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        構建我國藥學類學科資源庫聯(lián)盟的策略

        2017-03-21 06:04:08
        中華醫(yī)學圖書情報雜志 2017年4期
        關鍵詞:學科資源

        學科資源庫“Subject repository”又名學科知識庫“Disciplinary repository”,是基于學科的開放存取倉儲,對某一學科的各類資源進行收集、保存,并通過互聯(lián)網(wǎng)實現(xiàn)開放存取的知識庫[1]。

        學科資源庫收錄的資源類型包括已發(fā)表的白色文獻,如期刊論文、學位論文、會議文獻、圖書、視聽資料和專利等,也包括科研活動中產(chǎn)生的研究資料、實驗數(shù)據(jù)、技術報告、圖表、筆記等灰色文獻。近年來美國大學圖書館也很重視學科數(shù)據(jù)存儲和檢索服務,例如哈佛大學建立的數(shù)據(jù)存儲網(wǎng)絡(Dataverse Network)、普林斯頓大學圖書館開展的數(shù)據(jù)及統(tǒng)計服務(Data and Statistical Services,DSS)等。與美國相比,我們還存在較大差距。因此,我們應當構建學科資源庫聯(lián)盟,依托聯(lián)盟成員的合作,增強我國學科成果的共享。

        學科資源庫聯(lián)盟是由同學科多個機構成員構成,專業(yè)性強且內容豐富。藥學學科資源庫聯(lián)盟的構建,有利于解決單個藥學學科資源庫的資金緊缺和人才不足問題,有利于藥學特色資源的整合與利用,有利于自產(chǎn)藥學資源的保存與共享。目前我國藥學學科資源庫聯(lián)盟還不成熟,有很大的發(fā)展空間。本文將從協(xié)作模式、平臺建設、資源的采集與組織、存取政策、版權問題、質量控制、資金來源等幾個方面去闡述。

        1協(xié)作模式

        構建聯(lián)盟需要各成員機構相互協(xié)作,主要有以下幾種協(xié)作模式。

        1.1 集中存儲模式

        集中存儲模式即統(tǒng)一構建、運行及維護學科資源庫聯(lián)盟系統(tǒng),其他成員機構的學術資源和對應的元數(shù)據(jù)上傳到這個系統(tǒng)中,不需要承擔構建及維護系統(tǒng)的任務[2]。該模式的優(yōu)點是社會總成本低,避免大量不必要的重復建設,適合大型學術機構帶領周邊中小型學術機構共同建設;缺點是無法很好地體現(xiàn)成員機構自身的科研特色,而是凸顯大科研機構的品牌,不能很好地體現(xiàn)成員機構的學術品牌,導致成員機構成就感較低,影響成員機構參與的主動性與積極性。

        1.2 分布采集模式

        該模式指成員機構根據(jù)共同數(shù)據(jù)交互標準和協(xié)議,分別構建和維護各自獨立的藥學學科資源庫,元數(shù)據(jù)再被整合到集中的搜索數(shù)據(jù)庫中,聯(lián)盟構建統(tǒng)一的檢索平臺,該平臺內可搜索所有成員機構的學科資源[3]。該模式的優(yōu)點是成員機構擁有較高的自主權,能保持各自機構的主體性,展現(xiàn)本身研究特色與實力,適合聯(lián)盟內各成員機構均是技術、資金實力相當且雄厚的地區(qū);缺點是成員機構參與成本高。

        1.3 層級構建模式

        受IFLA 2010年報告《通過國際圖聯(lián)的能力建設圖書館協(xié)會計劃》啟發(fā)[4],層級構建模式是一種自上而下且分工明確的聯(lián)盟模式。機構成員可推舉一個學術能力最強、科研成果最多、在藥學領域最具權威性的學術機構為“管理級”,負責學科資源庫聯(lián)盟建設工作的整體安排,向領導部門爭取政策支持、向資助機構爭取資金援助,并且負責制定學科資源庫聯(lián)盟的發(fā)展規(guī)劃、存取政策以及各成員機構的具體分工;再由機構成員中最具有技術實力的2-3個學術機構組成“支撐級”,負責聯(lián)盟平臺的技術開發(fā)與維護、數(shù)據(jù)管理與質量控制;其他中小型學術機構為“資源級”,負責聯(lián)盟平臺學術資源的建設。這種“管理級+支撐級+資源級”的組織模式,優(yōu)點是分工明確,執(zhí)行力強,這也是借鑒CALIS機構知識庫平臺(China Academic Institutional Repository,CHAIR)的組織模式[5]。該模式較適合當前我國藥學學科資源庫聯(lián)盟構建。

