何軍敏,孫 軍,余 雄,阿依達爾.霍江臺,木合依扎.熱很別克,黃錫霞*
(1.新疆農(nóng)業(yè)大學動物科學學院,新疆烏魯木齊 830052;2.特克斯縣畜牧獸醫(yī)局,新疆特克斯 835500)
MC1R與Slc7a11基因多態(tài)性與哈薩克羊毛色相關的研究
何軍敏1,孫 軍2,余 雄1,阿依達爾.霍江臺2,木合依扎.熱很別克1,黃錫霞1*
(1.新疆農(nóng)業(yè)大學動物科學學院,新疆烏魯木齊 830052;2.特克斯縣畜牧獸醫(yī)局,新疆特克斯 835500)
本研究采集新疆伊犁哈薩克自治州特克斯縣4種不同被毛顏色2~3周歲的220只哈薩克母羊血樣用于提取DNA,其中黑色被毛羊52只,棕色被毛羊52只,青灰色被毛羊59只,白色被毛羊57只;并采集綿羊左側(cè)肩胛皮膚樣本,每種毛色各10個,用于組織形態(tài)學觀察。本研究運用PCR-SSCP技術及測序技術對MC1R基因及Slc7a11基因多態(tài)性及其對哈薩克羊毛色的影響進行研究。運用皮膚樣本制作切片用于不同毛色組織形態(tài)學觀察。結(jié)果表明:MC1R基因突變位點在白色和棕色被毛群體中,只存在BB基因型;而在黑色和青灰色被毛群體中,存在AA、AB和BB 3種基因型;且AB基因型均為優(yōu)勢基因型,A等位基因為優(yōu)勢等位基因。由組織形態(tài)學觀察可知,黑色和青灰色被毛組織毛囊分布極為相似,毛囊分布稀疏且皮脂腺發(fā)達;棕色被毛最具特色,毛囊叢分布明顯,皮脂腺分布不發(fā)達;白色被毛毛囊分布最為密集,且皮脂腺分布密集并且最為發(fā)達。經(jīng)χ2檢驗,MC1R基因的基因型頻率在4種毛色羊中的分布差異極顯著(P<0.01)。Slc7a11基因位點在伊犁哈薩克羊群體中發(fā)現(xiàn)其不存在多態(tài)性。
哈薩克綿羊;MC1R基因;Slc7a11基因;PCR-SSCP;遺傳多態(tài)性
哈薩克綿羊是我國3大綿羊品種之一,同時也是新疆的優(yōu)秀地方綿羊品種。目前國內(nèi)外對于MC1R基因?qū)_克羊毛色影響的研究報道較少,尤其本研究中哈薩克羊群體存在4種毛色,目前僅在特克斯縣發(fā)現(xiàn)第4種毛色的哈薩克羊。孫浩浩[1]研究報道了TYR基因、ASIP基因多態(tài)性在綿羊中的相關分析。毛色受TYR、ASIP、MC1R、TYRP1等多種基因控制和影響,其通過參與生物合成活性或者調(diào)節(jié)有關黑色素生成細胞的分布過程等來調(diào)控毛色[2-3]。MC1R與黑色素細胞刺激激素α結(jié)合激活腺苷酸環(huán)化酶(cAMP),最終增加了黑色素的合成[4]。當Slc7a11基因突變后,導致其編碼的蛋白缺乏,使得氨基酸在轉(zhuǎn)運載體時失去功能,導致細胞不能攝取到足夠的胱氨酸,因此無法還原成半胱氨酸,從而無法滿足細胞中合成偽黑色素的需要,最終導致毛色主要表現(xiàn)為真黑色素的黑顏色,從而缺乏由偽黑色素產(chǎn)生的黃色[5-7]。王樂等[8]總結(jié)了目前MC1R基因在各種動物中的研究,但關于哈薩克羊存在青灰色被毛的研究至今未見報道。本實驗旨在研究特克斯縣哈薩克羊形成4種毛色的原因,從而進一步了解哈薩克羊毛色形成的規(guī)律,完善哈薩克羊毛色基因的研究。
1.1 實驗材料 本研究采集新疆伊犁哈薩克自治州特克斯縣4種不同被毛顏色2~3周歲的220只哈薩克母羊血樣及40個肩胛皮膚組織,所有綿羊毛色均為純色,不含有任何斑點或其他雜色,頭毛與蹄毛均與被毛一致,均為純色。其中黑色被毛樣本52個,棕色被毛樣本52個,青灰色被毛樣本59個,白色被毛樣本57個,血樣-20℃保存用于提取基因組DNA;采集綿羊左側(cè)肩胛皮膚組織每種毛色各10個,用福爾馬林保存用于組織形態(tài)學觀察。
