李舒荃 貴志芳 楊亞洋 沈燦 許斌 許健
長(zhǎng)鏈非編碼RNA在胰腺癌診斷與預(yù)后中的研究進(jìn)展
李舒荃 貴志芳 楊亞洋 沈燦 許斌 許健?
長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類(lèi)長(zhǎng)度>200個(gè)核苷酸,不編碼蛋白質(zhì)的非編碼RNA。已有研究表明,異常表達(dá)的lncRNA與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),并能在腫瘤中表現(xiàn)癌基因和抑癌基因的功能。胰腺癌是常見(jiàn)的消化系統(tǒng)腫瘤,惡性程度高,預(yù)后差,治愈率低。因此,研究胰腺癌發(fā)生發(fā)展和侵襲轉(zhuǎn)移的機(jī)制、尋找其診斷和預(yù)后的標(biāo)志物成為近年來(lái)的研究熱點(diǎn)?,F(xiàn)就lncRNA在癌癥中的作用和在胰腺癌診斷與預(yù)后中的研究進(jìn)展作一綜述。
癌癥是一種具有細(xì)胞維持增殖信號(hào),逃避生長(zhǎng)抑制,抵抗細(xì)胞凋亡等特點(diǎn)的疾?。?]。雖然在腫瘤中已發(fā)現(xiàn)許多癌基因和抑癌基因,但腫瘤發(fā)生發(fā)展的細(xì)胞機(jī)制仍未清楚。由于lncRNA具有在不同腫瘤中選擇性表達(dá)的特點(diǎn),目前研究者也將研究腫瘤發(fā)生的目光投向了lncRNA[2]?,F(xiàn)已發(fā)現(xiàn)許多l(xiāng)ncRNA能作為“癌基因”或“抑癌基因”在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮作用。
1.1 致癌相關(guān)的lncRNA 目前,已有一些致癌相關(guān)的lncRNA得到充分研究。Li T等[3]使用基因芯片技術(shù),發(fā)現(xiàn)ZEB1反義RNA 1(ZEB1-AS1)在肝癌組織特別是轉(zhuǎn)移性腫瘤組織中表達(dá)上調(diào),ZEB1-AS1的過(guò)表達(dá)與異常的DNA甲基化有關(guān)。腫瘤組織ZEB1-AS1高表達(dá)或ZEB1-AS1低甲基化的患者無(wú)復(fù)發(fā)生存率低。ZEB1-AS1能促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)和遷移,在肝癌細(xì)胞中作為癌基因發(fā)揮作用。最近由Ma Y等[4]新發(fā)現(xiàn)的結(jié)直腸癌相關(guān)的lncRNA(CCAL)在結(jié)直腸癌組織中呈現(xiàn)高表達(dá)現(xiàn)象,能通過(guò)靶向作用于激活蛋白2α(AP-2α)激活Wnt/β-catenin信號(hào)通路來(lái)誘導(dǎo)結(jié)直腸癌細(xì)胞多藥耐藥和促進(jìn)結(jié)直腸癌發(fā)展。近期一項(xiàng)新的研究表明[5],RGMB反義RNA1(RGMB-AS1)在非小細(xì)胞肺癌中上調(diào),并與腫瘤分化程度,淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及臨床分期有關(guān),與反義導(dǎo)向分子b(RGMB)呈負(fù)相關(guān)。