        2 平臺建設

        藥學學科資源庫聯(lián)盟建設選擇的協(xié)作模式不同,其平臺架構也就不同。根據(jù)前文闡述的集中存儲模式、分布采集模式和層級構建模式,在平臺架構和功能模塊設計上,也應分為3種情況。

        2.1 集中存儲式平臺

        該平臺只有一個統(tǒng)一的學科資源庫系統(tǒng),成員機構的學術資源都上傳到該學科資源庫系統(tǒng)中。本平臺基于J2EE的系統(tǒng)架構,該架構包含的各類組件、服務架構及技術層次均有共通的標準及規(guī)格,使各平臺系統(tǒng)之間存在良好的兼容性。該系統(tǒng)由學科知識獲取體系、學科知識組織體系、學科知識利用體系三部分組成。

        學科知識獲取體系主要采集各類型藥學學科資源。學科知識組織體系是對學科信息資源進行整合、管理、格式轉換和建立索引,實現(xiàn)學科信息倉儲與數(shù)據(jù)共享,是學科資源匯聚、流通、應用和維護的平臺[6]。此外,應用功能組件化,可實現(xiàn)與其他資源服務平臺的“嵌入式”應用集成。學科知識利用體系是與用戶互動交流的窗口,用戶可以通過客戶端直接訪問平臺中心獲取或共享資源,利用統(tǒng)一檢索平臺為用戶提供形式多樣如學科知識檢索、學科知識導航、學科知識地圖、學科知識推送、學科知識群組、個人知識空間等符合學科需求的服務體驗,實現(xiàn)泛在學科服務。該平臺具體構建如圖1。

        2.2 分布采集式平臺

        分布采集式學科資源庫聯(lián)盟建設首先要遵循共同的交互標準與協(xié)議[7],獲取藥學學科資源,包括教學資源、科研資源、學術成果和數(shù)據(jù)庫資源等。

        根據(jù)存儲協(xié)議將獲取的學科資源存儲在各機構建立的學科資源庫中,再由成員機構聯(lián)合建設藥學學科資源庫聯(lián)盟統(tǒng)一檢索平臺。該平臺是對各機構學科資源庫中存儲的學科知識進行描述,與機構學科資源庫中的學科資源存在映射關系。

        用戶通過身份驗證后,發(fā)出檢索請求,系統(tǒng)對檢索請求通過語義分析,提取檢索關鍵詞,將檢索關鍵詞在統(tǒng)一檢索平臺中與相應概念匹配;然后根據(jù)檢索平臺和機構學科庫的映射關系,找到學科庫中具體的知識文檔[8]。該平臺具體構建如圖2。

        圖1 集中存儲式藥學學科資源庫聯(lián)盟平臺

        圖2 分布采集式藥學學科資源庫聯(lián)盟平臺

        2.3 層級構建式平臺

        根據(jù)“管理級+支撐級+資源級”的層級原則,利用開源軟件DSpace采用“模型-視圖控制器”(Model View Controller,MVC)的設計原則,搭建一個層級結構的聯(lián)盟平臺,每層之間通過一個公共的API接口實現(xiàn)層與層的順序調用[9]。

        “管理級”對應平臺的組織管理層主要負責政策支持、資金運營、發(fā)展規(guī)劃、協(xié)作規(guī)范、存儲標準、存取政策以及機構成員分工等統(tǒng)籌性事務。“支撐級”對應平臺的功能實現(xiàn)層利用系統(tǒng)所支持的OAI、DOI、OpenURL等協(xié)議,從分布的藥學學科數(shù)據(jù)源提取所需元數(shù)據(jù),并按統(tǒng)一標準對自存儲與采集的元數(shù)據(jù)進行抽取、加工、處理,實現(xiàn)對異構系統(tǒng)間元數(shù)據(jù)的收割、鏈接、聚合、發(fā)現(xiàn)等功能;然后利用學科資源庫統(tǒng)一檢索平臺,按照用戶的個性化需求進行知識匯總與分類,應用知識表征、知識地圖、語義網(wǎng)絡等技術向用戶展示挖掘出的學科知識和可提供的藥學學科服務?!百Y源級”對應平臺的用戶應用層主要是采集數(shù)據(jù)開發(fā)商、圖書館信息資源、OA資源、教學科研人員和其他任何能提供知識的組織所提供的學科資源,用戶也可利用學科資源庫統(tǒng)一檢索平臺獲取資源與服務。該平臺具體構建如圖3。

