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        一例肝豆?fàn)詈俗冃约彝サ腁TP7B基因突變研究

        2017-01-20 15:44:57趙龍國慧劉世國宋衛(wèi)青
        關(guān)鍵詞:基因突變

        趙龍國慧劉世國宋衛(wèi)青

        一例肝豆?fàn)詈俗冃约彝サ腁TP7B基因突變研究

        趙龍1國慧2劉世國3宋衛(wèi)青1

        目的 檢測肝豆?fàn)詈俗冃裕╓ilson Disease)患兒及其父母的ATP7B基因突變類型。方法 采用全基因組外顯子測序技術(shù)(WES)對1例肝豆?fàn)詈俗冃曰純杭捌涓改窤TP7B基因進(jìn)行檢測。結(jié)果 患兒母親ATP7B-exon8基因發(fā)生了錯義突變(c.2 333G>T),導(dǎo)致p.R778L;患兒父親ATP7B-exon11基因發(fā)生了錯義突變(c.2 621C>T),導(dǎo)致p.A874V。結(jié)論 患兒父母均為肝豆?fàn)詈俗冃曰驍y帶者。

        肝豆?fàn)詈俗冃?;ATP7B基因;突變;測序分型

        肝豆?fàn)詈俗冃裕╓ilson Disease)又稱威爾遜氏病,是一種遺傳性銅代謝障礙所致的肝硬化和以基底節(jié)為主的腦部變性的常染色體隱性遺傳的銅代謝障礙疾病。世界范圍發(fā)病率為1/10萬~1/3萬[1],雜合子頻率為1/200~1/100[2],其中中國是高發(fā)區(qū),發(fā)病年齡多在5~35歲[3],但報(bào)道經(jīng)基因確診的3~72歲均有[4-5]。該病是位于13q14.3的ATP7B基因突變所致,導(dǎo)致銅轉(zhuǎn)運(yùn)P型ATP酶缺失,從而導(dǎo)致血漿銅藍(lán)蛋白降低及銅在體內(nèi)器官的沉積等一系列臨床表現(xiàn)。肝豆?fàn)詈俗冃允悄壳吧贁?shù)可以治療的神經(jīng)遺傳病之一,患者如果能在發(fā)病早期或癥狀前期即被確診并得到及時(shí)治療,大多預(yù)后良好,反之病情逐漸加重甚至危及生命。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料

        患兒,女,12歲,父母非近親結(jié)婚。血清學(xué)檢查結(jié)果顯示血清銅藍(lán)蛋白52 mg/L,23 h尿銅排泄量232 μg,影像學(xué)檢查結(jié)果顯示輕度肝硬化,腦MRI雙側(cè)豆?fàn)詈顺蕦ΨQ性低密度陰影,診斷為肝豆?fàn)詈俗冃浴2杉純杭捌涓改竿庵莒o脈血5 ml,用于提取DNA。

        1.2 方法

        1.2.1 樣本采集 患者、患者父母分別采集靜脈血10 ml,保存于抗凝管中。

        1.2.2 基因組DNA提取 選用天根生化科技生產(chǎn)的DNA提取試劑盒,對該家庭3人采集靜脈血進(jìn)行基因組DNA提取。

        1.2.3 外顯子測序(WES) 對基因組DNA隨機(jī)片段化制備cDNA文庫。PCR擴(kuò)增并純化富集回收產(chǎn)物后,采用安捷倫人全外顯子試劑盒特異性捕獲外顯子區(qū)域序列。使用安捷倫2100檢測DNA樣品的濃度和含量。在Illumina MISeq2000高通量測序平臺對樣品進(jìn)行雙向測序,并通過SOAPaligner2.20對比軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析,初步篩選高質(zhì)量單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)。

        1.2.4 Sanger重測序驗(yàn)證 對于WES測序所檢測到的突變結(jié)果在原標(biāo)本中進(jìn)行Sanger測序。來驗(yàn)證外顯子測序結(jié)果的準(zhǔn)確性。PCR突變所在的外顯子,引物序列由青島生工生物科技有限公司合成。 取擴(kuò)增產(chǎn)物10 μl置于15 g/L的瓊脂糖凝膠中電泳,使用ABI70測序儀(Applied Biosystems)進(jìn)行產(chǎn)物程序。采用DNAMAN軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并與GenBank中的ATP7B基因序列進(jìn)行對比,判斷是否為新突變位點(diǎn)。

        2 結(jié)果

        2.1 全基因組外顯子測序

        結(jié)果表明,患兒的父親 ATP7B-exon11基因發(fā)生了錯義突變(c.2 621C>T),導(dǎo)致p.A874V;患兒的母親ATP7B-exon8基因發(fā)生了錯義突變(c.2 333G>T),導(dǎo)致p.R778L。

        2.2 Sanger測序驗(yàn)證

        以PCR擴(kuò)增為基礎(chǔ)的Sanger測序也得到了與WES方法完全相同的突變。

        3 討論

        肝豆?fàn)詈俗冃詮V泛分布于各族群人種之間,通常發(fā)生于兒童和青少年期,少數(shù)成年期發(fā)病。若早發(fā)現(xiàn)早診斷早治療,一般較少影響生活質(zhì)量和生存期。銅代謝障礙是該病的主要特征之一。銅離子在體內(nèi)異常沉積的速度、部位不同使得患者出現(xiàn)一個(gè)或多個(gè)器官功能損傷,隨著病情的不斷進(jìn)展,可導(dǎo)致數(shù)個(gè)臟器不可逆的損傷,并出現(xiàn)各種并發(fā)癥,危及患者生命。

