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        食用栝樓種苗雌雄性別的DNA鑒定技術初步研究

        2016-09-09 08:30:10金關榮駱霞虹楊曉伶王亦斌朱云國陳常理浙江省農(nóng)業(yè)科學院花卉研究開發(fā)中心浙江杭州30同濟大學生命科學與技術學院上海0009
        浙江農(nóng)業(yè)科學 2016年7期
        關鍵詞:栝樓雌雄條帶

        金關榮,程 舟,駱霞虹,楊曉伶,王亦斌,李 珊,朱云國,陳常理*(.浙江省農(nóng)業(yè)科學院花卉研究開發(fā)中心,浙江杭州 30;.同濟大學生命科學與技術學院,上海 0009)

        食用栝樓種苗雌雄性別的DNA鑒定技術初步研究

        金關榮1,程舟2,駱霞虹1,楊曉伶2,王亦斌2,李珊2,朱云國2,陳常理1*
        (1.浙江省農(nóng)業(yè)科學院花卉研究開發(fā)中心,浙江杭州 311202;2.同濟大學生命科學與技術學院,上海 200092)

        應用ISSR分子標記構建食用栝樓雌雄植株的DNA指紋圖譜,獲得與食用栝樓雌雄性別相關的分子標記,可準確、有效地鑒定食用栝樓種苗雌雄性別,為栝樓產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展提供技術支撐。

        食用栝樓;種苗;雌雄性別;ISSR;鑒定

        文獻著錄格式:金關榮,程舟,駱霞虹,等.食用栝樓種苗雌雄性別的DNA鑒定技術初步研究[J].浙江農(nóng)業(yè)科學,2016,57(7):1066-1068.

        栝樓(Trichosanthes kirilowii Maxim.)是葫蘆科(Cucurbitaceae)栝樓屬(Trichosanthes L.)多年生草質(zhì)藤本植物,其根、果實、果皮、種子均可入藥,是我國的重要藥用植物資源[1]。食用栝樓,又叫仁栝樓,俗稱吊瓜,是野生栝樓的栽培種,其種子富含脂肪和蛋白質(zhì)、味香爽口、油而不膩,具有較高的食用價值。目前,在長三角地區(qū)尤其是浙江省長興、麗水、江蘇省宜興、常州等縣市栝樓已廣泛種植,僅長興縣今年的種植面積就近6 667 hm2,取得了良好的經(jīng)濟效益。

        栝樓是雌雄異株植物,開花前雌、雄株間無明顯的形態(tài)差異,雌雄株難辯。在栝樓栽培生產(chǎn)中雌、雄株的合理搭配在9∶1左右,而用種子繁殖栝樓時其幼苗的雌雄比例約為3∶7,目前產(chǎn)區(qū)多采用開花后人工去除雄株,以控制雌雄株比率。栝樓雌雄株比例失調(diào)直接影響產(chǎn)量和經(jīng)濟效益,不僅對土地、資源、人力等方面都造成較大浪費,而且已經(jīng)成為制約食用栝樓產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要因素。

        DNA指紋鑒定技術是近十幾年發(fā)展起來的研究生物種群遺傳多樣性的有效技術,可對種、品種甚至個體間的微小差異進行有效的標記和鑒定,如限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)、隨機擴增多態(tài)性DNA(RAPD)、擴增性酶切片段長度多態(tài)性(AFLP)和微衛(wèi)星標記(SSR)等。這些方法由于具有靈敏、所需樣品量少、不受材料外形的影響、直接檢測樣品的遺傳物質(zhì)DNA等特點,現(xiàn)已被廣泛用于基因定位、醫(yī)學鑒定以及種質(zhì)資源的鑒定和保護等領域。特別是對于檢測生物個體間的細微差別具有其他方法難以比擬的優(yōu)越性。

