張傳靜,吳 婷,任紅鑫,張玲帆,杜一平
(華東理工大學(xué) 化學(xué)與分子工程學(xué)院,上海 200237)
研究報告
基于MALDI-TOF MS的串聯(lián)富集策略在磷酸化蛋白組學(xué)中的應(yīng)用
張傳靜,吳 婷*,任紅鑫,張玲帆,杜一平
(華東理工大學(xué) 化學(xué)與分子工程學(xué)院,上海 200237)
提出一種除鹽-富集串聯(lián)用于磷酸肽富集研究的思路。選用C18柱和鈰(Ⅳ)修飾的殼聚糖材料進(jìn)行脫鹽實驗,以制備的基于聚合物基體螯合Fe3+的親和色譜材料為富集材料。將直接富集和串聯(lián)策略應(yīng)用到標(biāo)準(zhǔn)品和血清中,研究結(jié)果表明,該富集材料具有高選擇性和高靈敏度(1.6 fmol),鈰(Ⅳ)修飾的殼聚糖材料前提下的串聯(lián)策略能明顯降低樣品的復(fù)雜性。相比直接富集方法,能夠提高磷酸化肽的覆蓋率。
脫鹽;固定金屬離子親和色譜;基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時間質(zhì)譜;磷酸肽;串聯(lián)富集
蛋白質(zhì)的磷酸化是一個可逆過程,是極其重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾的方式之一,調(diào)控著很多的生理過程,諸如基因表達(dá)、細(xì)胞的增殖與分裂、新陳代謝以及信號的轉(zhuǎn)導(dǎo)[1-3]。因此,關(guān)于磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)的研究備受關(guān)注。
生物質(zhì)譜技術(shù)具備反映生物信息的能力,現(xiàn)已被廣泛用于蛋白質(zhì)的磷酸化分析。然而,在磷酸化蛋白質(zhì)的酶解產(chǎn)物中,磷酸化肽段的含量低,與此同時離子化效率也低。在進(jìn)行質(zhì)譜檢測時,磷酸化肽段的信號會被高豐度的非磷酸化肽段的信號干擾和抑制[4],甚至無法進(jìn)行檢測。所以,在檢測之前,需從樣品中將磷酸化肽選擇性地分離富集出來。目前,固定金屬離子親和色譜法(IMAC)的操作過程最簡單方便,是磷酸化肽段分離富集中使用最為頻繁的重要技術(shù)之一,其基本原理是利用金屬離子與磷酸肽中的磷酸基團(tuán)之間形成強(qiáng)的螯合作用力,從而實現(xiàn)磷酸肽的分離與富集。IMAC材料主要由色譜基質(zhì)、連接臂和金屬離子組成。傳統(tǒng)的固定Fe3+、Ga3+和Al3+的IMAC材料[5-7]以亞氨基二乙酸和次氮基三乙酸為連接臂,連接臂和金屬離子間的親和作用力較弱,在使用過程中易丟失金屬離子,限制了材料的富集效率。近年來,固定Zr4+和Ti4+的IMAC材料[8-10]基于磷酸肽的磷酸根與金屬離子間牢固的親和作用力實現(xiàn)磷酸肽富集;固定Ce4+的IMAC材料[11]金屬離子固載量豐富且可重復(fù)使用性好,實驗室現(xiàn)有的鈰(Ⅳ)修飾的殼聚糖材料(Ce-MCM)不僅具備上述優(yōu)點,還具有寬泛的使用范圍,在pH 3.0~11.0下均可使用,在一般的有機(jī)介質(zhì)中也很穩(wěn)定,能夠耐受離心和超聲處理。
一般直接采用IMAC方法來實現(xiàn)磷酸化肽的富集。但由于一些鹽分和污染物的存在,造成加合峰過多形成峰包,給質(zhì)譜分析帶來不便。為解決實際問題,相關(guān)的研究致力于串聯(lián)策略[12]。二維色譜的完美結(jié)合,諸如強(qiáng)陰離子交換-金屬氧化物親和色譜法(SAX-MOAC)[13]、強(qiáng)陽離子交換-固定金屬離子親和色譜法(SCX-IMAC)[14]、固定金屬離子親和色譜-親和作用色譜(IMAC-HILIC)[15]、固定金屬離子親和色譜- C18(IMAC-C18)[16]柱和固定金屬離子親和色譜(IMAC-IMAC)[17]已成為趨勢并在磷酸化肽的識別上表現(xiàn)出各自的特性。
為改善質(zhì)譜檢測結(jié)果[18],通常需對肽和蛋白樣品進(jìn)行除鹽。本文提出一種除鹽-富集串聯(lián)策略用于研究磷酸化肽的分離富集,分別選用商品化的C18柱和Ce-MCM進(jìn)行除鹽實驗,以制備的一種基于聚合物基體螯合Fe3+的IMAC材料為富集材料。綜合比較了兩者的除鹽能力以及串聯(lián)之后富集磷酸化肽的效果。
