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        關(guān)于CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)的研究進(jìn)展及應(yīng)用前景

        2017-07-12 13:59:03劉慧簡(jiǎn)潔雯
        科學(xué)中國(guó)人 2017年20期
        關(guān)鍵詞:間隔基因組位點(diǎn)

        劉慧,簡(jiǎn)潔雯

        信陽職業(yè)技術(shù)學(xué)院檢驗(yàn)學(xué)院

        關(guān)于CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)的研究進(jìn)展及應(yīng)用前景

        劉慧,簡(jiǎn)潔雯

        信陽職業(yè)技術(shù)學(xué)院檢驗(yàn)學(xué)院

        1 、研究目的

        所謂的基因編輯技術(shù)指的就是研究人員為了使得特定的某種目的能夠被達(dá)成,而去修飾動(dòng)物的遺傳組成的過程,這以技術(shù)綜合性以及挑戰(zhàn)性相對(duì)較強(qiáng),其對(duì)于整個(gè)基因遺傳學(xué)的發(fā)展有著極為重要的意義?;蚓庉嫾夹g(shù)的應(yīng)用能夠使得相關(guān)人員精確的對(duì)DNA進(jìn)行添加、刪除、置換操作,進(jìn)而使得基因能夠依照人們意愿所呈現(xiàn)。CRISPR/Cas9系統(tǒng)是通過對(duì)一種RNA的調(diào)控來達(dá)到DNA修飾的目的的基因編輯工具,其本質(zhì)為叫鋅指核酸酶和轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶,和其他基因編輯工具相比,此種基因編輯工具打靶在標(biāo)準(zhǔn)型以及高效性上所具有的優(yōu)勢(shì)性更加明顯,并且其在設(shè)計(jì)上更加容易操作,所具有的特異性也更加突出。

        2 、研究現(xiàn)狀

        CRISPR/Cas9的興起時(shí)間是1987年,研究人員以日本科研人員為主,其在大腸桿菌的基因組中發(fā)現(xiàn)了以相互間隔狀態(tài)所存在的短文序列,這些短文序列的存在可以在一定程度上給予細(xì)菌和古細(xì)菌免疫性,基于這一點(diǎn)當(dāng)時(shí)就有研究人員提出CRISPR/Cas9可能會(huì)在DNA修復(fù)系統(tǒng)中起到作用。CRISPR/Cas9主要存在于原核生物中,絕大多數(shù)的古細(xì)菌以及細(xì)菌都會(huì)具備此種蛋白免疫系統(tǒng),這為CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)的進(jìn)一步研究創(chuàng)造了條件,在最開始的時(shí)候CRISPR/Cas9系統(tǒng)并不能夠直接應(yīng)用到人或動(dòng)物上,只有通過一定的改造手段對(duì)其進(jìn)行改造才能夠使其成為把核酸酶作為核心的基因編輯技術(shù)并加以應(yīng)用。在2002年,相關(guān)研究人員以原核生物為對(duì)象進(jìn)行了生物信息學(xué)的分析,分析結(jié)果表明短文序列主要存在的品種為原核生物,這和上文的研究結(jié)果是能夠達(dá)成一致的,此外研究人員也指出重復(fù)序列在不同原核生物的長(zhǎng)度是有一定差別的,一般長(zhǎng)度為21bp到37bp之間,并且其在存在過程中也會(huì)被某些非重復(fù)序列所隔開,在這個(gè)時(shí)期研究人員才把該基因家族定義為CRISPR(Jansen etal.2002)。此外在此研究中也對(duì)CRISPR的位點(diǎn)進(jìn)行了分析,分析表明CRISPR位點(diǎn)側(cè)翼區(qū)是一個(gè)先導(dǎo)序列,先導(dǎo)序列的長(zhǎng)度為300到500bp之間。前導(dǎo)序列和重復(fù)序列之間存在一定的聯(lián)系,一般情況下同一個(gè)物種中兩者之間的保守程度相對(duì)較大,不同物種中所呈現(xiàn)的變異性則相對(duì)較為突出。同時(shí)每個(gè)物種中存在不同CRISPR位點(diǎn)的可能性也是非常大的。(Jansen et al.2002)。