1.2 方法 綿羊血樣基因組DNA運用酚-氯仿法進行抽提。皮膚組織由蘭州軍區(qū)總醫(yī)院組織切片制作室進行切片制作。運用PCR-SSCP技術分析MC1R基因在不同顏色被毛哈薩克羊的多態(tài)性,以提取的綿羊基因組DNA為模板進行PCR,反應體系參照Taq DNA聚合酶說明書。運用顯微鏡進行組織形態(tài)學觀察并進行圖像采集。
表1 PCR擴增的引物序列
1.2.1 引物設計 本研究MC1R基因(GenBank登錄號為FN600553)引用李洪濤[9]的引物序列,Slc7a11基因(GenBank登錄號為JQ085938)采用Primer Premier 5.0軟件設計引物,由上海生工合成,引物序列如表1所示。
1.2.2 PCR擴增程序的建立 PCR擴增條件:經(jīng)94℃預變性3 min;94℃變性30 s,MC1R基因61℃、Slc7a11基因59℃退火45 s,72℃延伸45 s,共35個循環(huán);72℃延伸5 min。于低溫保存待后續(xù)實驗。
1.2.3 PCR反應體系的建立 PCR擴增反應體系20 μL,其中 10 μL 2× PCR Master Mix,1 μL DNA 模板,上、下游引物(10 μmol/L)各0.5 μL,8 μL ddH2O 。
1.2.4 PCR產(chǎn)物測序 經(jīng)過普通PCR擴增及2%瓊脂糖凝膠電泳檢測合格后,將PCR產(chǎn)物送到上海生工進行單向測序。
1.2.5 PCR-SSCP過程 擴增產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,取3 μL的PCR產(chǎn)物,加入7 μL 上樣緩沖液(9.8 mL甲酰胺,10 mg 溴酚藍,10 mg二甲苯青, 0.5 mol/LEDTA 0.2 mL)混合,98℃變性10 min,立即冰浴15 min,并用12%聚丙烯酰胺凝膠(高板)進行電泳檢測。300 V 預電泳5 min 使樣品快速入膠,然后室溫恒壓180 V 電泳16~18 h。銀染液顯色后拍照,統(tǒng)計各基因型的個體數(shù)。
1.2.6 組織切片制作 皮膚組織送往蘭州軍區(qū)總醫(yī)院組織切片制作室進行切片制作,對皮膚組織進行橫切后制成切片,運用顯微鏡進行觀察并采集圖片。
1.3 統(tǒng)計分析 運用SPSS 18.0軟件對數(shù)據(jù)進行χ2獨立性檢驗,并進行多態(tài)信息含量(PIC)、遺傳純合度(Ho)、雜合度(He)和有效等位基因數(shù)(Ne)的計算。
2.1 組織形態(tài)學觀察 由圖1可知,在白色被毛組織中,毛囊分布密集但并未形成明顯的毛囊叢,毛囊分布均勻。皮脂腺分布密集較為發(fā)達。由圖2可知,在黑色被毛皮膚組織中,毛囊分布較白色稀疏,同樣未有明顯的毛囊叢存在,皮脂腺發(fā)達并且分布均勻。由圖3可知,在青灰色皮膚組織中,與黑色皮膚組織極為相似,毛囊分布稀疏,皮脂腺發(fā)達,分布均勻。由圖4可知,在棕色皮膚組織中,形成了明顯的毛囊叢,單一的毛囊叢中毛囊分布密集,毛囊叢之間分布較為離散,皮脂腺不發(fā)達。
圖1 白色被毛皮膚組織(100×)
圖2 黑色被毛皮膚組織(100×)
圖3 青灰色被毛皮膚組織(100×)
圖4 棕色被毛皮膚組織(100×)
2.2 DNA完整性檢測結(jié)果 將提取的基因組DNA用1%的瓊脂糖凝膠進行電泳檢測。結(jié)果表明,實驗提取的基因組DNA模板質(zhì)量良好、純度高、不需要純化,可直接用作模板DNA。
