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        雙源CT冠狀動(dòng)脈三維分割算法的研究*

        2016-11-09 08:32:12趙潔蔣世忠黃展鵬歐陜興
        生物醫(yī)學(xué)工程研究 2016年3期
        關(guān)鍵詞:管狀鄰域灰度

        趙潔,蔣世忠,黃展鵬,歐陜興

        (1.廣東藥科大學(xué)醫(yī)藥信息工程學(xué)院,廣州510006;2.南方醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院廣東省醫(yī)學(xué)圖像處理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣州510515;3.廣州軍區(qū)總醫(yī)院放射科,廣州510010)

        1 引 言

        據(jù)世界衛(wèi)生組織2008年公布的統(tǒng)計(jì)結(jié)果,冠心病是當(dāng)前世界范圍內(nèi)引發(fā)死亡的主要原因[1]。早診斷、早治療是降低死亡率的方法。雙源CT圖像采集速度比多層螺旋CT快,可以在一個(gè)心動(dòng)周期內(nèi)采集心臟圖像,并且輻射劑量要減少一半以上,在冠心病診斷中發(fā)揮著重要作用。但是,一名患者的心臟CT一般要產(chǎn)生大于400張圖像,讀片會(huì)耗費(fèi)醫(yī)生大量精力,增加誤判率。如何幫助醫(yī)生從大量CTA數(shù)據(jù)中準(zhǔn)確快速的分割出冠狀動(dòng)脈,是我們研究的主要問題[2]。

        冠狀動(dòng)脈的快速準(zhǔn)確分割是血管定量、定性測量和疾病診斷的前提。但是由于心臟CTA圖像數(shù)據(jù)量大、冠狀動(dòng)脈和其周邊組織灰度比較相近、運(yùn)動(dòng)偽影和外部磁場引起的噪聲干擾等問題,準(zhǔn)確分割非常困難。目前,國內(nèi)外對冠狀動(dòng)脈提取常規(guī)的方法分有:區(qū)域生長法、統(tǒng)計(jì)學(xué)方法、活動(dòng)輪廓模型法、中心線法、多尺度模型,下面是幾種方法的介紹[3-4]。

        區(qū)域生長法較為簡單,速度快,但是生長條件和種子點(diǎn)需人為指定,由于冠狀動(dòng)脈與心室灰度相近,當(dāng)受到噪聲和對比劑不均勻影響時(shí),目標(biāo)局部會(huì)出現(xiàn)孔洞和泄露問題。Metz等[5]在經(jīng)典區(qū)域生長算法的基礎(chǔ)上加入分支和泄露檢測,提取出冠狀動(dòng)脈的三個(gè)大的血管分支,但是小分支仍無法分割。楊榮騫等[6,7]用形態(tài)學(xué)方法和區(qū)域生長法從雙源CT數(shù)據(jù)中分割出心腔和冠狀動(dòng)脈。Tuchschmid等[8]用波傳播技術(shù),通過與空間結(jié)構(gòu)一致的方向生長出冠狀動(dòng)脈。

        統(tǒng)計(jì)學(xué)方法包括聚類法、分類器法、馬爾科夫模型等。Yan Yang在2004年IEEE EMBS國際會(huì)議[9]提出一種基于CT的冠狀動(dòng)脈三維分割算法,具有一定代表性。Lacoste C等[10]利用Markov標(biāo)記點(diǎn)進(jìn)行2D造影圖像的冠狀動(dòng)脈分割,但是,目前該方法僅限于2D數(shù)據(jù),由于3D造影數(shù)據(jù)計(jì)算量龐大,尚未能擴(kuò)展。

        活動(dòng)輪廓法在醫(yī)學(xué)圖像分割上用的較多,效果較好。1988年,Osher和 Sethian[11]提出了利用水平集方法來求解幾何曲線的演化。水平集的演化曲線是閉合的,可以較好的收斂到目標(biāo)邊緣。但是,傳統(tǒng)水平集存在對噪聲敏感,弱邊緣不易檢測,易越過邊緣的問題[12]。在對冠狀動(dòng)脈分割上,選取的初始輪廓必須在目標(biāo)附近,并且由于和鄰近組織灰度相近,容易擴(kuò)展到心腔。針對血管泄露問題,Yan Yang等[13]通過在水平集中加入統(tǒng)計(jì)信息進(jìn)行了改進(jìn),可以分割出左冠狀動(dòng)脈,左前降支,左旋支和右冠狀動(dòng)脈的主干,但是更細(xì)的血管未實(shí)現(xiàn)分割。

        中心線血管分割主要包括:(1)跟蹤法,(2)最小路徑技術(shù)。跟蹤法通常需要在初始點(diǎn)和分支點(diǎn)進(jìn)行人工交互,為了自動(dòng)判斷分支結(jié)構(gòu),Piasque[14]提出利用球和平行六面體的連通分量來判斷,蔣世忠、趙潔[15]和黃展鵬[16]提出構(gòu)造球模型,通過層次聚類算法來自動(dòng)判斷分支。最小路徑技術(shù)有利于局部病變血管的提取,快速行進(jìn)法是最小路徑技術(shù)的優(yōu)化,可通過優(yōu)化計(jì)算代價(jià)函數(shù)的歐幾里得距離,產(chǎn)生亞像素精度的血管路徑[5]。

