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        基于FCM聚類算法的人腦MRI圖像分割

        2018-01-22 09:33:25
        大理大學(xué)學(xué)報 2017年12期
        關(guān)鍵詞:區(qū)域

        謝 勇

        (大理大學(xué)工程學(xué)院,云南大理 671003)

        臨床上,磁共振成像(MRI)被廣泛用于腦功能、腦部病理改變的診斷和研究。然而,由于腦部組織(腦白質(zhì)、腦灰質(zhì)、腦脊液等)之間的相互交疊,再加上磁共振成像過程中磁場的不均勻性、部分容積效應(yīng)、場偏移效應(yīng),以及噪聲的干擾,使腦部MRI圖像中各種組織之間的邊界難以清晰地區(qū)分出來〔1〕。在實際應(yīng)用中,我們需要將圖像按照不同的性質(zhì)、特征按區(qū)域劃分出來,以提取我們感興趣的信息。有很多方法被用于醫(yī)學(xué)圖像的分割,如基于水平集的圖像分割〔2-3〕,基于分水嶺的圖像分割〔4-5〕,基于區(qū)域生長的圖像分割技術(shù)〔6-7〕,等。模糊聚類分割是近幾年發(fā)展比較快的一種分割技術(shù),它是在美國著名計算機(jī)與控制專家查德(L.A.Zadeh)教授提出的模糊集合理論的基礎(chǔ)上產(chǎn)生的一種圖像分割方法。這種方法能很好地分割出顱腦圖像中的灰質(zhì)、白質(zhì)和腦脊液等組織,而且分割效果優(yōu)于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法〔8〕。

        在各種模糊聚類算法中,模糊C-均值(FCM)聚類算法的應(yīng)用最為廣泛〔9-10〕。FCM法對噪聲不太敏感,比較適合于灰度圖像中存在不確定性和模糊性的特點。本文主要討論基于MATLAB平臺的醫(yī)學(xué)圖像FCM聚類分割的實現(xiàn)。

        1 FCM聚類算法

        FCM算法的基本思想是將樣本數(shù)據(jù)按照某種準(zhǔn)則(如圖像中像素點與聚類中心的相似度等)將樣本數(shù)據(jù)聚集為一定的類數(shù),同類對象之間具有最大的隸屬度。

        設(shè)X={x1,x2,…,xn}∈Rpn為p維的樣本數(shù)為n的數(shù)據(jù)集,共分為c類,X中任意樣本xk對i類的隸屬度為uik,聚類結(jié)果用模糊隸屬度矩陣U={uik}∈Rcn表示。FCM的目標(biāo)函數(shù)Jm(U,V)定義為〔11〕,,利用拉格朗日乘子法,目標(biāo)函數(shù)J(U,V)取極小值的條件為(k=1,2,…,n):

        其中分類數(shù)c滿足2≤c≤n;m∈[1,∞)為模糊加權(quán)指數(shù),m的最佳取值范圍為[1.5,2.5]〔12〕,實際應(yīng)用中通常取m=2;(xk,vi)表示樣本Xk到第i類中心的歐氏距離;uik是樣本xk對第i類的隸屬度。根據(jù)條件

        FCM是通過反復(fù)迭代優(yōu)化目標(biāo)函數(shù)式(1)來實現(xiàn)的,具體算法流程為:

        (1)設(shè)定聚類數(shù)c和加權(quán)指數(shù)m,選取迭代停止閾值ε,設(shè)置最大迭代次數(shù)T,初始化聚類中心置迭代次數(shù)為k=1。

        (2)計算隸屬度矩陣U(k)。

        如果?j,r,d(xi,>0,則uik用公式(2)計算;如果?j,r,d(xj,v(rk))=0,則取u(rkj)=1,且對于i≠r=0。

        (3)計算聚類中心

        FCM具有無監(jiān)督、運算速度快、容易實現(xiàn)等特點,能夠準(zhǔn)確分割信噪比較高的圖像。

        2 實驗結(jié)果

        實驗環(huán)境為Intel? Core(TM)i5 CPU 1.60 GHz,2.30 GHz,12.0 G內(nèi)存,實驗平臺為MATLAB R2011b。實驗圖像選擇了一幅正常人腦的MRI圖像(259×200像素),一幅腦部惡性膠質(zhì)瘤MRI圖像(197×240像素)和一幅男性因車禍造成的顱內(nèi)出血的MRI圖像(525×420像素)。見圖1。

        圖1 實驗原始圖像

        2.1 圖像預(yù)處理對灰度圖像的分割,要求圖像的灰度值分布值有可區(qū)分的統(tǒng)計分布,不同灰度值的區(qū)域之間應(yīng)該有適當(dāng)?shù)倪吔绶秶D2是采用prewitt算子對3幅圖像的區(qū)域分布邊界的檢測結(jié)果。

        圖2 prewitt算子邊界檢測結(jié)果

        從圖2可看出,正常人腦MRI圖像的腦脊液、腦灰質(zhì)和腦白質(zhì)的邊界還是清晰的。惡性膠質(zhì)瘤MRI圖像中腫瘤區(qū)域邊界不十分清晰,噪音有些大。顱內(nèi)出血MRI圖像中的出血區(qū)域和周圍的灰度分布幾乎是連續(xù)的,所以邊界不十分明確。后面的兩幅圖片分割的難度要大一些。

