黃文俊,李濤,范學(xué)慧,余奕言,楊艷,曾曉榮,譚曉秋
(西南醫(yī)科大學(xué)心血管醫(yī)學(xué)研究所、醫(yī)學(xué)電生理學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、四川省心血管疾病防治協(xié)同創(chuàng)新中心,四川瀘州646000)
論著
Flag和GFP雙標(biāo)記的SK2通道表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建、鑒定和序列分析*
黃文俊,李濤,范學(xué)慧,余奕言,楊艷,曾曉榮,譚曉秋
(西南醫(yī)科大學(xué)心血管醫(yī)學(xué)研究所、醫(yī)學(xué)電生理學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、四川省心血管疾病防治協(xié)同創(chuàng)新中心,四川瀘州646000)
目的:采用Overlapping PCR(重疊PCR)法進(jìn)行人源SK2通道Flag和GFP融合表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建,為下一步胞外運(yùn)用Flag抗體進(jìn)行SK2通道的轉(zhuǎn)運(yùn)調(diào)控研究奠定基礎(chǔ)。方法:在既往克隆的人SK2通道基因的表達(dá)質(zhì)粒pIRES-SK2的基礎(chǔ)上,采用重疊PCR法構(gòu)建Flag和GFP雙標(biāo)簽標(biāo)記的表達(dá)質(zhì)粒pEGFP-N3-Flag-SK2(簡(jiǎn)寫為Flag-SK2-GFP)。結(jié)果:構(gòu)建的表達(dá)質(zhì)粒Flag標(biāo)簽插入SK2通道的S1-S2胞外環(huán)區(qū)域,GFP標(biāo)簽連接SK2通道胞內(nèi)的C末端,通過酶切、測(cè)序等證實(shí)質(zhì)粒構(gòu)建成功。結(jié)論:成功構(gòu)建人心房肌SK2通道基因表達(dá)質(zhì)粒Flag-SK2-GFP,為下一步研究SK2通道轉(zhuǎn)運(yùn)過程及調(diào)控機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
小電導(dǎo)鈣激活鉀通道;重疊PCR;基因工程
近年來,小電導(dǎo)鈣激活鉀通道(small conductance calcium activated potassium channels,SK2)在人心房肌上被發(fā)現(xiàn)并且證明其在心肌細(xì)胞的復(fù)極化過程中扮演重要的角色[1-3]。由于SK2通道在心房肌的表達(dá)原高于心室肌,因此,尋找針對(duì)SK2通道調(diào)控的靶點(diǎn)將為房性心律失常(如心房顫動(dòng))的治療提供新的思路[4-7]。對(duì)SK2通道的深入研究,尤其是調(diào)控機(jī)制的研究就顯得尤為重要。目前異源表達(dá)表達(dá)離子通道在工具細(xì)胞如HEK293,CHO等已成為研究離子通道功能活動(dòng)和藥物篩選的主要方法之一,本研究旨在采用重疊PCR方法進(jìn)行含標(biāo)簽的表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建,為下一步研究SK2通道蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)過程以及功能活性奠定基礎(chǔ)。
圖1 重疊PCR構(gòu)建融合表達(dá)質(zhì)粒pEGFP-Flag-SK2示意圖
1.1 試劑和儀器
主要試劑包括膠回收試劑盒(北京天根)、質(zhì)粒提取試劑盒(北京天根)、PCR反應(yīng)試劑(寶生物生物科技)、限制性內(nèi)切酶(寶生物生物科技)、瓊脂糖粉(Biowest公司)、LB培養(yǎng)基(上海生工),大腸桿菌DH5α(碧云天)、DNA Marker(碧云天)和連接反應(yīng)試劑(Promega公司),其余試劑為國(guó)產(chǎn)分析純。主要實(shí)驗(yàn)儀器有PCR儀(ABI公司)、紫外分光光度儀(Nanodrop公司)和離心機(jī)(Eppendorf公司)。
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
本實(shí)驗(yàn)旨在已有編碼人心肌SK2通道的表達(dá)質(zhì)粒pIRES-SK2和pEGFP-N3的基礎(chǔ)上,構(gòu)建Flag和GFP雙標(biāo)簽標(biāo)記的SK2通道表達(dá)質(zhì)粒Flag-SK2-GFP,其中Flag標(biāo)簽的氨基酸序列為:DYKDDDDK,擬將其插入SK2通道S1與S2跨膜序列的胞外側(cè)連接處,插入后的氨基酸序列為:SNPIESDYKDDDDKCQNFYKDF。構(gòu)建Flag標(biāo)簽的目的是用于檢測(cè)SK2通道蛋白在細(xì)胞膜上的表達(dá)水平。GFP標(biāo)簽連接于SK2通道胞內(nèi)的C末端,用于檢測(cè)SK2通道蛋白在細(xì)胞整體的表達(dá)水平。本實(shí)驗(yàn)的基因克隆在實(shí)驗(yàn)室前期構(gòu)建的表達(dá)質(zhì)粒pIRES-SK2的基礎(chǔ)上[8],進(jìn)行重疊PCR法和酶切連接完成的。引物序列見表1所示,引物由Invitrogen公司合成。
