目前,鮮有我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊在PubMed中數(shù)據(jù)展示方面的研究。

        基于以上2個(gè)原因,本研究對(duì)我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中的收錄和數(shù)據(jù)展示情況進(jìn)行了分析,以了解我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊在國(guó)際化進(jìn)程中的現(xiàn)狀及存在的問(wèn)題,為其在國(guó)際舞臺(tái)上更好地展示學(xué)術(shù)成果及擴(kuò)大期刊國(guó)際影響力提供參考。

        1 研究方法

        1.1 檢索及分析PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中收錄的中文醫(yī)學(xué)期刊

        首先,通過(guò)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nlmcatalog進(jìn)入PubMed數(shù)據(jù)庫(kù),選擇Journals in NCBI Databases中的高級(jí)搜索功能,在“Language”輸入框中輸入“Chinese”,即可初步檢索到PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中收錄的中文醫(yī)學(xué)期刊。然后,查閱PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中的期刊簡(jiǎn)介和期刊官方網(wǎng)站上的期刊簡(jiǎn)介,當(dāng)二者信息不一致時(shí),查閱期刊最新的刊期,確定期刊基本信息。根據(jù)期刊發(fā)表的文獻(xiàn)是否以中文文獻(xiàn)為主作為研究的納入條件,排除不符合條件的期刊。對(duì)納入期刊的刊期、出版地、PubMed收錄時(shí)間進(jìn)行分析。

        1.2 分析中文醫(yī)學(xué)期刊在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)展示情況

        從展示速度和展示內(nèi)容兩方面對(duì)數(shù)據(jù)展示情況進(jìn)行分析,包括數(shù)據(jù)更新時(shí)間、摘要語(yǔ)種、數(shù)字對(duì)象唯一標(biāo)識(shí)符(Digital Object Identifier, DOI)和全文鏈接。在https://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed的檢索框中輸入期刊名稱,檢索到期刊文獻(xiàn),記錄最新文獻(xiàn)時(shí)間,并通過(guò)文獻(xiàn)摘要頁(yè)面記錄摘要語(yǔ)種、DOI、全文鏈接等信息。

        1.3 分析中文醫(yī)學(xué)期刊與國(guó)際高影響力期刊在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)展示差異

        選擇CA-ACancerJournalforClinicians作為國(guó)際高影響力期刊的代表,分析其在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)展示情況,并與中文醫(yī)學(xué)期刊進(jìn)行對(duì)比,探討中文醫(yī)學(xué)期刊與國(guó)際高影響力期刊間的差異。

        2 研究結(jié)果

        2.1 中文醫(yī)學(xué)期刊在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中的收錄現(xiàn)狀

        通過(guò)PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)初步檢索到75種中文醫(yī)學(xué)期刊,經(jīng)查閱期刊簡(jiǎn)介信息,排除15種不符合要求的期刊。其中,2種期刊曾經(jīng)是中文期刊,現(xiàn)已變更為英文期刊;9種期刊是含有中文摘要的英文期刊;4種期刊主要刊登英文文章,偶有中文文章。最后納入研究的中文醫(yī)學(xué)期刊為60種。

        60種期刊中,周刊1種,半月刊3種,月刊36種,雙月刊20種;出版地為北京的期刊共35種,四川5種,廣東、上海、天津各3種,湖南、遼寧、江蘇各2種,浙江、湖北、陜西、重慶、臺(tái)灣各1種。

        1973年,PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了我國(guó)第1種中文醫(yī)學(xué)期刊《中華醫(yī)學(xué)雜志》。PubMed收錄中文期刊的高峰期為1997年(11種),其次為1979年(7種)和2003年(6種)。2008年后新收錄的中文期刊數(shù)目明顯減少,2013—2017年無(wú)新收錄中文期刊。

        2.2 中文醫(yī)學(xué)期刊在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)展示情況

        2.2.1 數(shù)據(jù)展示速度

        根據(jù)PubMed中檢索到的最新文獻(xiàn)時(shí)間和期刊出版刊期計(jì)算文獻(xiàn)更新時(shí)間,將其分為4類(lèi):<3個(gè)月、3~<6個(gè)月、6~<12個(gè)月和≥12個(gè)月。檢索結(jié)果表明,60種期刊中,數(shù)據(jù)更新時(shí)間<3個(gè)月的期刊為35種,3~<6個(gè)月的期刊為6種,6~<12個(gè)月的期刊為2種,≥12個(gè)月的期刊為17種。這表明大多數(shù)期刊(58.3%)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行了及時(shí)更新(<3個(gè)月),但仍有28.3%的期刊有1年以上時(shí)間未能及時(shí)更新數(shù)據(jù)。60種樣本期刊均沒(méi)有開(kāi)展提前在線出版(ePub Ahead of Print)。