        傳統(tǒng)臨床上用于診斷肝豆?fàn)詈俗冃缘氖侄芜€比較單一,給臨床診治帶來一定困擾。較多的肝豆?fàn)詈俗冃缘幕颊咴缙诎Y狀復(fù)雜多樣,易被誤診為其他疾病如慢性肝炎、肝硬化、脾功能亢進(jìn)、溶血性貧血等。而且銅代謝檢查存在自身的局限性,假陰性假陽性結(jié)果較多。若能及早得到正確的診斷和治療,大多數(shù)患者可恢復(fù)良好,且生活質(zhì)量和壽命與正常人相似。

        DNA測序技術(shù)是目前診斷肝豆?fàn)詈俗冃宰畛S玫幕驒z測方法,是該病基因診斷的標(biāo)準(zhǔn)。ATP7B基因全長約80 kb,由21個(gè)外顯子和20個(gè)內(nèi)含子組成[6]?;蜷L度為78 821 bp,大多數(shù)外顯子的長度為200 bp左右。結(jié)構(gòu)分析表明肝豆?fàn)詈俗冃曰虺室粋€(gè)開放讀碼框,cDNA序列長度為4 233 bp,編碼由1 411個(gè)氨基酸組成的P-型銅轉(zhuǎn)運(yùn)ATP酶。

        隨著基因測序技術(shù)的不斷發(fā)展,及早確定ATP7B的基因突變類型,對于盡早明確診斷,及時(shí)做出干預(yù)有非常重要的意義,使機(jī)體早日免受器官損傷的風(fēng)險(xiǎn)。目前該基因以逐步作為產(chǎn)前診斷和新生兒篩查的指標(biāo)[7]。然而ATP7B基因突變類型非常多,目前報(bào)道的ATP7B基因突變類型有550多種,以少數(shù)幾個(gè)突變?yōu)橹鳎嬖诿黠@的種族和地區(qū)差異[8]。這些突變大多是雜合突變,了解這些突變對基因檢測至關(guān)重要。Kenney SM等[9]于2007年報(bào)道在肝豆?fàn)詈俗冃缘?18種突變中,379種是致病的,139種為非致病性的,還有一些突變尚不能確定是否致病。

        我們本次的研究僅有1例樣本,對研究基因型與表現(xiàn)型的關(guān)系尚存在局限性。另外,闡明本地區(qū)ATP7B基因突變類型對于產(chǎn)前診斷和新生兒篩查非常重要,未來我們將收集更多患者資料,確定本地區(qū)肝豆?fàn)詈俗冃曰蜃儺惖幕A(chǔ),并在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步闡明ATP7B基因型與表現(xiàn)型的關(guān)系。

        [1] Figus A,Angius A,Loudianos G,et al. Molecular pathology and haplotype analysis of Wilson disease in Mediterranean populations[J].Am J Hum Genet,1995,57(6):1318-1324.

        [2] Als A,Walker AP,Ashkan K,et al. Wilson’s disease[J]. Lancet,2007,369(9559):397-408.

        [3] Roberts EA.Schisky ML. Division Gastroenterology and Nutrition. A practice guideline on Wilson disease[J]. Hepatology,2003,37(6):1475-1492.

        [4] Wilson DC,Phillips MJ,Cox DW,et al. Severe hepatic Wilson’s disease in preschool-aged children[J]. J Pediatr,2000,137(5):719-722.

        [5] 陳晶貞,孟艷燕. ATP7B蛋白在肝豆?fàn)詈俗冃灾械姆肿訖C(jī)制研究進(jìn)展[J]. 臨床和實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2008,7(8):183-185.

        [6] 陳定邦,馮黎,李洵樺. 肝豆?fàn)詈俗冃缘姆肿由飳W(xué)研究進(jìn)展[J].分子診斷與治療雜志,2011,3(2):120-124.

        [7] Roberts EA,Schilsky ML. Diagnosis and treatment of Wilson disease:an update[J]. Hepatology (Baltimore, Md),2010,47(6):2089-2111.

        [8] 張秀海,劉偉. 肝豆?fàn)詈俗冃缘倪z傳學(xué)研究及治療進(jìn)展[J]. 臨床醫(yī)學(xué),2008,28(11):109-111.

        [9] Kenney SM,Cox DW. Sequence variation database for the Wilson disease copper transporter,ATP7B [J]. Hum Mutat,2007,28(12):1171-1177.

        Study on ATP7B Gene Mutation in a Family With Wilson Disease

        ZHAO Long1GUO Hui2LIU Shiguo3SONG Weiqing11 Medical College of Qingdao University, Qingdao Shandong 266003, China; 2 International Clinic, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao Shandong 266003, China; 3 Prenatal Diagnosis Center, The Affiliated Hospital of Qingdao University, Qingdao Shandong 266003, China

        ObjectiveTo investigate the type of ATP7B mutation in a child with Wilson disease and her parents.MethodsUsing whole-genome exon Sequencing(WES) to detect ATP7B gene in one patient with Wilson's disease and her parents.ResultsMissense mutations (c.2 333G>T) in ATP7B-exon8 gene occurred in patient’s mother, which lead to p.R778L;Missense mutations (c.2 621C>T) in ATP7B-exon8 gene occurred in patient’sfather, which lead to p.A874V.ConclusionPatient’s parents are Wilson disease gene carriers.

        wilson disease; ATP7B gene; mutation; multilocussequence typing

        R446.6

        A

        1674-9316(2017)06-0090-03

        10.3969/j.issn.1674-9316.2017.06.054

        1 青島大學(xué)醫(yī)學(xué)部,山東 青島 266003;2 青島大學(xué)附屬青島市市立醫(yī)院國際門診,山東 青島 266003;3 青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院產(chǎn)前診斷中心,山東 青島 266003

        宋衛(wèi)青

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