1.2 抑癌相關(guān)的lncRNA 除表現(xiàn)癌基因的作用,一些lncRNA也被證實(shí)具有抑癌基因的作用。最近新發(fā)現(xiàn)的TSLC1反義RNA1(TSLC1-AS1)在神經(jīng)膠質(zhì)瘤中表達(dá)下調(diào)[6],TSLC1-AS1的過(guò)表達(dá)引起TSLC1的上調(diào)并抑制腫瘤細(xì)胞增殖,遷移和侵襲。TSLC1-AS1的表達(dá)與其他抑癌基因如NF1,VHL,PIK3R1呈正相關(guān),而與癌基因BRAF呈負(fù)相關(guān)。Yao J等研究發(fā)現(xiàn)[7],CADM1反義RNA1(CADM1-AS1)在腎透明細(xì)胞癌中表達(dá)下調(diào),干擾CADM1-AS1的表達(dá)能促進(jìn)腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)和遷移,減少細(xì)胞凋亡率。CADM1-AS1能通過(guò)“CADM1-AS1/CADM1 mRNA基因配對(duì)”表達(dá)模式調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖,凋亡和遷移來(lái)發(fā)揮其抑癌基因的作用。有研究者發(fā)現(xiàn)[8],?;撬嵘险{(diào)的基因1(TUG1)的低表達(dá)與非小細(xì)胞肺癌的高級(jí)別TNM分期,腫瘤尺寸及患者更低的總生存期有關(guān)。TUG1表達(dá)的抑制顯著促進(jìn)腫瘤細(xì)胞和組織的增殖。
除表現(xiàn)致癌或抑癌作用,也有l(wèi)ncRNA既有致癌特性又有腫瘤抑制特性。LncRNA H19在胰腺癌,胃癌、乳腺癌、結(jié)直腸癌等許多癌癥中表現(xiàn)上調(diào)的特點(diǎn),證明其具有癌基因的作用。在另一方面,也有研究表明H19具有抑癌基因的作用,最近Lv J等[9]發(fā)現(xiàn),抑制H19和MiR-675的表達(dá)能激活A(yù)KT/GSK-3β/Cdc25A信號(hào)通路促進(jìn)肝癌細(xì)胞的遷移和侵襲。
目前,隨著我國(guó)人民生活水平的提高及飲食結(jié)構(gòu)的變化,胰腺癌的發(fā)病率近年來(lái)呈不斷上升的趨勢(shì),然而胰腺癌患者5年生存率<5%,發(fā)病率接近于病死率。目前,由于早期診斷率低,惡性程度高,腫瘤發(fā)展快和轉(zhuǎn)移早等多種原因,胰腺癌已成為預(yù)后最差的惡性腫瘤之一[10-11]。目前,一般用于檢測(cè)胰腺癌的腫瘤標(biāo)志物是糖抗原19-9(CA19-9),胰腺癌患者血清中CA19-9水平明顯增高。然而,一些良性的疾病,多種類(lèi)型的消化腺癌,特別是晚期胃腸道癌也能引起血清CA19-9的升高,這表明CA19-9診斷胰腺癌并不是特異性的。因此,能夠根據(jù)腫瘤的生物學(xué)行為和異常的基因改變對(duì)患者進(jìn)行分類(lèi)的生物標(biāo)志物十分必要。相比蛋白質(zhì),核酸不易受變性或變形的影響,核酸的擴(kuò)增在技術(shù)上也容易實(shí)現(xiàn),核酸作為胰腺癌早期診斷及預(yù)后預(yù)測(cè)的新型生物標(biāo)志物具有廣闊的應(yīng)用前景。有較多研究已證明,一些lncRNA 與胰腺癌的診斷和預(yù)后有著顯著的關(guān)聯(lián),能作為新的生物標(biāo)志物診斷胰腺癌并預(yù)測(cè)其結(jié)局。
2.1 MALAT1 MALAT1基因定位于染色體11q13,包含幾個(gè)與染色體易位相關(guān)的斷點(diǎn)。MALAT1是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)與胰腺癌預(yù)后有關(guān)的lncRNA。Jiao F等[12]應(yīng)用qRT-PCR技術(shù)分析6組胰腺癌組織和相鄰非癌組織MALAT1表達(dá)的差異,發(fā)現(xiàn)與非癌組織比較,胰腺癌組織中MALAT1表達(dá)水平顯著升高。隨后檢測(cè)的7株胰腺癌細(xì)胞系中MALAT1表達(dá)水平均高于胰腺導(dǎo)管上皮細(xì)胞。進(jìn)一步的研究表明,MALAT1的下調(diào)能抑制人類(lèi)胰腺癌細(xì)胞AsPC-1和CFPAC-1在體外的生長(zhǎng)和增殖,減少細(xì)胞遷移和侵襲。