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        人LDH-B 基因克隆及其真核表達(dá)載體的構(gòu)建*

        2016-11-05 07:52:17胡湘麟卿鑫曾凡才
        現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生 2016年20期
        關(guān)鍵詞:雙酶細(xì)胞系克隆

        胡湘麟,卿鑫,曾凡才△

        (西南醫(yī)科大學(xué):1.臨床醫(yī)學(xué)院;2.生物化學(xué)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室,四川瀘州646000)

        人LDH-B 基因克隆及其真核表達(dá)載體的構(gòu)建*

        胡湘麟1,卿鑫2,曾凡才2△

        (西南醫(yī)科大學(xué):1.臨床醫(yī)學(xué)院;2.生物化學(xué)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室,四川瀘州646000)

        目的克隆人乳酸脫氫酶B(LDH-B)基因并構(gòu)建其真核表達(dá)載體。方法提取人乳腺癌細(xì)胞系MDA-MB-231的總RNA,逆轉(zhuǎn)錄生成cDNA,以cDNA為模板,采用PCR擴(kuò)增獲得LDH-B基因編碼區(qū)序列片段,限制性核酸內(nèi)切酶Bam HⅠ和KpnⅠ雙酶切LDH-B基因片段及pUC19質(zhì)粒,連接反應(yīng)構(gòu)建pUC19-LDH-B克隆載體,并將其轉(zhuǎn)入大腸埃希菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,藍(lán)白篩選挑取白色菌落,酶切驗(yàn)證后測(cè)序鑒定。將序列正確的LDH-B基因亞克隆到pcDNA3.1(-)載體上,構(gòu)建LDH-B真核表達(dá)載體pcDNA3.1(-)-LDH-B。結(jié)果PCR擴(kuò)增后可見約1.0 kb的特異性條帶,與預(yù)期的LDH-B片段長(zhǎng)度相符合;Bam HⅠ和KpnⅠ雙酶切pUC19-LDH-B后可見約2.6 kb和1.0 kb的條帶,分別與pUC19和LDH-B的片段長(zhǎng)度相符合,LDH-B測(cè)序結(jié)果與DNA序列數(shù)據(jù)庫(Genebank)中的參考序列相一致;Bam HⅠ和KpnⅠ雙酶切pcDNA3.1(-)-LDH-B后可見約5.5 kb和1.0 kb的條帶,分別與pcDNA3.1(-)和LDH-B的片段長(zhǎng)度相符合。結(jié)論成功克隆了人LDH-B基因,并構(gòu)建了其真核表達(dá)載體,為進(jìn)一步探究LDH-B的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。

        L-乳酸脫氫酶;基因;克隆,分子;遺傳載體;真核細(xì)胞

        乳酸脫氫酶(LDH)是糖酵解最后一步反應(yīng)中負(fù)責(zé)催化丙酮酸與乳酸相互轉(zhuǎn)變的一組同工酶,是由LDH-A和LDH-B 2種亞基以不同的比例組裝而成,主要有LDH1(B4)、LDH2(A1B3)、LDH3(A2B2)、LDH4(A3B1)、LDH5(A4)5種形式。通常情況下,LDH1和LDH2存在于心肌并催化乳酸生成丙酮酸,而LDH4和LDH5存在于骨骼肌并催化丙酮酸生成乳酸,即四聚體中LDH-A的比例越高,則該同工酶催化丙酮酸發(fā)生乳酸反應(yīng)的能力也就越強(qiáng)。研究發(fā)現(xiàn),LDH4和LDH5還普遍高表達(dá)于惡性腫瘤組織中,通過上調(diào)LDH-A/LDH-B比例,促進(jìn)腫瘤乳酸產(chǎn)生,造成組織乳酸堆積,密切影響著腫瘤的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移。抑制LDH-A以減少乳酸生成被認(rèn)為是抗腫瘤治療的理想靶點(diǎn)之一[1-2]。

        LDH-B作為構(gòu)成LDH的另一種亞基形式,有著與LDH-A相反方向的催化功能。Bonuccelli等[3]在免疫組織化學(xué)染色中發(fā)現(xiàn),LDH-B會(huì)選擇性地高表達(dá)于乳腺癌的腫瘤間質(zhì),可能在支持癌細(xì)胞的生長(zhǎng)上同樣發(fā)揮著作用。目前,LDH-A在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中的作用已備受關(guān)注和論述,而有關(guān)LDH-B與腫瘤關(guān)系的研究卻仍需進(jìn)一步闡明。因此,本實(shí)驗(yàn)研究旨在克隆人LDH-B基因,并通過構(gòu)建其真核表達(dá)載體,為進(jìn)一步探究LDH-B的生物學(xué)功能做好準(zhǔn)備。