        圖3 層級構建式藥學學科資源庫聯(lián)盟平臺

        3 學科資源采集與組織

        3.1 學科資源采集

        學科資源采集主要有自存儲、強制存儲和代理存儲3種。其中,自存儲是科研人員將學科學術成果上傳至學科資源庫聯(lián)盟平臺,由系統(tǒng)管理員審核;強制存儲是根據(jù)資源庫聯(lián)盟存取政策,確保學科資源的存儲、整合和共享;代理存儲是學科館員將網(wǎng)絡上或成員機構中有關藥學學科的學術資源采集入學科資源庫聯(lián)盟平臺,因此需要學科館員和學科專家根據(jù)藥學學科研究領域的特征采集本學科搜索關鍵詞,關鍵詞可以是特殊用詞,也可以是幾個限定詞的結合,要盡可能全面涵蓋所需的主要概念,并用精確無歧義的詞語加以描述和確立不同概念間的關系。系統(tǒng)管理員對學科專家提交的關鍵詞進行篩選,保留具有查詢價值的關鍵詞,提交給數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)。數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)定期根據(jù)關鍵詞或關鍵詞組合在網(wǎng)絡或成員機構數(shù)據(jù)庫中查找藥學學科資源,并對數(shù)據(jù)進行去重和加權處理,將新采集到的學科資源交給資源組織系統(tǒng)進行整合。

        值得注意的是,在藥學研究中,除了大型科研項目外,還有更多經(jīng)費較低、規(guī)模較小而參與人員眾多的小科研項目。這些小科研項目數(shù)據(jù)被視為“長尾科研數(shù)據(jù)”[10]。增強“長尾科研數(shù)據(jù)”管理具有頗多益處:項目科研人員的變動不影響科研工作的連續(xù)性,可以避免不必要的重復工作,驗證研究結果,可以開展更多的合作和科學研究;增強研究的顯示度和影響力等。因此采集資源時也要把這些易被忽視的小項目科研數(shù)據(jù)收入聯(lián)盟平臺,增設科研數(shù)據(jù)管理服務,如伊利諾伊大學香檳分校2010年就開始了RDS(Research Data Service)服務 。 只有讓科研工作者切實感受到學科資源庫聯(lián)盟平臺的便利和學術價值,才能促進學科資源庫聯(lián)盟的不斷發(fā)展[11]。

        3.2 學科資源組織

        學科資源組織系統(tǒng)主要是對采集系統(tǒng)采集的學科數(shù)據(jù)進行描述、標引、分類和整序。目前資源組織主要有分類法和主題法兩種。

        分類法用于構建知識結構,針對藥學學科資源庫可繼續(xù)按學科細化分類,藥學類學科可分為藥學、中藥學、生物醫(yī)藥學、藥學經(jīng)濟學類等;藥學類又可細分為藥物化學、藥物代謝動力學、藥劑學、藥物分析學、藥理學、生理學、病理學、臨床藥學、制藥工程學等,中藥學類可分為中西藥結合學、天然藥物化學、生藥學、藥用植物學、中醫(yī)藥學、中藥分析學、中藥藥理學、中藥制劑學、中藥生物技術學、中藥復方學等,生物醫(yī)藥類可分為生物化學、微生物學、生物制藥學、微生物制藥學、海洋藥學等,藥學經(jīng)濟學可分為藥事管理學、藥品營銷學等。

        主題法用于詞匯控制,來自資源內容。資源組織工具主要包括中圖法與學科關系表、中圖分類主題詞表、漢語主題詞表、醫(yī)學主題詞表等,以確定檢索詞的上下文關系,也是作為分詞處理、學科標引等操作時的基準詞庫,以便完成全文索引、自動分類等工作[12]。