2.3 MC1R基因的PCR擴增結(jié)果 PCR產(chǎn)物經(jīng)2.0%的瓊脂糖凝膠進行電泳檢測,可知MC1R與Slc7a11基因引物PCR產(chǎn)物長度為169 bp和237 bp,與生物公司提供片段符合。結(jié)果表明,PCR擴增特異性良好,片段長度一致,引物的片段長度符合預期大小,可直接用于PCR-SSCP的分析。
2.4 MC1R和Slc7a11基因的PCR-SSCP多態(tài)性檢測結(jié)果 如圖5、6所示,MC1R基因存在3種不同的帶型,將其命名為AA、AB、BB型;Slc7a11基因均為AA基因型,不存在多態(tài)性。
圖5 MC1R的SSCP
圖6 Slc7a11基因的SSCP產(chǎn)物
2.5 MC1R序列分析 由測序結(jié)果分析可知,在哈薩克羊群體中發(fā)現(xiàn)此序列在91 bp處發(fā)生突變(圖7)。由AA基因型突變?yōu)锽B基因型,AB為雜合子。通過對氨基酸序列的分析發(fā)現(xiàn),其A91T突變點為非同義突變,由甲硫氨酸突變?yōu)橘嚢彼帷?/p>
2.6 MC1R的遺傳多態(tài)性分析 由表2可知,MC1R基因在不同毛色中均有差異。在白色和棕色被毛群體中,只存在BB基因型;在黑色被毛群體中,存在AA、AB和BB 3種基因型,其基因型頻率分別為0.27、0.71和0.02,且BB基因型頻率所占比例極小。由此可知,AB基因型為優(yōu)勢基因型;其A和B等位基因頻率分別為0.63和0.37,可知A等位基因為優(yōu)勢等位基因;而在青灰色被毛群體中,存在AA、AB和BB 3種基因型,其基因型頻率分別為0.32、0.54和0.14,由此可知AB基因型為優(yōu)勢基因型;其A和B等位基因頻率分別為0.59和0.41,可知A等位基因為優(yōu)勢等位基因。經(jīng)χ2檢驗,MC1R基因的基因型頻率在4種毛色羊中的分布差異極顯著(P<0.01)。
圖7 MC1R突變點不同基因型測序峰圖
表3 哈薩克羊MC1R基因遺傳參數(shù)
2.7 MC1R基因遺傳參數(shù)分析 由表3可知,MC1R基因在該哈薩克羊群體中黑色與青灰色均處于中度多態(tài)(0.25 大量研究表明,多數(shù)脊椎動物MC1R基因的突變能夠引起毛色的變化,如小鼠、牛、馬、雞、狐貍、豬、綿羊、山羊和狗,均發(fā)現(xiàn)毛色由淺變深;對人的研究亦是如此[10]。對小鼠進行遺傳學研究表明 ,MCIR是一種獨特的具有雙功能控制的受體。對豬的 MC1R 基因已經(jīng)定位 ,并且已建立了PCR-RFLP技術來檢測不同豬種的等位基因的多肽。研究發(fā)現(xiàn)綿羊中的extension 等位基因為ED, 從而導致顯性的黑色毛色。Vage等[11]分析了黑色被毛綿羊的MC1R基因,發(fā)現(xiàn)其存在2個突變即Asp121Asn 與Met73Lys。而對引進鼠的相對應的MC1R 基因進行藥理學分析發(fā)現(xiàn),Met73Lys突變點是組成型活性的MC1R,其可能是導致綿羊的黑色毛色的主要原因[8]。姜俊兵等[12]實驗證明,羊駝MC1R基因中存在著單鏈構(gòu)象多態(tài)性,存在AA和AB 2種基因型。 表2 MC1R基因頻率和基因型頻率的分布以及Hardy-Weinberg平衡的卡方檢驗 本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),MC1R基因突變的AB基因型與黑色被毛極顯著相關,說明該位點對黑色被毛有顯性作用,這與Vage等[11]報道的顯性黑等位基因(ED)控制黑色被毛的結(jié)果相一致。