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        XRCC1多態(tài)性與胰腺癌發(fā)病風險的meta分析

        2017-08-22 05:33:32蘇國明黃彬洋韓雨欣向俊蓓宋琪玲王貴年王佳妮
        臨床薈萃 2017年8期
        關鍵詞:胰腺癌基因型文獻

        蘇國明,黃彬洋,韓雨欣,向俊蓓,宋琪玲,張 齊,王貴年,王佳妮

        (1. 四川護理職業(yè)學院 藥學與檢驗系,四川 成都 610100;2. 川北醫(yī)學院附屬醫(yī)院 檢驗科,四川 南充 637000)

        ·薈萃分析·

        XRCC1多態(tài)性與胰腺癌發(fā)病風險的meta分析

        蘇國明1,黃彬洋1,韓雨欣1,向俊蓓1,宋琪玲2,張 齊1,王貴年1,王佳妮1

        (1. 四川護理職業(yè)學院 藥學與檢驗系,四川 成都 610100;2. 川北醫(yī)學院附屬醫(yī)院 檢驗科,四川 南充 637000)

        目的 本文旨在系統(tǒng)評價X線修復交叉互補基因1(X-rayrepaircross-complementatinggroup1,XRCC1)的單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphisms,SNP)與胰腺癌發(fā)病風險的相關性。方法 計算機檢索數(shù)據(jù)庫PubMed、Embase、theCochraneLibrary、WebofScience、中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫(CBM)、萬方數(shù)據(jù)庫、中國期刊全文數(shù)據(jù)庫(CNKI),按照納入與排除標準篩選文獻,對研究結果進行meta分析,評價發(fā)表偏倚并進行敏感性分析。結果 共納入8篇病例-對照研究,合并結果顯示:XRCC1上的Arg399Gln(rs25487G>A)突變和Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌發(fā)病風險之間的關聯(lián)差異無統(tǒng)計學意義;XRCC1上的Arg280His(rs25489G>A)突變與胰腺癌的發(fā)病風險密切相關(AvsG:OR=0.743,95%CI=0.576~0.958,P=0.022;GAvsGG:OR=0.701,95%CI=0.525~0.936,P=0.016;AA+GAvsGG:OR=0.710,95%CI=0.537~0.939,P=0.016);Egger檢驗顯示不存在發(fā)表偏倚(P>0.05);敏感分析逐個剔除研究后meta分析結果受單個研究的影響較小。結論本研究表明XRCC1上的Arg399Gln(rs25487G>A)突變和Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌的發(fā)病風險無明顯相關性;XRCC1上的Arg280His(rs25489G>A)突變可能與胰腺癌的發(fā)病風險有關聯(lián)。

        胰腺腫瘤;癌,基因;meta分析

        胰腺癌(pancreaticcancer)是全球常見的消化系統(tǒng)惡性腫瘤之一,發(fā)病隱匿,具有較高的病死率,在我國近10年來胰腺癌的發(fā)病率呈現(xiàn)上升趨勢。迄今為止,胰腺癌的發(fā)病機制仍然不確定,據(jù)文獻報道胰腺癌的發(fā)生可能與年齡、性別、遺傳變異、胰腺癌的家族史、肥胖、糖尿病、吸煙、飲酒等危險因素有關,其中基因因素在胰腺癌發(fā)生、發(fā)展中起重要作用。X線修復交叉互補基因1 (X-rayrepaircross-complementatinggroup1,XRCC1)是影響胰腺癌風險的最重要候選基因之一,其編碼的X線修復交叉互補蛋白1主要參與堿基切除修復以及單鏈斷裂損傷修復,而DNA損傷修復對于基因組保護和癌癥預防至關重要。迄今,在dbSNP數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)中的文獻報道在XRCC1上有若干單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphisms,SNP),近期有多篇文獻報道XRCC1上的3個SNP,即Arg399Gln(rs25487G>A)突變、Arg194Trp(rs1799782C>T)突變和Arg280His(rs25489G>A)突變與胰腺癌發(fā)病風險之間的相關性,但由于單個研究樣本量小和地區(qū)差異,導致研究結果不盡一致。本文旨在通過對已發(fā)表的病例-對照研究進行meta分析,提高檢驗效能,以綜合評價XRCC1的SNP與胰腺癌發(fā)病風險之間的關系。

