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        LAMP和Xpert Mtb/RIF早期診斷肺結(jié)核傳染源的價(jià)值比較

        2017-02-26 09:12:20張偉陽(yáng)鐘建平楊國(guó)彪金法祥許文芳王華鈞
        關(guān)鍵詞:涂陽(yáng)結(jié)核病肺結(jié)核

        張偉陽(yáng),鐘建平,楊國(guó)彪,金法祥,許文芳,王華鈞

        (紹興市立醫(yī)院,浙江紹興 312000,1.感染科;2.檢驗(yàn)科)

        ·臨 床 經(jīng) 驗(yàn)·

        LAMP和Xpert Mtb/RIF早期診斷肺結(jié)核傳染源的價(jià)值比較

        張偉陽(yáng)1,鐘建平1,楊國(guó)彪1,金法祥2,許文芳2,王華鈞1

        (紹興市立醫(yī)院,浙江紹興 312000,1.感染科;2.檢驗(yàn)科)

        目的:評(píng)價(jià)DNA環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增(LAMP)技術(shù)和Xpert Mtb/RIF早期發(fā)現(xiàn)肺結(jié)核傳染源的臨床應(yīng)用價(jià)值。方法:采用Xpert Mtb/RIF檢測(cè)試劑盒、MGIT液體培養(yǎng)和LAMP技術(shù)對(duì)肺結(jié)核300份痰液標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),其中涂陽(yáng)標(biāo)本100例。結(jié)果:肺結(jié)核涂陽(yáng)標(biāo)本100例,LAMP技術(shù)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌(MTB),陽(yáng)性96例,陽(yáng)性率為96.0%,Xpert Mtb/RIF檢測(cè)MTB,陽(yáng)性97例,陽(yáng)性率為97.0%,涂陽(yáng)標(biāo)本2種方法檢測(cè)結(jié)果差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。涂陰標(biāo)本200例,LAMP技術(shù)檢測(cè)MTB,陽(yáng)性107例,陽(yáng)性率為53.5%,Xpert Mtb/RIF檢測(cè)MTB,陽(yáng)性50例,陽(yáng)性率為25.0%,涂陰標(biāo)本2種方法檢測(cè)結(jié)果差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。結(jié)論:在診斷肺結(jié)核涂陽(yáng)標(biāo)本時(shí),LAMP技術(shù)與Xpert Mtb/RIF的敏感性相似;診斷涂陰標(biāo)本時(shí),LAMP技術(shù)優(yōu)于Xpert Mtb/RIF。

        抗酸桿菌;結(jié)核分枝桿菌;核酸擴(kuò)增技術(shù);診斷

        結(jié)核病嚴(yán)重危害人類健康。近10年來(lái),由于艾滋病的流行、移民和流動(dòng)人口的增加、耐多藥結(jié)核桿菌的增多,以及不少國(guó)家和地區(qū)對(duì)結(jié)核病控制的忽視等因素,全球結(jié)核病形勢(shì)急劇惡化[1]。結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌(mycobacteriumtuberculosis,MTB)感染引起的慢性傳染病,早期發(fā)現(xiàn)活動(dòng)性肺結(jié)核傳染源是預(yù)防和控制結(jié)核病傳播的重要措施之一。本研究采用DNA環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增試驗(yàn)(loopmediatedisothermalamplifyication,LAMP)技術(shù)及XpertMtb/RIF試劑盒對(duì)MTB進(jìn)行檢測(cè),并與MGIT液體培養(yǎng)法比較各檢測(cè)法的應(yīng)用價(jià)值。

        1 材料和方法

        1.1 標(biāo)本來(lái)源標(biāo)本均來(lái)自我院2014年住院診斷為肺結(jié)核病的患者(男195例,女105例,平均年齡43.7歲),每人送檢一份合格痰標(biāo)本,共300份,其中涂陽(yáng)標(biāo)本100例,涂陰標(biāo)本200例。

