陳繼兵+黃建都+林峰+林翮飛+林文
摘 要:利用SRAP分子標(biāo)記技術(shù),對閩茄5號及其親本材料、新組合(06-29×06-16)及其親本材料的DNA特異型條帶進(jìn)行分析研究,經(jīng)過多次重復(fù)試驗(yàn),從100對引物組合中篩選出1對引物(Em2/Me5)能擴(kuò)增出閩茄5號及其父本的多態(tài)性條帶;1對引物(Em3/Me3)能擴(kuò)增出新組合(06-29×06-16)及其父本的多態(tài)性條帶。說明該方法重復(fù)性好、準(zhǔn)確性高的優(yōu)點(diǎn),可用于茄子近緣品種間的檢測。
關(guān)鍵詞:閩茄5號;茄子;SRAP;分子標(biāo)記
中圖分類號:S641.1 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:1001-3547(2017)20-0050-03
茄子(Solanum melongena L.)為茄科茄屬植物,是世界上熱帶和溫帶地區(qū)重要的蔬菜,含有多種維生素、脂肪、糖以及礦物質(zhì)等,特別是富含維生素P,具有許多藥用價(jià)值,是一種很好的保健蔬菜。閩茄5號是福州市蔬菜科學(xué)研究所選育的優(yōu)良茄子新品種,其母本為中晚熟類型06-29,父本為中熟類型06-13。閩茄5號屬中熟類型,較耐低溫弱光,始花節(jié)位10~11節(jié),果形直,果色紫紅,果肉白,抗病性強(qiáng) [1]。2015年通過福建省非主要農(nóng)作物認(rèn)定,已在生產(chǎn)上大面積推廣。新組合(06-29×06-16)的母本與閩茄5號相同,父本為早熟類型06-16,在制種時(shí)容易發(fā)生混雜。種子純度是種子質(zhì)量的重要內(nèi)容,也是農(nóng)民增收的重要保證。因此,試驗(yàn)以閩茄5號及其親本和新組合(06-29×06-16)及其親本作為材料,通過SRAP分子標(biāo)記技術(shù),建立閩茄5號及新組合(06-29×06-16)DNA指紋圖譜,在提高種子質(zhì)量、純度檢測及生產(chǎn)推廣方面提供科學(xué)依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
閩茄5號及其父本1、新組合(06-29×06-16)及其父本2和共同的母本均由福州市蔬菜科學(xué)研究所茄子課題組提供。采用穴盤育苗,待幼苗長到2~3片真葉時(shí)取嫩葉提取DNA備用。SRAP引物參照Li等[2]的報(bào)道進(jìn)行設(shè)計(jì),由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成,引物序列見表1。dNTPs、Taq DNA酶、Buffer等由博彩公司生產(chǎn)。
1.2 試驗(yàn)方法
①茄子DNA提取 隨機(jī)選取各樣本10株,剪取剛展開的新鮮茄子嫩葉20 g,放至液氮中研磨。采用改良的CTAB法提取茄子總DNA[3],利用紫外分光光度計(jì)在260 nm和280 nm下測定OD值,檢驗(yàn)DNA的質(zhì)量和濃度,使用時(shí)將DNA稀釋到40 ng/L。
②SRAP擴(kuò)增 選擇10條上游引物和10條下游引物,隨機(jī)配成100對引物組合。25 μL反應(yīng)體系為:30 ng/μL DNA 模板,2.0 mmol/L MgCl2,
200 μmol/L dNTPs,0.25 μmol/L 引物,0.75 U Taq酶。PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性5 min;94℃變性1 min,35℃復(fù)性1 min,72℃延伸2 min,5個(gè)循環(huán);94℃變性1 min,50℃復(fù)性1 min,72℃延伸2 min,35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min,4℃保存。
③PCR產(chǎn)物的檢測 采用1%的瓊脂糖凝膠,恒壓120 V電泳35 min。使用EB染色,在凝膠成像系統(tǒng)上觀察并拍照保存。
2 結(jié)果與分析
2.1 多態(tài)性引物的篩選
利用10條上游引物(Me1~Me10)和10條下游引物(Em1~Em10)組成的100對引物組合對供試材料的混合DNA進(jìn)行擴(kuò)增篩選。結(jié)果表明,大部分SRAP引物均能在250~2 000 bp擴(kuò)增出條帶。選擇條帶清晰并且條帶數(shù)目較多的引物組合對閩茄5號、新組合(06-29×06-16)及各自親本材料進(jìn)行SRAP擴(kuò)增。篩選出1對引物組合(Me5/Em2)擴(kuò)增的閩茄5號譜帶表現(xiàn)為偏父型;1對引物組合(Me3/Em3)擴(kuò)增的新組合(06-29×06-16)譜帶表現(xiàn)為偏父型。
2.2 指紋圖譜的建立
利用篩選出的具有特異性譜帶的引物進(jìn)行SRAP擴(kuò)增,經(jīng)過多次重復(fù)試驗(yàn),結(jié)果表明,引物組合Me5/Em2 對閩茄5號擴(kuò)增在1 200 bp具有偏父性條帶(圖1);引物組合Me3/Em3對新組合(06-29×06-16)擴(kuò)增在460 bp具有偏父性條帶(圖2)。2對引物組合的擴(kuò)增產(chǎn)物具有高度穩(wěn)定性和重復(fù)性。
3 小結(jié)與討論
本試驗(yàn)利用SRAP分子標(biāo)記技術(shù)對閩茄5號及新組合進(jìn)行PCR擴(kuò)增,經(jīng)過多次重復(fù)試驗(yàn),篩選出Me5/Em2和Me3/Em3分別對閩茄5號及新組合建立指紋圖譜,可以將閩茄5號及新組合很好地區(qū)分開。
SRAP標(biāo)記是顯性標(biāo)記,并且符合孟德爾遺傳規(guī)律,親本所具有的特異性帶能在雜交F1代的譜帶中表現(xiàn)出來[4],因此,通過檢測F1代帶中是否出現(xiàn)雙親的特異性帶,可以對不同品種進(jìn)行鑒定。在新品種選育過程中,一些優(yōu)勢較強(qiáng)的自交系往往作為母本被重復(fù)利用,因而選育出的新組合與原品種之間具有較高的同源性,用分子標(biāo)記檢測種子純度時(shí)不能選擇母本的特異型條帶,而應(yīng)以父本的特異型帶進(jìn)行篩選。在制種前也可以利用此圖譜作為父本除雜的依據(jù),提高種子質(zhì)量。
參考文獻(xiàn)
[1] 陳繼兵,林峰,林文.茄子新品種閩茄5號的選育[J].中國蔬菜,2012(24):99-100.
[2] Li G, Quiros C F. Sequence-related amplified polymorphism(SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica[J]. Theor Appl Genet, 2001, 103: 455-461.
[3] 王關(guān)林,方宏筠.植物基因工程[M].北京:科學(xué)出版社,2002:742-744.
[4] 郭修武,張鵬翔,郭印山,等.應(yīng)用SRAP分子標(biāo)記技術(shù)鑒定葡萄種間雜交后代[J].分子植物育種,2011(9):1 389-1 393.endprint