者湘漪 ,朱君玲 ,姜心雨 ,何鴻昌 ,潘貞貞 ,4,蔣琦偉 ,王媛 ,李洪濤 ,鄭威楠 ,潘澤民 *
(1新疆地方與民族高發(fā)病教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)教研室,新疆 石河子 832002;2喀什地區(qū)第一人民醫(yī)院病理科,新疆 喀什 844000;3石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)系,新疆 石河子 832002;4新疆兵團(tuán)第四師醫(yī)院檢驗(yàn)科,新疆 伊犁 835000)
宮頸癌在婦女最常見(jiàn)的惡性腫瘤中位居第三位,僅次于乳腺癌和結(jié)直腸癌。2012年全球?qū)m頸癌新確診 527,624例,死亡 265,653例[1]。我國(guó)宮頸癌患病率高,尤其在新疆維吾爾族婦女中,宮頸癌的發(fā)病率高達(dá)527/100000[2]。宮頸癌的發(fā)生涉及諸多因素,其中持續(xù)性感染高危型人乳頭瘤病毒HPV16,已被公認(rèn)為是引起宮頸癌,以及發(fā)展成為侵潤(rùn)性宮頸癌最主要的因素[3]。
宮頸癌的發(fā)展和進(jìn)展涉及多種因素,大多數(shù)HPV16感染會(huì)在感染后一到兩年內(nèi)自動(dòng)被免疫系統(tǒng)清除,只有一小部分HPV病毒感染發(fā)展成為宮頸癌[4-6]。HPV16作為宮頸癌最常見(jiàn)的高危型人乳頭瘤病毒,促使發(fā)展成為宮頸癌的因素還不清楚。
基于HPV16E6基因區(qū)域單核苷酸多態(tài)性(SNPs)系統(tǒng)發(fā)育模式,可將HPV16定義為6個(gè)亞型:歐洲型(E),亞洲型(As),非洲 1 型(Af1),非洲 2 型(Af2),亞洲美洲型(AA)和北美型(NA)[7]。HPV16 譜系有地理區(qū)域集中分布現(xiàn)象,以及民族性差別。不同的HPV16亞型具有不同的致癌潛能,可能與某些重要序列位點(diǎn)突變有關(guān)[8-11]。然而,新疆維吾爾族宮頸癌HPV16亞型還鮮為人知。
人乳頭瘤病毒HPV16 E6,E7基因編碼的癌蛋白在HPV16介導(dǎo)的宮頸癌過(guò)程中持續(xù)表達(dá),并且涉及多個(gè)信號(hào)通路[12]。已有研究表明,HPV16 E6,E7基因是研究HPV16疫苗很有前景的靶基因[13-14]。E6,E7基因多個(gè)位點(diǎn)突變影響HPV16病毒的抗原性,免疫原性以及易感性[5-6]。多項(xiàng)研究表明,非歐洲型的(non-European)病毒感染相比于歐洲型HPV16感染,更容易進(jìn)展為高度鱗狀上皮病變(HSIL)[15]。
本研究通過(guò)分析維吾爾族婦女宮頸癌HPV16病毒 E6,E7基因核苷酸序列,研究本地區(qū)HPV16亞型突變情況和分布特點(diǎn),探討HPV16E6,E7基因突變與新疆地區(qū)維吾爾族婦女宮頸癌高發(fā)的關(guān)系。
采集喀什人民醫(yī)院和烏魯木齊自治區(qū)人民醫(yī)院2011-2014年維吾爾族婦女宮頸鱗癌手術(shù)或活檢樣本(經(jīng)病理檢測(cè)確定為宮頸鱗癌),用HPV16 E6引物篩選出43例感染HPV16病毒的宮頸鱗癌樣本。其中,20例為新疆南部維吾爾族婦女,23例為新疆北部維吾爾族婦女,患者均無(wú)外地長(zhǎng)期居住史。樣本于-80℃凍存。
DNA提取采用SK1252基因組DNA提取試劑盒(上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司),步驟按照試劑盒說(shuō)明書(shū)操作。設(shè)計(jì)HPV16 E6引物,用PCR方法對(duì)樣本進(jìn)行HPV16病毒檢測(cè)。鑒定HPV16 E6引物序列 HPV16E6-F:5’-GACCCAGAAAGTTACCACAG-3’,HPV16 E6-R:5′-CACAACGGTTTGTTGTATTG-3′(F:正向引物;R:反向引物)。
HPV16 E6,E7基因片段通過(guò)PCR技術(shù)進(jìn)行擴(kuò)增,PCR體系50 μL包含上下游引物各20 pmoles,50 mmol/L KCl,2.5 mmol/L MgCl2,100 mmol/L Tris-HCl,pH 8.3,0.1%TritonX-100,50 μmmol/L dNTP,1.8 U HotStar Taq polymerase和5 μL DNA模版。PCR反應(yīng)條件均為:94℃ 5 min;30個(gè)循環(huán) 55℃ 45 s,72℃60 s,94 ℃ 15 s,55 ℃ 45 s;72 ℃ 5 min。測(cè)序引物見(jiàn)表1。
表1 引物信息Tab.1 Information of primers
PCR產(chǎn)物用SAP (Promega)和Exo I(Epicentre)進(jìn)行純化后,通過(guò)ABI Big-DyeTerminator v3.1 Cycle Sequencing Kit DNA分析儀(ABI3130XL,上海天昊生物醫(yī)藥科技有限公司)進(jìn)行測(cè)序,用Polyphred軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性(SNP)分析,以及和HPV16歐洲標(biāo)準(zhǔn)株 (GenBank:NC_001526.2)以及其它典型的HPV16變異株進(jìn)行比較 (GenBank:AF472508;HQ644238),AA (GenBank:AF402678) 和AA1(GenBank:HQ644247)。進(jìn)化樹(shù)通過(guò)軟件MEGA 6構(gòu)建(圖 1)。
