郁有祝,宋群立,郭玉華
(1.安陽(yáng)工學(xué)院化學(xué)與環(huán)境工程學(xué)院,河南安陽(yáng)455000;2.許昌幼兒師范學(xué)校,河南許昌461700)
紫外光譜法研究2-羥甲基苯并咪唑與DNA的相互作用
郁有祝1,宋群立2,郭玉華1
(1.安陽(yáng)工學(xué)院化學(xué)與環(huán)境工程學(xué)院,河南安陽(yáng)455000;2.許昌幼兒師范學(xué)校,河南許昌461700)
用紫外光譜法和黏度法研究2-羥甲基苯并咪唑與DNA的相互作用,考察離子強(qiáng)度對(duì)兩者相互作用的影響。結(jié)果表明:在pH=7.40的Tris-HCl緩沖溶液中,DNA使2-羥甲基苯并咪唑的紫外吸收光譜減色且紅移,測(cè)得2-羥甲基苯并咪唑與DNA的結(jié)合常數(shù)為5.2×107L·mol-1。隨2-羥甲基苯并咪唑濃度增大,DNA黏度增大,NaCl濃度增加,DNA-2-羥甲基苯并咪唑體系吸光度無(wú)明顯變化,2-羥甲基苯并咪唑以嵌插作用方式與DNA結(jié)合。
2-羥甲基苯并咪唑;DNA;紫外光譜;黏度;相互作用
D01∶10.19329/j.cnki.1673-2928.2016.06.004
苯并咪唑是含2個(gè)氮原子的芳香雜環(huán),這種特殊的結(jié)構(gòu)可以與生物體內(nèi)的酶和受體等形成氫鍵。以苯并咪唑環(huán)構(gòu)筑的藥物分子,有廣泛的生物活性,如作為組胺受體拮抗劑、質(zhì)子泵抑制劑、抗高血壓、抗菌、抗病毒、抗癌、鎮(zhèn)痛等[1]。同時(shí),獨(dú)特的π-共軛結(jié)構(gòu)以及對(duì)DNA序列具有高度的選擇性親和作用,使它的衍生物作為分子探針應(yīng)用于DNA結(jié)構(gòu)的研究。唐凌天等[2]研究發(fā)現(xiàn)在pH= 3.4時(shí)2-(4-二甲氨基苯基)-5-氟-6-嗎啉-1-氫-苯并咪唑(1)與小牛胸腺DNA存在明顯的相互作用,分子(1)是一種潛在的測(cè)定DNA的定量試劑。因此,苯并咪唑化合物與DNA相互作用的研究,有助于人們從分子水平上了解藥物的作用機(jī)理,為設(shè)計(jì)臨床上以DNA為靶標(biāo)的藥物分子提供理論指導(dǎo)。
本文利用紫外光譜結(jié)合黏度法研究了2-羥甲基苯并咪唑與DNA的相互作用機(jī)理及作用方式,并進(jìn)一步求出它們的結(jié)合常數(shù)。
1.1 儀器與試劑
HP8453紫外光譜儀;烏貝路德黏度計(jì)(上海良晶玻璃儀器廠);pHS-2C型酸度計(jì)(上海虹益儀器儀表有限公司)。
2-羥甲基苯并咪唑按文獻(xiàn)方法合成和純化[3],配制成濃度為1.00×10-3mol.L-1儲(chǔ)備液;小牛胸腺DNA(Sigma公司),用含有50mmol/L NaCl的Tris-HCl(pH=7.40)緩沖溶液配制,其濃度確定見文獻(xiàn)[4],濃度為3.89×10-4mol/L,溶液保存于4℃冰箱中備用;0.05mol/L Tris-HCl溶液(pH=7.4);1mol/L NaCl溶液;所用試劑均為分析純,實(shí)驗(yàn)用水為二次蒸餾水。
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 紫外吸收光譜
分別取0.5mL 1.00×10-3mol.L-12-羥甲基苯并咪唑、不同體積3.89×10-4mol/L DNA溶液、2.0mL 0.05mol/L Tris-HCl(pH=7.4)緩沖溶液于10mL比色管中,用蒸餾水定容,混勻后放置30min,以相應(yīng)的DNA和Tris-HCl緩沖溶液為參比,測(cè)定其在200~400nm的紫外吸收光譜圖。
1.2.2 DNA黏度測(cè)定
用烏貝路德黏度計(jì)測(cè)量黏度,溫度恒定在(25 土0.1)℃。黏度測(cè)試中,固定DNA的濃度,2-羥甲基苯并咪唑濃度逐漸增加。測(cè)試液相對(duì)黏度的測(cè)量方法及計(jì)算見文獻(xiàn)[5]。
2.1 2-羥甲基苯并咪唑與DNA作用的紫外吸收光譜