Flag標(biāo)簽插入pEGFP-N3-Flag-SK2的具體步驟和實(shí)驗(yàn)流程見圖1所示:①將Flag(紅色)插入到含有酶切位點(diǎn)Hind III和BamH I的表達(dá)質(zhì)粒pIRES-SK2(藍(lán)色)S1與S2胞外環(huán)的位點(diǎn)(圖1A)。以質(zhì)粒pIRES-SK2為模板,分段擴(kuò)增包含有部分SK2通道和Flag標(biāo)簽的片段1和片段2(圖1B);②以片段1和片段2的混合片段為模板,使用片段1的上游引物和片段2的下游引物,進(jìn)行重疊PCR反應(yīng)得到包含有Flag的SK2通道片段3(圖1C);③選擇酶切位點(diǎn)BamHⅠ和HindⅢ,采用雙酶切法酶切質(zhì)粒pEGFP-N3和片段3后,然后進(jìn)行T4連接反應(yīng),將連接產(chǎn)物進(jìn)行轉(zhuǎn)化就得到含有Flag標(biāo)簽的SK2通道表達(dá)質(zhì)粒pEGFP-N3-Flag-SK2(圖1D)。
首先以pIRES-SK2質(zhì)粒為模板,利用表1中引物分別擴(kuò)增得到產(chǎn)物片段1和片段2(圖2A)。再以片段1和片段2為模板,利用片段1的上游引物和片段2下游引物PCR擴(kuò)增得到含F(xiàn)lag標(biāo)簽序列的片段3產(chǎn)物(圖2B)。利用HindⅢ和BamHⅠ對(duì)片段3和pEGFP-N3進(jìn)行雙酶切,繼而進(jìn)行連接反應(yīng),從而可以將含有Flag標(biāo)簽序列的SK2序列克隆到pEGFP-N3載體,繼而得到含有Flag和GFP雙標(biāo)記的SK2表達(dá)質(zhì)粒pEGFP-N3-Flag-SK2(圖3A)。將連接產(chǎn)物進(jìn)行轉(zhuǎn)化培養(yǎng)后提取質(zhì)粒,酶切鑒定,測(cè)序。測(cè)序正確的質(zhì)粒進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。
PCR反應(yīng)體系、酶切反應(yīng)體系和連接反應(yīng)體系都是根據(jù)試劑公司推薦的實(shí)驗(yàn)條件進(jìn)行。PCR反應(yīng)的退火溫度根據(jù)引物的Tm降低2℃設(shè)置,酶切反應(yīng)為37℃水浴過夜,連接反應(yīng)為16℃水浴過夜。轉(zhuǎn)化步驟按照碧云天大腸桿菌DH5α說明書進(jìn)行。
表1 重疊PCR引物序列
2.1 Flag標(biāo)簽插入質(zhì)粒pIRES-SK2以及pEGFPN3-Flag-SK2質(zhì)粒酶切鑒定
使用PCR分別得到含有部分SK2通道和Flag標(biāo)簽的片段1和片段2,PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果如圖2A所示,目標(biāo)條帶位置與預(yù)測(cè)大小基本一致。然后以這兩個(gè)片段為模板,使用重疊PCR方法得到片段3后,F(xiàn)lag標(biāo)簽插入SK2通道S1-S2之間,同時(shí)還含有BamHⅠ與HindⅢ酶切位點(diǎn),片段3條帶大小約2 000 bp,電泳條帶位置符合預(yù)期(圖3B)。質(zhì)粒pEGFP-N3雙酶切后,與片段3進(jìn)行連接反應(yīng),得到含有Flag標(biāo)簽的質(zhì)粒pEGFP-N3-Flag-SK2。得到的質(zhì)粒首先經(jīng)過BamHⅠ與HindⅢ雙酶切鑒定,結(jié)果如圖2C所示,經(jīng)BamHⅠ與HindⅢ雙酶切之后能夠得到一約2 000 bp左右的目的條帶。
圖2 重疊PCR產(chǎn)物電泳圖
2.2 Flag-SK2-GFP質(zhì)粒測(cè)序結(jié)果
測(cè)序結(jié)果顯示:Flag插入SK2通道的S1-S2胞外環(huán)(圖3B),GFP標(biāo)簽連接與SK2通道的胞內(nèi)C末端(圖3C)。
圖3 Flag-SK2-GFP質(zhì)粒結(jié)構(gòu)示意圖和測(cè)序結(jié)果
由于SK2通道在心房表達(dá)的特異性,同時(shí)又將胞內(nèi)鈣與膜電位相偶聯(lián),因此,SK2通道被認(rèn)為房性心律失常的潛在治療靶點(diǎn)[9]。既往研究發(fā)現(xiàn),SK2通道在心房快速起搏的家兔心房肌表達(dá)量增加,更為重要的是心房快速起搏促進(jìn)了SK2通道蛋白由胞漿向細(xì)胞膜的轉(zhuǎn)運(yùn)過程[10]。這提示我們,SK2通道轉(zhuǎn)運(yùn)過程在心房快速起搏(或房顫)是出現(xiàn)了異常,但是其深入機(jī)制未明。離子通道轉(zhuǎn)運(yùn)功能調(diào)節(jié)可能為疾?。ㄐ穆墒С#┑闹委熖峁┧悸穂11-12]。目前離子通道轉(zhuǎn)運(yùn)功能研究的策略較少,為此,本研究構(gòu)建Flag與GFP雙標(biāo)記的SK2通道表達(dá)質(zhì)粒Flag-SK2-GFP,其中Flag插于胞外環(huán)S1-S2之間,GFP連接于C末端。插入GFP標(biāo)簽的優(yōu)勢(shì)是可以直接使用激光共聚焦顯微鏡和活細(xì)胞工作站、流式細(xì)胞術(shù)等技術(shù)實(shí)時(shí)、動(dòng)態(tài)的觀察活細(xì)胞SK2通道蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)過程和調(diào)控機(jī)制。