        1 資料與方法

        1.1 文獻檢索 計算機檢索英文數(shù)據(jù)庫PubMed、Embase、CochraneLibrary、WebofScience及中文數(shù)據(jù)庫中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫(CBM)、萬方數(shù)據(jù)庫、中國期刊全文數(shù)據(jù)庫(CNKI),檢索時間均為建庫到2017年5月。英文檢索式:“XRCC1ORrs25487ORArg399GlnORrs1799782ORArg194TrpORrs25489ORArg280His”和“pancreaticcancerORtumourORneoplasmORcarcinoma”;中文檢索式:“X線修復交叉互補基因1 或者XRCC1 或者rs25487 或者Arg399Gln或者rs1799782 或者Arg194Trp或者rs25489 或者Arg280His”和“胰腺癌或者惡性腫瘤或者腺癌”。查閱相關研究的參考文獻,手工檢索相關學術期刊。

        1.2 納入標準 ①研究類型:病例-對照研究;②研究對象:病例組為經(jīng)臨床確診為胰腺癌的患者;對照組為健康人群;③暴露因素:XRCC1上的3個SNP,即Arg399Gln(rs25487G>A)突變、Arg194Trp(rs1799782C>T)突變或Arg280His(rs25489G>A)突變;④結局指標:胰腺癌的發(fā)病風險。

        1.3 排除標準 ①病例報告、會議摘要、評論、綜述或系統(tǒng)評價;②無法獲得基因型頻率或等位基因頻率的文獻;③重復發(fā)表的數(shù)據(jù)。

        1.4 文獻篩選 由2名作者按預先制定的表格獨自進行資料提取,如遇不一致則交由第三位作者協(xié)助裁定。資料提取內(nèi)容包括第一作者姓名、發(fā)表年限、國家、種族、基因型檢測方法、病例組和對照組的樣本量、文獻研究的基因位點及基因型頻率等。

        1.5 統(tǒng)計學方法 采用Stata13.0軟件進行meta分析。首先,對納入研究的對照組基因型進行哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinbergequilibrium,HWE)檢驗,P<0.05為不符合HWE。然后,對納入的文獻進行異質(zhì)性檢驗(Q檢驗和I2檢驗),若P>0.10或I2<50%,選擇固定效應模型合并數(shù)據(jù)進行分析;反之,則采用隨機效應模型。最后,采用比值比(oddsratio,OR)及其95%可信區(qū)間(95%CI)為效應統(tǒng)計量,分別對Arg399Gln(rs25487G>A)突變和Arg280His(rs25489G>A)突變進行等位基因頻率(AvsG)、雜合子模型(GAvsGG)、純合子模型(AAvsGG)、顯性遺傳模型(AA+GAvsGG)和隱性遺傳模型(AAvsGA+GG)的比較,對Arg194Trp(rs1799782C>T)突變進行等位基因頻率(TvsC)、雜合子模型(CTvsCC)、純合子模型(TTvsCC)、顯性遺傳模型(TT+CTvsCC)和隱性遺傳模型(TTvsCT+CC)的比較,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。Begg檢驗和Egger檢驗評價納入文獻的發(fā)表偏倚,同時通過敏感分析即逐一剔除單個研究的方法,評價余下研究的meta分析結果的穩(wěn)定性。

        2 結 果

        2.1 文獻篩選流程及結果 最初共檢索到3 082篇文獻,英文數(shù)據(jù)庫檢索文獻2 795篇,中文數(shù)據(jù)庫檢索文獻287篇。然后,閱讀標題和摘要后排除不符合納入標準文獻3 068篇,查閱全文排除不符合納入標準文獻6篇,最終8篇文獻滿足納入標準[1-8],其中報道Arg399Gln(rs25487G>A)突變有8篇文獻,包括2 093例患者和4 462例對照者;報道Arg194Trp(rs1799782C>T)突變有7篇文獻,包括1 594例患者和3 517例對照者;報道Arg280His(rs25489G>A)突變有3篇文獻,包括918例患者和1 147例對照者。