隨后的機(jī)制研究發(fā)現(xiàn),下調(diào)MALAT1的表達(dá)對(duì)胰腺癌細(xì)胞的抑制效應(yīng)可能通過(guò)誘導(dǎo)細(xì)胞周期G2/M期停滯并促進(jìn)細(xì)胞凋亡,抑制EMT,減少腫瘤干細(xì)胞樣特性達(dá)到[12]。Liu JH等[13]的研究發(fā)現(xiàn),MALAT1的表達(dá)水平與腫瘤大小,腫瘤分期,腫瘤浸潤(rùn)深度呈正相關(guān),Kaplan-Meier 生存分析表明MALAT1的高表達(dá)提示患者具有較低的無(wú)病生存率,提示MALATI可能是檢測(cè)胰腺癌疾病特異性生存率一項(xiàng)獨(dú)立的預(yù)測(cè)因子,可以作為胰腺癌診斷和基因治療的靶向物。Pang EJ等[14]也發(fā)現(xiàn)MALAT1的高表達(dá)可作為胰腺癌患者不利預(yù)后的生物標(biāo)志物。MALAT1在胰腺癌組織中的高表達(dá)可以使其成為診斷胰腺癌的潛在生物標(biāo)志物,有研究者已在胃癌患者的血漿中檢測(cè)到MALAT1[15],而我國(guó)學(xué)者Ren S等[16]則發(fā)現(xiàn)MALAT1可能以片段的形式存在于血漿中,不同片段在血漿中表達(dá)差異較大,在前列腺癌患者中,命名為來(lái)源于MALAT1的miniRNA(MD-miniRNA)表達(dá)量最高,這提示,在胰腺癌患者的體液中是否存在另一種MALAT1片段表達(dá)量最高的情況,而這種MALAT1片段可以成為特異性診斷胰腺癌的腫瘤標(biāo)志物,這需要未來(lái)研究者的進(jìn)一步研究。
2.2 HOXA遠(yuǎn)端轉(zhuǎn)錄物(HOTTIP) HOTTIP位于HOXA基因群的5’端,能與WDR5/MLL復(fù)合物相互作用并增加組蛋白H3賴(lài)氨酸4三甲基的表達(dá)來(lái)激活5’HOXA多基因表達(dá)[17]。Cheng Y等[18]發(fā)現(xiàn),HOTTIP在胰腺癌細(xì)胞中表達(dá)上調(diào),通過(guò)siRNA抑制胰腺癌Panc1細(xì)胞HOTTIP表達(dá),能抑制細(xì)胞增殖,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,減少細(xì)胞遷移。Li Z等[19]進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),在胰腺癌MIA PaCa-2和SW1990細(xì)胞內(nèi)通過(guò)短發(fā)卡RNA(shRNA)干擾HOTTIP的表達(dá),能抑制細(xì)胞增殖,使細(xì)胞周期阻滯在G0/G1期,誘導(dǎo)E-鈣黏蛋白的表達(dá),抑制波形蛋白和Snail蛋白的表達(dá),使胰腺癌細(xì)胞遷移和侵襲能力顯著下降。體內(nèi)與體外實(shí)驗(yàn)也發(fā)現(xiàn),HOTTIP的抑制能增強(qiáng)胰腺癌細(xì)胞對(duì)吉西他濱的敏感性。進(jìn)一步機(jī)制研究發(fā)現(xiàn),HOTTIP表達(dá)與HOXA13表達(dá)呈正相關(guān),HOTTIP能通過(guò)調(diào)節(jié)HOXA13促進(jìn)胰腺癌細(xì)胞增殖,侵襲和耐藥性,而HOXA13的高表達(dá)與胰腺癌患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、組織不良分化、總生存率降低有關(guān),生存分析表明,高表達(dá)的HOXA13提示胰腺癌患者具有較差的預(yù)后,故可認(rèn)為HOTTIP/HOXA13軸是胰腺癌潛在的治療靶點(diǎn)并能作為胰腺癌診斷和預(yù)后評(píng)估的分子生物標(biāo)志物[19]。