        1 材料與方法

        1.1儀器與試劑T100型PCR擴(kuò)增儀、凝膠成像分析系統(tǒng)購自美國Bio-Rad公司,TGL-16R型低溫高速離心機(jī)購自珠海黑馬醫(yī)學(xué)儀器有限公司,ZHWY-2102C型恒溫?fù)u床購自上海智成分析儀器制造有限公司,電泳儀及水平電泳槽購自北京君意東方電泳設(shè)備有限公司。人乳腺癌MDA-MB-231細(xì)胞系、大腸埃希菌DH5α感受態(tài)菌株、pcDNA3.1(-)質(zhì)粒均為本實(shí)驗(yàn)室保存,質(zhì)粒抽提試劑盒、DNA瓊脂糖凝膠回收試劑盒均購自北京天根生化科技有限公司,PCR產(chǎn)物純化試劑盒購自Roche公司,Trizol total RNA提取試劑盒、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒、PCR試劑盒、pUC19質(zhì)粒、Taq DNA聚合酶、Bam HⅠ和KpnⅠ限制性核酸內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶均購自大連寶生物(TaKaRa)公司。

        1.2方法

        1.2.1引物設(shè)計(jì)根據(jù)DNA序列數(shù)據(jù)庫(Genebank)所提供的人LDH-B基因mRNA序列(NM_002300.6),使用Primer Premier 5.0軟件進(jìn)行引物設(shè)計(jì),引物由上海Invitrogen公司合成。上游引物序列:5′-CGGGATCCAAAATGGCAACTCTTAAGG-3′,雙下劃線處為BamHⅠ酶切位點(diǎn),單下劃線處為起始密碼子,5′端加入2個(gè)保護(hù)堿基;下游引物序列:5′-GGGGTACCTCACAGGTCTTTTAGGTC-3′,雙下劃線處為KpnⅠ酶切位點(diǎn),單下劃線處為終止密碼子,5′端加入2個(gè)保護(hù)堿基。PCR擴(kuò)增目標(biāo)片段長(zhǎng)度為1 006 bp。

        1.2.2細(xì)胞總RNA的提取與逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)MDA-MB-231細(xì)胞系培養(yǎng)于含有10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基中,37℃、5%CO2孵箱中待細(xì)胞生長(zhǎng)近80%呈融合狀態(tài)時(shí)收集細(xì)胞,使用Trizol total RNA試劑盒提取細(xì)胞總RNA,超微量紫外分光光度計(jì)測(cè)定總RNA濃度及吸光度(A)值??俁NA量固定為1 μg,使用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA,操作嚴(yán)格按照試劑盒說明書進(jìn)行。以cDNA為模板,PCR擴(kuò)增LDH-B基因片段,共20.0 μL反應(yīng)體系:15.4 μL ddH2O(雙蒸水),2.0 μL 10×Taq buffer,0.4 μL Taq DNA聚合酶,0.4 μL dNTP mixture of 10 mmol/L,0.4 μL正向引物(10.0μmol/L),0.4 μL反向引物(10.0 μmol/L)和1.0 μL cDNA;反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性3min后,95℃變性30s,61℃退火30 s,

        72℃延伸1 min,重復(fù)34個(gè)循環(huán),72℃最后延伸5 min。PCR產(chǎn)物行1%瓊脂糖凝膠電泳(120 V,30 min),溴化乙錠(ethidium bromide,EB)染色成像。

