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        MICA基因多態(tài)性與結直腸癌的易感關聯(lián)性研究

        2016-11-15 08:18:42鄒學森聶德魁王春陽呂賽平陳純靜
        實驗與檢驗醫(yī)學 2016年5期
        關鍵詞:易感性關聯(lián)性等位基因

        陳 恩,鄒學森,聶德魁,王春陽,呂賽平,陳 慧,陳純靜,林 琳

        (1、江西省腫瘤醫(yī)院檢驗科,江西南昌330029;2、豐城市婦幼保健計劃生育服務中心,江西豐城331100;3、中南大學湘雅醫(yī)學院免疫學系,湖南長沙410008;4、廈門醫(yī)學院基礎醫(yī)學部,福建廈門361008)

        MICA基因多態(tài)性與結直腸癌的易感關聯(lián)性研究

        陳 恩1,鄒學森1,聶德魁2,王春陽1,呂賽平1,陳 慧1,陳純靜3,林 琳4

        (1、江西省腫瘤醫(yī)院檢驗科,江西南昌330029;2、豐城市婦幼保健計劃生育服務中心,江西豐城331100;3、中南大學湘雅醫(yī)學院免疫學系,湖南長沙410008;4、廈門醫(yī)學院基礎醫(yī)學部,福建廈門361008)

        目的研究MICA等位基因多態(tài)性與結直腸癌易感性之間的關聯(lián)性。方法采用PCR-SSP和PCR-SBT方法對樣本MICA等位基因的多態(tài)性進行檢測。結果結直腸癌患者中檢出7種MICA等位基因;和對照組相比較,結直腸癌患者組中MICA*010等位基因分布頻率更高,可能是結直腸癌的易感基因(30.0%vs 6.2%,OR=6.43,95%CI:3.51-11.76,Pc<0.05),MICA*008和MICA*045等位基因分布頻率更低,可能是保護基因(MICA*008:14%vs 25.4%,OR=0.48,95%CI:0.29-0.78,Pc<0.05;MICA*045:2%vs 12.9%,OR=0.14,95%CI:0.05-0.40,Pc<0.05)。結論MICA等位基因多態(tài)性與結直腸癌的易感性間存在關聯(lián)性。

        MICA基因;基因多態(tài)性;結直腸癌

        結直腸癌(colorectal cancer,CRC)是較為常見的消化道惡性腫瘤,近年來在世界范圍內其發(fā)病率和死亡率總體呈不斷上升的趨勢。結直腸癌的發(fā)生發(fā)展與飲食、生活方式、危險因素暴露及基因變異等多種因素有關。MICA(MHC class I related chain A)是腫瘤相關基因,位于人類第6號染色體短臂,具有廣泛的多態(tài)性,1994年由美國西雅圖大學研究中心Spies教授領導的研究隊伍報道[1-3]。MICA編碼產(chǎn)物與HLAI類分子極其相似,包括信號肽、胞外α1、α2和α3結構,跨膜區(qū)和胞質區(qū),但不與β2球蛋白結合。MICA分子是NK細胞表面活化性受體NKG2D分子的配體,研究表明MICA基因的多態(tài)性與多種疾病易感性相關,但暫無與中國南方人群結直腸癌患者易感性相關的報道[4-7]。因此本研究以南方漢族結直腸癌人群為研究對象,以健康人群作為正常對照,對MICA基因多態(tài)性及結直腸癌易感性之間的關聯(lián)性進行研究。

        1 材料與方法

        1.1 研究對象100名結直腸癌患者來自于南華大學附屬南華醫(yī)院2012年10月-2014年10月的住院病人,均經(jīng)病理診斷或輔助診斷,符合結直腸癌診斷的要求?;颊咂骄挲g59.5歲(33歲~81歲),其中男性64例(64%),女性36例(36%)。120例健康人群作為對照,年齡35.0歲(18歲~75歲),其中男性82例(68%),女性38例(32%)。研究對象相互間無親緣關系,均簽署知情同意書,并符合倫理委員會的其它相關要求。

        1.2 外周血基因組DNA的提取收集新鮮的EDTA抗凝靜脈血2ml,采用WHO推薦的標準鹽析法提取DNA[8],測定波長260nm和280nm的OD值,A260/A280值在1.6~1.8范圍內為宜。