        在2005年,著名學(xué)者Pourcel C為了對(duì)CRISPR/Cas9間隔序列進(jìn)行進(jìn)一步的研究與探討,以三種鼠疫桿菌為對(duì)象對(duì)CIRPSR位點(diǎn)進(jìn)行了測(cè)序處理,測(cè)序完成后其發(fā)現(xiàn)了29個(gè)新的間隔序列,這些間隔序列存在一定的差異性。此外其還對(duì)9株鼠疫桿菌株進(jìn)行了實(shí)驗(yàn),在9株鼠疫桿菌株中,發(fā)現(xiàn)的間隔序列達(dá)到了132個(gè),所發(fā)現(xiàn)的這些間隔序列在擺脫那個(gè)菌株中以相同狀態(tài)所存在的數(shù)量只有三個(gè),其他的序列都以不同狀態(tài)所存在(Pourcel et al.2005)。研究學(xué)者M(jìn)ojica等在2005年通過實(shí)驗(yàn)也發(fā)現(xiàn)了CRISPR間隔序列和外源質(zhì)粒的同源性是非常高的,當(dāng)噬菌體或者外源質(zhì)粒受到細(xì)菌的再次感染時(shí),間隔序列的細(xì)菌可以起到組織噬菌體以及外源致粒再次入侵的作用。(Mojica et al.2005)。著名學(xué)者Bolotin為了對(duì)間隔序列進(jìn)行進(jìn)一步的了解而進(jìn)行了噬菌體敏感性實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明間隔序列的主要來源為外部的噬菌體以及基因組,進(jìn)而可以得出原核生物的CRISPR位點(diǎn)本質(zhì)上其實(shí)就是外援病毒以及噬菌體在對(duì)細(xì)菌入侵過程中所留下的痕跡,其和細(xì)菌的免疫機(jī)制有著一定的聯(lián)系。Bolotin et al.2005;Barrangou et al.2007)。

        Cas蛋白是CRISPR/Cas系統(tǒng)的重要組合部分之一,其在整個(gè)CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)作用發(fā)揮過程扮演著極為重要的角色。在2005年,Haft等研究學(xué)者就通過對(duì)生物信息學(xué)的應(yīng)用發(fā)現(xiàn)了45種Cas蛋白,其中和DNA修復(fù)有著密切關(guān)系的的Cas蛋白種類為Csm3-5,Cmrl,Cmr3,Cmr4,Cmr6和Csx7蛋白(Haft et al.2005)。在所有的Cas蛋白中,存在于古細(xì)菌以及絕大部分細(xì)菌中的是Casl-6,其他種類的Cas蛋白則具備一定的種屬特異性(Ternsand Terns 2011)。Cas1和Cas2蛋白在細(xì)菌免疫處于干擾階段時(shí)并不會(huì)發(fā)揮出作用,但是在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)這兩種蛋白都具有一定的核算內(nèi)切酶的火星,因此其在間隔序列中起到的作用也是非常重要的。

        3 、CRISPR/Cas9技術(shù)的在動(dòng)物基因組編輯研究中的應(yīng)用

        基因編輯動(dòng)物的獲得是科學(xué)領(lǐng)域研究基因技術(shù)的一個(gè)突破,由于CRISPR/Cas9系統(tǒng)所具有的高效、簡(jiǎn)單等優(yōu)勢(shì),在其得到研究開發(fā)后被廣泛應(yīng)用到生物遺傳改造中。在2013年,Cong等通過對(duì)源于釀弄鏈球菌CRISPR/Cas9系統(tǒng)的構(gòu)建實(shí)現(xiàn)了對(duì)人體293FT細(xì)胞EMX1、PVALB位點(diǎn)的切割(Cong et al.2013)。

        同年,Mali等則以內(nèi)源性的AAVSI基因?yàn)閷?duì)象,通過CRISPR/ Cas9技術(shù)的應(yīng)用使得293T細(xì)胞、K562細(xì)胞以及IPS細(xì)胞得到一定程度的敲除(Mali et al.2013b)。

        T細(xì)胞在人體血液循環(huán)過程以及免疫過程中扮演著極為重要的角色,其是未來醫(yī)藥技術(shù)開發(fā)過程中重點(diǎn)開發(fā)的靶點(diǎn)細(xì)胞之一,T細(xì)胞基因組的研究與開發(fā)會(huì)在一定能夠程度上為癌癥、艾滋病等免疫性疾病的研究提供更多的可能性。在2013年,Ebina等研究人員通過靶向HIV-1 LTR的CRISPR/Cas9系統(tǒng)的利用使得HIV-1的LTR得到啟動(dòng)并表達(dá),并誘發(fā)了T細(xì)胞的產(chǎn)生。

        [1]李響,董波.CRISPR/Cas9技術(shù)及其在海洋生物中的應(yīng)用現(xiàn)狀與展望[J].水生生物學(xué)報(bào),2017,41(1):244-256.

        [2]任文琳,張俊,徐桂霞,等.CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因組編輯技術(shù)及其在RNA編輯中的潛在應(yīng)用[J].生物技術(shù)進(jìn)展,2017(1):1-6.

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