        2.2.2 摘要語(yǔ)種

        根據(jù)PubMed中期刊文獻(xiàn)摘要的語(yǔ)種標(biāo)注方式,將其分為英語(yǔ)單語(yǔ)種摘要和中英雙語(yǔ)種摘要2種類(lèi)型。檢索結(jié)果表明,60種期刊中,25種(41.7%)期刊提供中英雙語(yǔ)摘要,35種(58.3%)期刊提供英語(yǔ)單語(yǔ)種摘要。

        2.2.3 DOI

        60種期刊中,32種期刊(53.3%)的文獻(xiàn)標(biāo)注了DOI,28種期刊(46.7%)的文獻(xiàn)未標(biāo)注DOI。在標(biāo)注DOI的32種期刊中,12種期刊的DOI具有鏈接功能,點(diǎn)擊DOI可以自動(dòng)鏈接到期刊官方網(wǎng)站或出版平臺(tái)的該文獻(xiàn)頁(yè)面;20種期刊的DOI是靜態(tài)的,沒(méi)有提供鏈接。

        在標(biāo)注DOI的文獻(xiàn)中,存在少數(shù)DOI信息無(wú)法解析的情況。期刊DOI的解析地址有2類(lèi):期刊官方網(wǎng)站和數(shù)字出版平臺(tái)(萬(wàn)方數(shù)據(jù)庫(kù)、中國(guó)知網(wǎng)數(shù)據(jù)庫(kù)等)。

        2.2.4 全文鏈接

        60種期刊中,27種期刊(45%)提供了全文鏈接,33種期刊(55%)未提供全文鏈接。進(jìn)一步分析全文鏈接的內(nèi)容,發(fā)現(xiàn)3種期刊的鏈接為PDF格式文件,24種期刊的鏈接為超文本標(biāo)記語(yǔ)言(Hyper Text Markup Language, HTML)格式文件;全文鏈接生成方式包括統(tǒng)一資源定位符(Uniform Resource Locator,URL)和DOI解析2種方式。

        60種期刊中,同時(shí)提供中英雙語(yǔ)摘要、DOI和全文鏈接的期刊共21種(35%);既非雙語(yǔ)摘要也不提供DOI和全文鏈接的期刊也有21種(35%)。

        2.3 中文醫(yī)學(xué)期刊與國(guó)際高影響力期刊在PubMed中的數(shù)據(jù)展示差異

        CA-ACancerJournalforClinicians的文獻(xiàn)均采用了提前在線出版方式,提前出版時(shí)間為1~3個(gè)月;標(biāo)注了DOI,且點(diǎn)擊DOI可自動(dòng)鏈接到期刊官方網(wǎng)站的該文獻(xiàn)頁(yè)面;提供了摘要和全文鏈接,全文鏈接方式為DOI解析。我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊與CA-ACancerJournalforClinicians在數(shù)據(jù)展示方面的主要差異是提前在線出版。

        3 討論

        3.1 中文醫(yī)學(xué)期刊被PubMed收錄的現(xiàn)狀

        提升科技期刊國(guó)際影響力的重要途徑之一就是被學(xué)科相關(guān)的國(guó)際權(quán)威數(shù)據(jù)庫(kù)收錄。對(duì)于中文醫(yī)學(xué)期刊來(lái)說(shuō),入選PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)提升期刊的國(guó)際影響力具有重要的意義。本研究結(jié)果表明,PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊數(shù)量?jī)H為60種,所占比例非常低,國(guó)際化進(jìn)程不容樂(lè)觀。PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)收錄中文期刊的高峰期為1997年,2008年后新收錄的中文期刊數(shù)量明顯減少。這與PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)收錄我國(guó)生物醫(yī)學(xué)期刊數(shù)量逐年增加的趨勢(shì)不同,其原因是我國(guó)目前被PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的期刊主要為英文期刊[9]。中文醫(yī)學(xué)期刊新收錄數(shù)量減少的原因可能為:優(yōu)秀稿件外流,中文醫(yī)學(xué)期刊學(xué)術(shù)質(zhì)量下降;辦刊模式未與國(guó)際接軌,而高質(zhì)量的英文醫(yī)學(xué)期刊越來(lái)越多。針對(duì)這種情況,我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊應(yīng)在提升稿件質(zhì)量上下功夫,向國(guó)內(nèi)外知名專家約稿,并參照國(guó)際學(xué)術(shù)期刊辦刊模式,提高期刊整體水平,爭(zhēng)取早日進(jìn)入PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)。