        1.3 MICA基因分型方法采用PCR-SSP(PCR sequence-specific primers)[9]與PCR-SBT(PCR sequence-based typing)[10,11]兩種不同的方法對樣本進行MICA基因分型。大部分樣本采用PCR-SSP方法進行分型,考慮到部分罕見MICA等位基因型別無法用PCR-SSP方法分析,采用PCR-SBT方法分析。PCR-SBT方法參照文獻[12,13],設計并合成一對外部引物,擴增引物序列如下:

        Forward:5'-CGTTCTTGTCCCTTGCCCGTGTG C-3',

        Reverse:5'-GATGCTGCCCCATTCCCTTCCCA A-3',

        擴增產(chǎn)物長度2.2kb。測序引物序列為:

        1F:5'-ATTTCCTGCCCCAGGAAGGTTGG-3';

        2R:5'-CAACTCTAGCAGAATTGGAG-3';

        3F:5'-AAGAGAAACAGCCCTGTTCCTCTCC-3'

        4R:'-GATGCTGCCCCATTCCCTTCCCAA-3'。

        引物合成及測序由華大生物公司完成。采用Chromas Lite 2.01軟件對測序結果進行分析,掃描MICA多態(tài)位點,進行人工判讀并與MICA序列數(shù)據(jù)庫中的標準序列進行比對,獲得相應的MICA等位基因型別。

        1.4 統(tǒng)計學分析MICA等位基因頻率、MICA基因型頻率、Hardy-Weinberg equilibrium(HWE)采用SHESIS軟件進行計算獲得。關聯(lián)性分析采用Logistic回歸進行統(tǒng)計分析,顯著性檢驗采用Fisher精確概率檢驗進行,對P值采用Bonferroni校正后得到的Pc值在5%水平上進行檢驗。

        2 結果

        2.1 Hardy-Weinberg平衡吻合度檢驗所選擇的健康對照經(jīng)Hardy-Weinberg平衡吻合度檢驗分析表明,各等位基因的分布理論頻率與觀察頻率之間無顯著性差異,表明本實驗所選樣本是符合Hardy-Weinberg平衡的隨機婚配群體。

        2.2 MICA基因PCR-SSP產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖圖1為一隨機研究對象的MICA基因PCR-SSP法擴增產(chǎn)物電泳圖,參照MICA分型格局表對其基因型進行分析判斷,該隨機研究對象MICA基因型為MICA*01201/01201。

        圖1 一隨機研究對象的MICA PCR產(chǎn)物電泳圖譜M:Marker;1~67為67個引物對,68孔為空白對照。

        1.5.3 MICA等位基因多態(tài)性與結直腸癌相關性分析結直腸癌患者中共檢出7種MICA等位基因,其中MICA*010、MICA*019、MICA*002是患者組中分布頻率最高的3種等位基因,分別占30.0%、22.0%、20.0%。和對照組相比較,結直腸癌患者組中MICA*010等位基因分布頻率顯著偏高(30.0% vs 6.2%,OR=6.43,95%CI:3.51~11.76,Pc<0.05);MICA*010等位基因可能對結直腸癌易感(OR= 6.43,95%CI:3.51~11.76,Pc<0.05);。MICA*008和MICA*045等位基因在結直腸癌患者組分布頻率顯著偏低(MICA*008:14.0%vs 25.4%,OR= 0.48,95%CI:0.29~0.78,Pc<0.05;MICA*045:2.0% vs 12.9%,OR=0.14,95%CI:0.05~0.45,Pc<0.05),見表1。

        1.5.4 MICA-STR基因多態(tài)性與結直腸癌關聯(lián)性分析結直腸癌患者中共檢出5種MICA-STR等位基因,其中MICA-A5在結直腸癌患者組中分布頻率最高,占52.0%,與對照組比較,結直腸癌患者組中MICA-A5等位基因顯著升高(52%vs 35.4%,OR=1.98,95%CI:1.35~2.90,Pc<0.05);MICA-A5.1等位基因分布則顯著降低(14.0%vs 25.4%,OR= 0.48,95%CI:0.29~0.78,Pc<0.05)(見表2)。