        1.2 試劑與儀器LAMP試劑(廣州華峰生物科技有限公司),GeneXpertMtb/RIF檢測(cè)儀及試劑盒(美國(guó)Cepheid公司),顯微鏡(日本奧林巴斯株式會(huì)社),低溫高速離心機(jī)(美國(guó)ThermoFisherScientific公司),生物安全柜(美國(guó)Nuaire公司)。

        1.3 分枝桿菌菌株14株非MTB(包括胞內(nèi)分枝桿菌5株、鳥分枝桿菌3株、膿腫分枝桿菌1株、瘰疬分枝桿菌1株、堪薩斯分枝桿菌2株、海分枝桿菌1株、偶發(fā)分枝桿菌1株),均為本院臨床分離株,通過(guò)DNA微陣列芯片法進(jìn)行菌種鑒定;H37RvMTB標(biāo)準(zhǔn)株1株來(lái)自浙江省結(jié)核病防治研究所。

        1.4 檢驗(yàn)方法每份痰標(biāo)本同時(shí)進(jìn)行MGIT液體培養(yǎng)、XpertMtb/RIF檢測(cè)及LAMP技術(shù)檢測(cè)。

        1.5 MGIT液體培養(yǎng)采用N-乙酰-L-半胱氨酸-氫氧化鈉(NALC-NaOH)處理中和離心法培養(yǎng)MTB。

        1.6 LAMP技術(shù)

        1.6.1 DNA制備:根據(jù)痰液標(biāo)本量,加入2倍體積4%NaOH溶液,充分混勻,室溫靜置液化30min;吸取1mL液化液加入無(wú)菌1.5mL離心管中,15000r/min離心5min,棄上清;沉淀用1mL0.9%氯化鈉溶液洗滌,15000r/min離心5min,棄上清,沉淀用1mL0.9%氯化鈉溶液重懸洗滌,15000r/min離心5min,棄上清,沉淀用于模板提取;分別加入100μLDNA提取液I和0.25μLProteinaseK,56℃溫浴30min,再沸水浴10min;加入12.5μLDNA提取液I I,混勻,12000r/min離心5min,上清即為DNA模板。

        1.6.2 核酸擴(kuò)增:取出HF管于室溫解凍。向上述反應(yīng)管內(nèi)按順序分別加入陰性對(duì)照、待檢模板和陽(yáng)性對(duì)照各2.5μL;置65℃恒溫反應(yīng)60min。反應(yīng)結(jié)束,將HF管倒置甩動(dòng)2次,再正置甩動(dòng)2次,使工作液與顯色液充分混合,冷卻至室溫后觀察。

        1.6.3 結(jié)果判讀:待檢標(biāo)本反應(yīng)管液體呈綠色,結(jié)果為MTB陽(yáng)性;待檢標(biāo)本反應(yīng)管液體呈橙色,則報(bào)告MTB檢驗(yàn)結(jié)果為陰性。

        1.7 Xpert Mtb/RIF檢測(cè)檢測(cè)試劑由美國(guó)Cepheid公司研發(fā),PCR檢測(cè)所需的3個(gè)步驟(DNA提取、擴(kuò)增和檢測(cè))自動(dòng)化,WHO于2010年批準(zhǔn)了該法的應(yīng)用,按試劑說(shuō)明書操作。

        1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理方法率的比較采用χ2檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 LAMP和Xpert Mtb/RIF檢測(cè)結(jié)果涂陽(yáng)標(biāo)本100例,LAMP檢測(cè)MTB陽(yáng)性率為96.0%,XpertMtb/ RIF檢測(cè)MTB陽(yáng)性率為97.0%,2種方法檢測(cè)結(jié)果差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.15,P>0.05),見表1。

        表1 涂陽(yáng)標(biāo)本檢測(cè)MTB結(jié)果

        涂陰標(biāo)本200例,LAMP檢測(cè)MTB陽(yáng)性率為53.5%,XpertMtb/RIF檢測(cè)MTB陽(yáng)性率為25.0%,2種方法檢測(cè)結(jié)果差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=34.1,P<0.01),見表2。