1.1 儀器與試劑
真空掃描電子顯微鏡(SEM,型號:HITACHI-S3400N),傅立葉變換紅外光譜儀(FT-IR,型號:6700),基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時間質(zhì)譜儀(AB SCIEX 4800 plus MALDI-TOF/TOF MS)。美國Millipore公司Milli-Q(Millipore,Bedford,MA)水處理系統(tǒng)。
甲基丙烯酸縮水甘油酯(GMA)、2,2′-二甲氧基-2-苯基苯乙酮(DMPA)、三氟乙酸(TFA,99%)購自阿拉丁試劑有限公司。乙氧化三羥甲基丙烷三丙烯酸酯(SR454)、α-酪蛋白(α-Casein)、β-酪蛋白(β-Casein)、牛血清白蛋白(BSA)、2,5-二羥基苯甲酸(2,5-DHB)、二硫蘇糖醇(DTT,99%)、碘代乙酰胺(IAA,99%)、亞氨基二乙酸(IDA)和乙腈(ACN,高效液相色譜級別)購自西格瑪奧德里奇(上海)貿(mào)易有限公司。無水碳酸鈉、六水合氯化鐵、氯化鈉、濃氨水和碳酸氫銨購自國藥控股有限公司。人血清為100例健康人血清混合樣品,樣品存儲于-80 ℃冰箱待用。實驗用水由Milli-Q水處理系統(tǒng)處理。
1.2 GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料的制備
GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA的合成流程如圖1所示。
圖1 GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料的制備示意圖Fig.1 Synthesis of GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA material
粉末狀GMA-co-SR454材料的合成:稱取甲基丙烯酸縮水甘油酯1.9 g,乙氧化三羥甲基丙烷三丙烯酸酯2.9 g,2,2′-二甲氧基-2-苯基苯乙酮(DMPA)0.12 g,置于10 mL離心管中。移取環(huán)己醇6.234 mL和甲醇1.517 mL于上述離心管中,使用渦旋振蕩器加速固體完全溶解。轉(zhuǎn)移上述溶液于8 cm的玻璃培養(yǎng)皿中,用波長為365 nm的便攜式紫外燈照射10 min,促使自由基聚合反應(yīng)發(fā)生。聚合反應(yīng)完成后,關(guān)閉紫外燈,分別用甲醇和超純水洗去致孔劑和未反應(yīng)完的單體,得到整體柱材料。將所合成的整體柱材料通過研磨、篩分后,獲得一定大小的粉末狀GMA-co-SR454材料。
GMA-co-SR454-IDA材料的合成:根據(jù)已有報道[19],對GMA-co-SR454材料進(jìn)行羧基改性。將1.5 g上述合成的粉末狀GMA-co-SR454材料置于100 mL圓底燒瓶中,加入0.50 g 20 mL IDA 的碳酸鈉溶液(pH 10.0),再加入0.25 g氯化鈉,置于75 ℃水浴中,攪拌反應(yīng)6 h。之后離心,棄去上清液,將材料用超純水洗至中性。
GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料的合成:根據(jù)方法[8],對GMA-co-SR454-IDA材料固定金屬離子。取適量的上述材料于100 mL圓底燒瓶中,隨后加入40 mL 50 mmol/L的三氯化鐵溶液,常溫下攪拌反應(yīng)3 h。減壓抽濾,用超純水洗至中性,自然環(huán)境下晾干,即得粉末狀的GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料。
1.3 標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的酶解及人血清樣品制備
1)部分街道名稱標(biāo)注不清。如創(chuàng)新街和創(chuàng)業(yè)街,兩條街的地理位置接近,老百姓極易混淆。個別街道名稱后來經(jīng)過更名,而更名后的街道名稱反而給老百姓帶來記憶上的混亂。如北宮街的其中一段在2014年更名為通亭街,新、老北宮街沒有實現(xiàn)實際的對接,給老百姓出行帶來一定困擾。
