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        醫(yī)藥巨頭加快臨床試驗的數(shù)據(jù)分析

        2017-11-28 17:26:41ClintBoulton沈建苗
        IT經(jīng)理世界 2017年22期
        關鍵詞:制藥臨床試驗

        Clint+Boulton+沈建苗

        首席數(shù)據(jù)官(CDO)Mark Ramsey在幫助這家制藥巨頭將數(shù)十年積累下來的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為藥物發(fā)現(xiàn)資產(chǎn)。

        葛蘭素史克(GSK)在大數(shù)據(jù)方面懷有遠大夢想。通過利用數(shù)十年積累下來的臨床試驗數(shù)據(jù),這家制藥巨頭旨在更迅速地將藥物投放市場。如果成功的話,它有望在這個因步伐緩慢而常常飽受詬病的行業(yè)占據(jù)優(yōu)勢。

        這是葛蘭素史克首席數(shù)據(jù)官(CDO)Mark Ramsey的主要目標和挑戰(zhàn);他承認,GSK在利用數(shù)據(jù)方面動作遲緩的行業(yè)是個落后者。2015年GSK聘請Ramsey,便是希望扭轉(zhuǎn)這個頹勢。Ramsey說:“與金融服務、電信或零售等行業(yè)相比,制藥業(yè)在使用數(shù)據(jù)作為戰(zhàn)略資產(chǎn)方面沒有取得多大進展?!彼诩用薌SK之前,在三星移動擔任過CDO,并在IBM效力18年期間擔任過幾個數(shù)據(jù)分析崗位?!拔覀兊氖滓繕耸侨绾胃咝У亻_展臨床試驗,以加快藥物發(fā)現(xiàn)?!?/p>

        并非只有各大制藥公司任由可能很豐富的數(shù)據(jù)閑置在龐大的孤島中。Gartner的一項調(diào)查顯示,許多公司在物色領導人,幫助從這些數(shù)據(jù)寶藏中發(fā)掘優(yōu)勢和運營效率,預計到2019年底,90%的大公司會設有CDO。Gartner分析師Doug Laney認為,到2020年,50%的領先企業(yè)會設有戰(zhàn)略影響力和權威性與首席信息官(CIO)不相上下的CDO。CDO可以將其個人的優(yōu)先事項與企業(yè)的優(yōu)先事項結(jié)合起來,以此確立領導地位。這正是Ramsey所努力的方向。

        以下是Ramsey如何致力于全面改變GSK的數(shù)據(jù)戰(zhàn)略。

        奠定數(shù)據(jù)基礎

        制藥公司(許多公司有數(shù)十年、甚至數(shù)百年的歷史)經(jīng)常從臨床試驗收集和存儲海量數(shù)據(jù)。然而,大多數(shù)只是將這些數(shù)據(jù)用不同的數(shù)據(jù)庫存儲起來,每次臨床試驗后,積累的信息越來越多。Ramsey表示,GSK有300多年的歷史,它在2100多個孤島中存放著數(shù)PB級的此類數(shù)據(jù),這些孤島有待制藥公司挖掘,以獲得寶貴的洞察力。

        Ramsey來到GSK后評估了該公司的數(shù)據(jù)概況,迅速了解到數(shù)據(jù)分析技術并沒有在整個公司得到全面使用。相反,這項技術只是用于旨在將新藥投向市場的一次性臨床試驗。他從中看到了共享眾多試驗的數(shù)據(jù)的大好機會,但要是沒有一種全面的數(shù)據(jù)平臺:GSK大數(shù)據(jù)信息平臺,這就無從談起。

        該平臺的基礎是一個Cloudera Hadoop數(shù)據(jù)湖,StreamSets公司的自動化機器人技術從成千上萬個作業(yè)系統(tǒng)中獲取數(shù)據(jù)后放入到該數(shù)據(jù)湖。隨后,GSK使用Trifacta軟件清理雜亂、復雜的數(shù)據(jù)集,并做成業(yè)務用戶有興趣分析的視圖。GSK還利用Tamr公司的機器學習軟件,將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)移到行業(yè)本體(Ontology),并利用AtScale軟件對數(shù)據(jù)進行虛擬化處理。業(yè)務用戶通過Zoomdata可視化軟件查看數(shù)據(jù)。該平臺中的其他工具還包括谷歌的TensorFlow、Tibco Spotfire和Anaconda等。Ramsey表示,各種技術整合起來,那樣它們可以共享數(shù)據(jù),而這使臨床試驗更容易。

        作為這個項目的一部分,該公司已在11個月內(nèi)將大約12TB的結(jié)構化數(shù)據(jù)和近8PB的非結(jié)構化信息轉(zhuǎn)移到該平臺――這個速度對任何一家企業(yè)來說都很快,更不用說是制藥公司了。 Ramsey解釋:“盡管GSK已有300多年的歷史,但我們正盡量像一家初創(chuàng)公司那樣來運作。”

        縮小數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)窗口

        GSK大數(shù)據(jù)信息平臺已經(jīng)獲得了成效,縮短了為臨床試驗篩選數(shù)據(jù)的時間。過去研究人員要花一年的時間來分析臨床試驗,從而找出血液類型與呼吸藥物療效之間的關系,現(xiàn)在卻只需要短短30分鐘。Ramsey說:“這給研究人員的工作效率帶來了巨大的影響。”

        Ramsey表示,GSK最近還與英國生物樣本庫(UK Biobank)簽署了一項合作協(xié)議,利用其平臺為500000名患者開展外顯子組測序(Exome Sequencing),幫助研究人員分析與這些特點有關的DNA特性。Ramsey說:“這與研發(fā)過程有關,所以帶來了巨大的價值?!盙SK希望用其平臺開展的計算機模擬將幫助該公司將藥物發(fā)現(xiàn)周期從五年或七年縮短至兩年。

        Ramsey為力求做好數(shù)據(jù)分析工作的公司提供建議。

        進行整體評估:你先要了解數(shù)據(jù)在哪里、是什么樣的數(shù)據(jù)、如何使用數(shù)據(jù)。Ramsey加入GSK后,發(fā)現(xiàn)IT部門對數(shù)據(jù)毫無頭緒。于是他讓IT團隊構建了一項數(shù)據(jù)搜索技術,找到研發(fā)部門的每個數(shù)據(jù)源。一旦你對數(shù)據(jù)環(huán)境進行了評估,就可以設立一個支持那些任務的數(shù)據(jù)分析團隊,并開始考慮建立獲取、處理和分析數(shù)據(jù)的平臺。

        先對數(shù)據(jù)運用分析技術:許多公司常常忽略仔細呈現(xiàn)用于分析的數(shù)據(jù),就是由于它們一門心思想解決業(yè)務問題。Ramsey鼓勵同行專注于數(shù)據(jù)篩選,并利用市面上的機器學習工具了解你擁有的數(shù)據(jù)。他說:“確保將大數(shù)據(jù)工具運用于數(shù)據(jù)本身,讓這成為現(xiàn)實。只有篩選數(shù)據(jù),并將篩選過的數(shù)據(jù)提供給業(yè)務用戶,才可以開始創(chuàng)造價值?!?/p>

        獲得業(yè)務部門的支持:Ramsey表示,獲得公司高層的認可至關重要,他的直屬上司是GSK的研發(fā)部門總裁。他說:“擁有一種出色的平臺只完成了一半;你要有挑戰(zhàn)極限,而且想要改變決策方式,從而為公司提升價值的高層?!眅ndprint

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