        表2 涂陰標(biāo)本檢測(cè)MTB結(jié)果

        涂陰標(biāo)本200例,LAMP技術(shù)檢測(cè)MTB的陽(yáng)性率與MGIT液體培養(yǎng)法比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=42.2,P<0.01);XpertMtb/RIF檢測(cè)與MGIT液體培養(yǎng)法比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.5,P>0.05)。

        2.2 非MTB檢測(cè)結(jié)果LAMP技術(shù)和XpertMtb/RIF檢測(cè)14株非MTB(胞內(nèi)分枝桿菌5株,鳥分枝桿菌3株,膿腫分枝桿菌1株,瘰疬分枝桿菌1株,堪薩斯分枝桿菌2株,海分枝桿菌1株,偶發(fā)分枝桿菌1株),結(jié)果均未檢出。XpertMtb/RIF檢測(cè)MTBH37Rv標(biāo)準(zhǔn)株,結(jié)果MTB陽(yáng)性,利福平耐藥基因rpoB未檢測(cè)到突變結(jié)果,即對(duì)利福平敏感;LAMP技術(shù)檢測(cè)MTBH37Rv標(biāo)準(zhǔn)株,結(jié)果陽(yáng)性。

        2.3 LAMP技術(shù)檢測(cè)結(jié)果300例痰液標(biāo)本,陽(yáng)性203例,陽(yáng)性率為67.7%,檢測(cè)結(jié)果肉眼判斷,沒(méi)有靶序列DNA的則為橙色,含有靶序列DNA管中有大量的LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物而顯綠色,結(jié)果觀察見圖1。

        3 討論

        圖1 LAMP技術(shù)檢測(cè)結(jié)果(綠色為陽(yáng)性,橙色為陰性)

        結(jié)核病細(xì)菌學(xué)檢查是發(fā)現(xiàn)結(jié)核病傳染源的主要途徑和手段,是確定結(jié)核病診斷和化療方案的重要依據(jù)[2]。痰涂片染色法臨床中應(yīng)用最普遍,但敏感性低,漏檢率較高,且無(wú)法區(qū)分MTB和非MTB,也不能確定菌體是活菌還是死菌。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,建立在核酸擴(kuò)增基礎(chǔ)上的檢測(cè)法推動(dòng)更多科學(xué)研究,全球已經(jīng)開發(fā)了多種新型的結(jié)核病實(shí)驗(yàn)室診斷新技術(shù),其中LAMP技術(shù)反應(yīng)2h即可完成核酸擴(kuò)增,通過(guò)目測(cè)可以得到清晰的結(jié)果,不需要長(zhǎng)時(shí)間的循環(huán)溫度,不需要PCR等昂貴的儀器,僅需要一恒溫設(shè)備,檢測(cè)成本大大降低。XpertMtb/RIF是WHO推薦的一種全新的結(jié)核病快速檢測(cè)方法,其采用熒光定量核酸擴(kuò)增技術(shù),檢測(cè)MTB利福平耐藥基因rpoB的81bp耐藥核心區(qū)是否發(fā)生突變,從而判斷受檢菌株是否對(duì)利福平耐藥。該檢測(cè)系統(tǒng)所需試劑價(jià)格昂貴,在結(jié)核病高發(fā)的發(fā)展中國(guó)家,其廣泛應(yīng)用還存在困難。本研究結(jié)果顯示,XpertMtb/RIF檢測(cè)陽(yáng)性147例,陽(yáng)性率為49.0%,LAMP檢測(cè)陽(yáng)性率為67.7%,明顯高于MGIT液體培養(yǎng)法,這與國(guó)內(nèi)外文獻(xiàn)[3-6]報(bào)道基本一致。