稱取1.00 mg 標(biāo)準(zhǔn)磷酸化蛋白質(zhì)(α-/β-酪蛋白),溶解于500 μL 25 mmol/L碳酸氫銨溶液(pH 8.2),按照酶與蛋白質(zhì)量比1∶50的比例加入胰蛋白酶,于37 ℃酶解18 h。
稱取2.00 mg牛血清白蛋白,溶于1 mL含8 mol/L尿素和50 mmol/L碳酸氫銨(pH 8.3)的溶液中,加入20 μL 1 mol/L二硫蘇糖醇,于60 ℃孵育1 h。隨后加入7.20 mg碘代乙酰胺,置于室溫和暗室的環(huán)境下烷基化反應(yīng)45 min,用50 mmol/L碳酸氫銨(pH 8.3)溶液稀釋10倍。按照酶與蛋白質(zhì)量比1∶50加入胰蛋白酶,37 ℃酶解18 h。酶解結(jié)束后,分裝凍干,存儲于-20 ℃冰箱備用。
對于人血清,收集血液樣品5 mL于室溫下凝結(jié)1 h,離心,保留上清液并分裝,存儲于-20 ℃冰箱備用。
1.4 樣品脫鹽處理
C18柱除鹽步驟比較成熟,可參考已有文獻(xiàn)[20]。而Ce-MCM脫鹽的流程如下:首先用60% ACN/1.0% TFA體系將樣品稀釋至所需濃度,加入0.10 mg Ce-MCM,室溫下振蕩10 min。離心,移去上清液,用50% ACN/0.1% TFA體系清洗殘留物3次,將殘留在材料表面的鹽分、干擾物或結(jié)合不牢固的肽段清洗下來。最后,使用5%(體積分?jǐn)?shù))NH3·H2O作為洗脫液,將結(jié)合在材料上的肽段洗脫下來,待用。
1.5 GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料分離富集磷酸肽
將樣品溶液用上樣液(80% ACN/0.1% TFA或1.0% TFA)稀釋至所需濃度,加入0.50 mg GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料,室溫下振蕩30 min。于8 000 r/min下離心5 min,棄去上清液。依次用上樣液和80% ACN溶液進(jìn)行清洗,前者洗2次,后者洗1次。加入10 μL 15% NH3·H2O洗脫2次,收集洗脫液,待用。
取0.5 μL洗脫液點覆于不銹鋼靶板的圓點處,室溫自然揮干,再將0.5 μL DHB基質(zhì)溶液點覆在樣品表面,室溫下自然揮干;將制備好的樣品送入MALDI-TOF MS進(jìn)行分析。
2.1 GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料的合成與表征
圖1為GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA的合成過程。首先,GMA單體在交聯(lián)劑和紫外光的共同作用下,發(fā)生聚合反應(yīng),制備出GMA-co-SR454整體柱材料。其次,整體柱材料上的環(huán)氧基與IDA發(fā)生親電取代反應(yīng)而開環(huán),生成GMA-co-SR454-IDA材料。最后,通過Fe3+與雜原子氧之間的螯合作用,而成功將Fe3+固載在材料上。
采用傅立葉紅外光譜(FT-IR)分析GMA與SR454的聚合情況以及亞氨基二乙酸與該聚合物的反應(yīng)情況(圖2)。如圖2a所示,908 cm-1處的峰對應(yīng)于GMA中環(huán)氧基的對稱伸縮振動,說明聚合反應(yīng)生成了GMA-co-SR454。圖2b中3 425 cm-1處的吸收峰對應(yīng)于締合的O—H的伸縮振動,1 129 cm-1處的峰對應(yīng)于C—OH的伸縮振動,608 cm-1處的峰對應(yīng)于締合狀態(tài)的醇類中O—H的面外變形振動,說明亞氨基二乙酸接到GMA-co-SR454聚合物上,從而使環(huán)氧基發(fā)生開環(huán)。
掃描電鏡圖(圖3)顯示,GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA呈堆積的球形結(jié)構(gòu),直徑約為100 nm。
圖2 GMA-co-SR454(a)與GMA-co-SR454-IDA(b)的傅立葉變換紅外光譜圖Fig.2 FT-IR spectra of GMA-co-SR454(a) and GMA-co-SR454-IDA(b)