2-羥甲基苯并咪唑與DNA相互作用的紫外吸收光譜圖如圖1所示。加入DNA后,沒(méi)有新的吸收峰出現(xiàn),但最大吸收波長(zhǎng)處的吸收峰強(qiáng)度隨DNA濃度的增大明顯減小,且吸收峰出現(xiàn)少許紅移。據(jù)Long E C[6]的研究結(jié)果,減色效應(yīng)、紅移現(xiàn)象是物質(zhì)與DNA發(fā)生嵌插作用的標(biāo)志。通常認(rèn)為,插入小分子與堿基對(duì)之間存在的堆積作用使得小分子的π*軌道與堿基的π軌道發(fā)生偶合,從而導(dǎo)致π-π*躍遷能量減小,產(chǎn)生紅移現(xiàn)象。同時(shí)偶合的π*軌道因部分填充電子,使得π-π*躍遷的概率減小,從而產(chǎn)生減色效應(yīng)。同時(shí)還看到在215nm
處出現(xiàn)等吸收點(diǎn),這說(shuō)明二者形成了穩(wěn)定的絡(luò)合物[7]。
圖1 不同DNA濃度下2-羥甲基苯并咪唑紫外吸收光譜圖
2.2 結(jié)合常數(shù)
可求小分子與DNA的結(jié)合常數(shù)kb。其中,εa為加有一定量DNA的2-羥甲基苯并咪唑的摩爾吸光系數(shù),εb為完全結(jié)合DNA后2-羥甲基苯并咪唑的摩爾吸光系數(shù),εf為未加DNA的2-羥甲基苯并咪唑的摩爾吸光系數(shù),CDNA為DNA的濃度。根據(jù)該公式,以CDNA/(εa-εf)對(duì)CDNA作圖得到直線(如圖2),直線的斜率與截距之比即為結(jié)合常數(shù)Kb,求得2-羥甲基苯并咪唑與ctDNA的結(jié)合常數(shù)Kb=5.2×107L·mol-1。
圖2 2-羥甲基苯并咪唑與DNA的結(jié)合常數(shù)
2.3 黏度實(shí)驗(yàn)
黏度法也被認(rèn)為是檢測(cè)小分子與DNA相互作用的重要依據(jù)之一[9]。當(dāng)小分子以嵌插模式與DNA結(jié)合時(shí),DNA的相鄰堿基對(duì)的距離會(huì)變大以容納插入的小分子,導(dǎo)致DNA雙螺旋伸長(zhǎng),DNA溶液的黏度增大;而以靜電或者溝槽模式結(jié)合,DNA溶液的黏度無(wú)明顯變化[10]。由圖3可見,隨著2-羥甲基苯并咪唑濃度的增大,DNA相對(duì)黏度不斷增大,表明2-羥甲基苯并咪唑以嵌插模式與DNA結(jié)合,這與2.1結(jié)論相一致。
2.4 離子強(qiáng)度的影響
離子強(qiáng)度對(duì)2-羥甲基苯并咪唑-DNA體系吸光度的影響如圖4所示,隨著NaCl濃度的增大,體系的吸光度幾乎沒(méi)有變化,說(shuō)明2-羥甲基苯并咪唑與DNA之間不存在靜電作用[11]。
圖3 2-羥甲基苯并咪唑?qū)NA黏度的影響
圖4 離子強(qiáng)度的影響
紫外光譜法、離子強(qiáng)度的影響及黏度實(shí)驗(yàn)表明,在pH=7.40的Tris-HCl緩沖體系中,2-羥甲基苯并咪唑以嵌插方式與DNA結(jié)合,測(cè)得結(jié)合常數(shù)為5.2×107L·mol-1。本文為苯并咪唑類藥物的藥理研究提供一定的理論依據(jù)。
[1]孟江平,耿蓉霞,周成合,等.苯并咪唑類藥物研究進(jìn)展[J].中國(guó)新藥雜志,2009,18(16)∶1506-1514.
[2]唐凌天,王毅,劉新起,等.光譜法研究2-(4-二甲氨基苯基)-5-氟-6-嗎啉-1-氫-苯并咪唑與小牛胸腺DNA的相互作用[J].光譜學(xué)與光譜分析,2005,25(10)∶1618-1621.
[3]陳偉.苯并咪唑衍生物的合成及其金屬配合物羰基化催化反應(yīng)研究[D].西安:西北大學(xué),2010.
[4]CATER M T,RODRIGUEZ M,BARD A J.Voltammetric studies of the interaction of metal chelates with DNA.2.Trischelated complexes of cobalt(III)and iron(II)with 1,10-phen?anthroline and 2,2'-bipyridine[J].J Am Chem Soc,1989,111 (24)∶8901-8911.
[5]劉幸平,胡潤(rùn)淮,杜薇.物理化學(xué)[M].北京∶科學(xué)出版社,2002,275.
[6]LONG E C,BARTON J K.On Demonstration DNA Interca?lation[J].Accounts Chem.Res.,1990,23(9)∶271-273.book=2016,ebook=27
O657.32
A
1673-2928(2016)06-0010-03
2016-03-11
郁有祝(1978-),男,山東臨沂人,安陽(yáng)工學(xué)院副教授,主要從事有機(jī)分析方面研究。