        圖像的聚類分割中,分割的類別數(shù)要選擇恰當(dāng),類數(shù)過多,運算時間會很長,聚類效果也可能不理想。聚類的數(shù)目過少,重疊信息過多,達(dá)不到分割的目的。圖像的灰度直方圖可以為我們選擇聚類隨數(shù)目提供參考。圖3是3幅圖像的灰度直方圖。

        圖3 灰度直方圖

        由圖3可以看出,正常人腦MRI、惡性膠質(zhì)瘤MRI的直方圖都有3個極小區(qū),可以將圖像分成3類或4類。而顱內(nèi)出血MRI有很多的極小區(qū),但大致也可以分為3類或4類。

        2.2 FCM聚類分割利用FCM算法,分別按照3類和4類聚類對3幅圖像進(jìn)行分割。表1是3幅圖像FCM分割實驗的隸屬度矩陣中的最小值和最大值。表2是3幅圖像FCM分割過程中各類的聚類中心距離。

        表1 3幅圖像FCM分割實驗隸屬度矩陣極值

        表2 3幅MRI圖像FCM分割實驗聚類中心距離

        分割結(jié)果見圖4和圖5。

        圖4 FCM聚類分割結(jié)果(3類)

        圖5 FCM聚類分割結(jié)果(4類)

        從圖4可以看出,按3類聚類,腦脊液和腦灰質(zhì)沒有被分開,而圖5中腦脊液、腦灰質(zhì)、腦白質(zhì)和背景被很好地分割開了,而且分割出的圖像中膠質(zhì)瘤和顱內(nèi)出血區(qū)域的邊界非常清楚,獲得了較好的分割效果。圖6是按4類FCM聚類分割后分別提取的惡性膠質(zhì)瘤和顱內(nèi)出血的圖像。

        圖6 正常人腦MRI分割圖像提取

        2.3 FCM聚類分割與其他分割方法的比較常用的圖像分割方法有基于區(qū)域、基于邊緣、基于區(qū)域與邊緣混合的分割,以及模糊聚類分割方法等。我們選擇了一幅經(jīng)常頭痛患者的腦部T2加權(quán)MRI圖像(452×394像素),對常用的分水嶺算法和基于區(qū)域生長算法與FCM算法在醫(yī)學(xué)圖像分割方面進(jìn)行了對比研究,結(jié)果見表3和圖7。

        表3 不同算法分割醫(yī)學(xué)圖像的時間對比(s)

        圖7 幾種算法分割醫(yī)學(xué)圖像的結(jié)果

        從圖7可看出,F(xiàn)CM聚類分割的效果顯著優(yōu)于分水嶺算法和基于區(qū)域生長算法。然而,表3的數(shù)據(jù)提示,F(xiàn)CM聚類分割算法的處理時間比另外兩種算法長很多。如果需要處理的圖像像素更大些,這種差距就更加明顯。

        3 總結(jié)

        從圖5和圖7可看出,對人腦相關(guān)的MRI圖像的FCM聚類分割是有效的,提取出的特定區(qū)域的邊界比較清晰。FCM聚類分割方法在分割對比度明顯、信噪比較高的臨床MRI圖像方面有著顯著的優(yōu)勢。但如果在聚類過程中考慮到相鄰像素之間的影響,充分利用圖像的空間信息,則分割要困難很多。另外,F(xiàn)CM聚類因需要大量的迭代運算而使得處理過程變長,效率偏低。所以,如何探索出一種快速而不失主要信息的算法,是我們下一步要研究的課題。

        〔1〕楚存坤,李月卿,王昌元,等.顱腦MRI圖像模糊聚類分割算法中模糊聚類數(shù)的討論〔J〕.泰山醫(yī)學(xué)院學(xué)報,2007,28(3):175-178.

        〔2〕朱曉舒,孫權(quán)森,夏德深,等.基于MultiLayer水平集的腦MRI圖像分割框架〔J〕. 計算機(jī)科學(xué),2014,41(9):297-300.

        〔3〕周則明,尤建潔,范春暉,等.結(jié)合水平集方法和形狀約束Snake模型的左心室MRI圖像分割〔J〕.模式識別與人工智能,2006,19(6):782-786.

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        〔5〕戴橙,陳勝.改進(jìn)的分水嶺算法用于X光醫(yī)學(xué)圖像分割〔J〕. 電子科技,2015,28(6):9-12.

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        〔9〕 HALL L O,BENSAID A M,CLARKE L P,et al.A comparison of neural network and fuzzy clustering tech?niquesin segmentingmagneticresonanceimagesof the brain〔J〕.Neural Networks IEEE Trans,1992,3(5):672-681.

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        〔11〕趙鳳.基于模糊聚類的圖像分割〔M〕.西安:西安電子科技大學(xué)出版社,2015.

        〔12〕 NIKHIL P R,BEZDEK J C.On cluster validity for the fuzzy C-means model〔J〕.IEEE Transactions on

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