圖3 GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料的掃描電鏡圖Fig.3 SEM image of GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA material
2.2 GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料用于標(biāo)準(zhǔn)磷酸化蛋白質(zhì)酶解液中磷酸化肽的富集
為考察GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料對磷酸化肽段的富集性能,首先使用磷酸化的β-酪蛋白標(biāo)準(zhǔn)品(通常含有α-酪蛋白)的酶解液進(jìn)行評價。如圖4A所示,直接分析時,僅能檢測到2條弱信號強(qiáng)度和低信噪比的目標(biāo)肽段,這是由于磷酸化肽的豐度低、離子化效率低,以及高豐度的非磷酸化肽對磷酸化肽有強(qiáng)烈的信號抑制作用。然而,經(jīng)GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料富集后(圖4B),非磷酸化肽段的質(zhì)譜峰幾乎消失,檢測到4條高信號強(qiáng)度和高信噪比β-酪蛋白酶解液中的磷酸化肽段以及4條低信號強(qiáng)度的α-酪蛋白中的磷酸化肽段。其中有一系列特征性的片段,如丟失磷酸基團(tuán)的肽段,信號強(qiáng)度比較可觀。另外,評估了該材料對α-酪蛋白酶解液中磷酸化肽段的富集能力,成功捕捉到21條目標(biāo)肽段。以上富集到的目標(biāo)肽段的詳細(xì)信息見表1。
圖4 直接分析β-酪蛋白酶解液(A)以及經(jīng)GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料富集后(B)的質(zhì)譜圖Fig.4 MALDI-TOF MS of tryptic digest of β-casein direct analysis(A) and after enrichment with GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA(B)the phosphopeptides and their dephosphorylated fragments of the metastable losses of phosphoric acid were marked with β and -nH3PO4,respectively
為進(jìn)一步評價GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料的富集選擇性,將該材料用于β-酪蛋白酶解液與牛血清白蛋白酶解液的混合體系。當(dāng)兩者的摩爾比為1∶10時,在未富集之前有2條信號強(qiáng)度很低的磷酸化肽段,非磷酸化肽段的峰占主導(dǎo)位置。而經(jīng)該材料富集后,在洗脫液中檢測到4條β-酪蛋白酶解液中的磷酸化肽段。即使將兩者的摩爾比降至1∶500,該材料仍能高效地富集到3條目標(biāo)肽段。
2.3 GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料對β-酪蛋白酶解液中磷酸化肽的富集靈敏度
將GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料分別用于富集不同稀釋濃度的β-酪蛋白酶解液。結(jié)果顯示,MALDI-TOF MS可以檢測出4 fmolβ-酪蛋白酶解液中的4條磷酸化肽;當(dāng)β-酪蛋白酶解液的濃度降低至1.6 fmol時,質(zhì)譜圖上有β1和β5峰,β5峰的強(qiáng)度隨蛋白酶解液濃度的降低發(fā)生規(guī)律性地變化。由于在β-酪蛋白酶解液的濃度降于1.6 fmol的情況下,質(zhì)譜儀未檢測到任何峰。因此,當(dāng)選用β5峰來定義檢出限時,GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA材料對磷酸化肽的檢出限為1.6 fmol。優(yōu)于文獻(xiàn)[18-19]中其他IMAC材料的檢出限(如chitosan-GMA-IDA-Fe3+為5 fmol,NPs poly(AGE/DVB)-Fe3+wafer為2 fmol)。