本研究發(fā)現(xiàn),哈薩克羊被毛的顏色與MC1R基因有密切聯(lián)系,它的突變決定著黑色和青灰色被毛的性狀,且在黑色與青灰色被毛中AB基因型所占頻率大。MC1R基因的基因型頻率在4種毛色羊中的分布差異極顯著。黑色與青灰色被毛中存在AA、AB和BB 3種基因型,與李洪濤等[9]的結(jié)果有一定差異;而在白色和棕色群體中僅存在BB基因型,與李洪濤等[9]的結(jié)果有一定的相似性。李洪濤等[9]將MC1R和ASIP進行基因型聯(lián)合分析時沒有發(fā)現(xiàn)對毛色有互補效應,說明控制哈薩克綿羊黑色被毛的主要基因是MC1R。對于綿羊的白色和棕色可能存在著其他位點的調(diào)控。有報道稱,Spotting位點決定著綿羊的白色被毛[13],Slc7a11 位點與綿羊的棕色被毛相關。而本研究Slc7a11基因位點在本實驗中運用PCR-SSCP技術并未檢測到其多態(tài)性,有待進一步研究。 經(jīng)皮膚組織形態(tài)學觀察發(fā)現(xiàn)在白色被毛組織中,毛囊分布密集且均勻;皮脂腺分布密集較為發(fā)達[14]。在黑色被毛皮膚組織中,毛囊分布較白色分布稀疏,皮脂腺發(fā)達并且分布均勻。在青灰色皮膚組織中,與黑色皮膚組織極為相似,毛囊分布稀疏,皮脂腺發(fā)達,分布均勻。在棕色皮膚組織中,形成了明顯的毛囊叢,單一的毛囊叢中毛囊分布密集,毛囊叢之間分布較為離散,皮脂腺不發(fā)達[15]。黑色與青灰色皮膚組織觀察極為相近,而白色與棕色各具特色,白色毛囊密集或許因白色毛發(fā)吸收光的能力較弱因而保暖更為密集,而其他顏色相對白色對光的吸收能力強,棕色形成了明顯的毛囊叢,此原因有待進一步研究。棕色皮脂腺較其他顏色不發(fā)達,也許與毛囊叢的形成在組織學中有一定的關系,有待專業(yè)人士進一步分析。 本研究分析了MC1R和 Slc7a11基因多態(tài)性與哈薩克綿羊被毛顏色之間的關系。結(jié)果表明,哈薩克羊被毛顏色與MC1R基因有密切聯(lián)系,且在黑色與青灰色被毛中AB基因型所占頻率大。MC1R基因的基因型頻率在4種毛色羊中的分布差異極顯著。Slc7a11基因位點在此群體中運用PCR-SSCP技術未檢測到多態(tài)性。由組織形態(tài)學可知,黑色與青灰色被毛組織毛囊分布極為相似;棕色被毛最具特色,毛囊叢分布明顯,皮脂腺分布不發(fā)達;白色被毛毛囊分布最為密集,且皮脂腺分布密集并且最為發(fā)達。 [1] 孟浩浩. TYR、ASIP基因多態(tài)性與綿羊毛色相關的研究[D]. 石河子: 石河子大學, 2014. [2] Fontanesi L, Dall'olio S, Beretti F, et al. Coat colours in the Massese sheep breed are associated withmutations in the agouti signalling protein (ASIP) and melanocortin 1 receptor (MC1R) genes[J]. Animal, 2010, 5(1): 8-17. [3] Royo L J, Ailvarez I, Arranz J J, et al. Differences in the expression of the ASIP gene are involved in the recessive black coat colour pattern in sheep: evidence from the rare Xalda sheep breed[J]. Anim Genet, 2008, 39(3):290-293. [4] Slominshi A, Tobin D J, Shibahara S, et al. Melanin pigmentation in mammalian skin and its hormonal regulation [J]. Physiol Rev, 2004, 84:1155-1228. [5] 張俊珍, 董常生, 范瑞文, 等. 