        1.5.5 MICA基因型與結直腸癌相關性分析和對照組相比較,結直腸癌患者組MICA*008/008基因型分布頻率顯著減少(2.0%vs 10.8%,OR= 0.17,95%CI:0.04~0.76,Pc<0.05);MICA*002/010、MICA*010/010基因型分布顯著升高(MICA*002/ 010:14.0%vs 4.2%,OR=3.74,95%CI:1.30~10.79,Pc<0.05;MICA*010/010:16.0%vs0.8%,OR= 22.67,95%CI:2.95~174.24,Pc<0.05)(見表3)。

        3 討論

        結直腸癌是常見的消化道惡性腫瘤,其在世界范圍內的發(fā)病率和死亡率總體呈不斷上升的趨勢。在我國,隨著經(jīng)濟社會發(fā)展和人們生活水平提高,包括飲食、生活方式在內的多種環(huán)境因素都在不斷的發(fā)生變化,直腸癌的發(fā)病率也呈逐年上升的趨勢[14]。結直腸癌的發(fā)病機制復雜,其發(fā)生受飲食、生活方式、環(huán)境因素、遺傳因素、致癌物的暴露強度、種族、地域等多種因素影響。近年來,直結腸癌的遺傳易感性機制在其發(fā)病中的意義越來越引起人們的重視,大量的研究開始關注于直結腸癌發(fā)病與基因多態(tài)性之間的關聯(lián)性研究。研究表明,MMP-7基因多態(tài)性可能是直腸癌進展的一個因素;XRCC2基因多態(tài)性與直腸癌發(fā)病風險存在關聯(lián)性;IGFBP7 rs11133472AG、rs1718848AG基因型增加直腸癌患病風險[15-17];以上研究結果充分說明,直結腸癌的發(fā)生發(fā)展與遺傳因素密切相關;結直腸癌的發(fā)生是多種基因共同作用的結果;單一基因對結直腸癌的發(fā)生作用有限;因此需對結直腸癌與基因多態(tài)性之間的關聯(lián)進行深入研究。

        表1 MICA等位基因頻率在結直腸癌病人與對照人群中的比較

        表2 MICA-STR等位基因頻率在肺癌病人與對照人群中的比較

        表3 MICA基因型頻率在結直腸癌病人與對照人群中的比較

        MICA基因具有高度的多態(tài)性,目前已報道超過100個基因型。MICA基因的高度多態(tài)性與腫瘤、自身免疫病等多種疾病發(fā)生發(fā)展相關[14-16]。根據(jù)編碼跨膜區(qū)DNA序列微衛(wèi)星GCT重復次數(shù)的不同,已發(fā)現(xiàn)有A4、A5、A5.1、A6、A7、A9和A10等MICA跨膜區(qū)微衛(wèi)星基因型。A5.1與其他微衛(wèi)星基因型主要區(qū)別在于第952位處插入了一個鳥嘌呤核苷酸殘基,導致移碼突變,這種變異的MICA分子在翻譯部分跨膜結構后遇終止密碼而被中斷,從而使MICA-A5.1分子僅含有部分膜區(qū)結構,但胞漿尾部結構完全缺失[18]。Gambelunghe G等發(fā)現(xiàn),MICA-A5.1基因與SLE易感正相關[19]。邢永華等人通過對青?;刈逦赴┤巳旱腗ICA-TM等位基因的分型研究發(fā)現(xiàn),MICA-A5.1基因是胃癌易感相關基因[20]。Zhao J等人近來研究表明,功能性的MICA-129基因多態(tài)性與潰瘍性結腸炎的發(fā)病呈正相關[21]。Garcia G等人發(fā)現(xiàn)MICA*008型別為登革熱發(fā)病的易感基因[22],MICA-A5.1與多種疾病的易感之間具有關聯(lián)性[23]。

