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        結(jié)直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變情況及其臨床意義

        2017-06-19 19:27:15陳伊韋常宏寧淑芳韋文娥劉海洲利基林張力圖
        山東醫(yī)藥 2017年16期
        關(guān)鍵詞:突變率密碼子基因突變

        陳伊,韋常宏,寧淑芳,韋文娥,劉海洲,利基林,張力圖

        (廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院,南寧 530021)

        結(jié)直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變情況及其臨床意義

        陳伊,韋常宏,寧淑芳,韋文娥,劉海洲,利基林,張力圖

        (廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院,南寧 530021)

        目的 探討結(jié)直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變情況及其臨床意義。方法 選擇行手術(shù)治療的結(jié)直腸癌患者262例,采用ARMS-PCR法檢測其結(jié)直腸癌組織KRAS基因外顯子2第12、13位密碼子及BRAF V600E基因突變情況,分析其與患者臨床病理參數(shù)、肝轉(zhuǎn)移及預(yù)后的關(guān)系。結(jié)果 262例結(jié)腸癌患者中女性患者98例。262例份結(jié)腸癌組織中,KRAS基因突變49例(18.7%),其中第12位密碼子突變37例(包括1例KRAS復(fù)合突變),第13位密碼子突變12例;184例份結(jié)腸癌組織中,BRAF V600E基因突變6例。結(jié)直腸癌組織KRAS基因突變與患者性別(女性)、原發(fā)腫瘤直徑、遠處轉(zhuǎn)移情況均有關(guān),BRAF基因突變與民族、家族史、原發(fā)腫瘤分化程度均有關(guān)(P均<0.05)。同時性肝轉(zhuǎn)移患者KRAS基因突變率高于異時性肝轉(zhuǎn)移患者,KRAS基因G13D突變率低于異時性肝轉(zhuǎn)移患者(P均<0.05)。KRAS基因突變的結(jié)直腸癌患者生存時間短于未突變者(P<0.05)。KRAS基因突變是結(jié)直腸癌患者預(yù)后的獨立危險因素(P<0.01)。BRAF基因突變與未突變者生存時間比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。結(jié)論 結(jié)直腸癌組織KRAS基因突變率高,BRAF基因突變率低;KRAS基因突變多發(fā)生于女性,與結(jié)直腸癌的發(fā)生、發(fā)展有關(guān)。

        結(jié)直腸癌;KRAS基因;BRAF基因;基因突變;預(yù)后

        KRAS基因是EGFR信號通路上的一個重要作用靶點,抗EGFR單克隆抗體(西妥昔單抗、帕尼單抗)治療結(jié)直腸癌的療效與KRAS基因突變狀態(tài)密切相關(guān),只有KRAS野生型患者才可從抗 EGFR單克隆抗體單藥治療或聯(lián)合化療中獲益[1]。BRAF V600E基因是KRAS基因下游的作用位點,其突變狀態(tài)可能會影響抗EGFR單克隆抗體的治療效果。2009年1月~2012年12月,本研究觀察了結(jié)直腸癌組織KRAS與BRAF基因的突變情況,現(xiàn)分析結(jié)果并探討其臨床意義。

        1 資料與方法

        1.1 臨床資料 選擇同期于廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院行手術(shù)治療的結(jié)直腸癌患者262例,男164例、女98例,年齡24~87歲、中位年齡55歲;民族:漢族182例、壯族70例、其他10例;家族史:結(jié)直腸腺癌家族史4例、大腸腺瘤家族史2例、潰瘍性結(jié)腸炎家族史2例、家族性腺瘤性息肉病1例;組織學(xué)類型:腺癌229例、黏液腺癌+印戒細胞癌33例;腫瘤部位:左半結(jié)腸81例、右半結(jié)腸70例、直腸111例;原發(fā)腫瘤分化程度:低分化93例、中分化161例、高分化8例;原發(fā)腫瘤直徑:≤5 cm 146例、>5 cm 116例;T分期:T1、T2期20例、T3、T4期242例;N分期:N0期95例、N1期98例、N2期69例;遠處轉(zhuǎn)移情況:無轉(zhuǎn)移70例、肝轉(zhuǎn)移135例、其他部位轉(zhuǎn)移57例;肝轉(zhuǎn)移情況:同時性肝轉(zhuǎn)移105例、異時性肝轉(zhuǎn)移30例;臨床分期:Ⅰ、Ⅱ期35例、Ⅲ、Ⅳ期227例。均經(jīng)病理組織學(xué)檢查確診為結(jié)直腸癌,術(shù)前均未接受抗EGFR靶向治療。本研究經(jīng)醫(yī)院倫理委員會審核,患者及其家屬均簽署知情同意書。

