亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        不同產(chǎn)地花臉香蘑菌絲體及子實(shí)體的RAPD分析

        2017-08-22 03:10:11張麗麗王蘭英唐萌楊海茹胡玲蔡佳
        湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年14期
        關(guān)鍵詞:聚類分析

        張麗麗+王蘭英+唐萌+楊海茹+胡玲+蔡佳旋+黃艷怡

        摘要:采用RAPD分析了5個(gè)不同產(chǎn)地的花臉香蘑(Lepista sordida)菌絲體和子實(shí)體的DNA多樣性。用12種引物分別對(duì)5種樣品進(jìn)行PCR擴(kuò)增,從中選出8種引物擴(kuò)增后的結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)算樣品間的遺傳相似系數(shù)(GS值),進(jìn)而根據(jù)遺傳相似系數(shù)矩陣,利用UPGMA法進(jìn)行聚類分析。結(jié)果表明,花臉香蘑菌絲體和子實(shí)體分為兩個(gè)類群,又將3個(gè)不同產(chǎn)地的菌絲體分為2個(gè)亞群,為花臉香蘑后期研究提供參考。

        關(guān)鍵詞:花臉香蘑(Lepista sordida);DNA多樣性;聚類分析

        中圖分類號(hào):S646 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):0439-8114(2017)14-2758-03

        DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2017.14.041

        Abstract: Using RAPD analysis of the five different regions of mycelia and fruiting body of Lepista sordida DNA diversity. Respectively with 12 primers for PCR amplification, five samples selected by 8 primers' amplification result for data analysis, the genetic similarity coefficient between the sample value(GS),and then according to the genetic similarity coefficient matrix, the cluster analysis using UPGMA method. The results showed that RAPD mycelia and fruiting body Lepista sordida method is divided into two groups, and the mycelium of three different regions can be divided into two subsets, it can be seen that the genetic relationship provide reference for later study of Lepista sordida.

        Key words: Lepista sordida; DNA diversity; clustering analysis

        花臉香蘑(Lepista sordida)又名紫香花臉蘑,隸屬于傘菌目(Agaricales)白蘑科(Tricholomataceae)香蘑屬(Lepista)[1],花臉香蘑的子實(shí)體營(yíng)養(yǎng)豐富,風(fēng)味獨(dú)特,是一種具有較高開發(fā)價(jià)值的食用菌[2]。但人工栽培的花臉香蘑存在子實(shí)體易碎、不易運(yùn)輸?shù)热毕荩写谕ㄟ^(guò)雜交等育種方式進(jìn)行改良,這就需要對(duì)花臉香蘑種質(zhì)資源進(jìn)行廣泛采集和科學(xué)鑒定,以避免因形態(tài)相似或分離失誤而出現(xiàn)偏差[3]。

        本研究利用RAPD技術(shù),鑒定花臉香蘑菌株,克服傳統(tǒng)的標(biāo)記手段和形態(tài)分類學(xué)的缺點(diǎn),為花臉香蘑的深入研究提供了強(qiáng)有力的工具和手段,其應(yīng)用和發(fā)展前景廣闊。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        花臉香蘑1號(hào)菌種購(gòu)于蘇州北納創(chuàng)聯(lián)生物技術(shù)有限公司,編號(hào)為BNCC117075,采集地為山東;花臉香蘑2號(hào)菌種購(gòu)于蘇州北納創(chuàng)聯(lián)生物技術(shù)有限公司,編號(hào)為BNCC110924,采集地為黑龍江;花臉香蘑3號(hào)菌種由吉林大學(xué)珠海學(xué)院化學(xué)與藥學(xué)系實(shí)驗(yàn)中心提供;花臉香蘑4號(hào)子實(shí)體產(chǎn)地為內(nèi)蒙古大興安嶺阿爾山林區(qū);花臉香蘑5號(hào)子實(shí)體產(chǎn)地為吉林長(zhǎng)白山地區(qū),以上5種菌類原始樣品,樣品編號(hào)1~5。

        1.2 基因組DNA的提取

        采用CTAB法提取樣品基因組DNA,具體步驟參考Zhang等[4]方法進(jìn)行。

        1.3 RAPD分析

        1.3.1 RAPD反應(yīng)體系和擴(kuò)增條件 PCR擴(kuò)增體系(20 μL)為DNA模板2 μL、Primer 1 μL、DNA Mix 10 μL、去離子水7 μL。PCR擴(kuò)增程序?yàn)?4 ℃預(yù)變性 3 min;94 ℃變性30 s,36 ℃退出50 s,72 ℃延伸1.5 min,40個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃保存[5]。