        4 學科資源存取政策

        藥學學科資源庫聯(lián)盟平臺建設的目的就是為了藥學學科資源更有序、合理地存儲與取用,“存”與“取”則都應當有相應的政策來規(guī)范。

        4.1 學科資源“存儲”政策

        “存儲”政策主要分為強制性政策和建議性政策2種。

        強制性政策適用于受到基金資助的科研項目。為保證科研數(shù)據(jù)和研究成果的真實性和完整性,應有強制性存儲要求。通常獲得基金資助的科研項目,其學科價值和研究團隊都具有一定保障,存儲這些科研項目的科研數(shù)據(jù)和研究成果不但能豐富學科資源庫聯(lián)盟平臺的資源數(shù)量,也可以確保存儲資源的質量。支持藥學研究的科研基金很多,包括國家自然科學基金、何梁何利基金、重大新藥創(chuàng)制科技基金等。學科資源庫聯(lián)盟應與各藥學學科資助基金取得合作,將強制存儲科研數(shù)據(jù)和研究成果列為獲取基金資助的條件之一,同時學科資源庫也應明確科研數(shù)據(jù)和學科成果的資金來源,加強對資助基金的宣傳。如RCUK及其7個理事會,均在《RUCK數(shù)據(jù)政策通用原則》的基礎上制定了各自的數(shù)據(jù)管理政策[13],NIH在2003 年3月制定了《數(shù)據(jù)共享政策和實施指導》[14],2010年NSF發(fā)布了數(shù)據(jù)管理政策[15]。它們普遍要求受到資助的科研項目,其科研數(shù)據(jù)必須得到長期保存??蒲袛?shù)據(jù)是在科研項目生命周期過程中產(chǎn)生的數(shù)據(jù),很多科研數(shù)據(jù)都是唯一的。例如藥物圖譜光譜和波普的解析數(shù)據(jù)、靶標通路圖、高效液相色譜檢驗藥物雜質數(shù)據(jù)等,損壞后很難恢復。制定強制性科研數(shù)據(jù)存儲政策,有利于增大保護研究成果的力度,加強對研究成果的監(jiān)督,以及科研數(shù)據(jù)共享。聯(lián)盟還可以與一些藥學類獎項合作,例如中國藥學會科學技術獎、施維雅青年藥學化學獎、賽諾菲青年生物藥物獎等。強制要求凡是獲獎的學術成果必須在學科資源庫聯(lián)盟平臺內共享,聯(lián)盟平臺則可以設置專欄介紹宣傳這些獎項,達到雙贏的效果。

        建議性政策適用于學科課件、圖譜、實驗、會議、報告等科研人員個人或社群的學科成果,鼓勵用戶主動提交。由于開放級別可自我設定,即便作為一個存儲空間使用,防止數(shù)據(jù)丟失,用戶也樂意使用。高校和科研機構可以通過改革科研成果考核制度中對數(shù)據(jù)貢獻者的獎勵方式,激勵科研人員和學術社群重視科研數(shù)據(jù)保存與管理。

        4.2 學科資源“取用”政策

        “取用”政策體現(xiàn)著學科資源的共享程度,可從內容和范圍兩個角度去規(guī)范。

        從內容角度,對學科資源庫中存儲的各類學科資源進行學術價值評估,并與版權相關單位和個人達成一致,兼顧數(shù)據(jù)源的版權要求,將學科資源取用分為“禁止再利用”“不允許自動獲取”“允許非商業(yè)用途”“允許商業(yè)用途”4個等級[16]。對于灰色文獻或涉及個人隱私的學科資源,聯(lián)盟平臺必須尋求數(shù)據(jù)所有者的同意或者遵守相關規(guī)定,限制數(shù)據(jù)訪問,在特定范圍內進行分享。