        1.2.3LDH-B克隆載體的構(gòu)建與鑒定紫外光下切取上述包含目的條帶的凝膠塊,使用DNA瓊脂糖凝膠回收試劑盒回收目的片段。Bam HⅠ和KpnⅠ雙酶切膠回收產(chǎn)物及pUC19質(zhì)粒,根據(jù)1.0μL酶最大能切1.0μg DNA配置20.0μL酶切體系,37℃酶切1 h,酶切產(chǎn)物使用PCR產(chǎn)物純化試劑盒進(jìn)行純化,測(cè)量純化后DNA的濃度及OD值。取酶切純化后的pUC19載體DNA1.0μL(約50ng),酶切純化后的目的基因片段20.0μL(約200ng),10×連接緩沖液5.0 μL,T4 DNA連接酶1.0 μL,加雙蒸水至連接體系50.0μL,16℃連接過夜。取10.0μL連接液迅速加入至100.0 μL的DH5α感受態(tài)細(xì)菌中,冰浴30 min,42℃熱激50 s,再次冰浴2 min,加入1 mL的LB液體培養(yǎng)基后,37℃、180r/min搖菌1h。取約200.0μL轉(zhuǎn)化菌液涂布于含異丙基硫代半乳糖苷、5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷和氨芐西林的LB固體平板上,37℃培養(yǎng)過夜。挑取平板上單個(gè)較大的白色菌落,接種于5 mL的LB液體培養(yǎng)基中,37℃、180 r/min搖菌12 h,提取質(zhì)粒,Bam HⅠ和KpnⅠ雙酶切質(zhì)粒以篩選重組成功的質(zhì)粒。選取包含重組質(zhì)粒的菌液送往廣州光正物園研發(fā)中心進(jìn)行DNA測(cè)序,運(yùn)用美國國家生物技術(shù)信息中心中的BLAST工具進(jìn)行序列比對(duì)。

        1.2.4LDH-B真核表達(dá)載體的構(gòu)建Bam HⅠ和KpnⅠ雙酶切含有正確LDH-B基因序列的重組質(zhì)粒,酶切產(chǎn)物行1%瓊脂糖凝膠電泳,EB染色成像后,紫外光下切取包含LDH-B基因的凝膠塊,回收凝膠塊中的LDH-B基因片段。Bam HⅠ和KpnⅠ雙酶切pcDNA3.1(-)質(zhì)粒,純化酶切產(chǎn)物。參照1.2.3步驟中的連接體系及條件,配制pcDNA3.1(-)-LDH-B連接液,并將其轉(zhuǎn)化至DH5α感受態(tài)細(xì)菌,體外培養(yǎng)后將轉(zhuǎn)化菌液涂布于含氨芐西林的LB固體平板上,37℃培養(yǎng)過夜。挑取平板上的菌落作模板,菌落PCR篩選出包含pcDNA3.1(-)-LDH-B的陽性菌落,Bam HⅠ和KpnⅠ雙酶切其質(zhì)粒驗(yàn)證,挑選酶切驗(yàn)證陽性的菌落送往廣州光正物園研發(fā)中心測(cè)序后進(jìn)一步確認(rèn)。

        2 結(jié)果

        2.1RT-PCR擴(kuò)增LDH-B基因RT-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳、EB染色成像后,在1.0 kb處可見一明顯的特異性條帶(圖1),與預(yù)期的LDH-B片段長(zhǎng)度1 006 bp相符合。膠回收PCR產(chǎn)物,超微量紫外分光光度計(jì)測(cè)得濃度為10.12ng/μL,A260/A280=1.89。

        2.2pUC19-LDH-B酶切驗(yàn)證及測(cè)序挑取藍(lán)白篩選平板上的白色菌落,LB液體培養(yǎng)基擴(kuò)大培養(yǎng),提取質(zhì)粒,Bam HⅠ和KpnⅠ雙酶切質(zhì)粒,酶切產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳、EB染色成像后可見約2.6 kb和1.0 kb的條帶(圖2),分別與pUC19和LDH-B的片段長(zhǎng)度相符合,表明pUC19-LDH-B克隆載體構(gòu)建成功。測(cè)序結(jié)果經(jīng)BLAST序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),目的片段的編碼區(qū)堿基序列與Genebank中LDH-B的編碼區(qū)參考序列一致性為100.0%,表明LDH-B基因克隆成功。

        圖1 PCR擴(kuò)增LDH-B產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果

        圖2 pUC19-LDH-B酶切產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果

        2.3pcDNA3.1(-)-LDH-B酶切驗(yàn)證菌落PCR篩選包含pcDNA3.1(-)-LDH-B重組質(zhì)粒的陽性菌落,挑取單克隆搖菌提取質(zhì)粒,Bam HⅠ和KpnⅠ雙酶切質(zhì)粒后可見約5.5kb和1.0kb的條帶(圖3),分別與pcDNA3.1(-)和LDH-B的片段長(zhǎng)度相符合,進(jìn)一步測(cè)序后證明pcDNA3.1(-)-LDH-B真核表達(dá)載體構(gòu)建成功。

