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        淺談犬庫(kù)布病毒及檢測(cè)方法

        2017-06-05 14:58:00陽(yáng)愛國(guó)
        獸醫(yī)導(dǎo)刊 2017年2期
        關(guān)鍵詞:胃腸炎淺談病毒

        侯 巍 陽(yáng)愛國(guó) 郭 莉 莫 西

        (四川省動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,四川成都 610041)

        淺談犬庫(kù)布病毒及檢測(cè)方法

        侯 巍 陽(yáng)愛國(guó) 郭 莉 莫 西

        (四川省動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,四川成都 610041)

        犬庫(kù)布病毒(Canine Kobuviruses,CaKoV)屬于小RN A病毒科(Picornaviridae)A型愛知病毒(Aichivirus A)屬。研究表明犬庫(kù)布病毒(Canine Kobuviruses)與犬病毒性腹瀉存在一定相關(guān),2011年該病毒第一次在美國(guó)從患急性胃腸炎的犬中檢測(cè)出[1],而后中國(guó)[2]、非洲[3]、意大利[4]、英國(guó)[5]等國(guó)家相繼被發(fā)現(xiàn)。

        庫(kù)布病毒;檢測(cè)

        1 犬庫(kù)布病毒的簡(jiǎn)史

        1.1 犬庫(kù)布病毒的發(fā)現(xiàn)及其分類

        庫(kù)布病毒屬于小RNA病毒科中新增加的屬。2011年,從美國(guó)患有急性胃腸炎的犬中檢測(cè)出第一株犬庫(kù)布病毒。根據(jù)基因序列分析,其距離AiV基因A和B型,因此研究人員對(duì)這些病毒命名為犬科庫(kù)布病毒(CaKoV)[1]。研究證明[2]- [7],庫(kù)布病毒通過被污染的食物或水糞-口途徑感染,并且它們?cè)谌撕蛣?dòng)物[8][9]的胃腸炎中具有潛在的致病作用[10]。

        根據(jù)基因序列分析顯示,CaKoV在遺傳上接近小鼠庫(kù)布病毒M-5(在氨基酸水平同源性84.0%)[4]與 AiV(在氨基酸水平同源性達(dá)80.0%)[11]。根據(jù)國(guó)際病毒分類學(xué)委員會(huì)(ICTV)制定的標(biāo)準(zhǔn)(小RNA病毒科內(nèi),如果在P1、P2和P3區(qū)域氨基酸具有40%、40%和50%同源性,就可以歸為一屬),因此CaKoV可以被認(rèn)為是來自鼠科布病毒(MuKoV 1型)和人類AiV(AiV1型)的不同基因型(CaKoV 1型),同屬愛知A型[12]。

        1.2 犬庫(kù)布病毒的流行

        犬庫(kù)布病毒的國(guó)內(nèi)外流行情況見表1

        表1 犬庫(kù)布病毒流行情況表

        2 犬庫(kù)布病毒基因結(jié)構(gòu)

        犬庫(kù)布病毒是一種極小的球形病毒,直徑約為 30nm,二十面體、無囊膜的單股正鏈 RNA 病毒。與所有的微RNA 病毒一樣,CaKoV成員具有相似的基因組結(jié)構(gòu):包括 5- UTR、一個(gè)大的開放閱讀框(open reading frame,ORF)、3-UTR以及Poly(A)tail。ORF編碼的蛋白依次為L(zhǎng)(非結(jié)構(gòu)蛋白)、VP0、VP3和VP1(結(jié)構(gòu)蛋白)、2A-2B-2C(非結(jié)構(gòu)蛋白)和3A-3B-3C-3D(非結(jié)構(gòu)蛋白)。

        根據(jù)Genbank載錄的全基因序列分析中國(guó)株CH-1,韓國(guó)株12D049,英國(guó)株UK003, 美國(guó)株US-PC0082。中國(guó)CH-1株長(zhǎng)度為8216bp,韓國(guó)12D049株長(zhǎng)度為8292bp,英國(guó)UK003株的長(zhǎng)度為8213bp。

        3 病毒的鑒定

        3.1 病毒的培養(yǎng)