        綜上所述,在診斷肺結(jié)核涂陽(yáng)標(biāo)本時(shí),LAMP技術(shù)與XpertMtb/RIF的敏感性相似;診斷肺結(jié)核涂陰標(biāo)本,LAMP技術(shù)優(yōu)于XpertMtb/RIF,且具有試劑成本低的優(yōu)勢(shì)。LAMP技術(shù)檢測(cè)過(guò)程僅需2h,能早期診斷和鑒別診斷肺結(jié)核,預(yù)防非耐藥結(jié)核病進(jìn)一步轉(zhuǎn)變?yōu)槟退幗Y(jié)核病,阻止和減少耐藥MTB在社區(qū)中的播散。因此,LAMP技術(shù)是一種簡(jiǎn)便、快速、靈敏度高的結(jié)核分枝桿菌檢測(cè)技術(shù)。

        [1] 金法祥, 王華鈞, 許文芳, 等. 4種新方法快速檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌的臨床研究[J]. 中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志, 2015, 25(21): 3638-3639.

        [2] 戴廣明, 曹以誠(chéng), 杜正平, 等. 結(jié)核分枝桿菌環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增(LAMP)快速檢測(cè)方法的評(píng)價(jià)[J]. 中國(guó)防癆雜志, 2011, 33(1): 47-51.

        [3] 金法祥, 王華鈞, 孫小軍. DNA環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增試驗(yàn)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌的研究[J]. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志, 2011, 21 (12): 2639-2640.

        [4] IWAMOTO T, SONOBE T, HAYASHI K. Loop-mediated isothermal amplification for direct of mycobacterium tuberculosis complex, M.avium, and M.intracellulare in sputum samples[J]. J Clin Microbiol, 2003, 41(6)∶ 2616-2666.

        [5] PANDEY B D, POUDEL A, YODA T, et al. Development of an in-house Loop-mediated isothermal amplifyication (LAMP) assay for detection of Mycobacterium tuberculosis and evaluateon in sputum samples of Neaplese patients[J]. J Med Microbiol, 2008, 57(4)∶ 439-443.

        [6] LAIFANGBAM S, SINGH H L, SINGH N B, et al. A comparative study of fuorescent microscopy with Ziehl-Neelsen staining and culture for the diagnosis of pulmonary tuberculosis[J]. Kathmandu Univ Med J, 2009, 7(27)∶ 226-230.

        (本文編輯:丁敏嬌)

        Clinical application of LAMP and Xpert Mtb/RIF in early detection of pulmonary tuberculosis infection

        ZHANG Weiyang1, ZHONG Jianping1, YANG Guobiao1, JIN Faxiang2, XU Wenfang2, WANG Huajun1. 1.Department of Infectious Diseases, Shaoxing Municipal Hospital, Shaoxing, 312000; 2.Department of Clinical Laboratory, Shaoxing Municipal Hospital, Shaoxing, 312000

        Objective:To compare the clinical application of DNA loop mediated isothermal amplifcation (LAMP) technology and Xpert MTB/RIF in early detection of the infectious source of pulmonary tuberculosis.Methods:Three hundred TB sputum samples were detected using Xpert Mtb/RIF detection, MGIT liquid culture and LAMP technology, of which 100 cases of smear-positive specimens, 200 cases of smear-negative specimens.Results:In 100 cases of TB smear-positive specimens, the positive rate was 96.0% with LAMP technology, and the positive rate was 97.0% with Xpert Mtb/RIF detection (P>0.05). In 200 cases of smear-negative specimens, the positive rate was 53.5% with LAMP technology, and the positive rate was 25.0% with Xpert Mtb/RIF detection (P<0.01).Conclusion:In the diagnosis of smear positive specimens, the sensitivity of LAMP technology and Mtb RIF/Xpert was similar. In the diagnosis of smear negative specimens, LAMP technology is better than Mtb Xpert/RIF.

        acid fast bacilli; mycobacterium tuberculosis; nucleic acid amplifcation techniques; diagnosis

        R446.5

        B

        10.3969/j.issn.2095-9400.2017.01.013

        2016-05-31

        紹興市衛(wèi)生計(jì)生科技計(jì)劃成果轉(zhuǎn)化項(xiàng)目(2016ZH003)。

        張偉陽(yáng)(1965-),男,浙江新昌人,主任醫(yī)師。

        金法祥,主任技師,Email:sxjfx0575@126.com。

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