        3.2 中文醫(yī)學(xué)期刊在PubMed中的數(shù)據(jù)展示情況

        3.2.1 數(shù)據(jù)展示速度

        期刊文獻(xiàn)在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中的展示速度直接影響文獻(xiàn)的閱讀和被引情況。我國(guó)被PubMed收錄的60種中文醫(yī)學(xué)期刊中,58.3%的期刊及時(shí)更新了數(shù)據(jù),但是也有28.3%的期刊超過(guò)1年時(shí)間未更新數(shù)據(jù)。PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)的一個(gè)優(yōu)點(diǎn)就是數(shù)據(jù)更新速度快,如果期刊數(shù)據(jù)長(zhǎng)時(shí)間不更新,不但影響到文獻(xiàn)的被引頻次,長(zhǎng)久下去還會(huì)影響到PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)是否愿意繼續(xù)收錄該期刊,從而使期刊存在被剔除的風(fēng)險(xiǎn),這應(yīng)當(dāng)引起期刊出版者的高度重視,并盡快完成數(shù)據(jù)的更新。

        3.2.2 摘要語(yǔ)種

        PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)默認(rèn)的收錄語(yǔ)種為英語(yǔ),2013年P(guān)ubMed開(kāi)發(fā)了支持非英文摘要的功能,允許數(shù)據(jù)提供者向PubMed 上傳其他語(yǔ)言文字的摘要,極大地方便了母語(yǔ)為非英語(yǔ)的讀者閱讀[13]。我國(guó)60種中文醫(yī)學(xué)期刊中,只有25種(41.7%)標(biāo)注了中英雙語(yǔ)摘要,35種(58.3%)仍為英語(yǔ)單語(yǔ)種摘要。建議被PubMed收錄的中文醫(yī)學(xué)期刊盡快提供論文的中文摘要,為讀者提供高質(zhì)量的服務(wù)。

        3.2.3 DOI

        DOI是數(shù)字資源全球范圍內(nèi)的唯一永久性標(biāo)識(shí)符,具有對(duì)數(shù)字資源進(jìn)行永久命名標(biāo)識(shí)、動(dòng)態(tài)解析鏈接的特征。通過(guò)DOI可以鏈接到期刊官方網(wǎng)站或出版平臺(tái)中的文獻(xiàn),實(shí)現(xiàn)資源的網(wǎng)絡(luò)快捷共享[11,14],增加期刊論文的被訪問(wèn)次數(shù)。研究表明,我國(guó)60種中文醫(yī)學(xué)期刊中,32種期刊的文獻(xiàn)標(biāo)注了DOI,28種期刊的文獻(xiàn)未標(biāo)注DOI;在標(biāo)注了DOI的期刊中,12種期刊的DOI可以直接鏈接到文獻(xiàn)所在的期刊官方網(wǎng)站或出版平臺(tái)頁(yè)面。研究同時(shí)發(fā)現(xiàn),部分期刊文獻(xiàn)在PubMed中標(biāo)注的DOI無(wú)法正確解析,這可能是因?yàn)槲墨I(xiàn)雖然標(biāo)注了DOI,但是這些DOI只是形式上的存在,DOI中心并無(wú)相關(guān)信息。因此期刊文獻(xiàn)在標(biāo)注了DOI后,要及時(shí)向DOI中心上傳數(shù)據(jù)進(jìn)行注冊(cè)。本研究發(fā)現(xiàn)期刊DOI的解析地址主要分為期刊官方網(wǎng)站和出版平臺(tái)(萬(wàn)方數(shù)據(jù)庫(kù)、中國(guó)知網(wǎng)數(shù)據(jù)庫(kù)等)。與出版平臺(tái)相比,期刊官方網(wǎng)站除了可以提供文獻(xiàn)全文信息外,還可以增加對(duì)期刊網(wǎng)站的訪問(wèn)量。所以,建議出版者盡快建立期刊的官方網(wǎng)站,并將DOI鏈接到期刊官方網(wǎng)站,從而充分利用DOI實(shí)現(xiàn)期刊網(wǎng)站與各個(gè)檢索平臺(tái)之間的相互鏈接,提升期刊的展示度和影響力。