        病毒分離培養(yǎng)是鑒定病原行之有效的方法,AiV可以在Vero或BS-C-1細(xì)胞上增殖并能觀察到明顯的細(xì)胞病變[13]。

        3.2 病毒的檢測(cè)

        3.2.1 免疫學(xué)檢測(cè)方法

        2016年日本學(xué)者通過酶聯(lián)免疫吸附的方法在犬的糞便中成功檢測(cè)到AiV[14]。此外,報(bào)道稱,有研究學(xué)者在198只狗血清樣品和97只貓血清樣品中檢測(cè)到愛知病毒IgG抗體的,分別為74只(37.4%)的67只(69.9%),檢測(cè)到的抗體最高滴度為1:2000。

        3.2.2 分子生物技術(shù)

        由于PCR 方法具有敏感、快速、特異及可重復(fù)性的優(yōu)點(diǎn),因此對(duì)于CaKoV的檢測(cè)大都采用了RT-PCR 的方法。由于CaKoV的致病性及其機(jī)制尚不清楚,臨床診斷也無法進(jìn)行,基因檢測(cè)可能是在未來很長(zhǎng)時(shí)間內(nèi)的主要檢測(cè)方法見表2。

        表2 檢測(cè)犬庫(kù)布病毒方法

        [1] Kapoor A,Simmonds P,Dubovi E J,et al. Characterization of a canine homolog of human Aichivirus[J].Journal of Virology,2011,85 (21):11520-11525.

        [2] Li C,Wei S,Guo D,et al. Prevalence and phylogenetic analysis of canine kobuviruses in diarrhoetic dogs in northeast China[J].Journal of Veterinary Medical Science,2015,78(1):70-74.

        [3] Olarte-Castillo X A,Heeger F,Mazzoni C J,et al.Molecular characterization of canine kobuvirus in wild carnivores and the domestic dog in Africa[J].Virology,2015,477(3):89-97.

        [4] Di M B,Di F E,Ceci C,et al. Canine kobuviruses in diarrhoeic dogs in Italy[J].Veterinary Microbiology,2013,166(1):246-249.

        [5] Carmonavicente N,Buesa J,Brown P A,et al. Phylogeny and prevalence of kobuviruses in dogs and cats in the UK[J].VeterinaryMicrobiology,2013,164(3-4):246-252.

        [6] Soma T,Matsubayashi M,Sasai K. Detection of kobuvirus RNA in Japanese domestic dogs[J]. Journal of Veterinary Medical Science,2016,78(11):117.

        [7] Choi S,Lim S I,Yong K K,et al. Phylogenetic Analysis of Astrovirus and Kobuvirus in Korean Dogs[J].Journal of Veterinary Medical Science,2014,76(3):1141-1145.

        [8] Khamrin P,Maneekarn N,Okitsu S,et al. Epidemiology of human and animal kobuviruses[J].VirusDisease,2014,25(2):195-200.

        [9] Felix D J,Sigrid B,Souza L L K D,et al. Aichi virus shedding in high concentrations in patients with acute diarrhea[J].Emerging Infectious Diseases,2011,17(8):1544-1548.

        [10] Ambert-Balay K,Lorrot M,Bon F,et al. Prevalence and genetic diversity of Aichi virus strains in stool samples from community and hospitalized patients[J].Journal of Clinical Microbiology,2008,46 (4):1252-1258.

        [11] Phan TG,Kapusinszky B,Wang C,et al. The fecal viral flora of wild rodents[J].PLoS Pathog,2011,(7):218.

        [12] Knowles N J,Hovi T,Hyypi? T,et al. Virus Taxonomy,Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses:Picornaviridae[J]. 2012,(5):855-881.

        [13] Y amashita T,Kobayashi S,Sakae K,et al. Isolation of cytopathic small round viruses with BS-C-1 cells from patients with gastroenteritis[J].The Journal of Infectious Diseases,1991,164 (5):954-957.

        [14] Wang C,Lan D,Cui L,et al. Molecular characterization of a porcine kobuvirus strain in China.[J].Archives of Virology,2012,157(3):573-578.

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