許淑君,于海龍
(宿遷市公安局物證鑒定所,江蘇宿遷 223800)
·研究簡報·
宿遷地區(qū)漢族人群25個Y-STR遺傳標記的遺傳多態(tài)性
許淑君,于海龍
(宿遷市公安局物證鑒定所,江蘇宿遷 223800)
法醫(yī)遺傳學;多態(tài)現(xiàn)象,遺傳;短串聯(lián)重復(fù)序列;Y染色體;漢族
Y染色體是人類染色體中最小的一條,目前已經(jīng)精確定位到Y(jié)染色體上的STR遺傳標記有400多個[1],而在法醫(yī)學領(lǐng)域被廣泛研究的只有20多個[2,3]。YSTR遺傳標記被廣泛應(yīng)用于人類進化、群體遺傳結(jié)構(gòu)分析、親子鑒定、性犯罪等領(lǐng)域。
Y-STR遺傳標記呈現(xiàn)嚴格的父系遺傳特征,在混合斑男性成分分析、男性個體來源推斷、父系親權(quán)關(guān)系鑒定、性犯罪和重大刑事案件排查等方面發(fā)揮重要作用[4-6]。本研究采用Yfiler?Plus PCR擴增試劑盒對宿遷地區(qū)639名漢族無關(guān)男性個體進行25個YSTR遺傳標記的遺傳多態(tài)性調(diào)查,在群體水平評估其法醫(yī)學鑒定的可行性,為法醫(yī)學鑒定應(yīng)用提供科學的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
639名宿遷地區(qū)漢族無關(guān)男性個體FTA卡血樣,全部來自日常案件。采用Yfiler?Plus PCR擴增試劑盒(美國AB公司)在9700型PCR擴增儀(美國AB公司)上對25個Y-STR基因座進行復(fù)合擴增。PCR擴增體系為10 μL,擴增產(chǎn)物用3130xl型遺傳分析儀(美國AB公司)進行毛細管電泳,運用GeneMapper? ID-X軟件分析實驗數(shù)據(jù),得到Y(jié)-STR基因分型后,用直接計數(shù)法計算各等位基因頻率。按照公式[n(1-∑Pi2)]/(n-1)計算基因多態(tài)性(gene diversity,GD)和單倍型多樣性(haplotype diversity,HD),其中Pi為等位基因(或單倍型)頻率,n為樣本數(shù)。
宿遷地區(qū)漢族人群639名無關(guān)男性個體25個Y-STR基因座都得到了有效擴增,等位基因分布頻率見表1,基因多樣性(GD)見表2。結(jié)果顯示,DYS385a/b基因座在639例樣本中檢測到40種不同的基因分型,DYF387S1基因座檢測到38種不同的基因分型。其中DYS385a/b的GD值最高,為0.964,DYF387S1為0.949,DYS391和DYS438的GD值低于0.5,其他23個基因座在宿遷地區(qū)漢族人群中具有較高的基因多樣性。本研究使用Arlequin v3.1軟件計算639名無關(guān)男性個體樣本的單倍型頻率為0.001 565,單倍型多樣性可以達到0.99999989,且在所有樣本中沒有發(fā)現(xiàn)共享的單倍型。
表1 宿遷地區(qū)漢族人群25個Y-STR基因座等位基因頻率分布(n=639)
續(xù)表1
表2 25個Y-STR遺傳標記在宿遷地區(qū)漢族人群中的基因多樣性(n=639)
本研究使用的試劑盒為美國AB公司推出的Yfiler?Plus PCR擴增試劑盒,該試劑盒增加的YSTR遺傳標記在宿遷地區(qū)漢族人群中具有較高的多態(tài)性和單倍型解析度,完全能夠滿足法醫(yī)學檢案中涉及Y染色體基因檢測的各種需求,可用于法醫(yī)學實際應(yīng)用。
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DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2017.03.020
1004-5619(2017)03-0307-03
2015-04-01)
(本文編輯:李成濤)
許淑君(1975—),女,副主任法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)DNA研究;E-mail:Xuliyu66@163.com