插入Flag標(biāo)簽是基于目前直接針對(duì)SK2通道蛋白胞外抗體的特異性和親和力較差,不能準(zhǔn)確反映通道蛋白在細(xì)胞膜上的表達(dá)水平。而針對(duì)Flag標(biāo)簽抗體的特異性和親和力要高很多,因而更能準(zhǔn)確的研究SK2通道在細(xì)胞膜上的表達(dá)水平。由于僅僅只有離子通道在細(xì)胞膜上表達(dá)的高低是不能準(zhǔn)確反映通道蛋白在向細(xì)胞膜轉(zhuǎn)運(yùn)的過程是促進(jìn)還是抑制,結(jié)合GFP熒光強(qiáng)度代表SK2通道的總體表達(dá)水平,可以使用流式細(xì)胞術(shù)、共聚焦顯微成像技術(shù)等準(zhǔn)確地研究細(xì)胞膜上通道蛋白與整體表達(dá)水平之間的比例關(guān)系,從而更加準(zhǔn)確反映通道蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)效率。因此,采用Flag標(biāo)簽抗體研究蛋白定位和表達(dá)時(shí),比直接使用目的蛋白的抗體陽性率、準(zhǔn)確性均有明顯提高,同時(shí)還能降低研究的科研成本,是一項(xiàng)可以值得推廣的研究策略。而采用該質(zhì)粒,結(jié)合配套的熒光顯微鏡膜片鉗系統(tǒng),研究SK2通道的電生理特性及其藥物作用機(jī)制,大大提高實(shí)驗(yàn)效率并簡(jiǎn)化篩選穩(wěn)定表達(dá)克隆的過程。
此外,本實(shí)驗(yàn)利用的重疊PCR技術(shù)具有不需要限制性內(nèi)切酶的消化和連接酶的處理的特點(diǎn),可以很好的用于在融合基因的構(gòu)建、長(zhǎng)片段基因的擴(kuò)增等方面。
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(2016-04-23收稿)
Construction of SK2 channel expression plasmid with double labeling of Flag and GFP
Huang Wenjun,Li Tao,Fan Xuehui,Yu Yiyan,Yang Yang,Zen Xiaorong,Tan Xiaoqiu
Institute of Cardiovascular Research,Southwest Medical University,Luzhou,Sichuan Province,646000, China;the Key Laboratory of Medical Electrophysiology of Ministry of Education;Collaborative Innovation Center for Prevention and Treatment of Cardiovascular Disease
Objective:This study aimed to construct a SK2 channel plasmid with two tags using overlapping PCR to provide the easiness to track the transportation of the channel protein.Methods:Based on human SK2 channel expression plasmid pIRES-SK2,the full length of SK2 cDNA with a Flag insertion was amplified using overlapping PCR method,which was then subcloned into pEGFP-N3 vector.The double-tagged expression plasmid,pEGFP-N3-Flag-SK2(Flag-SK2-GFP)was confirmed by DNA sequencing.Results:A Flag tag was inserted in-between the S1-S2 extracellular loops of SK2 channel whose C-terminus was fused in-frame to GFP. The constructed plasmid was further confirmed by DNA sequencing.Conclusion:The expression plasmid Flag-SK2-GFP was constructed successfully with overlapping PCR.
Small conductance calcium activated potassium channels;Overlapping PCR;Gene cloning
R972.4
A
10.3969/j.issn.1000-2669.2016.06.009
*國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(NO:31300948;81670310),四川省科技廳支撐計(jì)劃(2011FZ0106),瀘州市-四川醫(yī)科大學(xué)聯(lián)合資助項(xiàng)目(2015LZCYD-S03)
黃文?。?983-),女,助理研究員,碩士
譚曉秋(1981-),男,副研究員。E-mail:tanxiaogiu1981@163.com