        1.2 癌組織KRAS、BRAF基因突變檢測 采用ARMS-PCR法。收集262例患者術(shù)中切除的新鮮腫瘤組織,立即放入液氮中冷凍, -80 ℃冰箱保存。將組織進行甲醛固定、石蠟包埋,4 μm厚切片,脫蠟、水化,共10張切片。取1張切片進行HE染色,顯微鏡下選擇腫瘤細胞富集區(qū)域,確保其腫瘤細胞比例≥80%。取其余9張切片,參照DNeasy Blood &Tissue Kit和QIAamp DNA FFPE Tissue Kit試劑盒(德國Qiagen公司)說明書提取樣本DNA,采用ARMS-PCR法檢測KRAS基因外顯子2第12、13位密碼子突變情況。其中184例份結(jié)直腸癌組織僅行BRAF V600E突變檢測。參照人類KRAS基因7種突變檢測試劑盒和人類BRAF基因V600E突變檢測試劑盒說明書,KRAS基因外顯子2上游引物:5′-AGGCCTGCTGAAAATGACTG-3′,下游引物:5′-GGTGCAGGACCATTCTTTGA-3′,目的片段:173 bp;BRAF基因第15號外顯子上游引物:5′-GCTFGCTCTGATAGGAAAATGAG-3′,下游引物:5′-GTAACTCAGCAGCATCTCAGG-3′,目的片段:237 bp。反應(yīng)循環(huán)參數(shù):95 ℃、5 min;95 ℃、25 s,64 ℃、20 s,72 ℃、20 s,循環(huán)15次;93 ℃、25 s,60 ℃、35 s,72 ℃、20 s,循環(huán)31次。每次試驗均按要求設(shè)定陰性、陽性對照孔及空白對照孔。使用Roche480Ⅱ?qū)崟r熒光定量PCR儀進行檢測,PCR產(chǎn)物經(jīng)3%瓊脂糖凝膠電泳確定后,根據(jù)突變檢測試劑盒說明書提供的判讀原則,將樣品ΔCt值(突變Ct值-外控Ct值)與信號閾值比較,樣品檢測結(jié)果分為陽性和陰性。

        1.3 相關(guān)性分析 分析KRAS、BRAF基因突變與患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系;隨訪至2015年12月,以死亡為終點事件,繪制生存曲線,分析KRAS、BRAF基因突變與患者生存時間及預(yù)后的關(guān)系。

        1.4 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS19.0統(tǒng)計軟件。KRAS、BRAF基因突變率與臨床病理參數(shù)的關(guān)系采用χ2檢驗或Fisher確切概率法。采用Kaplan-Meier法繪制生存曲線,Log-Rank檢驗法分析KRAS、BRAF基因突變對患者生存時間的影響,COX比例風(fēng)險回歸模型進行預(yù)后影響因素分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 KRAS、BRAF基因突變情況 262例份結(jié)腸癌組織中,KRAS基因突變49例(18.7%);第12位密碼子突變37例(14.1%),包括1例KRAS復(fù)合突變(G12V和G12R同時突變),第13位密碼子突變12例(4.6%),未檢出第12、13位密碼子同時突變;其余均未發(fā)生突變。184例份結(jié)腸癌組織中,BRAF V600E基因突變6例(3.3%)。見表1。同時性與異時性肝轉(zhuǎn)移患者KRAS基因突變率分別為27.6%(29/105)、6.7%(2/30),二者比較P<0.05; KRAS基因G13D突變率分別為4.8%(5/105)、30%(9/30),二者比較P<0.05;同時性與異時性肝轉(zhuǎn)移患者KRAS基因其他類型突變率比較P均>0.05。

        2.2 結(jié)直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變與患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系 見表2。

        2.3 結(jié)直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變與患者預(yù)后的關(guān)系 患者術(shù)后隨訪2.37~77.31個月,失訪8例,隨訪率為96.9%。 共30例患者死亡, 中位

        表1 結(jié)直腸癌組織中KRAS、BRAF基因突變情況

        注:檢出1例KRAS復(fù)合突變,為G12V和G12R同時突變。

        表2 結(jié)直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變與患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系

        生存時間為22.43個月。生存曲線分析結(jié)果顯示,KRAS基因突變的結(jié)直腸癌患者生存時間為(27.43±3.2)個月,未突變者為(46.22±4.25)個月,二者比較P<0.05;BRAF基因突變的結(jié)直腸癌患者生存時間為(31.23±3.61)個月,未突變者為(35.93±2.19)個月,二者比較P>0.05。COX比例風(fēng)險回歸模型多因素分析結(jié)果顯示,KRAS基因突變是結(jié)直腸癌患者預(yù)后不良的獨立危險因素(β=2.044,RR=7.725,95%CI:2.722~21.927,P<0.01)。