        通過在不同尺度下分析Hessian矩陣的特征值,可以判斷每一個(gè)體素點(diǎn)是否屬于管狀結(jié)構(gòu)。基于多尺度空間,F(xiàn)rangi[17]提出血管增強(qiáng)方法,Manniesing[18]提出血管增強(qiáng)擴(kuò)散模型,均可以有效增強(qiáng)圖像中的管狀結(jié)構(gòu)。

        由于心臟CTA圖像數(shù)據(jù)量大、冠狀動(dòng)脈和其周邊組織灰度比較相近、運(yùn)動(dòng)偽影和外部磁場會(huì)引起噪聲干擾等因素,血管的準(zhǔn)確分割非常困難,而錯(cuò)誤的分割會(huì)使重建和測量精確度受到影響,影響醫(yī)生診斷。在已有的心臟血管分割文獻(xiàn)中,一些方法在二維圖像中可以很好的分割出血管,但是模型復(fù)雜、速度較慢,并不適合三維分割。本研究提出的三維自動(dòng)分割方法,考慮了血管的形態(tài)、灰度和鄰域特征,基于Hessian矩陣、統(tǒng)計(jì)模型和26鄰域生長算法,可以自動(dòng)分割冠狀動(dòng)脈并精確測量血管狹窄信息。

        2 算法設(shè)計(jì)

        為了檢測血管,本算法同時(shí)從血管形態(tài)、灰度特征和鄰域關(guān)系三個(gè)方面考慮。血管的形態(tài)是管狀的,通過對每個(gè)像素點(diǎn)求Hessian矩陣的特征值增強(qiáng)管狀結(jié)構(gòu)。增強(qiáng)后的圖像,血管區(qū)域灰度偏亮,背景區(qū)域偏暗,利用統(tǒng)計(jì)模型,對血管類和背景類進(jìn)行高斯建模。在血管類中,通過26鄰域生長來約束鄰域關(guān)系,生長出冠狀動(dòng)脈。算法的流程見圖1。

        圖1 算法流程圖Fig 1 the flow chart of the proposed method

        3 Hessian矩陣

        Hessian矩陣可用來區(qū)分圖像中的管狀,片狀,點(diǎn)狀結(jié)構(gòu)。冠狀動(dòng)脈的形態(tài)是近似管狀,因此,利用Hessian矩陣的多尺度濾波可去除其他結(jié)構(gòu),增強(qiáng)血管。首先,對每個(gè)體素做Hessian矩陣運(yùn)算,見公式(1)。

        Hessian矩陣的差分被定義為圖像與δ階高斯倒數(shù)的卷積,見公式(2)。

        對每個(gè)體素點(diǎn)的Hessian矩陣計(jì)算特征值λ1,λ2和λ3。特征值判斷準(zhǔn)則見公式(3),可以區(qū)分管狀結(jié)構(gòu),如血管[15]。

        Frangi定義了血管檢測的方程:

        其中:

        為增強(qiáng)冠狀動(dòng)脈,消除其他組織和主動(dòng)脈,濾波尺度定為[13],步長為0.5。

        4 概率決策分類

        高斯混合模型假設(shè)每一類組織符合同一高斯分布,整個(gè)體數(shù)據(jù)的分布由各組織類的高斯概率線性組合而成。

        在上一步驟中,通過Hessian矩陣增強(qiáng)了圖像中的管狀結(jié)構(gòu)。假設(shè)增強(qiáng)后的圖像分為2類,分別為背景和管狀區(qū)。管狀區(qū)包含血管、骨骼等管狀結(jié)構(gòu)和少量噪聲??偟捏w數(shù)據(jù)概率分布由這2類組織的高斯概率密度混合而成,見式(5),wk為每一類所占的權(quán)重。

        每一類組織符合同一高斯分布,見式(6)。

        參數(shù)wk,uk,σk依靠最大期望算法估計(jì)。

        E步利用分布參數(shù)計(jì)算每個(gè)實(shí)例的聚類概率,見式(7),t代表迭代步數(shù)。

        M步用最大似然估計(jì)重新估計(jì)分布參數(shù),得到:

        EM兩步反復(fù)迭代直至收斂,得到高斯混合模型的參數(shù)。然后對每一個(gè)體素判別屬于哪一類,判別條件為 wkp(x|k)>wjp(x|j),k~=j(luò)時(shí)屬于第 k類[19-20]。

        5 三維區(qū)域生長

        概率決策分類后數(shù)據(jù)被分為2類,血管類和背景[21]。在冠狀動(dòng)脈上設(shè)置種子點(diǎn),在三維體數(shù)據(jù)中進(jìn)行區(qū)域生長,生長步驟如下:

        (1)將種子點(diǎn)標(biāo)記為1。

        (2)搜索種子點(diǎn)26鄰域,如果閾值小于設(shè)定值,則合并到種子區(qū)域,并將其置為1。

        (3)直到無鄰域點(diǎn)滿足條件時(shí)生長截止。

        由于在三維區(qū)域生長算法之前約束了血管形狀和灰度,去除了心室等區(qū)域,可以在生長過程中避免泄漏。

        6 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)來自廣州軍區(qū)總醫(yī)院的SOMATOM Definition雙源CT,采用心電門控技術(shù)獲取的心臟雙源CT三維數(shù)據(jù),分辨率為512×512×411。圖2為位于一組CT序列的第1幀、第40幀和第60幀切片。

        圖2 心臟CTA圖像(第1、40、60幀)Fig 2 Cardiac Computed tomography angiography images(slice1,slice40,slice60)

        從圖2第40幀和第60幀切片可以看出,左前降支與左回旋支均和左心室空間相鄰并且灰度接近。如果直接使用區(qū)域生長或活動(dòng)輪廓等方法進(jìn)行分割,會(huì)發(fā)生灰度泄露。

        用本研究提出的新方法,首先對體數(shù)據(jù)每個(gè)像素進(jìn)行Hessian運(yùn)算,利用式(4)檢測出血管,得到圖3,可以看出管狀結(jié)構(gòu)被增強(qiáng)。

        圖3 多尺度濾波結(jié)果(第1、40、60幀)Fig 3 Multi-scale filtering results(slice1,slice40,slice60)

        用雙高斯模型,多尺度濾波后的數(shù)據(jù)可分為背景和血管兩大類,因此,三維的血管分割問題變?yōu)榱穗p高斯模型的參數(shù)估計(jì)問題。根據(jù)EM算法,估計(jì)出每一類組織的均值和方差,擬合出圖4。

        圖4 雙高斯直方圖擬合Fig 4 Double Gaussian histogram fitting

        以圖4中的參數(shù)進(jìn)行分割,得到分類結(jié)果,黑色為背景,白色為血管,見圖5。

        圖5 統(tǒng)計(jì)分類結(jié)果(第1、40、60幀)Fig 5 Statistical classification results(slice1,slice40,slice60)

        在冠狀動(dòng)脈與升主動(dòng)脈結(jié)合部分任選1點(diǎn)作為種子點(diǎn),進(jìn)行26鄰域區(qū)域生長,生長結(jié)果見圖6。因?yàn)榉诸惤Y(jié)果已被處理為黑白圖,所以生長速度非???。

        圖6 三維區(qū)域生長結(jié)果(第1、40、60幀)Fig 6 Three dimensional region growing results(slice1,slice40,slice60)

        將分割好冠狀動(dòng)脈進(jìn)行三維重建,可以看到血管的三維效果圖,見圖7,左冠狀動(dòng)脈重建效果較好,避免了血管泄露問題,無偽血管,動(dòng)脈狹窄清晰可見。

        圖7 左冠狀動(dòng)脈三維重建結(jié)果Fig 7 Three dimensional reconstruction of left coronary artery

        圖8 中心線提取結(jié)果Fig 8 Centerline extraction result

        圖8中明顯有冠狀動(dòng)脈狹窄,狹窄處僅為1~2個(gè)像素寬,但本文算法依然可以正確分割,沒有發(fā)生斷裂。

        為了對所提算法進(jìn)行定量分析,本研究測試了MICCAI08中已手工標(biāo)注了冠狀動(dòng)脈中心線的數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)來源于SOMATOM Definition,分辨率為512×512×288。圖9為算法分割的冠狀動(dòng)脈中心線與金標(biāo)準(zhǔn)之間的對比。

        根據(jù)鹿特丹冠狀動(dòng)脈評(píng)價(jià)軟件計(jì)算[22],本研究分割的中心線與金標(biāo)準(zhǔn)之間的重合率為89%,經(jīng)廣州軍區(qū)總醫(yī)院放射科醫(yī)生評(píng)價(jià),主要的三級(jí)冠狀動(dòng)脈基本提取,符合醫(yī)學(xué)診斷要求。

        7 小結(jié)

        本研究所提算法結(jié)合了血管灰度特征、形態(tài)特征和結(jié)構(gòu)特征,基于統(tǒng)計(jì)分類,多尺度Hessian血管增強(qiáng)和三維區(qū)域生長構(gòu)建出心臟血管模型。新算法對冠狀動(dòng)脈的分割比較準(zhǔn)確,避免了灰度泄露等問題,重建效果好,能很好的應(yīng)用于心臟雙源CTA序列圖像。正確的分割出冠狀動(dòng)脈是心血管疾病診斷的基礎(chǔ),下一步工作要解決的問題是自動(dòng)檢測冠狀動(dòng)脈狹窄,輔助醫(yī)生實(shí)施合理的心血管疾病輔助診斷和心臟手術(shù)規(guī)劃。

        圖9 本文算法中心線分割結(jié)果與金標(biāo)準(zhǔn)比較(a)本文算法;(b)金標(biāo)準(zhǔn)Fig 9 Comparison between the results of the proposed method and golden standard(a)the proposed algorithm(b)golden standard

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