        ISSR(inter-simple sequence repeat)簡單序列重復區(qū)間擴增多態(tài)性,是利用生物基因組中常出現(xiàn)的簡單序列重復SSR(simple sequence repeat)設計引物,檢測多態(tài)性的一種分子標記。ISSR分子標記技術具有操作簡單、無須預先知道DNA序列、比RAPD標記更為靈敏、穩(wěn)定且實驗重復性好等優(yōu)點[2-4]。

        以往對栝樓的研究較少,僅對其生物學特性、栽培技術、病蟲害防治、遺傳多樣性、內(nèi)含物等方面有少量報道[3-7],對栝樓雌雄株DNA鑒定的研究尚屬空白。因此,本研究嘗試應用ISSR分子標記構建栝樓雌雄植株的DNA指紋圖譜,尋找與性別相關的分子標記,優(yōu)化操作程序,建立準確、有效、實用的食用栝樓種苗雌雄性別鑒定技術,為栝樓產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展提供技術支撐。

        1 材料與方法

        1.1材料

        2005年5月在浙江省農(nóng)業(yè)科學院花卉研究開發(fā)中心苗圃,從已知雌雄性別的3年生食用栝樓植株中選取6株雄株和10株雌株的新鮮葉片,用于DNA指紋圖譜分析。另選已知雌雄性別的2年生食用栝樓種苗30株用于驗證實驗。

        1.2基因組DNA的提取

        取上述各栝樓植株的新鮮嫩葉0.2 g,用液氮研磨后轉(zhuǎn)入離心管中,加入600μL預熱的CTAB緩沖液(2%CTAB、1.4 mol·L-1NaC1、0.2%β-巰基乙醇、100 mmol·L-1Tris-HC1、20 mmol·L-1EDTA,pH值8.0),65℃保溫1 h。加入600μL氯仿/異戊醇混合液(體積比24∶1),輕搖混勻5 min,室溫12 000 r·m in-1離心10 min。取上清,加入500μL氯仿/異戊醇混合液(24∶1),輕搖混勻10 m in,12 000 r·m in-1離心10 m in。取上清,加入1/10體積的3 mol·L-1NaAc和2倍體積的預冷的無水乙醇,顛倒混勻后在-20℃中保存30 m in。10 000 r·min-1離心5 m in,取沉淀,用70%乙醇清洗,5 000 r·min-1離心5 min。取沉淀干燥后用100μL TE緩沖液(10 mmol·L-1Tris-HC1、1 mmol·L-1EDTA,pH值8.0)溶解,用0.7%的瓊脂糖凝膠檢測DNA質(zhì)量。

        1.3ISSR引物篩選和PCR擴增

        選擇雌雄各2株的4個DNA樣品篩選14條ISSR引物,即The University of British Columbia(UBC)SSR Primer(RAPD)Synthesis Project Oligonucletide Set 100/9(表1)。反應體系20μL含2 mmol·L-1MgC12、0.25 mmol·L-1dNTPs、0.2μmol·L-1引物、10 ng模板、1×buffer和0.75 U Fx Taq DNA聚合酶(TaKaRa)。使用Eppendorf Mastercycler Gradient PCR儀進行擴增反應,擴增條件為94℃預變性5 min;40個循環(huán):94℃變性45 s,48~55℃退火45 s(退火溫度隨引物變化見表1),72℃延伸45 s;最后72℃延伸10 min。

        表1 本研究所用的ISSR引物

        擴增產(chǎn)物在1.5%瓊脂糖凝膠中電泳分離(以100 V恒壓電泳35 min),以100 bp DNA Ladder Plus(MBI Fermentas)作為分子量標準,用1μg· m L-1溴化乙啶染色后于UVP-GDS8000自動成像儀中拍照、觀察、記錄并保存電泳圖片,構建栝樓雌雄植株的DNA指紋圖譜。