        2.2 納入文獻的基本特征 納入文獻的基本特征見表1。共納入8篇文獻[1-8],其中6英文文獻[1-2,4-5,7-8],2篇中文文獻[3,6]。HWE檢驗結果顯示,關于Arg399Gln(rs25487G>A)突變,除Wang等[1]和Duell等[8]發(fā)表的研究外,納入的其他研究對照組人群基因型分布均符合HWE定律(P>0.05);類似地,關于Arg194Trp(rs1799782C>T)突變,除Wang等[1]和Hou等[2]發(fā)表的研究外,納入的其他研究對照組人群基因型分布均符合HWE定律(P>0.05);關于Arg280His(rs25489G>A)突變,除Wang等[1]發(fā)表的研究外,納入的其他研究對照組人群基因型分布均符合HWE定律(P>0.05)。

        表1 納入文獻的基本特征

        注:PCR,聚合酶鏈反應;RFLP,限制性片段長度多態(tài)性

        2.3Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌meta分析 共有8篇文獻描述了Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌風險的關系。Meta分析結果顯示Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌發(fā)病風險之間的關聯(lián)差異無統(tǒng)計學意義(AvsG:OR=1.110,95%CI=0.951~1.297,P=0.186;GAvsGG:OR=1.080,95%CI=0.960~1.216,P=0.200;AAvsGG:OR=1.200, 95%CI=0.888~1.620,P=0.235;AA+GAvsGG:OR=1.125,95%CI=0.939~1.348,P=0.203;AAvsGA+GG:OR=1.122,95%CI=0.939~1.340,P=0.204),雜合子模型(GAvsGG)比較的森林圖見圖1 (其他基因模型比較的森林圖未提供)。同時進行分層分析,結果顯示在亞洲人中Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌發(fā)病風險之間的關聯(lián)差異無統(tǒng)計學意義(表2)。排除對照組人群基因型分布不符合HWE定律的文獻后,Meta分析發(fā)現(xiàn)Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌發(fā)病風險之間的關聯(lián)差異無統(tǒng)計學意義(表2)。

        圖1 在雜合子模型(GAvsGG)下Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌發(fā)病風險的森林圖

        表2 XRCC1上的單核苷酸多態(tài)性與胰腺癌發(fā)病風險關系的meta分析

        2.4Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌meta分析 共有7篇文獻描述了Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌風險的關系。Meta分析結果顯示Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌發(fā)病風險之間的關聯(lián)差異無統(tǒng)計學意義(TvsC:OR=1.223,95%CI=0.939~1.592,P=0.136;CTvsCC:OR=1.229,95%CI=0.881~1.713,P=0.225;TTvsCC:OR=1.140,95%CI=0.832~1.563,P=0.414;TT+CTvsCC:OR=1.247,95%CI=0.900~1.726,P=0.184;TTvsCT+CC:OR=1.130,95%CI=0.831~1.534,P=0.436),雜合子模型(CTvsCC)比較的森林圖見圖2(其他基因模型比較的森林圖未提供)。同時進行分層分析,在亞洲人中Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌發(fā)病風險之間的關聯(lián)差異無統(tǒng)計學意義(表2)。排除對照組人群基因型分布不符合HWE定律的文獻后,Meta分析發(fā)現(xiàn)Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌發(fā)病風險之間的關聯(lián)差異無統(tǒng)計學意義(表2)。

        圖2 在雜合子模型(CTvsCC)下Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌發(fā)病風險的森林圖

        2.5Arg280His(rs25489G>A)突變與胰腺癌meta分析 共有3篇文獻描述了Arg280His(rs25489G>A)突變與胰腺癌風險的關系。Meta分析結果顯示Arg280His(rs25489G>A)突變與胰腺癌發(fā)病風險之間的關聯(lián)差異無統(tǒng)計學意義(表2)。排除對照組人群基因型分布不符合HWE定律的文獻后,Meta分析發(fā)現(xiàn)Arg280His(rs25489G>A)突變與胰腺癌的發(fā)病風險密切相關(AvsG:OR=0.743,95%CI=0.576~0.958,P=0.022;GAvsGG:OR=0.701,95%CI=0.525~0.936,P=0.016;AA+GAvsGG:OR=0.710,95%CI=0.537~0.939,P=0.016)。