圖5 直接分析β-酪蛋白酶解液(A),經(jīng)C18吸附材料除鹽后(B),以及經(jīng)Ce-MCM除鹽后(C)的質(zhì)譜圖Fig.5 MALDI-TOF MS of tryptic digest of β-caseinA.no desalting;B.desalted by C18;C.desalted by Ce-MCM;NPP:non-phosphopeptide(非磷酸肽);PP:phosphopeptide(磷酸肽)
2.4直接IMAC富集與串聯(lián)策略分離富集比較
為考察除鹽效果,首先檢測了脫鹽后的酶解液。如圖5A所示,直接分析β-酪蛋白的酶解液時,由于碳酸氫銨的干擾,僅能檢測到10條肽段。而經(jīng)過除鹽后,得到的質(zhì)譜圖有明顯改善,肽段的數(shù)目及信號強(qiáng)度有所增加(圖5B、C)。通過比較發(fā)現(xiàn),經(jīng)Ce-MCM除鹽后,質(zhì)譜儀能檢測出20條肽段數(shù),其中磷酸化肽段有9條;而經(jīng)C18柱處理后的質(zhì)譜結(jié)果是15條肽段中有4條磷酸化肽段。這是由于Ce-MCM是一種IMAC材料,在使用的ACN/TFA體系下,對特定的肽段沒有選擇性,能保留更多的肽段,在堿性條件下,保留的肽段能被有效地洗脫下來;而C18吸附材料易使一些親水性的肽段丟失或者在鹽濃度高的情況下,作用效率低。由此可知,Ce-MCM的除鹽效果更為理想。
另外,將串聯(lián)策略分離富集的質(zhì)譜圖與直接富集的質(zhì)譜圖進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)C18柱和Ce-MCM的脫鹽對富集產(chǎn)生不同影響。如圖6所示,前者(圖A)使磷酸化肽的數(shù)目及信號強(qiáng)度減弱。后者(圖B)卻恰恰相反,單磷酸化肽段(β1,β4)的峰明顯增強(qiáng),1條新的單磷酸化肽段(β3)被富集到,而在多磷酸化肽段中,β5肽段減弱,β2肽段幾乎不見。
為進(jìn)一步說明問題,將串聯(lián)策略應(yīng)用到α-酪蛋白酶解液中。如圖7所示,相比直接IMAC富集,Ce-MCM/IMAC(圖7A)能捕捉到更多的目標(biāo)肽段(24條),并且有不同的目標(biāo)肽段。而C18/IMAC(圖7B)表現(xiàn)效果不佳。通過比較圖7A與圖7B發(fā)現(xiàn),圖7A中,單磷酸化肽段的峰如α3、α4、α6、α7、α10、α11從無到有,而且峰α8的信號強(qiáng)度顯著增強(qiáng)。但在一些多磷酸肽段的峰中,峰α21、α23、α25、α27、α29減弱,峰α18、α24、α26、α30消失不見。這些現(xiàn)象歸因于脫鹽材料各自不同的特性,Ce-MCM是一種金屬螯合親和色譜材料,在60% ACN/1.0% TFA上樣液體系下,非磷酸化肽和磷酸化肽在材料上產(chǎn)生共吸附,保留的肽段經(jīng)5% NH3·H2O洗脫液洗脫后,其質(zhì)譜響應(yīng)信號明顯改善,此外,Ce-MCM上的鈰(Ⅳ)金屬離子對磷酸酯鍵的水解作用[21],使一些多磷酸肽的含量降低,甚至使含量不高的多磷酸肽達(dá)不到質(zhì)譜檢測時需求的濃度。而C18吸附材料是反相色譜材料,易造成一些親水性的肽段如磷酸肽的丟失[22]。綜上可知,Ce-MCM/IMAC串聯(lián)策略中的Ce-MCM的親和色譜性質(zhì)有利于磷酸化肽數(shù)目的增加。以上富集到的目標(biāo)肽段的詳細(xì)信息見表1。
圖6 β-酪蛋白酶解液經(jīng)C18/IMAC富集后(A),經(jīng)Ce-MCM/IMAC富集后(B)的質(zhì)譜圖Fig.6 MALDI-TOF MS of tryptic digest of β-casein after enrichment by C18/IMAC(A) and Ce-MCM/IMAC(B)-nHPO3 :the metastable losses of metaphosphoric acid(-nHPO3為脫亞磷酸基團(tuán)肽段)