        3.2.4 全文鏈接

        LinkOut全文鏈接是美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)提供的一項(xiàng)允許第三方將特定的NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)記錄與相關(guān)網(wǎng)絡(luò)資源進(jìn)行鏈接的服務(wù),可以實(shí)現(xiàn)從PubMed 條目到在線期刊全文的鏈接。對(duì)于期刊來(lái)說(shuō),全文鏈接可以達(dá)到快速傳播文獻(xiàn)的目的,提高文獻(xiàn)閱讀量[12]。

        常見(jiàn)的文獻(xiàn)展示形式為PDF格式全文和HTML格式全文。PDF全文是一個(gè)靜態(tài)頁(yè)面,只能用于閱讀和下載,無(wú)法實(shí)現(xiàn)知識(shí)間的相互鏈接;HTML全文是一個(gè)開(kāi)放式資源,除了可滿足閱讀文獻(xiàn)的需要,還可以實(shí)現(xiàn)各種知識(shí)間的相互鏈接。研究發(fā)現(xiàn),60種中文醫(yī)學(xué)期刊中,僅27種期刊提供了全文鏈接,其中3種期刊為PDF全文,24種期刊為HTML全文。

        期刊全文鏈接的生成方式有2種:一種為URL方式,一種為DOI解析方式。與URL方式相比,DOI解析方式具有以下優(yōu)勢(shì):(1)穩(wěn)定、易調(diào)整,當(dāng)文獻(xiàn)所在網(wǎng)址發(fā)生變更時(shí),只需要更新DOI的數(shù)據(jù)信息,不需要更改各個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中的信息;(2)可增加DOI解析量,全文鏈接每點(diǎn)擊1次,DOI解析量就會(huì)增加1次。目前,DOI解析量已經(jīng)被多個(gè)評(píng)價(jià)系統(tǒng)作為期刊評(píng)價(jià)的重要指標(biāo)之一,而中文醫(yī)學(xué)期刊的DOI 解析量主要來(lái)源于PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)的解析鏈接。因此,建議全文鏈接時(shí)選擇DOI解析生成的方式鏈接到期刊官方網(wǎng)站上的HTML全文,這樣作者查閱全文的同時(shí),不但增加了期刊文獻(xiàn)的閱讀量,擴(kuò)大了期刊網(wǎng)站的宣傳范圍,同時(shí)也增加了DOI的解析量,提高了期刊的影響力。

        3.3 中文醫(yī)學(xué)期刊與國(guó)際高影響力期刊在數(shù)據(jù)展示方面的差異

        為了解國(guó)際高影響力期刊在數(shù)據(jù)展示方面的舉措,本研究選擇了國(guó)際高影響力期刊CA-ACancerJournalforClinicians作為研究對(duì)象,分析中文醫(yī)學(xué)期刊與國(guó)際高影響力期刊間的差異。結(jié)果表明,二者的最大差異主要表現(xiàn)為提前在線出版,CA-ACancerJournalforClinicians的文獻(xiàn)均提前在線出版,而我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊均未采用提前在線出版。提前在線出版具有縮短出版周期的優(yōu)點(diǎn),可以盡早展示研究成果,提高文獻(xiàn)閱讀量和被引頻次[15]。近年來(lái),PubMed中提前在線出版的論文和期刊數(shù)量已呈快速增長(zhǎng)趨勢(shì)[16],因此,建議中文醫(yī)學(xué)期刊在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中增加優(yōu)先數(shù)字出版。

        4 結(jié)語(yǔ)

        PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)是我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊在國(guó)際舞臺(tái)上展示的主要平臺(tái)之一,我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊被PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的數(shù)量較少,而且已經(jīng)被收錄的期刊在文獻(xiàn)更新速度和內(nèi)容方面也需要進(jìn)一步改進(jìn)。提前在線出版是我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊與國(guó)際高影響力期刊在數(shù)據(jù)展示方面的主要差距,我國(guó)中文醫(yī)學(xué)期刊應(yīng)充分利用PubMed國(guó)際檢索平臺(tái)的優(yōu)勢(shì),更好地向全世界展示我國(guó)學(xué)術(shù)成果,提升期刊的國(guó)際影響力。

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