Wang Y等[20]使用人類(lèi)lncRNA芯片技術(shù)檢測(cè)胰腺癌組織和慢性胰腺炎組織內(nèi)lncRNA的表達(dá)譜,發(fā)現(xiàn)HOTTIP的剪接變異體HOTTIP-005在胰腺癌組織內(nèi)顯著上調(diào)。HOTTIP-005的過(guò)表達(dá)與胰腺癌患者病理分化、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、早期復(fù)發(fā)有關(guān),是預(yù)測(cè)胰腺癌患者總生存期的一項(xiàng)獨(dú)立的預(yù)后指標(biāo)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),血漿和血清中存在HOTTIP-005的片段,命名為來(lái)源于HOTTIP-005的RNA片段(HDRF),HDRF在胰腺癌患者血清和血漿內(nèi)表達(dá)顯著升高,并且HDRF可以在血漿和血清中穩(wěn)定存在,這使得HDRF可以成為診斷胰腺癌的潛在腫瘤標(biāo)志物。
2.3 PVT1 漿細(xì)胞瘤變體易位1(PVT-1)相鄰于MYC基因,位于人類(lèi)染色體8q24上。全基因組關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn),PVT1是胰腺癌易感性相關(guān)位點(diǎn)之一[21]。Huang C等發(fā)現(xiàn)PVT1的表達(dá)水平在胰腺癌組織中顯著增高,PVT1的表達(dá)與胰腺癌臨床分期和分級(jí)有關(guān)。與低PVT1表達(dá)的胰腺癌患者比較,高PVT1表達(dá)的患者總生存期短,利用單因素和多因素Cox分析發(fā)現(xiàn)PVT1能作為評(píng)估胰腺癌患者預(yù)后的潛在分子標(biāo)志物[22]。目前,已有科學(xué)家[23]檢測(cè)胰腺癌患者與正常人唾液中PVT1表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)胰腺癌患者唾液中PVTI表達(dá)顯著高于正常人,而當(dāng)患者進(jìn)行胰腺切除手術(shù)后,PVTI表達(dá)降低。除此之外,其還檢測(cè)了8種引起人類(lèi)死亡的主要癌癥與對(duì)照組的唾液標(biāo)本,均未發(fā)現(xiàn)PVTI有顯著差異,由此可發(fā)現(xiàn),PVTI不僅能成為診斷胰腺癌的潛在生物標(biāo)志物,而且其作為標(biāo)志物對(duì)診斷胰腺癌具有特異性。
2.4 其他lncRNA AFAP1反義RNA1(AFAP1-AS1)在胰腺癌組織中的高表達(dá)與腫瘤組織的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,神經(jīng)周?chē)?rùn)和不良預(yù)后有關(guān),是預(yù)測(cè)胰腺癌患者臨床轉(zhuǎn)歸潛在的預(yù)后指標(biāo)[24]。而LncR RP11-567G11.1不僅在胰腺癌組織中的過(guò)表達(dá)與胰腺癌患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和總生存期有關(guān),可以作為胰腺癌預(yù)后的生物標(biāo)志物,而且,在血清和血漿中可以檢測(cè)到穩(wěn)定存在的RP11-567G11.1的片段,提示其也可以作為胰腺癌診斷的生物標(biāo)志物[20]。