        從范圍角度,主用通過用戶的地理范圍來限制資源使用權限。例如希臘國家文獻中心(NDC)、弗吉尼亞理工大學(VT)和西弗吉尼亞大學(WVU)采用區(qū)域性學術資源訪問限制。有的文檔可以全球下載,例如公開出版后的藥學學術文章、藥學類MOOC課程、《中藥與美容》等常識科普性的藥學視頻、藥用植物資源介紹、FDA藥品評估、新藥評審介紹等;有的只能在規(guī)定的范圍內下載,如未發(fā)表的藥學學科論文或原料藥的重結晶原理、藥物結構、藥物制備、藥物篩選等專業(yè)性知識,必須在校園IP范圍內,或者通過學生、教師的固定有效ID,通過代理服務器才可以查看或檢索全文。還有一些較為機密的藥學科研數(shù)據(jù),如烷化劑的抗腫瘤研究、生物藥物分離純化技術與親和層析技術、藥物研究中質譜的離子源研究、黃酮類化合物分離研究、孤兒藥界定與市場準入政策研究等,它的訪問權限可能只覆蓋研究生院,或者必須在某些固定的實驗室內。對于擬申報的專利、擬申請的課題、擬發(fā)表的學科論文,例如代謝性疾病藥物研發(fā)、腫瘤分子病理學研究、分子影像與納米醫(yī)藥研究等這種保密等級最高的,可能只有固定的計算機才有訪問權限[17]。

        5 版權問題和質量控制

        5.1 版權問題

        學科資源庫聯(lián)盟平臺存儲了數(shù)量龐大的學科學術資源,這意味著版權會成為一個重要且不可回避的問題。為了防止版權糾紛的發(fā)生,對每項收錄的學術成果都要公開提供資源來源與附加背景。根據(jù)《知識產(chǎn)權法》和中國圖書館學會發(fā)布的《數(shù)字圖書館資源建設和服務中的知識產(chǎn)權保護政策指南》等相關法律法規(guī),對學術成果的使用范圍和使用方法做出了規(guī)定。對已公開發(fā)表的學術成果,可根據(jù)出版社、雜志出版商、資助基金取得聯(lián)系,確認版權歸屬和具體存取政策;對于未公開的學術成果,可由具體單位統(tǒng)一提交,提交單位可以是藥學院、中藥學院、基礎醫(yī)學與臨床藥學學院等院系,也可以是藥物分析測試中心、藥物科學研究院、天然藥物活性組分與藥效實驗室等科研機構,但提交之前各科研單位應聯(lián)系科研成果具體產(chǎn)出的個人或社群,根據(jù)成果產(chǎn)出人具體的要求來確定學術資源的使用范圍。此外,要廣開言路,接受群眾監(jiān)督,只要發(fā)現(xiàn)版權歸屬異議,產(chǎn)生版權問題糾紛都可以向聯(lián)盟平臺管理員反映;管理員要盡快與出版商或個人溝通解決,不能達成一致或構成侵權,必須刪除該學術資源。

        5.2 質量控制

        聯(lián)盟平臺不僅是學術資源的存儲庫,也是學術研究的重要文獻參考,因此聯(lián)盟平臺共享的學科資源的學術價值要得到一定保障。作為藥學的“旗艦型”資源聚集地,這些學術資源必須具備較高的學術質量和學科權威性。因此對于已發(fā)表的學術成果,可根據(jù)發(fā)表期刊或專著出版社的等級,或以科研人員的學術地位,如職稱、職務等作為劃分依據(jù),進行分級存儲;對于未公開發(fā)表的學術成果,可邀請知名院校例如密西根大學制藥工程系、德國馬格德堡大學醫(yī)學院、中科院上海藥物研究所等專家組成評審組,對科研成果的學術價值進行同行評議后,進行分級存儲。學科資源的點擊量和下載量,以及用戶對于資源質量的反饋意見,也應當作為平臺學術資源質量控制的重要參考。聯(lián)盟平臺可以對這些科研成果進行數(shù)據(jù)挖掘,對藥學類主要研究領域的學術成果進行階段性梳理,形成報告或綜述,為科研人員的后續(xù)研究奠定文獻基礎;還可以將學科課程分類整合,例如工業(yè)藥劑學、疾病治療與藥物發(fā)現(xiàn)、藥物化學、藥物分析、生藥學、生物制藥工藝學、藥事法規(guī)等這些藥學類比較重要的學科。將同課程不同教授的課件或課程視頻放在一起,有利于用戶查找與分析比較。為擴大學術交流平臺,增強學科國際合作,可將聯(lián)盟平臺內的學術資源進行多語種翻譯,特別是英語、德語、法語、俄語、日語、意大利語、西班牙語、阿拉伯語等,吸引跨國學術交流與學科合作。