        2 結果與分析

        2.1食用栝樓雌雄株的ISSR指紋圖譜的構建

        用已知雌雄性別的栝樓DNA樣品從14條ISSR引物中篩選出8個擴增條帶清晰、重復性好的引物,對所有樣本進行擴增。其中引物826和861兩條引物對已知雌雄性別的栝樓的DNA擴增結果表明,栝樓雌雄植株在ISSR指紋圖譜上表現(xiàn)出明顯的差異。在ISSR指紋圖譜(引物826)上,栝樓雌株在2 100 bp處出現(xiàn)特征性條帶,栝樓雄株則在1 100 bp處出現(xiàn)特征性條帶(圖1)。在ISSR指紋圖譜(引物861)上,栝樓雌株在1 400和1 000 bp處出現(xiàn)特征性條帶,栝樓雄株則在700 bp處出現(xiàn)特征性條帶(圖2)。根據(jù)栝樓雌雄株在ISSR指紋圖譜上的特征性條帶,可對栝樓種苗的雌雄性別進行早期鑒定。

        圖1 食用栝樓種苗雌雄植株的ISSR指紋圖譜(引物826)

        2.2食用栝樓種苗雌雄性別鑒定

        根據(jù)構建的栝樓雌雄株的ISSR指紋圖譜及其特征性條帶,對栝樓種苗的雌雄性別鑒定的可靠性進行了驗證實驗,對已知雌雄性別的數(shù)十株栝樓種苗進行了DNA鑒定。圖3展示的是用ISSR引物826擴增出的食用栝樓種苗(雌株)及對照樣品栝樓雄株、雌株、野生株的指紋圖譜,結果食用栝樓種苗雌雄性別鑒定100%成功。同樣,用ISSR引物861擴增出的指紋圖譜也可以成功鑒定食用栝樓種苗的雌雄性別(圖2)。

        3 小結

        食用栝樓雌雄植株的ISSR-DNA指紋圖譜差異明顯,并獲得與雌雄性別相關的特征性條帶。根據(jù)已構建的栝樓雌雄植株的ISSR指紋圖譜和特征性條帶,可準確、有效地將栝樓種苗的雌雄性別鑒定出來。本研究結果為食用栝樓雌雄株的鑒別、雌雄株合理搭配供應及配比栽培提供技術保障,對栝樓產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展具有重要意義及應用前景。

        圖2 用ISSR引物861擴增出的食用栝樓種苗的指紋圖譜

        圖3 用ISSR引物826擴增出的食用栝樓種苗的指紋圖譜

        [1] 國家藥典委員會.中華人民共和國藥典一部[M].北京:化學工業(yè)出版,2005:73-74.

        [2] 廖文芳,夏念和,鄧云飛,等.華木蓮的遺傳多樣性研究[J].云南植物研究,2004,26(1):58-64.

        [3] 楊廷楨,高敬東,楊明霞,等.栝樓的經(jīng)濟價值及栽培技術要點[J].甘肅農(nóng)業(yè)科技,2003(10):48-49.

        [4] 彭桂福,李彩琴,孫耘子.食用栝樓的生育特性及栽培技術[J].中國西瓜甜瓜,2003(4):44-46.

        [5] 高燕會,李慧慧,朱玉球,等.基于ISSR的栝樓遺傳多樣性分析[J].中草藥,2011,42(2):263-266.

        [6] 李慧慧,朱玉球,斯金平,等.栝樓ISSR-PCR體系的正交優(yōu)化[J].生物技術,2009,19(6):38-41.

        [7] 李珊,程舟,李彥,等.雌雄栝樓植株內(nèi)含物比較研究[J].中草藥,2008,39(2):260-263.

        (責任編輯:張 韻)

        S567

        A

        0528-9017(2016)07-1066-03

        10.16178/j.issn.0528-9017.20160734

        2016-02-16

        國家星火計劃項目(2005EA700082)

        金關榮(1959—),男,浙江杭州人,副研究員,從事經(jīng)濟作物育種、栽培及利用研究工作,E-mai1:jingr0@163.com。

        陳常理(1975—),男,助理研究員,碩士,從事經(jīng)濟作物育種、栽培及耕作科研工作,E-mai1:chenchangli66@163.com。

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