        1.3.2 RAPD擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè) 利用表1中的12種引物對(duì)5個(gè)樣品進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物在2.0%的瓊脂糖凝膠電泳中檢測(cè)。

        1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

        PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳位置在凝膠某個(gè)相同遷移率位置上有DNA條帶記為1,無(wú)DNA條帶記為0,如表2所示,形成RAPD的表型數(shù)據(jù)矩陣,可以將PCR擴(kuò)增的結(jié)果數(shù)字化,便于后續(xù)的分析。NTSYS軟件計(jì)算相似系數(shù)(DICE系數(shù)),并且按照遺傳距離進(jìn)行UPGMA聚類分析[6]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 DNA提取結(jié)果

        用CTAB方法提取5種樣本的基因組DNA,經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),發(fā)現(xiàn)所得的DNA主條帶清晰,沒有出現(xiàn)明顯的拖尾顯現(xiàn)(圖1)。說(shuō)明提取的DNA保持良好的完整性,花臉香蘑菌絲體及子實(shí)體中的多糖等去除的效果良好[7],可以進(jìn)行下一步RAPD檢測(cè)。

        2.2 RAPD分析結(jié)果

        利用RAPD分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)5個(gè)樣品進(jìn)行遺傳多樣性分析,12條引物擴(kuò)增如圖2所示。從圖2中可以看出,選出8種條帶清晰的引物進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,選擇的引物代碼為P2、P3、P5、P7、P8、P10、P11、P12。

        2.3 8種引物及其擴(kuò)增的多態(tài)性條帶數(shù)

        8種引物在5種樣品中共獲得46個(gè)擴(kuò)增條帶,其中多態(tài)性條帶有39個(gè),擴(kuò)增出的多態(tài)性條帶百分率為84.78%,說(shuō)明供試的5種樣品具有豐富的遺傳多態(tài)性,對(duì)不同的生存環(huán)境表現(xiàn)出較強(qiáng)的適應(yīng)能力,符合花臉香蘑廣泛分布的特點(diǎn)。P7引物擴(kuò)增出的多態(tài)性條帶數(shù)最多(7條),而P3引物擴(kuò)增出的多態(tài)性條帶數(shù)最少(2條)。不同引物擴(kuò)增出的清晰條帶數(shù)在4~8之間,平均每個(gè)引物擴(kuò)增出的條帶數(shù)為5.75條,多態(tài)性條帶數(shù)為4.88條,多態(tài)性條帶百分率為82.90%[8],表3列出了8種引物對(duì)5種樣品擴(kuò)增的多態(tài)性條帶數(shù)。

        2.4 供試材料的親緣關(guān)系分析

        利用8種引物在5種樣品中獲得46個(gè)擴(kuò)增片段,如表3所示。在NTSYS軟件中計(jì)算樣品間的遺傳相似系數(shù)(GS值),得到供試材料遺傳相似矩陣。遺傳相似系數(shù)越大,表明親緣關(guān)系越近,遺傳相似系數(shù)越小,表明親緣關(guān)系越遠(yuǎn)[9]。由表4可知,5種樣品的GS值范圍為0.282 6~0.913 0,變幅為0.630 4。其中4號(hào)樣品和5號(hào)樣品之間的遺傳相似系數(shù)最大為0.913 0,表明這兩個(gè)樣品之間的親緣關(guān)系較近,遺傳差異性小。3號(hào)樣品和4、5號(hào)樣品之間的遺傳相似系數(shù)最小為0.282 6,表明3號(hào)樣品與4、5號(hào)樣品之間的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),遺傳差異性較大,存在較高的遺傳多樣性。

        2.5 RAPD分子標(biāo)記聚類分析

        根據(jù)遺傳相似系數(shù)矩陣,利用UPGMA法進(jìn)行聚類分析,根據(jù)遺傳相似系數(shù)對(duì)各樣品進(jìn)行分類分析,聚類圖如2所示。5種樣品分成2類,樣品1、2、3是第一類,樣品4、5是第二類。其中第一類又分為2個(gè)亞類,第一亞類為1號(hào)樣品,樣品2、3號(hào)為第2亞類[10]。

        3 結(jié)論與討論

        4號(hào)樣品和5號(hào)樣品之間的親緣關(guān)系較近,遺傳差異性小。3號(hào)樣品與4、5號(hào)樣品之間的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),遺傳差異性較大,存在較高的遺傳多樣性。 5種樣品分成2個(gè)類群,樣品1、2、3是第一類群,樣品4、5是第二類群??梢?,RAPD將花臉香蘑菌絲體和子實(shí)體分為2個(gè)類群,2號(hào)和3號(hào)菌絲體親緣關(guān)系比與1號(hào)菌絲體親緣關(guān)系近?;樝隳⑦z傳多樣性,是由于自身遺傳體系與產(chǎn)地復(fù)雜變化的自然生態(tài)環(huán)境長(zhǎng)期共同作用的結(jié)果,為花臉香蘑后期開發(fā)提供一定的參考。

        參考文獻(xiàn):

        [1] 卯曉嵐.中國(guó)大型真菌[M].鄭州:河南科技技術(shù)出版杜,2000.