        圖3 pcDNA3.1(-)-LDH-B酶切產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果

        3 討論

        根據(jù)中國癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤,其發(fā)生率約占女性所有惡性腫瘤的15%,是45歲以下女性最常見的癌癥死因[4]。乳腺癌是一組高度異質(zhì)性的疾病,根據(jù)乳腺癌分子表達(dá)情況的不同,可將其分為多個(gè)亞型。其中三陰乳腺癌是指雌激素受體(estrogen receptor,ER)、孕激素受體(progesterone receptor,PR)和人類表皮生長(zhǎng)因子受體2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)表達(dá)均為陰性的乳腺癌。三陰乳腺癌侵襲性強(qiáng),惡性程度高,對(duì)傳統(tǒng)的內(nèi)分泌治療及曲妥珠單抗靶向治療均無反應(yīng),患者預(yù)后往往很差,因此,找出新的三陰乳腺癌的治療靶點(diǎn)極為重要[5]。

        Mccleland等[6]通過構(gòu)建siRNA文庫對(duì)8種三陰乳腺癌細(xì)胞系和3種管腔型乳腺癌細(xì)胞系共計(jì)79個(gè)基因進(jìn)行篩選,發(fā)現(xiàn)LDH-B基因是唯一一個(gè)三陰乳腺癌增殖所特定需要的基因。在體外或體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中運(yùn)用shRNA沉默LDH-B基因后,均會(huì)明顯抑制三陰乳腺癌細(xì)胞的增殖或其移植瘤的生長(zhǎng)。該研究小組認(rèn)為,三陰乳腺癌更加依賴于糖酵解產(chǎn)能,這與三陰乳腺癌中LDH-B和單羧酸轉(zhuǎn)運(yùn)子1(monocarboxylate transporter,MCT1)的共表達(dá)有很大關(guān)系。LDH-B可能作為干預(yù)三陰乳腺癌生長(zhǎng)的分子靶標(biāo)。高表達(dá)LDH-B的乳腺癌患者常預(yù)示其總生存期和無疾病進(jìn)展生存期較短。同時(shí),Dennison等[7]通過蛋白質(zhì)印跡結(jié)果發(fā)現(xiàn),LDH-A在各種乳腺癌細(xì)胞系中均有表達(dá),而LDH-B僅在三陰乳腺癌細(xì)胞系中高表達(dá)。shRNA沉默三陰乳腺癌細(xì)胞系的LDH-B基因后,將增加腫瘤細(xì)胞的氧化磷酸化。其臨床數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),LDH-B是預(yù)測(cè)三陰乳腺癌術(shù)后復(fù)發(fā)的唯一指標(biāo),并且高度認(rèn)為L(zhǎng)DH-B可以用于預(yù)測(cè)新輔助化療對(duì)乳腺癌的治療效果。由此可見,LDH-B無論是在基礎(chǔ)研究還是臨床應(yīng)用中,都與三陰乳腺癌之間有著十分緊密而特殊的聯(lián)系。

        明確LDH-B所涉及的分子機(jī)制是研究LDH-B的重要內(nèi)容。Zha等[8]的研究證明,在高度激活的哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)所介導(dǎo)的腫瘤發(fā)生過程中,LDH-B扮演著十分關(guān)鍵的角色。磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)/mTOR信號(hào)通路是機(jī)體調(diào)控細(xì)胞增殖、分化、代謝及血管形成等的一個(gè)重要信號(hào)通路,在許多惡性腫瘤中均發(fā)現(xiàn)有PI3K/Akt/mTOR信號(hào)通路的持續(xù)性激活,包括乳腺癌[9]。Zha等[8]研究發(fā)現(xiàn),mTOR是LDH-B的正調(diào)節(jié)分子,會(huì)促進(jìn)細(xì)胞LDH-B的表達(dá),即高度激活的mTOR能夠上調(diào)其下游的細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與轉(zhuǎn)錄激活因子3(STAT3),STAT3是一種轉(zhuǎn)錄因子,繼而激活LDH-B基因的轉(zhuǎn)錄而促進(jìn)LDH-B分子的表達(dá),即構(gòu)成mTOR/STAT/LDH-B信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,認(rèn)為L(zhǎng)DH-B可能會(huì)成為一個(gè)有效的靶點(diǎn),用于治療由PI3K/Akt/mTOR異常激活所導(dǎo)致的腫瘤。

