2018年1 月12 日，中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所黃三文研究員領銜的科研團隊在番茄風味品質(zhì)研究中取得重大突破。科學家利用大數(shù)據(jù)分析，揭示了番茄在馴化和育種過程中營養(yǎng)和風味物質(zhì)發(fā)生的變化，及其調(diào)控位點，為番茄果實風味、營養(yǎng)物質(zhì)的遺傳調(diào)控和全基因組設計育種提供了路線圖。相關科研論文在國際頂尖生命科學領域期刊《細胞（Cell）》2018年第1期發(fā)表，這是中國農(nóng)業(yè)科學院第一次在該刊上發(fā)表文章，也是今年中國科學家在該刊上發(fā)表的第一篇文章。

番茄是世界第一大果蔬作物，具有重要的經(jīng)濟價值。黃三文帶領科研團隊利用多重組學的大數(shù)據(jù)，揭示了在馴化和育種過程中番茄果實的營養(yǎng)和風味物質(zhì)發(fā)生的變化，并發(fā)現(xiàn)了調(diào)控這些物質(zhì)的重要遺傳位點，為植物代謝物的分子機理研究提供了源頭大數(shù)據(jù)和方法創(chuàng)新。同時，該研究結果為番茄果實風味和營養(yǎng)物質(zhì)的遺傳調(diào)控和全基因組設計育種提供了路線圖。據(jù)悉，《細胞（Cell）》同期發(fā)表的評述文章認為：該項研究加深了對作物品質(zhì)化學的科學認識，將推動高品質(zhì)品種培育，最終消費者能夠從風味更佳、營養(yǎng)更好的食品供應中獲益。

自2004年起，黃三文帶領科研團隊積極參與番茄基因組測序任務。經(jīng)過10余年的潛心研究，廣泛收集了全球600多份不同類型的番茄種質(zhì)資源，并開展了基因組、轉錄組、代謝組等多組學分析，產(chǎn)生了約7 Tb的原始序列數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)分析獲得了2 600萬個基因組變異位點、3萬多個基因的表達量和980種果實代謝物的群體多組學數(shù)據(jù)，構建了全球最大園藝作物組學數(shù)據(jù)庫。同時，利用基因組學技術闡明了番茄從野生番茄到大果栽培番茄的人工馴化過程，發(fā)現(xiàn)了現(xiàn)代番茄風味丟失的基因調(diào)控機制，并發(fā)現(xiàn)了控制番茄風味的多個調(diào)控路徑，為更為營養(yǎng)美味番茄的設計育種提供了路線圖。成果自2012年后陸續(xù)發(fā)表在《自然遺傳學（nature genetics）》《科學（Science）》等國際頂級學術期刊上，實現(xiàn)了我國在該領域上的“領跑”。

該論文的第一作者為黃三文實驗室博士后祝光濤、共同第一作者為羅杰實驗室的博士研究生王守創(chuàng)，通訊作者為黃三文研究員和羅杰教授。該項研究是中國農(nóng)科院基因組所與蔬菜花卉研究所、華中農(nóng)業(yè)大學、美國佛羅里達大學、美國佐治亞大學、德國馬普研究所的合作成果，得到了科技部、基金委、中國農(nóng)業(yè)科學院創(chuàng)新工程和廣東省、深圳市的支持。