目前對(duì)lncRNA作為診斷和預(yù)后預(yù)測(cè)標(biāo)志物在胰腺癌中的研究較少,主要集中在lncRNA表達(dá)及功能方面的研究。目前已有研究揭示lncRNA表達(dá)水平與胰腺癌患者預(yù)后的關(guān)系,但胰腺癌診斷相關(guān)的lncRNA卻鮮有報(bào)道。雖然蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物廣泛應(yīng)用于癌癥檢測(cè)或疾病的后續(xù)研究,但是lncRNA也有其優(yōu)勢(shì):lncRNA本身是效應(yīng)分子,能反映腫瘤的實(shí)際有效水平[25];lncRNA水平與特定類(lèi)型腫瘤的關(guān)聯(lián)使其成為準(zhǔn)確的腫瘤診斷和分類(lèi)工具;lncRNA的表達(dá)與腫瘤治療應(yīng)答有關(guān),可以作為療效預(yù)測(cè)指標(biāo);lncRNA結(jié)合其他預(yù)測(cè)預(yù)后方法可作為未來(lái)腫瘤標(biāo)志物的新方向,使臨床醫(yī)師易于鑒別不良預(yù)后的患者并延長(zhǎng)其生存期。新興發(fā)現(xiàn)的循環(huán)lncRNA在人血清中通常是穩(wěn)定存在的,因此通過(guò)測(cè)定標(biāo)志物RNA或整個(gè)轉(zhuǎn)錄組可以使無(wú)創(chuàng)一代的臨床指標(biāo)可靠和可行。但由于缺少循環(huán)lncRNA的生物學(xué)知識(shí),其在疾病診斷中的應(yīng)用受到限制。且一些問(wèn)題也不容忽視,如循環(huán)lncRNA是否在疾病的不同狀態(tài)下均能在人體液中保持穩(wěn)定。
除此之外,lncRNA在腫瘤治療中也有廣泛的應(yīng)用前景。目前,已有l(wèi)ncRNA用于腫瘤的治療。例如H19在較多腫瘤中表現(xiàn)上調(diào)并具有癌基因的功能,構(gòu)建攜帶白喉毒素和H19調(diào)控序列的質(zhì)粒,該質(zhì)粒的瘤內(nèi)注射成功應(yīng)用于減小膀胱癌,卵巢癌和胰腺癌腫瘤體積[26]。然而,lncRNA應(yīng)用于臨床還存在一些挑戰(zhàn)[27]:用于預(yù)后預(yù)測(cè)的lncRNA需要確保測(cè)量濃度代表標(biāo)本實(shí)際濃度,現(xiàn)有方法無(wú)法確保;lncRNA進(jìn)化上并不保守,臨床應(yīng)用前使用動(dòng)物模型研究這些分子十分困難;lncRNA在多種疾病異常表達(dá),其特定腫瘤的特異性檢測(cè)需要更多研究;胰腺癌相比于其他類(lèi)型腫瘤較不常見(jiàn),減少了可以用于研究的標(biāo)本。隨著人們對(duì)胰腺癌與lncRNA關(guān)系研究的不斷深入,越來(lái)越多異常表達(dá)的lncRNA會(huì)被發(fā)現(xiàn),而這些異常表達(dá)的lncRNA可能會(huì)成為胰腺癌早期診斷與預(yù)后預(yù)測(cè)的重要生物標(biāo)志物,也可能成為胰腺癌分子靶向治療和藥物研發(fā)的重要原料。需要更多研究揭示lncRNA的結(jié)構(gòu)和機(jī)能特性,詳細(xì)分析其表達(dá)模式,闡明其相互作用[25],這有助于更好的理解lncRNA在胰腺癌中的生物學(xué)作用,從而改進(jìn)診斷和改善預(yù)后的方法,發(fā)現(xiàn)預(yù)防和治療人類(lèi)腫瘤的新靶點(diǎn),研究治療胰腺癌的有效藥物。
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浙江省科技廳社會(huì)公益項(xiàng)目(2014C33265),浙江省自然科學(xué)基金(LY14H160037),浙江省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2015C37113)
310053 浙江中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院(李舒荃 貴志芳 楊亞洋 沈燦 許?。?/p>
310016 浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬邵逸夫醫(yī)院(許斌)
*通信作者