        [2] 郭 勇,彭衛(wèi)紅,賈定洪.花臉香蘑的栽培技術(shù)[J].食用菌,2007(3):41-42.

        [3] 戴彩云,崔曉明.茶園自生食用菌紫丁香蘑的馴化栽培[J].貴州茶葉,1994(1):24.

        [4] ZHANG Y F,MOLINA F I. Strain typing of Lentinula edodes by random amplified polymorphic DNA assay[J].Fems Microbiology Letters,1995,131(1):17-20.

        [5] WELSH J,HONEYCUTT R J,MCCLELLAND M,et al. Parentagede termination in maize hybirds using the arbitrarily primed polymerase chain reaction(AP-PCR)[J]. Theoretical & Applied Genetics,1991,82(4):473-476.

        [6] 孫 勇,林芳燦.中國(guó)香菇自然種質(zhì)遺傳多樣性的RAPD分析[J].菌物系統(tǒng),2003,22(3):387-393.

        [7] 湯 潔.不同種絞股藍(lán)的RAPD分析及其抑菌作用的研究[D].合肥:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué),2008.

        [8] 林 媛.雙孢蘑菇品種間RAPD遺傳多樣性與親緣關(guān)系的研究[D].福州:福建農(nóng)林大學(xué),2008.

        [9] 張金霞,黃晨陽(yáng),張瑞穎等.中國(guó)栽培白靈側(cè)耳的RAPD和IGS分析[J].菌物學(xué)報(bào),2004,23(4):514-519.

        [10] 譚 琦.用RAPD技術(shù)對(duì)香菇非對(duì)稱雜交后代遺傳性狀的分析[J].食用菌學(xué)報(bào),2001,8(2):10-14.

        猜你喜歡
        聚類分析
        基于譜聚類算法的音頻聚類研究
        基于Weka的江蘇13個(gè)地級(jí)市溫度聚類分析
        我國(guó)中部地區(qū)農(nóng)村居民消費(fèi)行為階段特征分析
        基于多元統(tǒng)計(jì)方法的高校科研狀況評(píng)價(jià)分析
        基于聚類分析的無(wú)須人工干預(yù)的中文碎紙片自動(dòng)拼接
        淺析聚類分析在郫縣煙草卷煙營(yíng)銷方面的應(yīng)用
        基于聚類分析研究貴州省各地區(qū)經(jīng)濟(jì)發(fā)展綜合評(píng)價(jià)
        商情(2016年39期)2016-11-21 08:45:54
        新媒體用戶行為模式分析
        農(nóng)村居民家庭人均生活消費(fèi)支出分析
        基于省會(huì)城市經(jīng)濟(jì)發(fā)展程度的實(shí)證分析
        白色白在线观看免费2| 国产亚洲精品hd网站| 亚洲高清一区二区三区视频| 少妇被按摩出高潮了一区二区| 中文字幕日韩三级片| 国产精品亚洲成在人线| 亚洲成精品动漫久久精久| 中文字幕东京热一区二区人妻少妇| 久久精品丝袜高跟鞋| 免费观看黄网站在线播放| 久久免费观看国产精品| 国产高清大片一级黄色| 亚洲综合图色40p| 亚洲18色成人网站www| 揄拍成人国产精品视频肥熟女| 国产三级视频在线观看国产| 色婷婷一区二区三区四区成人网| 国产国语熟妇视频在线观看| 久久综合视频网站| 亚洲天堂av在线观看免费| 日本丰满少妇裸体自慰| 国产大学生粉嫩无套流白浆| 99精品视频69v精品视频免费| 国产蜜桃传媒在线观看| 台湾佬中文娱乐网22| 无遮挡亲胸捏胸免费视频| 偷拍激情视频一区二区| 国产精品一区二区av麻豆日韩| 日韩吃奶摸下aa片免费观看| 亚洲VA中文字幕欧美VA丝袜| 精品国产av一区二区三四区| 亚洲爆乳精品无码一区二区三区| 色一情一区二| 免费人成黄页网站在线观看国内| 亚洲国产精品国自产拍久久蜜av | 亚洲国产一区二区a毛片| 亚洲欧美另类精品久久久| 国产一区二区三区精品毛片| 中文无码伦av中文字幕| 尤物99国产成人精品视频| 国产精品国产三级在线专区|