哺乳動物毛色形成研究進展[J]. 動物醫(yī)學進展, 2006, (S1): 65-68. [6] 孫笑尉, 張雪蓮, 李振, 等. 染色質(zhì)重塑因子BPTF、BRG1在不同毛色綿羊皮膚的表達與定位[J].畜牧獸醫(yī)學報, 2017, 48(3):446-453. [7] 王準. Gas在綿羊耳部不同毛色皮膚中的表達與定位[D].太原: 山西農(nóng)業(yè)大學, 2016. [8] 王樂, 張斌, 鄭文新, 等. 動物毛色與黑色素皮質(zhì)素受體1(MC1R)基因[J]. 草食家畜, 2009, (2):10-12. [9] 李洪濤, 曾獻存, 張文祥, 等. 哈薩克綿羊MC1R和ASIP基因多態(tài)性及表達量與被毛顏色表型相關性的研究[J].畜牧獸醫(yī)學報, 2013, (3):366-375. [10] Valvered P, Healy E, Jackson I, et al. Variants of the melanocyte-stimulating hormone receptor gene are associated with red hair and fair skin in humans[J]. Nat Genet, 1995, 11:328-330. [11] Vage D I, Lu D D, Dlungland D, et al. A non-epistatic interaction of Agouti and extension in the fox,Vulpes vulpes[J]. Nat Genet, 1997, 15:311-315. [12] 姜俊兵, 任杰, 于菊秀, 等. 中國羊駝種群MC1R基因的PCR-SSCP分析[J]. 家畜生態(tài)學報, 2010, 31(3): 15-18. [13] Kerns J A, Cargill E J, Clark L, et al. Linkage and segregation analysis of black and brindle coat color in domestic dogs[J]. Genetics, 2007, 176:1679-1689. [14] 姜曉龍, 陳建偉, 姚曉磊, 等. 綿羊卵巢組織石蠟切片制作條件優(yōu)化研究[J]. 上海畜牧獸醫(yī)通訊, 2013, (6):2-3. [15] 牟艷軍, 廖和榮, 趙宗勝, 等. 生長激素受體(GHR)mRNA在綿羊皮膚組織切片定位[J]. 安徽農(nóng)業(yè)科學,2006, (7):1295-1296. S826.2 A 10.19556/j.0258-7033.2017-10-039 2017-03-31; 2017-04-05 農(nóng)業(yè)部體系項目(CARS-40);疆農(nóng)業(yè)大學產(chǎn)學研聯(lián)合培養(yǎng)研究生示范基地項目(xjaucxy-yjs-20152011) 何軍敏(1991-),女,新疆烏蘇人,碩士研究生,主要從事動物遺傳育種的研究,E-mail: 1415230131@qq.com *通訊作者:黃錫霞(1963-),教授,博士生導師,主要從事動物遺傳育種的研究,E- mail:au- huangxixia@163.com3 討 論
4 結(jié) 論