        2.6 發(fā)表偏倚 通過Begg漏斗圖及Egger檢驗來評估納入文獻的發(fā)表偏倚情況。關于Arg399Gln(rs25487G>A)突變,Egger檢驗結果顯示各基因模型比較均無統(tǒng)計學意義(表3),各基因模型比較的Begg漏斗圖是基本對稱的,各基因模型比較的Begg漏斗圖見圖3,表明不存在發(fā)表偏倚。

        2.7 敏感性分析 在Arg399Gln(rs25487G>A)突變研究中,逐個剔除研究后關聯(lián)受單個研究的影響較小,雜合子模型(GAvsGG)比較的敏感性分析圖見圖4 (其他基因模型比較的敏感性分析圖未提供),提示本次meta分析結果是較穩(wěn)定的。

        表3 發(fā)表偏倚分析結果

        圖3 在各基因模型下Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌風險的Begg漏斗圖 (A:GAvsGG;B:AAvsGG;C:AA+GAvsGG;D:AAvsGA+GG)

        圖4 在雜合子模型(GAvsGG)下Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌風險的敏感性分析

        3 討 論

        XRCC1位于人染色體19q13.2,屬于DNA損傷修復基因的一種,編碼區(qū)SNP位點導致相應的氨基酸改變,致使其DNA修復能力下降,增加對誘變劑敏感性,增大癌癥的發(fā)病風險,然而,在遺傳流行病學研究方面有關胰腺癌的發(fā)病風險還沒有得到一個公認的結論。2002年,Duell等[8]首次提出XRCC1上的SNP與胰腺癌的可能存在遺傳易感性關聯(lián),目前已有多篇公開研究表明,XRCC1上的SNP與胰腺癌的發(fā)病風險可能具有相關性,但由于種族或樣本量的差異導致研究結論尚不統(tǒng)一,因此,本文采用meta分析的方法納入最新文獻做一系統(tǒng)評價,在等位基因頻率、雜合子模型、純合子模型、顯性遺傳模型、隱性遺傳模型等5種模型比較下,我們發(fā)現(xiàn)XRCC1上的Arg399Gln(rs25487G>A)突變和Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌發(fā)病風險無明顯相關性,然而,XRCC1上的Arg280His(rs25489G>A)突變可能與胰腺癌發(fā)病風險有關聯(lián)。

        關于XRCC1上的Arg399Gln(rs25487G>A)突變,本研究納入8篇病例-對照研究,合并結果顯示在5種遺傳基因模型下Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌發(fā)病風險均無明顯相關性。異質(zhì)性檢驗結果顯示各研究之間異質(zhì)性偏大,為了減小不同研究間異質(zhì)性因素對結果的影響,本研究基于亞洲人和HWE做分層分析,根據(jù)分層分析結果顯示在亞洲人中Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌發(fā)病風險之間也無明顯相關性,然而,Jiang等[9]發(fā)表的一篇meta分析表明在亞洲人中Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌發(fā)病風險之間有顯著關聯(lián),此結論與本研究結果矛盾,與這篇meta分析對比,我們發(fā)現(xiàn)本研究納入了新近發(fā)表的研究,提高了檢驗效能,結果更加可靠。排除對照組人群基因型分布不符合HWE定律的文獻后,Meta分析發(fā)現(xiàn)Arg399Gln(rs25487G>A)突變與胰腺癌的發(fā)病風險無明顯相關性,表明結果較穩(wěn)定;針對Arg399Gln(rs25487G>A)突變,本研究分析未見任何發(fā)表偏倚存在,敏感性分析也提示meta分析結果相對穩(wěn)定。

        關于XRCC1上的Arg194Trp(rs1799782C>T)突變,本研究納入7篇病例-對照研究,合并結果顯示在5種遺傳基因模型下Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌發(fā)病風險均無明顯相關性。He等[10]曾用5項研究來評估Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌的關聯(lián),結果TTvsCC:OR=1.11,95%CI=0.76~1.63,P=0.583;CTvsCC:OR=1.39,95%CI=0.92~2.10,P=0.118;TT+CTvsCC:OR=1.39,95%CI=0.92~2.10,P=0.121;TTvsCT+CC:OR=1.07,95%CI=0.73~1.55,P=0.743;TvsC:OR=1.31,95%CI=0.93~1.86,P=0.125。本文結論與其一致。基于亞洲人做分層分析,結果表明Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌發(fā)病風險無明顯相關性?;诜螲WE定律做分層分析,結果顯示Arg194Trp(rs1799782C>T)突變與胰腺癌的發(fā)病風險之間也無明顯相關性,表明上述結論較可靠。