        我們采用PCR-SSP及PCR-SBT方法檢測了結直腸癌患者中MICA等位基因分布的情況,首次報道了MICA等位基因在中國南方人群結直腸癌患者中的分布頻率。我們的研究發(fā)現(xiàn),結直腸癌患者中共檢出7種MICA等位基因,其中MICA *010、MICA*019、MICA*002是患者組中分布頻率最高的3種等位基因。MICA*008和MICA*045等位基因在結直腸癌患者組分布頻率較少,提示為結直腸癌的保護性等位基因(OR<1,Pc<0.05)。MICA*010等位基因在結直腸癌患者組分布較多,提示為結直腸癌的易感性等位基因(OR>1,Pc<0.05)。結直腸癌患者中共檢出5種MICA-STR等位基因,其中MICA-A5在直結腸癌患者組中分布頻率最高,提示為結直腸癌的易感性等位基因OR>1,Pc<0.05);MICA-A5.1在結直腸癌患者中分布較少,提示為結直腸癌的保護性等位基因(OR<1,Pc<0.05);這些結果提示結直腸癌的發(fā)生發(fā)展與MICA基因的多態(tài)性之間存在關聯(lián)。推測可能的致病機制是由于某些型別的MICA基因編碼的蛋白質分子與NK細胞、CD8+T細胞上的NKG2D受體親和力低,導致這些免疫細胞不能有效活化,對腫瘤細胞不能發(fā)揮正常的免疫監(jiān)視功能所致。特別的是,在本次研究中我們發(fā)現(xiàn),結直腸癌患者人群中MICA-A5.1分布率低,可能原因有二,一是標本數(shù)量偏少,二是直結腸癌腫瘤細胞表面MICA的α3區(qū)域與ERp5形成復合物,使得MICA可以被ADAM裂解,誘生可溶性的MICA(sMICA),即“MICA脫落”現(xiàn)象[24]。裂解下來的sMICA與NKG2D相互作用,然后誘導其內化及降解,并刺激免疫抑制性T細胞的增殖,使得MICA-A5.1等位基因表現(xiàn)出對結直腸癌不易感。然而結直腸癌的發(fā)生是環(huán)境和遺傳因素交互作用的結果,是一種多因素、多階段、多基因導致的疾病,目前仍不清楚MICA基因是如何獨立于其他基因對結直腸癌的發(fā)生發(fā)展起作用的機制,且不同人群中MICA基因型分布不完全相同。因此,我們將對不同地區(qū)及種族之間多個基因的多態(tài)性與結直腸癌易感性之間的關系進行進一步研究。

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        Study on the association between MICA gene polymorphism and colorectal cancer

        CHEN En1,ZOU Xuesen1,NIE Dekui2,WANG Chunyang1,LV Saiping1,CHEN Hui1,CHEN Chunjing3,LIN Lin4.
        1.Clincal Laboratory,Jiangxi Province Tumor Hospital,Nanchang 330029,China;2.Maternal And Child Health Care Family Planning Service Center of Fengcheng,F(xiàn)engcheng Jiangxi 331100,China;3.Department of Immunology,College of Basic Medical Sciences,Central South University,Changsha 410078,China;4.Faculty of Basic Medical Sciences,Xiamen Medical College,Xiamen Fujian 361008,China.

        Objective To study the association between the MICA gene polymorphism and susceptibility to colorectal cancer. Methods PCR-SSP and PCR-SBT were used to analyze the gene polymorphism of MICA in 100 colorectal cancer patients and 120 healthy individuals.Results Seven allele genes were found in the participants,the phenotype frequency of MICA*010 was higher in colorectal cancer patients when compared with healthy controls,presenting genic susceptibility to colorectal cancer(30. 0%vs 6.2%,OR=6.43,95%CI:3.51-11.76,Pc<0.05).Additionally,MICA*008 and MICA*045 were less frequent among patients(MICA*008:14%vs 25.4%in healthy controls,Pc<0.05,OR=0.48,95%CI:0.29-0.78;MICA*045:2%vs 12.9%in healthy controls,Pc<0.05,OR=0.14,95%CI:0.05-0.40),presenting genic protection to colorectal cancer.Conclusions These results suggest that the MICA allele gene polymorphism may be associated with susceptibility to colorectal cancer.

        MICA alleles;Gene polymorphism;Colorectal cancer

        R574.63,R446.62

        A

        1674-1129(2016)05-0545-05

        10.3969/j.issn.1674-1129.2016.05.003

        2016-05-18;

        2016-07-07)

        江西省衛(wèi)生計生委科技計劃項目(20165393)

        陳恩,1982年11月生,男,主管檢驗師,醫(yī)學博士,中南大學免疫學專業(yè)畢業(yè),主要從事遺傳免疫研究。TEL:079188313884;E-mail:cheneng3821@sina.com.

        林琳,1979年6月生,女,講師,醫(yī)學博士,中南大學免疫學專業(yè)畢業(yè),主要從事遺傳免疫研究。TEL:05922110642;E-mail:lynnvenn@sina.com.

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