        6 資金來源

        建設和運營的資金是聯(lián)盟平臺必須解決的問題。資金來源有以下幾種方式:首先是平臺構建作為一個項目申請各級基金的資助。其次可以通過與同學科商業(yè)數(shù)據(jù)庫、出版社、雜志出版商合作,例如專業(yè)數(shù)據(jù)庫Thomson Reuters、Materials Chemistry Frontiers、Web of Science、Springer Protocols、SciFinder等,以廣告投放的形式獲取一些商業(yè)贊助。著名出版公司Elsevier利用Scopus數(shù)據(jù)庫的研究數(shù)據(jù)發(fā)布的“2016年中國高被引學者榜單”中,藥理學、毒理學、藥劑學都有學者被入選,藥學學科資源庫聯(lián)盟可以與這樣的出版公司合作,在聯(lián)盟平臺發(fā)布他們的廣告和培訓通知等;同時也可以將這些高被引學者及其文章做專題介紹和文章共享,鼓勵更多的藥學學科學者發(fā)表與共享高質量的學科成果。再者,作為有基金資助的科研項目,使用學科資源庫聯(lián)盟平臺存儲實驗數(shù)據(jù)時,需要交納一定的費用;各成員機構用于自身學科建設的費用可部分用于學科資源庫聯(lián)盟平臺建設;學科資源庫聯(lián)盟幫助各成員機構建設各自學校的藥學學科發(fā)展支撐平臺時,也可以收取一定的費用;本著開放存取的原則雖然用戶使用和下載平臺的學術資源是免費的,但如向學科專家咨詢或者提出其他的學科服務要求,可根據(jù)實際情況適當收取費用,例如根據(jù)讀者的需求出具SCI檢索報告、出具藥學學科分析報告、可視化分析學術研究、ESI學科預測等。此外,還可以跟一些網(wǎng)絡講座合作,在學科資源庫聯(lián)盟平臺發(fā)布一些學術講座。例如“Taylor&Francis學術期刊投稿技巧”之類的講座,既可以收取費用運營藥學學科資源庫聯(lián)盟,又可以為廣大藥學科研工作者的學術成果發(fā)表帶來切實的幫助;又比如“藥研人員的七武器——利用Integrity站在醫(yī)藥研究最前沿”講座,可以幫助科研人員準確檢索藥物研發(fā)信息和制藥行業(yè)的最新發(fā)展動態(tài)。學科資源庫聯(lián)盟平臺還可與眾多藥企合作,例如博瑞生物醫(yī)藥、上海強生制藥、美國禮來公司等,在聯(lián)盟平臺內投放藥企招聘啟事,既可以獲得藥企贊助費用,又擴寬了學生就業(yè)渠道。

        7 結語

        本文從協(xié)作模式、平臺建設、資源的采集與組織、存取政策、版權問題、質量控制等方面探討了構建藥學類學科資源庫聯(lián)盟的策略。探索的道路還很漫長,需要不斷學習,更需要多與美國化學會這樣的組織交流,學習美國化學文摘社是如何運行和維護全球最權威的化學數(shù)據(jù)平臺的。泛在化和智能化是學科資源庫聯(lián)盟未來發(fā)展的方向。泛在化是隨著移動終端設備而蓬勃發(fā)展,學科資源庫聯(lián)盟平臺也可以有手機APP、Pad客戶端,方便用戶隨時使用學科資源;智能化是基于關系屬性的本體推理機制[18],以樹形搜索的方式檢索概念之間隱含的邏輯關系,進而自動推理出與檢索詞關系屬性相匹配的所有檢索詞,如可以根據(jù)檢索詞A和邏輯關系B,推理出與檢索詞A是邏輯關系B的所有概念集合;也可以根據(jù)兩個檢索詞,自動推理它們之間的邏輯關系。

        國家正在推動高等院?!半p一流”建設,建設一流學校、建設一流學科,可見學科建設在高等教育領域占據(jù)越來越重要的地位。藥學學科資源庫聯(lián)盟的建設,正是順應了這樣的潮流。以本校的重點學科或特色專業(yè)為突破,完善學科資源共享體系,集合相同學科形成規(guī)?;玫貫榻虒W、科研服務,也是提升高校信息素養(yǎng)教育水平的好途徑。

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