圖1 HPV16 E6進(jìn)化學(xué)分析Fig.1 Phylogenetic tree analysis of HPV16 E6 gene
本研究 HPV16 E6,E7基因測(cè)序序列在網(wǎng)站NCBIGenBank的登錄號(hào)分別為E6:KT959524-KT959566,E7:KT966608-KT966650。
43例患者全長(zhǎng)的HPV16 E6,E7基因完成測(cè)序后序列與歐洲標(biāo)準(zhǔn)株相比較,基因變異位點(diǎn)(表2)。
表2 HPV16 E6,E7基因變異位點(diǎn)Tab.2 Nucleotide sequence variations in HPV16 of E6,E7
在E6,E7的測(cè)序結(jié)果中,共發(fā)現(xiàn)6個(gè)突變位點(diǎn),4個(gè)為錯(cuò)義突變位點(diǎn),2個(gè)為無(wú)義突變位點(diǎn),分布在 E6基因的錯(cuò)義突變位點(diǎn)分別為T178G,T295G,T350G,A647G 位于E7基因,引起氨基酸改變分別為天冬氨酸→谷氨酸(D25E),天冬氨酸→谷氨酸(D64E),亮氨酸→纈氨酸(L83V),天冬酰胺→絲氨酸(N29S)。兩個(gè)無(wú)義突變均在E6基因,分別為nt 131,A →C,nt 96,G→A。HPV16 E6 最常見(jiàn)的突變位點(diǎn)是 T350G(34/43,79.1%)和 T295G(6/43,14.0%)。其中,T295G為一個(gè)新的突變位點(diǎn),從未見(jiàn)報(bào)道。值得注意的是,6例T295G樣本均存在T350G突變。與E6相比較,E7基因更保守,僅在一例樣本的測(cè)序中發(fā)現(xiàn)A131C,T178G和A647G。
E6進(jìn)化學(xué)分析表明(圖1),43例樣本當(dāng)中,只有XJ-5屬于亞洲株,其余屬于歐洲株,其中,有6例獨(dú)立成一個(gè)分支,這與E6 T295G突變有關(guān)。E7進(jìn)化學(xué)分析結(jié)果與E6的結(jié)果一致,只有XJ-5屬于亞洲株,其余均為歐洲株(圖2)。
圖2 HPV16 E7進(jìn)化學(xué)分析Fig.2 Phylogenetic tree analysis of HPV16 E7 gene
流行病學(xué)資料表明,相同的HPV類型的不同突變型具有生物學(xué)差異,可能會(huì)導(dǎo)致不同的致病風(fēng)險(xiǎn)[4]。因此,了解地區(qū)的HPV16變體的序列特征具有重要意義。多個(gè)研究報(bào)道,HPV16亞型在中國(guó)漢族女性中的分布高度相似,大多數(shù)為HPV16亞洲和歐洲型亞型[9,16-18]。但是,在維吾爾族婦女中HPV16亞型的分布還不清楚。我們的研究表明,新疆HPV16亞型最為普遍是歐洲株。相比之下,亞洲株普遍存在中國(guó)的其他地區(qū),我們的結(jié)果沒(méi)有觀察到美洲-亞洲,中美洲,非洲亞型,維吾爾族婦女中亞洲株較少,這可能是因?yàn)榫S吾爾人的種族特征有關(guān)。結(jié)果提示,新疆維吾爾族婦女浸潤(rùn)性宮頸癌的感染和發(fā)展可能和歐洲株有關(guān)。43例樣本包括HPV16歐洲原始株350T 8 例(8/43,18.6%),HPV16歐洲變異株 350G(L83V)34例(34/43,79.1%),亞洲變異株 1例(1/43,2.3%)。研究表明,HPV16 E6 L83V變種在摩洛哥婦女高度宮頸損傷中普遍存在,并且與宮頸癌的進(jìn)展密切相關(guān)[19];該變體比HPV16歐洲原始株E6350T在宮頸疾病持續(xù)感染HPV16的婦女中以及宮頸癌的惡性進(jìn)展中更為普遍[20-21]。此外,我們?cè)贖PV16歐洲株當(dāng)中發(fā)現(xiàn)了6例新的核苷酸變異HPV16 E6T295G,以及350G共突變。我們的研究結(jié)果提示,T350G-T295G可能可以作為是HPV16歐洲變異株新疆變種對(duì)中國(guó)新疆HPV16變異型進(jìn)行劃分。
研究表明,E7與E6相比更保守[22-23]。我們發(fā)現(xiàn)只有一例A647G(N29S)突變,這是一個(gè)熱點(diǎn)突變點(diǎn),在亞洲女性中很常見(jiàn)。研究顯示,韓國(guó)婦女宮頸癌中常見(jiàn)E7 N29S,并且增加了患宮頸癌的風(fēng)險(xiǎn)[17,24]。
我們的研究結(jié)果顯示,在新疆維吾爾族婦女宮頸癌中HPV16歐洲變異株是最常見(jiàn)的類型,明顯不同來(lái)自中國(guó)其他地方。未來(lái)的研究在擴(kuò)大樣本量的基礎(chǔ)上結(jié)合細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)來(lái)研究HPV16變體在宮頸癌發(fā)生發(fā)展中的作用。
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