圖7 α-酪蛋白酶解液經(jīng)Ce-MCM/IMAC富集后(A),以及經(jīng)C18/IMAC富集后(B)的質(zhì)譜圖Fig.7 MALDI-TOF MS of tryptic digest of α-casein after enrichment by Ce-MCM/IMAC(A) and C18/IMAC(B) *multi-phosphopeptides(多磷酸肽)
表1 直接IMAC方法和串聯(lián)策略從α-/β-酪蛋白酶解液中富集到的磷酸化肽段的磷酸化位點及序列Table 1 Phosphorylation sites and the sequence of identified peptides in tryptic digest of α-/β-casein enriched by direct IMAC and tandem desalting/IMAC
a:phosphorylated residue,b:oxidation on methionine,c:pyroglutamylation on the N-terminal
圖8 正常人的血清經(jīng)IMAC材料富集后(A),經(jīng)C18/IMAC富集后(B)以及經(jīng)Ce-MCM/IMAC富集后(C)的質(zhì)譜圖Fig.8 MALDI-TOF MS of the diluted human serum sample after enrichment with direct IMAC(A),with C18/IMAC(B) and with Ce-MCM/IMAC(C)F:phosphopeptides;-nHPO3 :dephosphorylated fragments of the metastable losses of metaphosphoric acid
以健康人血清為實際樣品,Ce-MCM/IMAC(圖8C)能捕捉到與直接IMAC方法(圖8A)等同的4條目標(biāo)肽段(1 389.5,1 460.5,1 545.6,1 616.6),此外還檢測到多余的峰,即去亞磷酸基團(tuán)的峰,這是鈰(Ⅳ)離子催化磷酸酯鍵發(fā)生水解作用的結(jié)果。但在C18/IMAC(圖8B)的情況下,僅能富集到3條目標(biāo)肽段,并且肽段F2和F3的峰強(qiáng)相對變?nèi)酢?/p>
制備了基于聚合物的GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA富集材料,并提出除鹽-富集串聯(lián)策略。通過考察標(biāo)準(zhǔn)品和實際樣品,發(fā)現(xiàn)該材料能選擇性地富集到β-酪蛋白酶解液中的4條目標(biāo)肽段和血清中的4條目標(biāo)肽段,檢出限達(dá)1.6 fmol。另外,Ce-MCM/IMAC串聯(lián)的結(jié)果優(yōu)于C18/IMAC和直接IMAC富集,能顯著降低樣品的復(fù)雜性和增加磷酸化肽的富集數(shù)目,方法重現(xiàn)性好。因此,該串聯(lián)富集策略可為增加磷酸化肽的覆蓋率提供一種新思路。
[1] Pawson T,Scott J D.TrendsBiochem.Sci.,2005,30(6):286-290.
[2] Reinders J,Sickmann A.Proteomics,2005,5(16):4052-4061.
[3] Dephoure N,Zhou C,Villen J,BeausoleilS A,Bakalarski C E,Elledge S J,Gygi S P.PNAS,2008,105(31):10762-10767.
[4] Zhou H L,Watts J D,Aebersold R.Nat.Biotechnol.,2001,19(4):375-378.
[5] Pan C S,Ye M L,Liu Y G,Feng S,Jiang X G,Han G H,Zhu J J,Zou H F.J.ProteomeRes.,2006,5(11):3114-3124.
[6] Zhang L Y,Liang Z,Zhang L H,Zhang Y K,Shao S J.Anal.Chim.Acta,2015,900:46-55.