        關于XRCC1上的Arg280His(rs25489G>A)突變,本研究僅納入3篇病例-對照研究,合并結果顯示在5種遺傳基因模型下Arg280His(rs25489G>A)突變與胰腺癌發(fā)病風險均無明顯相關性。Wang等[1]發(fā)表的研究中對照組人群基因型分布不符合HWE定律,排除這篇文獻后,Meta分析結果表明Arg280His(rs25489G>A)突變與胰腺癌的發(fā)病風險有顯著關聯(lián),由于納入的文獻數(shù)量較少,本論斷尚需來自其他種族和更多高質(zhì)量的研究進一步去驗證。

        本研究存在以下局限性:第一,文獻檢索語言為中文和英文,結果納入2篇中文文獻和6英文文獻,除此之外沒有其他語言文獻納入,這或許存在語言偏倚風險;第二,本研究僅對Arg399Gln(rs25487G>A)突變檢驗發(fā)表偏倚,由于納入文獻較少,本研究未對其他兩個SNP檢驗發(fā)表偏倚;第三,盡管本研究做了分層分析,但仍具有較大的異質(zhì)性,故應納入更多的高質(zhì)量文獻,基于多種因素做meta回歸分析,以明確各研究間異質(zhì)性的來源,以期得到更為可靠的結論。

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        AssociationbetweenXRCC1polymorphismsandpancreaticcancerrisk:ameta-analysis

        SuGuoming1,HuangBinyang1,HanYuxin1,XiangJunbei1,SongQiling2,ZhangQi1,WangGuinian1,WangJiani1

        1.DepartmentofPharmacyandLaboratory,SichuanNursingVocationalCollege,Chengdu610100,China; 2.MedicalLaboratory,theAffiliatedHospitalofNorthSichuanMedicalCollege,Nanchong637000,China

        SuGuoming,Email:guomingsu77@163.com

        ObjectiveTosystematicallyevaluatetheassociationbetweenXRCC1singlenucleotidepolymorphismsandpancreaticcancerrisk.MethodsAnelectronicsearchofPubMed,Embase,theCochraneLibrary,WebofScience,CBM,WanfangDataandCNKIdatabasewereconducted.Studieswereidentifiedwiththecriteriaforinclusionandexclusionformeta-analysis.Publicationbiaswasexaminedandsensitivityanalysiswasalsoperformed.ResultsAtotalofeightcase-controlstudieswereincludedinthemeta-analysis.ThecombinedresultsshowedthattherewasnosignificantassociationbetweenXRCC1Arg399Gln(rs25487G>A)mutantandArg194Trp(rs1799782C>T)mutantandpancreaticcancerrisk.TherewassignificantassociationbetweenXRCC1Arg280His(rs25489G>A)mutantandpancreaticcancerrisk(AvsG:OR=0.743,95%CI=0.576-0.958,P=0.022;GAvsGG:OR=0.701,95%CI=0.525-0.936,P=0.016;AA+GAvsGG:OR=0.710,95%CI=0.537-0.939,P=0.016).Eggerlinearregressiontestrevealedthattherewasnopublicationbias(P>0.05).Sensitivityanalysisshowedthattheresultswererobusttotheremovalofeachindividualtrialfromthemeta-analysis.ConclusionThisstudyshowedthatXRCC1Arg399Gln(rs25487G>A)mutantandArg194Trp(rs1799782C>T)mutanthadnosignificantcorrelationwiththeriskofpancreaticcancer.XRCC1Arg280His(rs25489G>A)mutantmightbeassociatedwiththeriskofpancreaticcancer.

        pancreaticneoplasms;oncogenes;meta-analysis

        蘇國明,Email:guomingsu77@163.com

        R

        A

        1004-583X(2017)08-0707-06

        10.3969/j.issn.1004-583X.2017.08.015

        2017-04-10 編輯:武峪峰

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