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        賽?;颍褐尾腄NA開始

        2016-11-17 08:04:18賀文
        IT經(jīng)理世界 2016年16期
        關鍵詞:數(shù)據(jù)庫智慧檢測

        賀文

        以“眾籌智慧”的方式,快速積聚專家人才,讓基因數(shù)據(jù)分析這一完全依賴人和設備的技術(shù)服務,越來越自動化、智能化。

        有沒有辦法將癌癥轉(zhuǎn)變?yōu)榭煽氐穆圆。?/p>

        “人類所有的疾病除了創(chuàng)傷以外都和遺傳基因相關,其實癌癥就是一種基因組疾病?!庇鄠煂γ绹鴩⑿l(wèi)生研究院(National Institutes ofHealth,NIH)院長弗朗西斯·柯林斯說過的這句話,一直記憶猶新,冥冥中他和同伴創(chuàng)業(yè)賽福基因也與這句話有關。

        如何通過基因?qū)用鎭矸乐伟┌Y?要通過基因檢測和與之相對應的解決方案。而現(xiàn)實的狀況是,中國目前還缺乏完整的數(shù)據(jù)庫,其次是生物信息分析和解讀時效低、成本高,此外基因檢測服務和臨床醫(yī)生之間存在斷層,有效溝通不足而導致檢測報告不容易被理解。基于這些痛點,賽?;驁F隊決定放棄美國的工作,回國創(chuàng)業(yè),他們的愿景是,結(jié)合生物信息學和分子醫(yī)學的技術(shù)去開發(fā)基因數(shù)據(jù)分析平臺,幫助醫(yī)生更精準地對疾病患者,尤其是癌癥病人的診斷分型與治療。

        眾籌智慧

        在創(chuàng)立賽?;蛑?,余偉師在NIH下屬的最大機構(gòu)——美國國家癌癥研究所從事博士后研究。那個時候關于基因測序“精準醫(yī)學”的計劃還沒有被美國總統(tǒng)奧巴馬正式提出來,他一直在思考一個問題:有沒有辦法讓這些研究基因數(shù)據(jù)的科研學者跟醫(yī)生合作把致癌的可控因素查出來,增強醫(yī)生對疾病診斷的準確率,提高癌癥治療的有效率,或者說把癌癥變成一種可控的慢性病。

        幸運的是,期間余偉師遇到了志同道合的人。創(chuàng)業(yè)初期,5個同伴,有住紐約的,有住新澤西的,有住華盛頓的,有學生物信息學的,有研究分子醫(yī)學的,有學分子遺傳學的,還有在耶魯大學讀應用數(shù)學的博士、畢業(yè)后開始做基因數(shù)據(jù)分析的,大家利用周末電話會議湊在一起,頭腦風暴,討論如何整合不同專業(yè)的專家學者智慧、把基因組數(shù)據(jù)分析的流程制定出來。

        余偉師本人有11年的基因和疾病相關領域的研究經(jīng)驗,2013年開始創(chuàng)建這個團隊,2015年帶著團隊回國創(chuàng)業(yè),其他的聯(lián)合創(chuàng)始人,比如,技術(shù)總監(jiān)劉湘濤是耶魯大學應用數(shù)學博士,市場負責人賈洪濤是俄亥俄州立大學生物醫(yī)學博士,運營負責人梁萌萌是南加州大學病理生物學博士。

        待到賽?;蚧貒鴦?chuàng)業(yè)時,已經(jīng)是整合了64位美國博士專家的團隊,通過兩年時間構(gòu)建了與基因有關的三大數(shù)據(jù)庫網(wǎng)絡——疾病、基因、藥物之間的關聯(lián),其中包括11000多種疾病相關的基因與基因突變位點信息;通過數(shù)據(jù)庫的整合,構(gòu)建自動化、智能化的基因數(shù)據(jù)分析平臺;同時他們也注意嚴格把控數(shù)據(jù)的安全性,將數(shù)據(jù)端、分析端和應用端隔離,從源頭杜絕數(shù)據(jù)的安全問題。

        在這個過程中,伴隨著基因數(shù)據(jù)量的增加,團隊如何解決專業(yè)分析與解讀的速度問題?“雖然說我們單個樣本分析能保證時效,如果大量的樣本數(shù)據(jù)未了怎么辦?我們從有這些想法起就開始以‘眾智的理念,眾籌智慧,吸收更多的專家學者參與進來?!庇鄠熃榻B,回國后,團隊專家一部分全職在北京,另一部分在海外以“顧問”的形式為賽?;蛱峁┲腔壑С帧?/p>