        在最近一項(xiàng)對(duì)乳腺癌荷瘤小鼠的研究中,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn),經(jīng)過持久運(yùn)動(dòng)和鍛煉的荷瘤小鼠,其瘤體內(nèi)LDH-B的表達(dá)水平將會(huì)增高,而LDH-A的表達(dá)水平則降低。此外,LDH同工酶電泳顯示,經(jīng)過持久鍛煉的荷瘤小鼠,在瘤體中開始更多地表達(dá)LDH1和LDH2,而未經(jīng)鍛煉的荷瘤小鼠在瘤體中仍較高地表達(dá)LDH4和LDH5[10]。

        本實(shí)驗(yàn)研究所選取的MDA-MB-231細(xì)胞系即為ER、PR和HER2均不表達(dá)的三陰乳腺癌細(xì)胞系,通過分、切、接、轉(zhuǎn)、篩等一系列的經(jīng)典操作,成功克隆了LDH-B基因的編碼區(qū)序列,并構(gòu)建了其真核表達(dá)載體pcDNA3.1(-)-LDH-B。在下一步的實(shí)驗(yàn)方案中,本課題組計(jì)劃將pcDNA3.1(-)-LDH-B轉(zhuǎn)染入T47D、MCF-7等不表達(dá)LDH-B的乳腺癌細(xì)胞系,并用蛋白質(zhì)印跡法檢測(cè)LDH-B分子的過表達(dá),以探究過表達(dá)LDH-B分子會(huì)對(duì)LDH同工酶酶譜產(chǎn)生如何的影響,過表達(dá)的LDH-B分子是否會(huì)對(duì)腫瘤的增殖、遷移和侵襲等生物學(xué)行為產(chǎn)生影響等。

        總之,本研究為進(jìn)一步探究LDH-B的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。開展LDH-B與乳腺癌等腫瘤關(guān)系的研究具有十分重要的意義。

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        Cloning of human lactate dehydrogenase B gene and construction of its eukaryotic expression vector*

        Hu Xianglin1,Qing Xin2,Zeng Fancai2△
        (1.Clinical Medical College;2.Laboratory of Biochemistry and Molecular Biology,Southwest Medical University,Luzhou,Sichuan 646000,China)

        ObjectiveTo clone human lactate dehydrogenase B(LDH-B)gene and to construct its eukaryotic expression vector.MethodsTotal RNA was extracted from human breast cancer cell line MDA-MB-231,cDNA was generated by reverse transcription,cDNA was used as the template and the sequence segment of LDH-B gene coding region was amplified by poly merase chain reaction(PCR),both LDH-B gene segment and pUC19 plasmid were digested with two restriction endonucleases of BamHⅠand KpnⅠ,pUC19-LDH-B cloning vector was constructed by ligation reaction and then transformed into E.coli DH5α competence cells,the single white bacterial colony was selected in the blue-white selection plates,positive recombinant plasmid was identified by double restriction endonucleases digestion and DNA sequencing.Eukaryotic expression vector of pcDNA3.1(-)-LDH-B was constructed by subcloning LDH-B gene segment with the right sequence into pcDNA3.1(-)vector.ResultsA specific DNA band about 1.0 kb was found by PCR amplification,which agreed with the expected fragment length of LDH-B;two DNA bands about 2.6 kb and 1.0 kb were seen after digestion of pUC19-LDH-B with BamHⅠand KpnⅠ,which agreed with the fragment length of pUC19 and LDH-B respectively,the LDH-B sequencing result was consistent with its reference sequence in Genebank;two DNA bands about 5.5 kb and 1.0 kb were seen after digestion of pcDNA3.1(-)-LDH-B with BamHⅠand KpnⅠ,which agreed with the fragment length of pcDNA3.1(-)and LDH-B respectively.ConclusionHuman LDH-B gene is successfully cloned in this experimental study and its eukaryotic expression vector is successfully constructed,which lays an essential foundation for further exploring LDH-B biological functions.

        L-lactate dehydrogenase;Genes;Cloning,molecular;Genetic vectors;Eukaryotic cells

        10.3969/j.issn.1009-5519.2016.20.004

        A

        1009-5519(2016)20-3106-03

        國家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(201410632010)。

        胡湘麟(1994-),2012級(jí)麻醉專業(yè)在讀本科生。

        △,E-mail:zfcai@swmu.edu.cn。

        (2016-06-08)

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