        3 討論

        結(jié)直腸癌的發(fā)生、轉(zhuǎn)移是一個受多基因、多因素影響的過程,EGFR與肝轉(zhuǎn)移密切相關(guān)[2]。KRAS、BRAF基因是該信號通路下游的重要位點,其中BRAF基因又是KRAS基因下游的重要位點,與惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)。KRAS基因野生型患者能從抗EGFR靶向治療中獲益,但仍有部分患者對抗EGFR藥物治療無反應(yīng);BRAF基因與抗EGFR治療效果的關(guān)系目前無統(tǒng)一定論,尚不能單獨作為預(yù)測因子。本研究結(jié)直腸癌組織KRAS基因突變率為18.7%,BRAF基因突變率為3.3%,與目前國內(nèi)外研究報道接近[3~5]。一項來自多地區(qū)、納入6 346例患者的研究表明, G12R突變?yōu)槲覈币娡蛔冾愋蚚6]。本研究檢出1例G12R突變,該患者同時伴有G12V突變;并未檢出KRAS基因第12、13位密碼子同時突變,表明各密碼子突變是相互獨立的。V600E為BRAF基因的常見突變位點,本研究顯示該位點突變率較低,僅為3.3%。

        高靜等[4]研究認為,KRAS突變更易發(fā)生在女性且分化程度較好的右半結(jié)腸癌患者中,并與年齡有關(guān)。也有研究認為,KRAS基因突變與結(jié)直腸癌患者的年齡、性別、分化程度、腫瘤位置等臨床病理參數(shù)均無關(guān)[7,8]。本研究結(jié)果顯示,結(jié)直腸癌組織KRAS基因突變與患者的性別、原發(fā)腫瘤直徑、遠處轉(zhuǎn)移情況均有關(guān)。Chen等[9]大樣本Meta分析結(jié)果顯示,女性、老年患者以及右半結(jié)腸癌患者BRAF基因突變率較高;但也有研究顯示BRAF突變與臨床病理參數(shù)之間無顯著性關(guān)系[10]。本研究中結(jié)直腸癌組織BRAF基因突變與患者的民族、家族史、原發(fā)腫瘤分化程度均有關(guān)。

        KRAS、BRAF基因突變對結(jié)直腸癌患者肝轉(zhuǎn)移及預(yù)后的影響報道不一[10,11]。Bazan等[12]認為,KRAS基因第13位密碼子突變與高度侵襲性結(jié)直腸癌相關(guān),預(yù)示其可能是腫瘤擴散和導(dǎo)致患者死亡的獨立危險因素。Yaeger等[13]研究表明,BRAF基因突變與轉(zhuǎn)移性結(jié)腸癌預(yù)后差有關(guān),伴有該基因突變的患者更容易發(fā)生肝、腹膜轉(zhuǎn)移,且轉(zhuǎn)移瘤術(shù)后生存期更短。Modest等[14]研究結(jié)果表明,KRAS基因第13位密碼子突變與結(jié)直腸癌發(fā)生同時性肝轉(zhuǎn)移及局部轉(zhuǎn)移相關(guān)。梁立等[15]指出,結(jié)直腸癌同時性肝轉(zhuǎn)移與RAS-RAF-ERK、P13K-PTEN-AKT通路同時激活有關(guān),異時性肝轉(zhuǎn)移與P13K-PTEN-AKT單獨激活、RAS-RAF-ERK不激活有關(guān)。本研究結(jié)果顯示,同時性肝轉(zhuǎn)移患者KRAS基因突變率高于異時性肝轉(zhuǎn)移患者,KRAS基因G13D突變率低于異時性肝轉(zhuǎn)移患者。G13D突變有一定的療效評估作用,G13D突變的結(jié)直腸癌患者能從一線西妥昔單抗治療中獲益,而且其獲益程度與KRAS野生型相仿,提示KRAS基因G13D突變的特殊性。由于已經(jīng)得出BRAF基因突變與患者遠處轉(zhuǎn)移情況無關(guān)的結(jié)果,故本研究未對同時性與異時性肝轉(zhuǎn)移患者的BRAF基因突變率進行對比分析。文獻報道,KRAS第13位密碼子突變的患者較未突變者生存期更短[5, 16]。但本研究結(jié)果顯示,KRAS基因突變的結(jié)直腸癌患者生存時間明顯短于未突變者,KRAS基因突變是結(jié)直腸癌患者預(yù)后的獨立危險因素,提示KRAS基因突變患者預(yù)后較差;但本研究并未發(fā)現(xiàn)KRAS基因G13D突變、BRAF基因突變與預(yù)后的關(guān)系,可能與樣本量小、隨訪時間短有關(guān)。

        綜上所述,結(jié)直腸癌組織KRAS基因突變率高,BRAF突變率低;KRAS基因突變多發(fā)生于女性,與結(jié)直腸癌的發(fā)生、發(fā)展有關(guān)。未來將進一步明確KRAS基因在結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移中的作用,及其突變相關(guān)生物標(biāo)志物的表達變化,以期為結(jié)直腸癌的快速診斷、病情判斷及預(yù)后評估提供理論依據(jù)。

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        廣西科學(xué)研究與技術(shù)開發(fā)計劃基金資助項目(桂科攻1298003-2-8);南寧市青秀區(qū)科學(xué)研究與技術(shù)開發(fā)計劃基金資助項目(2015S03)。

        張力圖(E-mail: zhanglitu@gmail.com)

        10.3969/j.issn.1002-266X.2017.16.026

        R735.3

        B

        1002-266X(2017)16-0077-04

        2016-10-13)

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