        其中是否涉及學術(shù)專利的問題?余偉師說,團隊對此相當謹慎。一方面,這些顧問在貢獻自己的知識智慧時,并不占用其所在機構(gòu)的資源,比如他原來做基因組分析是用老鼠做樣本,在賽?;虻念檰柗談t是將這些分析原理運用到人體樣本上;另一方面,針對疾病和癌癥,他們會利用一些公開的文獻數(shù)據(jù)庫,整合一些有價值的信息、以建立賽?;虻南嚓P數(shù)據(jù)庫,這也是“顧問”能夠貢獻智慧的;再者,賽福基因在美國也有自己的專業(yè)律師顧問,從一開始就對這些風險進行把控。

        “人”,以平臺的形式、共享經(jīng)濟的方式聚攏這些基因數(shù)據(jù)分析領域的專業(yè)人才,是賽?;虻囊淮髢?yōu)勢。余偉師介紹,在全球范圍來看,基因檢測技術(shù)領域里專家級別的人才,主要集中在美國,而且培養(yǎng)的成本都很高。相較而言,生物信息學在中國是這幾年才興起來的,而且基因檢測某種程度上是“綜合性”學科,真正要做生物信息學的分析,至少得有數(shù)學、生物學兩方面的專業(yè)背景,甚至是將計算機技術(shù)一起結(jié)合使用。同時,在中國做生物信息分析的成本非常高,還沒有非常專業(yè)的遺傳咨詢師,時效性就降低了,而且要從美國聘請相關專家回國成本相當高。

        搭建基因數(shù)據(jù)分析平臺

        如何以“眾籌智慧”的方式,快速積聚專家人才?如何讓基因數(shù)據(jù)分析這一完全依賴人和設備的技術(shù)服務,能夠越來越自動化、智能化?這是基因檢測領域的玩家們都在思考的,在中國這個領域的先進入者如華大基因,創(chuàng)新團隊如賽?;蚪允恰?/p>

        賽?;颥F(xiàn)在一方面在完善基因數(shù)據(jù)分析的相關數(shù)據(jù)庫建設,另一方面在推進自動化、智能化的基因數(shù)據(jù)分析平臺的IT化建設,最終要實現(xiàn)在平臺前端將客戶原始數(shù)據(jù)上傳,最后能夠看到相對簡單直接的數(shù)據(jù)解讀結(jié)果信息。

        在余偉師他們的設想中,當整合了一定數(shù)量的專家博士做平臺級的服務,慢慢建立中國人自己的數(shù)據(jù)庫,結(jié)合自動化、智能化的基因數(shù)據(jù)分析平臺,賽?;蚰芨咝У嘏c國內(nèi)的醫(yī)院、科研機構(gòu)、第三方檢測機構(gòu)進行深度合作。

        余偉師說,賽?;?qū)W⒂谥袊嘶蚪M大數(shù)據(jù)在健康管理與疾病診療領域的產(chǎn)業(yè)化應用,希望建立中國人的基因數(shù)據(jù)庫,也希望打造出國際一流的基因數(shù)據(jù)分析平臺。

        賽?;蛞环矫媾c之前醫(yī)院的合作項目不斷深入,比如北大腫瘤醫(yī)院,展開了多個項目的深度合作,在不同胃癌表型的臨床樣品中,挖掘潛在的與致病以及藥物敏感性相關的生物標志物,已經(jīng)取得了很好的結(jié)果;另一方面,在過去的幾個月內(nèi),憑借賽福基因數(shù)據(jù)分析與個性化解讀的核心優(yōu)勢,與國內(nèi)外十余家三甲醫(yī)院,以及美國克利夫蘭醫(yī)學中心(Cleavland Clinic)、美國俄亥俄州立大學醫(yī)學院等建立了緊密合作關系,其中包含臨床產(chǎn)品推廣與臨床基礎研發(fā),涉及腫瘤、心血管疾病、神經(jīng)性疾病、糖尿病、自閉癥等多種疾病的臨床診斷與治療。此外,賽?;蛞呀?jīng)與諾禾致源、藥明康德、云健康、海普諾斯、瑞奧康晨、百諾等第三方檢測機構(gòu)建立合作關系,就其各自的需求提供數(shù)據(jù)分析或解讀服務。

        相較于美國的基因檢測和抗癌藥物研發(fā),以及癌癥臨床治療之間已經(jīng)形成短期或中長期的互動關系,中國在這方面才剛剛起步。余偉師他們希望,賽福基因能夠?qū)⒅袊嘶蚪M數(shù)據(jù)庫規(guī)模做到百人基因組、千人基因組、萬人基因組……把更多的基因組數(shù)據(jù)收集起來,再去結(jié)合臨床的實驗、新藥的研發(fā),去推動精準醫(yī)療在中國的發(fā)展。關于數(shù)據(jù)共享與基因信息的保密機制,他們也樂意保持開放的態(tài)度與合作單位以及相關政府部門深入探討。

        當然,時間是最大的成本。余偉師他們樂觀估計,這個過程至少需要五年以上的時間。

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