[7] Biswas S,Sarkar A,Misra R.Biotechnol.Biotec.Eq.,2017,31(3):639-646.
[8] Zheng L Y,Dong H P,Hu L J.Ind.Eng.Chem.Res.,2013,52(23):7729-7736.
[9] Yu Z Y,Han G H,Sun S T,Jiang X N,Chen R,Wang F J,Wu R A,Ye M L,Zou H F.Anal.Chim.Acta,2009,636(1):34-41.
[10] Wu T,Shi J N,Zhang C J,Zhang L F,Du Y P.J.Chromatogr.B,2016,1008:234-239.
[11] Wang Z G,Cheng G,Liu Y L,Zhang J L,Sun D H,Ni J Z.J.ColloidInterf.Sci.,2014,417(3):217-226.
[12] Herring L E,Grant K G,Blackburn K,Haugh J M,Goshe M B.J.Chromatogr.B,2015,988:166-174.
[13] Nühse T S,Stensballe A,Jensen O N,Peck S C.Mol.Cell.Proteomics,2003,2(11):1234-1243.
[14] Villen J,Beausoleil S A,Gerber S A,Gygi S P.PNAS,2007,104(5):1488-1493.
[15] McNulty D E,Annan R S.Mol.Cell.Proteomics,2008,7(5):971-980.
[16] Chockalingam M,Darwish N,Le Saux G,Gooding J J.Langmuir,2011,27(6):2545-2552.
[17] Ye J,Zhang X,Young C,Zhao X,Hao Q,Cheng L,Jensen O N.J.ProteomeRes.,2010,9(7):3561-3573.
[18] Najamulhaq M,Saeed A,Jabeen F,Maya F,Ashiq M N,Sharif A.ACSAppl.Mater.Inter.,2014,6(5):3536-3545.
[19] Zou X,Liu D,Zhong L J,Yang B,Lou Y X,Hu B H,Yin Y X.Anal.Bioanal.Chem.,2011,401(4):1251-1261.
[20] Jehmlich N,Golatowski C,Murr A,Salazar G,Dhople V M,Hammer E,V?lker U.Clin.Chim.Acta,2014,434:16-20.
[21] Wu J H,Xiao K,Zhao Y,Zhang W P,Guo L,Feng Y Q.J.Sep.Sci.,2010,33(15):2361-2368.
[22] Hussain D,Najamulhaq M,Jabeen F,Ashiq M N,Athar M,Rainer M,Huck C W,Bonn G K.Anal.Chim.Acta,2013,775(7):75-84.
Application of Tandem Enrichment Strategy by MALDI-TOF MS in Phosphorylated Proteomics
ZHANG Chuan-jing,WU Ting*,REN Hong-xin,ZHANG Ling-fan,DU Yi-ping
(School of Chemistry and Molecular Engineering,East China University of Science and Technology,Shanghai 200237,China)
A scheme was presented for the tandem purification of phosphopeptide using desalting prior to immobilized metal ion affinity chromatography(IMAC).Both C18tip and the cerium(Ⅳ)-modified chitosan material(Ce-MCM) were used in the desalting experiments.GMA-co-SR454/Iron(Ⅲ)-IDA was synthesized,and used as an excellent phosphopetides enrichment material.They were applied to selectively capture the phosphopeptides in standards and human serum.Results demonstrated that C18/IMAC and Ce-MCM/IMAC have different performances because of their hydrophobic or hydrophilic properties.Ce-MCM/IMAC tandem strategy notably decreased the complexity of peptides,and yielded a far greater coverage for phosphopeptides than single IMAC.
desalting; IMAC; matrix-assisted laser desorption-ionization time of flight mass spectrometry(MALDI-TOF MS); phosphopeptides; tandem enrichment
O657.7;O657.63
:A
:1004-4957(2017)09-1061-08
2017-03-19;
:2017-05-20
國家質(zhì)檢總局科技計劃項目(2015IK201)
*
:吳 婷,博士,高級工程師,研究方向:蛋白質(zhì)組學(xué),Tel:021-64252107,E-mail:wu_ting@ecust.edu.cn
10.3969/j.issn.1004-4957.2017.09.001